More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_0959 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_0959  type III secretion exporter  100 
 
 		 377 aa  751    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2328  type III secretion exporter  45.51 
 
 		 363 aa  328  7e-89  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.645604  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0740  type III secretion exporter  46.49 
 
 		 381 aa  325  6e-88  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31030  flagellar biosynthesis pathway, component FlhB  45.79 
 
 		 422 aa  310  2.9999999999999997e-83  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1669  type III secretion exporter  47.18 
 
 		 360 aa  291  1e-77  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.058762  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2008  type III secretion exporter  41.55 
 
 		 380 aa  267  2e-70  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2973  type III secretion exporter  43.3 
 
 		 359 aa  259  7e-68  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0860  type III secretion exporter  43.94 
 
 		 391 aa  256  3e-67  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.311747  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2016  flagellar biosynthetic protein FlhB  40.16 
 
 		 387 aa  226  5.0000000000000005e-58  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1547  flagellar biosynthesis protein FlhB  39.49 
 
 		 383 aa  223  3e-57  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2604  flagellar biosynthesis protein FlhB  38.61 
 
 		 383 aa  223  3e-57  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1862  flagellar biosynthesis protein FlhB  38.56 
 
 		 383 aa  223  6e-57  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.90359  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16690  flagellar biosynthetic protein FlhB  35.04 
 
 		 356 aa  222  9e-57  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1245  flagellar biosynthetic protein FlhB  42.02 
 
 		 390 aa  221  1.9999999999999999e-56  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.215857  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1379  flagellar biosynthesis protein FlhB  38.92 
 
 		 377 aa  219  5e-56  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.294814 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2334  flagellar biosynthesis protein FlhB  39.67 
 
 		 386 aa  219  5e-56  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.178036  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2432  flagellar biosynthesis protein FlhB  39.67 
 
 		 386 aa  218  1e-55  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1334  flagellar biosynthetic protein FlhB  40.22 
 
 		 384 aa  214  2.9999999999999995e-54  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1930  flagellar biosynthetic protein FlhB  36.94 
 
 		 363 aa  213  2.9999999999999995e-54  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.922236  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0357  flagellar biosynthesis protein FlhB  32.42 
 
 		 368 aa  213  4.9999999999999996e-54  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1623  flagellar biosynthesis protein FlhB  32.6 
 
 		 362 aa  211  1e-53  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0380  flagellar biosynthesis protein FlhB  32.25 
 
 		 362 aa  212  1e-53  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.441846  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2074  flagellar biosynthesis protein FlhB  37.84 
 
 		 383 aa  211  1e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000897295 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1944  flagellar biosynthetic protein FlhB  37.63 
 
 		 381 aa  211  1e-53  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2069  flagellar biosynthesis protein FlhB  37.84 
 
 		 383 aa  211  1e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00553621 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3698  flagellar biosynthesis protein FlhB  41.31 
 
 		 380 aa  212  1e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0239481 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2938  flagellar biosynthesis protein FlhB  40.44 
 
 		 380 aa  211  1e-53  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0481554  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1208  flagellar biosynthesis protein FlhB  37.84 
 
 		 383 aa  211  1e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2129  flagellar biosynthesis protein FlhB  37.84 
 
 		 383 aa  211  2e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000192021 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3053  flagellar biosynthesis protein FlhB  37.1 
 
 		 377 aa  211  2e-53  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0535555 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1331  flagellar biosynthesis protein FlhB  37.84 
 
 		 383 aa  210  3e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.384239  hitchhiker  0.0000000000516194 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27920  flagellar biosynthetic protein  38.61 
 
 		 402 aa  209  5e-53  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0219879  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5615  flagellar biosynthesis protein FlhB  40.79 
 
 		 380 aa  209  8e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.891713  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0981  flagellar biosynthetic protein FlhB  38.21 
 
 		 390 aa  209  9e-53  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0800953 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1339  flagellar biosynthesis protein FlhB  39.12 
 
 		 377 aa  208  1e-52  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2154  flagellar biosynthetic protein FlhB  33.72 
 
 		 366 aa  208  1e-52  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1330  flagellar biosynthesis protein FlhB  33.43 
 
 		 358 aa  206  4e-52  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1515  flagellar biosynthesis protein FlhB  35.88 
 
 		 376 aa  206  7e-52  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.813027  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1163  flagellar biosynthesis protein FlhB  35.46 
 
 		 351 aa  205  1e-51  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1195  flagellar biosynthesis protein FlhB  37.05 
 
 		 377 aa  205  1e-51  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0240  flagellar biosynthetic protein FlhB  34.55 
 
 		 353 aa  203  3e-51  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.760621  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0484  flagellar biosynthetic protein FlhB  33.52 
 
 		 392 aa  203  3e-51  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0127914  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2696  flagellar biosynthetic protein FlhB  34.83 
 
 		 373 aa  204  3e-51  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2447  flagellar biosynthesis protein FlhB  34.83 
 
 		 382 aa  203  4e-51  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3441  flagellar biosynthesis protein FlhB  36.68 
 
 		 378 aa  203  5e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.456344 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4406  flagellar biosynthesis protein FlhB  35.56 
 
 		 357 aa  203  5e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.202983  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1866  flagellar biosynthesis protein FlhB  36.57 
 
 		 376 aa  202  6e-51  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.965675  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1384  flagellar biosynthesis protein FlhB  38.78 
 
 		 360 aa  202  6e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.696508  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1975  flagellar biosynthetic protein FlhB  37.37 
 
 		 378 aa  202  7e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.185057  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1519  flagellar biosynthesis protein FlhB  35.73 
 
 		 383 aa  202  8e-51  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1631  flagellar biosynthesis protein FlhB  37.09 
 
 		 377 aa  201  9.999999999999999e-51  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3678  flagellar biosynthesis protein FlhB  37.88 
 
 		 380 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.10386  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0868  flagellar biosynthesis/type III secretory pathway protein  34.92 
 
 		 369 aa  201  1.9999999999999998e-50  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0743  flagellar biosynthetic protein FlhB  33.81 
 
 		 381 aa  199  5e-50  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1412  flagellar biosynthetic protein FlhB  31.69 
 
 		 363 aa  199  6e-50  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.342211  normal  0.890154 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3215  flagellar biosynthesis protein FlhB  37.97 
 
 		 376 aa  199  6e-50  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1316  flagellar biosynthetic protein FlhB  36.69 
 
 		 366 aa  199  6e-50  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0669  flagellar biosynthesis protein FlhB  33.89 
 
 		 350 aa  199  7e-50  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0757109  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1374  flagellar biosynthesis protein FlhB  36.13 
 
 		 377 aa  199  9e-50  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2977  flagellar biosynthesis protein FlhB  37.5 
 
 		 398 aa  199  9e-50  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2295  flagellar biosynthesis protein FlhB  32.28 
 
 		 376 aa  198  1.0000000000000001e-49  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0018  flagellar biosynthetic protein FlhB  37.57 
 
 		 374 aa  197  2.0000000000000003e-49  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000937461  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0999  flagellar biosynthesis protein FlhB  33.71 
 
 		 357 aa  198  2.0000000000000003e-49  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1171  flagellar biosynthetic protein FlhB  36.31 
 
 		 383 aa  197  2.0000000000000003e-49  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.127204 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0018  flagellar biosynthetic protein FlhB  37.57 
 
 		 374 aa  197  3e-49  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000395256  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002828  flagellar biosynthesis protein FlhB  34.67 
 
 		 376 aa  197  3e-49  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1355  flagellar biosynthesis protein FlhB  37.39 
 
 		 376 aa  197  3e-49  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.424725  normal  0.225798 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5492  flagellar biosynthesis protein FlhB  35.67 
 
 		 359 aa  196  4.0000000000000005e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.14397  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1295  flagellar biosynthesis protein FlhB  37.39 
 
 		 376 aa  196  4.0000000000000005e-49  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.388157  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1362  flagellar biosynthesis protein FlhB  37.39 
 
 		 376 aa  196  4.0000000000000005e-49  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.873498 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3804  flagellar biosynthesis protein FlhB  37.98 
 
 		 403 aa  196  5.000000000000001e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1450  flagellar biosynthesis protein FlhB  37.64 
 
 		 376 aa  196  5.000000000000001e-49  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1307  flagellar biosynthesis protein FlhB  38.21 
 
 		 382 aa  196  7e-49  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0569687 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2575  flagellar biosynthetic protein FlhB  35.16 
 
 		 359 aa  196  7e-49  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.011127 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0130  flagellar biosynthesis protein FlhB  38.25 
 
 		 406 aa  196  8.000000000000001e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.561684  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01851  flagellar biosynthesis protein B  38.21 
 
 		 382 aa  195  1e-48  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1760  flagellar biosynthetic protein FlhB  38.21 
 
 		 382 aa  195  1e-48  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.304563  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1752  flagellar biosynthesis protein FlhB  38.21 
 
 		 382 aa  195  1e-48  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2112  flagellar biosynthesis protein FlhB  38.21 
 
 		 382 aa  195  1e-48  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0092  flagellar biosynthetic protein FlhB  34.17 
 
 		 376 aa  195  1e-48  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2913  flagellar biosynthesis protein FlhB  37.36 
 
 		 376 aa  195  1e-48  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.847075  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0011  flagellar biosynthetic protein FlhB  33.81 
 
 		 355 aa  195  1e-48  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01840  hypothetical protein  38.21 
 
 		 382 aa  195  1e-48  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1975  flagellar biosynthesis protein FlhB  38.21 
 
 		 382 aa  195  1e-48  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2393  flagellar biosynthetic protein FlhB  34.96 
 
 		 354 aa  195  1e-48  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1409  flagellar biosynthetic protein FlhB  38.7 
 
 		 361 aa  194  2e-48  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1137  flagellar biosynthesis protein FlhB  34.44 
 
 		 359 aa  194  2e-48  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2159  flagellar biosynthetic protein FlhB  36.77 
 
 		 377 aa  194  2e-48  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1552  flagellar biosynthesis protein FlhB  35.05 
 
 		 379 aa  194  2e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00640595  normal  0.373184 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1309  flagellar biosynthesis protein FlhB  36.92 
 
 		 392 aa  194  2e-48  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.791915  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3055  flagellar biosynthesis protein FlhB  37.36 
 
 		 376 aa  194  2e-48  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.247333 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45720  flagellar biosynthesis protein FlhB  37.02 
 
 		 378 aa  194  2e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2617  flagellar biosynthesis protein FlhB  37.94 
 
 		 382 aa  193  3e-48  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000137265 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0481  flagellar biosynthetic protein FlhB  36.29 
 
 		 391 aa  194  3e-48  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0342  flagellar biosynthesis protein FlhB  32.08 
 
 		 357 aa  193  3e-48  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00837822  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2169  flagellar biosynthesis protein FlhB  35.51 
 
 		 376 aa  193  4e-48  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001177  flagellar biosynthesis protein FlhB  34.38 
 
 		 375 aa  193  5e-48  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2923  flagellar biosynthesis protein FlhB  37.36 
 
 		 376 aa  193  5e-48  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03148  flagellar biosynthesis protein FlhB  34.32 
 
 		 376 aa  192  7e-48  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3878  flagellar biosynthesis protein FlhB  36.92 
 
 		 378 aa  192  9e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>