More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_001177 on replicon NC_013457
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009784  VIBHAR_04964  flagellar biosynthesis pathway, component FlhB  93.6 
 
 
375 aa  680    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001177  flagellar biosynthesis protein FlhB  100 
 
 
375 aa  769    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3484  flagellar biosynthetic protein FlhB  46.67 
 
 
376 aa  386  1e-106  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.994028  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3987  flagellar biosynthetic protein FlhB  45.6 
 
 
376 aa  372  1e-102  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0092  flagellar biosynthetic protein FlhB  43.2 
 
 
376 aa  366  1e-100  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3596  flagellar biosynthetic protein FlhB  50.8 
 
 
374 aa  365  1e-100  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.189893  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3667  flagellar biosynthetic protein FlhB  42.4 
 
 
376 aa  357  9.999999999999999e-98  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0086  flagellar biosynthetic protein FlhB  42.51 
 
 
376 aa  353  2.9999999999999997e-96  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.293777 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0242  flagellar biosynthesis protein FlhB  43.49 
 
 
379 aa  303  4.0000000000000003e-81  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1339  flagellar biosynthesis protein FlhB  41.11 
 
 
377 aa  300  2e-80  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2169  flagellar biosynthesis protein FlhB  39.68 
 
 
376 aa  300  3e-80  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3390  flagellar biosynthesis protein FlhB  43.23 
 
 
379 aa  300  4e-80  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1981  flagellar biosynthesis protein FlhB  39.41 
 
 
378 aa  298  9e-80  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.764273  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4645  flagellar biosynthesis protein FlhB  42.3 
 
 
379 aa  296  3e-79  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.223751  normal  0.675327 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3878  flagellar biosynthesis protein FlhB  39.25 
 
 
378 aa  296  6e-79  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45720  flagellar biosynthesis protein FlhB  38.98 
 
 
378 aa  294  2e-78  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0164  flagellar biosynthesis protein FlhB  42.18 
 
 
379 aa  293  3e-78  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1374  flagellar biosynthesis protein FlhB  40.26 
 
 
377 aa  292  8e-78  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0213  flagellar biosynthesis protein FlhB  42.11 
 
 
379 aa  291  1e-77  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.687218  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3441  flagellar biosynthesis protein FlhB  40.05 
 
 
378 aa  290  3e-77  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.456344 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1195  flagellar biosynthesis protein FlhB  38.87 
 
 
377 aa  290  3e-77  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0623  flagellar biosynthesis protein FlhB  40.58 
 
 
377 aa  289  7e-77  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3053  flagellar biosynthesis protein FlhB  39.47 
 
 
377 aa  288  1e-76  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0535555 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1975  flagellar biosynthetic protein FlhB  40.11 
 
 
378 aa  287  2e-76  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.185057  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0242  flagellar biosynthesis protein FlhB  40.31 
 
 
377 aa  286  4e-76  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.33455  normal  0.0187302 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4425  flagellar biosynthesis protein FlhB  44.56 
 
 
377 aa  285  7e-76  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.790893 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1631  flagellar biosynthesis protein FlhB  39.52 
 
 
377 aa  284  2.0000000000000002e-75  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2563  flagellar biosynthesis protein FlhB  39.34 
 
 
376 aa  283  3.0000000000000004e-75  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.757068  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1295  flagellar biosynthesis protein FlhB  39.34 
 
 
376 aa  282  6.000000000000001e-75  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.388157  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1362  flagellar biosynthesis protein FlhB  39.34 
 
 
376 aa  282  6.000000000000001e-75  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.873498 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3678  flagellar biosynthesis protein FlhB  41.44 
 
 
380 aa  282  9e-75  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.10386  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1355  flagellar biosynthesis protein FlhB  39.34 
 
 
376 aa  281  9e-75  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.424725  normal  0.225798 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1552  flagellar biosynthesis protein FlhB  38.4 
 
 
379 aa  280  2e-74  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00640595  normal  0.373184 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1334  flagellar biosynthetic protein FlhB  38.98 
 
 
384 aa  280  3e-74  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1379  flagellar biosynthesis protein FlhB  37.3 
 
 
377 aa  280  3e-74  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.294814 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0981  flagellar biosynthetic protein FlhB  37.67 
 
 
390 aa  279  5e-74  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0800953 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0713  flagellar biosynthetic protein FlhB  38.44 
 
 
379 aa  279  5e-74  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.31011  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2295  flagellar biosynthesis protein FlhB  39.24 
 
 
376 aa  279  7e-74  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1450  flagellar biosynthesis protein FlhB  38.5 
 
 
376 aa  279  7e-74  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3055  flagellar biosynthesis protein FlhB  38.5 
 
 
376 aa  278  8e-74  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.247333 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2913  flagellar biosynthesis protein FlhB  38.5 
 
 
376 aa  278  8e-74  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.847075  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0703  flagellar biosynthesis protein FlhB  40.48 
 
 
377 aa  278  1e-73  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.246065  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1866  flagellar biosynthesis protein FlhB  38.21 
 
 
376 aa  276  4e-73  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.965675  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3215  flagellar biosynthesis protein FlhB  38.5 
 
 
376 aa  276  4e-73  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2923  flagellar biosynthesis protein FlhB  38.23 
 
 
376 aa  276  5e-73  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0484  flagellar biosynthetic protein FlhB  41.31 
 
 
392 aa  275  6e-73  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0127914  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2809  flagellar biosynthesis protein FlhB  38.5 
 
 
378 aa  276  6e-73  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.326255  normal  0.0759815 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002828  flagellar biosynthesis protein FlhB  38.86 
 
 
376 aa  275  7e-73  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3914  flagellar biosynthesis protein FlhB  40.11 
 
 
380 aa  275  8e-73  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1515  flagellar biosynthesis protein FlhB  35.9 
 
 
376 aa  274  2.0000000000000002e-72  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.813027  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1944  flagellar biosynthetic protein FlhB  37.95 
 
 
381 aa  274  2.0000000000000002e-72  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1702  flagellar biosynthesis protein FlhB  38.63 
 
 
376 aa  273  4.0000000000000004e-72  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2159  flagellar biosynthetic protein FlhB  36.7 
 
 
377 aa  271  1e-71  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1514  flagellar biosynthesis protein FlhB  40.91 
 
 
380 aa  271  1e-71  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.819465  normal  0.151941 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03148  flagellar biosynthesis protein FlhB  39.16 
 
 
376 aa  271  1e-71  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4352  flagellar biosynthesis protein FlhB  39.3 
 
 
380 aa  271  2e-71  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.546846  normal  0.108757 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3034  flagellar biosynthetic protein FlhB  38.26 
 
 
374 aa  271  2e-71  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1245  flagellar biosynthetic protein FlhB  35.66 
 
 
390 aa  263  4e-69  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.215857  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02874  flagellar biosynthesis protein  39.95 
 
 
374 aa  262  6e-69  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1547  flagellar biosynthesis protein FlhB  35.29 
 
 
383 aa  261  1e-68  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1171  flagellar biosynthetic protein FlhB  39.09 
 
 
383 aa  261  1e-68  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.127204 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3431  flagellar biosynthetic protein FlhB  36.46 
 
 
378 aa  261  1e-68  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0481  flagellar biosynthetic protein FlhB  36.51 
 
 
391 aa  260  2e-68  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2284  flagellar biosynthesis protein FlhB  38.84 
 
 
377 aa  261  2e-68  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.562852  normal  0.66393 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1750  flagellar biosynthesis protein FlhB  37.7 
 
 
382 aa  257  3e-67  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1750  flagellar biosynthesis protein FlhB  37.7 
 
 
382 aa  256  4e-67  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5615  flagellar biosynthesis protein FlhB  34.05 
 
 
380 aa  256  6e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.891713  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1331  flagellar biosynthesis protein FlhB  36.46 
 
 
383 aa  251  1e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.384239  hitchhiker  0.0000000000516194 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1208  flagellar biosynthesis protein FlhB  36.68 
 
 
383 aa  251  1e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2069  flagellar biosynthesis protein FlhB  36.68 
 
 
383 aa  251  1e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00553621 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2074  flagellar biosynthesis protein FlhB  36.68 
 
 
383 aa  251  1e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000897295 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1519  flagellar biosynthesis protein FlhB  37 
 
 
383 aa  250  2e-65  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2016  flagellar biosynthetic protein FlhB  35.28 
 
 
387 aa  251  2e-65  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2129  flagellar biosynthesis protein FlhB  36.2 
 
 
383 aa  250  3e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000192021 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2334  flagellar biosynthesis protein FlhB  36.24 
 
 
386 aa  249  6e-65  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.178036  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2604  flagellar biosynthesis protein FlhB  36.34 
 
 
383 aa  249  6e-65  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0743  flagellar biosynthetic protein FlhB  34.32 
 
 
381 aa  248  1e-64  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2432  flagellar biosynthesis protein FlhB  35.88 
 
 
386 aa  246  4e-64  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0018  flagellar biosynthetic protein FlhB  37.99 
 
 
374 aa  245  8e-64  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000395256  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2447  flagellar biosynthesis protein FlhB  35.77 
 
 
382 aa  244  9.999999999999999e-64  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0011  flagellar biosynthetic protein FlhB  37.57 
 
 
355 aa  244  9.999999999999999e-64  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0018  flagellar biosynthetic protein FlhB  37.99 
 
 
374 aa  245  9.999999999999999e-64  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000937461  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27920  flagellar biosynthetic protein  34.75 
 
 
402 aa  243  3e-63  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0219879  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1862  flagellar biosynthesis protein FlhB  34.75 
 
 
383 aa  243  3.9999999999999997e-63  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.90359  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3370  flagellar biosynthesis protein FlhB  36.41 
 
 
398 aa  242  7e-63  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00184569  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4140  flagellar biosynthetic protein FlhB  34.67 
 
 
382 aa  241  1e-62  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1309  flagellar biosynthesis protein FlhB  35.45 
 
 
392 aa  239  5e-62  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.791915  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3077  flagellar biosynthesis protein  35.26 
 
 
387 aa  239  5e-62  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.539513 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2938  flagellar biosynthesis protein FlhB  35.87 
 
 
380 aa  239  5.999999999999999e-62  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0481554  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3804  flagellar biosynthesis protein FlhB  35.01 
 
 
403 aa  239  5.999999999999999e-62  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2977  flagellar biosynthesis protein FlhB  37.77 
 
 
398 aa  239  6.999999999999999e-62  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1307  flagellar biosynthesis protein FlhB  38.26 
 
 
382 aa  238  1e-61  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0569687 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0130  flagellar biosynthesis protein FlhB  33.87 
 
 
406 aa  238  1e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.561684  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1316  flagellar biosynthetic protein FlhB  37.85 
 
 
366 aa  238  1e-61  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1760  flagellar biosynthetic protein FlhB  38.42 
 
 
382 aa  237  2e-61  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.304563  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2112  flagellar biosynthesis protein FlhB  38.42 
 
 
382 aa  237  2e-61  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01840  hypothetical protein  38.42 
 
 
382 aa  237  2e-61  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1975  flagellar biosynthesis protein FlhB  38.42 
 
 
382 aa  237  2e-61  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3698  flagellar biosynthesis protein FlhB  33.77 
 
 
380 aa  238  2e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0239481 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1752  flagellar biosynthesis protein FlhB  38.42 
 
 
382 aa  237  2e-61  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>