More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_5492 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009485  BBta_5492  flagellar biosynthesis protein FlhB  100 
 
 
359 aa  735    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.14397  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1137  flagellar biosynthesis protein FlhB  74.23 
 
 
359 aa  569  1e-161  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4406  flagellar biosynthesis protein FlhB  73.01 
 
 
357 aa  555  1e-157  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.202983  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1522  flagellar biosynthesis protein FlhB  74.16 
 
 
358 aa  534  1e-150  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.23127  normal  0.258787 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1397  flagellar biosynthesis protein FlhB  74.65 
 
 
359 aa  523  1e-147  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.247493  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1698  flagellar biosynthesis protein FlhB  69.58 
 
 
357 aa  500  1e-140  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.736983 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3772  flagellar biosynthesis protein FlhB  69.19 
 
 
358 aa  477  1e-133  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0655991  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2633  flagellar biosynthetic protein FlhB  51.42 
 
 
355 aa  380  1e-104  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.295644  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2826  flagellar biosynthetic protein FlhB  49.72 
 
 
354 aa  375  1e-103  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.986887  normal  0.270742 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2603  flagellar biosynthetic protein FlhB  50 
 
 
354 aa  376  1e-103  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.371847  normal  0.56 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2575  flagellar biosynthetic protein FlhB  48.33 
 
 
359 aa  350  1e-95  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.011127 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5533  flagellar biosynthetic protein FlhB  48.01 
 
 
353 aa  322  7e-87  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.215661  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2230  flagellar biosynthetic protein FlhB  46.02 
 
 
355 aa  315  7e-85  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5150  flagellar biosynthetic protein FlhB  49.15 
 
 
353 aa  313  1.9999999999999998e-84  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0317747 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1930  flagellar biosynthetic protein FlhB  41.03 
 
 
363 aa  305  1.0000000000000001e-81  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.922236  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1384  flagellar biosynthesis protein FlhB  38.4 
 
 
360 aa  258  1e-67  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.696508  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2821  flagellar biosynthesis protein FlhB  44.35 
 
 
356 aa  242  7e-63  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.117691  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1866  flagellar biosynthesis protein FlhB  37.43 
 
 
376 aa  242  9e-63  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.965675  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3217  flagellar biosynthesis protein FlhB  38.61 
 
 
354 aa  238  9e-62  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.447718 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2016  flagellar biosynthetic protein FlhB  39.71 
 
 
387 aa  238  2e-61  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2808  flagellar biosynthesis protein FlhB  38.42 
 
 
360 aa  235  9e-61  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0739  flagellar biosynthesis protein FlhB  41.13 
 
 
379 aa  226  4e-58  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5615  flagellar biosynthesis protein FlhB  38.07 
 
 
380 aa  223  3e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.891713  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2447  flagellar biosynthesis protein FlhB  39.11 
 
 
382 aa  220  3e-56  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1374  flagellar biosynthesis protein FlhB  36.96 
 
 
377 aa  219  3.9999999999999997e-56  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1245  flagellar biosynthetic protein FlhB  36.94 
 
 
390 aa  219  5e-56  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.215857  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2074  flagellar biosynthesis protein FlhB  38.89 
 
 
383 aa  219  6e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000897295 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2069  flagellar biosynthesis protein FlhB  38.89 
 
 
383 aa  219  6e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00553621 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1208  flagellar biosynthesis protein FlhB  38.89 
 
 
383 aa  219  6e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2129  flagellar biosynthesis protein FlhB  38.89 
 
 
383 aa  219  7.999999999999999e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000192021 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1379  flagellar biosynthesis protein FlhB  35.28 
 
 
377 aa  219  7.999999999999999e-56  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.294814 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1331  flagellar biosynthesis protein FlhB  38.89 
 
 
383 aa  218  8.999999999999998e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.384239  hitchhiker  0.0000000000516194 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3431  flagellar biosynthetic protein FlhB  38.17 
 
 
378 aa  218  1e-55  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1547  flagellar biosynthesis protein FlhB  38.29 
 
 
383 aa  218  2e-55  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2295  flagellar biosynthesis protein FlhB  38.14 
 
 
376 aa  217  2.9999999999999998e-55  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4352  flagellar biosynthesis protein FlhB  39.23 
 
 
380 aa  216  4e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.546846  normal  0.108757 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0011  flagellar biosynthetic protein FlhB  36.93 
 
 
355 aa  216  4e-55  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0342  flagellar biosynthesis protein FlhB  36.36 
 
 
357 aa  216  5.9999999999999996e-55  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00837822  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1981  flagellar biosynthesis protein FlhB  36.83 
 
 
378 aa  216  5.9999999999999996e-55  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.764273  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3678  flagellar biosynthesis protein FlhB  39.55 
 
 
380 aa  216  5.9999999999999996e-55  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.10386  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0981  flagellar biosynthetic protein FlhB  36.66 
 
 
390 aa  215  8e-55  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0800953 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1129  flagellar biosynthesis protein FlhB  36.65 
 
 
360 aa  215  8e-55  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4222  flagellar biosynthesis protein FlhB  37.29 
 
 
356 aa  214  9.999999999999999e-55  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0484  flagellar biosynthetic protein FlhB  36.67 
 
 
392 aa  214  1.9999999999999998e-54  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0127914  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0130  flagellar biosynthesis protein FlhB  36.86 
 
 
406 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.561684  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3914  flagellar biosynthesis protein FlhB  38.4 
 
 
380 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3804  flagellar biosynthesis protein FlhB  36.07 
 
 
403 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1163  flagellar biosynthesis protein FlhB  36.13 
 
 
351 aa  214  2.9999999999999995e-54  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1195  flagellar biosynthesis protein FlhB  34.16 
 
 
377 aa  213  2.9999999999999995e-54  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1674  flagellar biosynthetic protein FlhB  34.94 
 
 
360 aa  213  4.9999999999999996e-54  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06204  flagellar biosynthesis protein FlhB  36.54 
 
 
376 aa  211  1e-53  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.236866  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3370  flagellar biosynthesis protein FlhB  37.15 
 
 
398 aa  211  1e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00184569  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00962  flagellar biosynthesis protein FlhB  36.54 
 
 
376 aa  211  1e-53  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.118534  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0309  flagellar biosynthesis protein FlhB  36.54 
 
 
359 aa  211  1e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45720  flagellar biosynthesis protein FlhB  34.82 
 
 
378 aa  211  1e-53  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0341  flagellar biosynthesis protein FlhB  36.75 
 
 
359 aa  211  1e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00619914 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0112  flagellar biosynthesis protein FlhB  38.32 
 
 
356 aa  211  1e-53  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.157288  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0121  flagellar biosynthesis protein FlhB  38.32 
 
 
356 aa  211  2e-53  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1334  flagellar biosynthetic protein FlhB  35.83 
 
 
384 aa  211  2e-53  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3053  flagellar biosynthesis protein FlhB  36.01 
 
 
377 aa  211  2e-53  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0535555 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3878  flagellar biosynthesis protein FlhB  34.53 
 
 
378 aa  211  2e-53  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0616  flagellar biosynthesis protein FlhB  32.87 
 
 
354 aa  210  3e-53  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.55435 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2334  flagellar biosynthesis protein FlhB  37.57 
 
 
386 aa  209  4e-53  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.178036  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27920  flagellar biosynthetic protein  37.11 
 
 
402 aa  210  4e-53  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0219879  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1944  flagellar biosynthetic protein FlhB  37.46 
 
 
381 aa  209  4e-53  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2696  flagellar biosynthetic protein FlhB  35.69 
 
 
373 aa  209  4e-53  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1519  flagellar biosynthesis protein FlhB  39.55 
 
 
383 aa  209  5e-53  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1093  flagellar biosynthesis protein FlhB  34.7 
 
 
358 aa  209  7e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.40975 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3698  flagellar biosynthesis protein FlhB  36.57 
 
 
380 aa  209  8e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0239481 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3215  flagellar biosynthesis protein FlhB  36.49 
 
 
376 aa  208  9e-53  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2393  flagellar biosynthetic protein FlhB  34.67 
 
 
354 aa  208  1e-52  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1171  flagellar biosynthetic protein FlhB  36.62 
 
 
383 aa  207  3e-52  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.127204 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2432  flagellar biosynthesis protein FlhB  37.29 
 
 
386 aa  207  3e-52  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0249  flagellar biosynthesis protein FlhB  36.67 
 
 
399 aa  206  5e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.190542  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1339  flagellar biosynthesis protein FlhB  33.51 
 
 
377 aa  206  5e-52  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2840  flagellar biosynthesis protein FlhB  36.24 
 
 
399 aa  206  5e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.151701  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0267  flagellar biosynthesis protein FlhB  36.24 
 
 
399 aa  206  5e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.110201  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1307  flagellar biosynthesis protein FlhB  40.22 
 
 
382 aa  206  7e-52  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0569687 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2809  flagellar biosynthesis protein FlhB  35.65 
 
 
378 aa  205  8e-52  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.326255  normal  0.0759815 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0721  flagellar biosynthesis protein FlhB  34.86 
 
 
361 aa  205  9e-52  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.366885  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2604  flagellar biosynthesis protein FlhB  36.21 
 
 
383 aa  205  9e-52  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2169  flagellar biosynthesis protein FlhB  36.75 
 
 
376 aa  205  1e-51  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1514  flagellar biosynthesis protein FlhB  38.67 
 
 
380 aa  204  1e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.819465  normal  0.151941 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1631  flagellar biosynthesis protein FlhB  35.46 
 
 
377 aa  204  1e-51  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0648  flagellar biosynthesis protein FlhB  32.87 
 
 
353 aa  204  2e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.214387 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1412  flagellar biosynthetic protein FlhB  34.54 
 
 
363 aa  204  2e-51  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.342211  normal  0.890154 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0637  flagellar biosynthesis protein FlhB  32.87 
 
 
353 aa  204  2e-51  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.111799  normal  0.438226 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1295  flagellar biosynthesis protein FlhB  35.93 
 
 
376 aa  204  2e-51  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.388157  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1362  flagellar biosynthesis protein FlhB  35.93 
 
 
376 aa  204  2e-51  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.873498 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1760  flagellar biosynthetic protein FlhB  39.94 
 
 
382 aa  204  3e-51  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.304563  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1515  flagellar biosynthesis protein FlhB  32.78 
 
 
376 aa  204  3e-51  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.813027  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4196  flagellar biosynthesis protein FlhB  35.41 
 
 
354 aa  204  3e-51  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2617  flagellar biosynthesis protein FlhB  40.22 
 
 
382 aa  204  3e-51  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000137265 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1750  flagellar biosynthesis protein FlhB  33.98 
 
 
382 aa  203  3e-51  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0868  flagellar biosynthesis/type III secretory pathway protein  34.44 
 
 
369 aa  203  3e-51  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2112  flagellar biosynthesis protein FlhB  39.94 
 
 
382 aa  204  3e-51  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01851  flagellar biosynthesis protein B  39.94 
 
 
382 aa  203  4e-51  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01840  hypothetical protein  39.94 
 
 
382 aa  203  4e-51  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1752  flagellar biosynthesis protein FlhB  39.94 
 
 
382 aa  203  4e-51  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1975  flagellar biosynthesis protein FlhB  39.94 
 
 
382 aa  203  4e-51  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>