More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A2821 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007643  Rru_A2821  flagellar biosynthesis protein FlhB  100 
 
 
356 aa  707    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.117691  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2575  flagellar biosynthetic protein FlhB  45.51 
 
 
359 aa  304  1.0000000000000001e-81  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.011127 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4406  flagellar biosynthesis protein FlhB  44.44 
 
 
357 aa  295  1e-78  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.202983  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1522  flagellar biosynthesis protein FlhB  46.37 
 
 
358 aa  291  1e-77  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.23127  normal  0.258787 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1698  flagellar biosynthesis protein FlhB  45.89 
 
 
357 aa  286  4e-76  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.736983 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5492  flagellar biosynthesis protein FlhB  44.35 
 
 
359 aa  285  5.999999999999999e-76  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.14397  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1137  flagellar biosynthesis protein FlhB  43.22 
 
 
359 aa  285  8e-76  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3772  flagellar biosynthesis protein FlhB  46.02 
 
 
358 aa  280  3e-74  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0655991  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1930  flagellar biosynthetic protein FlhB  38.76 
 
 
363 aa  273  2.0000000000000002e-72  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.922236  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2633  flagellar biosynthetic protein FlhB  42.54 
 
 
355 aa  270  2.9999999999999997e-71  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.295644  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2603  flagellar biosynthetic protein FlhB  41.85 
 
 
354 aa  269  5.9999999999999995e-71  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.371847  normal  0.56 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2826  flagellar biosynthetic protein FlhB  41.85 
 
 
354 aa  268  1e-70  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.986887  normal  0.270742 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0011  flagellar biosynthetic protein FlhB  42.33 
 
 
355 aa  267  2e-70  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1397  flagellar biosynthesis protein FlhB  44.26 
 
 
359 aa  266  4e-70  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.247493  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1384  flagellar biosynthesis protein FlhB  41.48 
 
 
360 aa  261  2e-68  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.696508  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1981  flagellar biosynthesis protein FlhB  41.53 
 
 
378 aa  256  4e-67  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.764273  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0484  flagellar biosynthetic protein FlhB  38.94 
 
 
392 aa  254  2.0000000000000002e-66  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0127914  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3034  flagellar biosynthetic protein FlhB  39.72 
 
 
374 aa  250  3e-65  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2230  flagellar biosynthetic protein FlhB  41.64 
 
 
355 aa  248  1e-64  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02874  flagellar biosynthesis protein  39.72 
 
 
374 aa  246  6e-64  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16690  flagellar biosynthetic protein FlhB  42.18 
 
 
356 aa  244  9.999999999999999e-64  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0658  flagellar biosynthetic protein FlhB  41.81 
 
 
353 aa  244  9.999999999999999e-64  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.622115  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2938  flagellar biosynthesis protein FlhB  41.76 
 
 
380 aa  243  5e-63  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0481554  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2169  flagellar biosynthesis protein FlhB  40.39 
 
 
376 aa  242  6e-63  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3431  flagellar biosynthetic protein FlhB  40.45 
 
 
378 aa  242  7e-63  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2016  flagellar biosynthetic protein FlhB  39.39 
 
 
387 aa  242  7.999999999999999e-63  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1379  flagellar biosynthesis protein FlhB  39.35 
 
 
377 aa  241  1e-62  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.294814 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1163  flagellar biosynthesis protein FlhB  38.07 
 
 
351 aa  241  1e-62  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002828  flagellar biosynthesis protein FlhB  39.62 
 
 
376 aa  241  1e-62  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0357  flagellar biosynthesis protein FlhB  38.8 
 
 
368 aa  241  1e-62  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0380  flagellar biosynthesis protein FlhB  38.8 
 
 
362 aa  239  4e-62  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.441846  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1245  flagellar biosynthetic protein FlhB  40.28 
 
 
390 aa  239  5e-62  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.215857  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1334  flagellar biosynthetic protein FlhB  40.56 
 
 
384 aa  239  5.999999999999999e-62  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0341  flagellar biosynthesis protein FlhB  41.37 
 
 
359 aa  239  6.999999999999999e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00619914 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1330  flagellar biosynthesis protein FlhB  39.67 
 
 
358 aa  238  1e-61  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1547  flagellar biosynthesis protein FlhB  38.71 
 
 
383 aa  238  1e-61  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2032  flagellar biosynthetic protein FlhB  39.32 
 
 
381 aa  238  1e-61  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.112007  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0868  flagellar biosynthesis/type III secretory pathway protein  38.81 
 
 
369 aa  238  1e-61  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0069  flagellar biosynthetic protein FlhB  39.34 
 
 
358 aa  238  1e-61  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3053  flagellar biosynthesis protein FlhB  39.94 
 
 
377 aa  238  2e-61  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0535555 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3698  flagellar biosynthesis protein FlhB  39.44 
 
 
380 aa  237  2e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0239481 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1374  flagellar biosynthesis protein FlhB  39.5 
 
 
377 aa  237  2e-61  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1355  flagellar biosynthesis protein FlhB  40.52 
 
 
376 aa  238  2e-61  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.424725  normal  0.225798 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1623  flagellar biosynthesis protein FlhB  38.8 
 
 
362 aa  238  2e-61  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3441  flagellar biosynthesis protein FlhB  40.28 
 
 
378 aa  236  3e-61  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.456344 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2432  flagellar biosynthesis protein FlhB  38.74 
 
 
386 aa  236  3e-61  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1975  flagellar biosynthetic protein FlhB  40.61 
 
 
378 aa  236  5.0000000000000005e-61  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.185057  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1295  flagellar biosynthesis protein FlhB  40.23 
 
 
376 aa  236  5.0000000000000005e-61  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.388157  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1362  flagellar biosynthesis protein FlhB  40.23 
 
 
376 aa  236  5.0000000000000005e-61  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.873498 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1195  flagellar biosynthesis protein FlhB  38.63 
 
 
377 aa  236  5.0000000000000005e-61  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5533  flagellar biosynthetic protein FlhB  40 
 
 
353 aa  236  6e-61  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.215661  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03148  flagellar biosynthesis protein FlhB  39.62 
 
 
376 aa  236  6e-61  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0721  flagellar biosynthesis protein FlhB  37.6 
 
 
361 aa  235  7e-61  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.366885  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2334  flagellar biosynthesis protein FlhB  38.74 
 
 
386 aa  235  8e-61  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.178036  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0342  flagellar biosynthesis protein FlhB  38.8 
 
 
357 aa  235  8e-61  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00837822  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2447  flagellar biosynthesis protein FlhB  37.39 
 
 
382 aa  235  9e-61  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1515  flagellar biosynthesis protein FlhB  37.57 
 
 
376 aa  235  1.0000000000000001e-60  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.813027  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1339  flagellar biosynthesis protein FlhB  39.06 
 
 
377 aa  234  1.0000000000000001e-60  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2696  flagellar biosynthetic protein FlhB  40.73 
 
 
373 aa  234  1.0000000000000001e-60  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0426  flagellar biosynthesis protein FlhB  38.29 
 
 
352 aa  234  2.0000000000000002e-60  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.888697  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3287  flagellar biosynthesis protein FlhB  39.72 
 
 
357 aa  234  2.0000000000000002e-60  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0743  flagellar biosynthetic protein FlhB  37.77 
 
 
381 aa  233  3e-60  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1412  flagellar biosynthetic protein FlhB  36.29 
 
 
363 aa  233  3e-60  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.342211  normal  0.890154 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3215  flagellar biosynthesis protein FlhB  39.37 
 
 
376 aa  233  4.0000000000000004e-60  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2809  flagellar biosynthesis protein FlhB  39.35 
 
 
378 aa  233  4.0000000000000004e-60  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.326255  normal  0.0759815 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2295  flagellar biosynthesis protein FlhB  36.73 
 
 
376 aa  233  4.0000000000000004e-60  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0999  flagellar biosynthesis protein FlhB  39.03 
 
 
357 aa  233  4.0000000000000004e-60  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2563  flagellar biosynthesis protein FlhB  39.83 
 
 
376 aa  233  5e-60  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.757068  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4196  flagellar biosynthesis protein FlhB  37.89 
 
 
354 aa  232  6e-60  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1862  flagellar biosynthesis protein FlhB  39.55 
 
 
383 aa  232  7.000000000000001e-60  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.90359  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0669  flagellar biosynthesis protein FlhB  37.47 
 
 
350 aa  232  7.000000000000001e-60  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0757109  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2604  flagellar biosynthesis protein FlhB  39.06 
 
 
383 aa  231  1e-59  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5615  flagellar biosynthesis protein FlhB  38.18 
 
 
380 aa  231  1e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.891713  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1702  flagellar biosynthesis protein FlhB  39.23 
 
 
376 aa  231  1e-59  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1208  flagellar biosynthesis protein FlhB  37.43 
 
 
383 aa  231  2e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0246  flagellar biosynthesis protein FlhB  41.37 
 
 
360 aa  230  2e-59  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.623088  normal  0.4035 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2069  flagellar biosynthesis protein FlhB  37.43 
 
 
383 aa  231  2e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00553621 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2074  flagellar biosynthesis protein FlhB  37.43 
 
 
383 aa  231  2e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000897295 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2129  flagellar biosynthesis protein FlhB  37.43 
 
 
383 aa  231  2e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000192021 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2923  flagellar biosynthesis protein FlhB  38.7 
 
 
376 aa  231  2e-59  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1331  flagellar biosynthesis protein FlhB  37.43 
 
 
383 aa  230  3e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.384239  hitchhiker  0.0000000000516194 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2913  flagellar biosynthesis protein FlhB  37.89 
 
 
376 aa  230  3e-59  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.847075  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0309  flagellar biosynthesis protein FlhB  39.06 
 
 
359 aa  230  3e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0981  flagellar biosynthetic protein FlhB  38.54 
 
 
390 aa  230  3e-59  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0800953 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1631  flagellar biosynthesis protein FlhB  38.32 
 
 
377 aa  229  4e-59  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0018  flagellar biosynthetic protein FlhB  38.37 
 
 
374 aa  229  6e-59  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000937461  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3804  flagellar biosynthesis protein FlhB  37.33 
 
 
403 aa  229  8e-59  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1519  flagellar biosynthesis protein FlhB  39.02 
 
 
383 aa  228  9e-59  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0018  flagellar biosynthetic protein FlhB  38.08 
 
 
374 aa  228  1e-58  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000395256  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1450  flagellar biosynthesis protein FlhB  38.42 
 
 
376 aa  228  1e-58  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1552  flagellar biosynthesis protein FlhB  38.87 
 
 
379 aa  228  1e-58  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00640595  normal  0.373184 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1944  flagellar biosynthetic protein FlhB  40.22 
 
 
381 aa  227  2e-58  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0130  flagellar biosynthesis protein FlhB  37.64 
 
 
406 aa  227  2e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.561684  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45720  flagellar biosynthesis protein FlhB  38.46 
 
 
378 aa  227  2e-58  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3055  flagellar biosynthesis protein FlhB  38.14 
 
 
376 aa  227  3e-58  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.247333 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1316  flagellar biosynthetic protein FlhB  37.68 
 
 
366 aa  227  3e-58  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0240  flagellar biosynthetic protein FlhB  37.12 
 
 
353 aa  226  3e-58  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.760621  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1397  flagellar biosynthetic protein FlhB  38.24 
 
 
363 aa  226  5.0000000000000005e-58  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1674  flagellar biosynthetic protein FlhB  37.54 
 
 
360 aa  226  6e-58  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0637  flagellar biosynthesis protein FlhB  39.15 
 
 
353 aa  225  7e-58  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.111799  normal  0.438226 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>