More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_0246 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009636  Smed_0246  flagellar biosynthesis protein FlhB  100 
 
 
360 aa  726    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.623088  normal  0.4035 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0309  flagellar biosynthesis protein FlhB  65.74 
 
 
359 aa  500  1e-140  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0341  flagellar biosynthesis protein FlhB  65.74 
 
 
359 aa  495  1e-139  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00619914 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0721  flagellar biosynthesis protein FlhB  57.26 
 
 
361 aa  449  1e-125  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.366885  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0112  flagellar biosynthesis protein FlhB  51.59 
 
 
356 aa  355  7.999999999999999e-97  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.157288  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3217  flagellar biosynthesis protein FlhB  48.43 
 
 
354 aa  355  8.999999999999999e-97  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.447718 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0121  flagellar biosynthesis protein FlhB  51.59 
 
 
356 aa  355  1e-96  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4222  flagellar biosynthesis protein FlhB  49.86 
 
 
356 aa  353  2.9999999999999997e-96  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1716  flagellar biosynthesis protein FlhB  47.59 
 
 
353 aa  339  4e-92  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0559282 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0648  flagellar biosynthesis protein FlhB  47.86 
 
 
353 aa  338  9.999999999999999e-92  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.214387 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0637  flagellar biosynthesis protein FlhB  47.86 
 
 
353 aa  337  9.999999999999999e-92  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.111799  normal  0.438226 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1093  flagellar biosynthesis protein FlhB  46.72 
 
 
358 aa  337  1.9999999999999998e-91  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.40975 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0616  flagellar biosynthesis protein FlhB  46.72 
 
 
354 aa  336  2.9999999999999997e-91  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.55435 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0307  flagellar biosynthesis protein FlhB  51.7 
 
 
363 aa  334  1e-90  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0022  flagellar biosynthesis protein FlhB  45.69 
 
 
359 aa  315  5e-85  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2808  flagellar biosynthesis protein FlhB  43.82 
 
 
360 aa  314  9.999999999999999e-85  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1153  flagellar biosynthesis protein FlhB  44.96 
 
 
356 aa  298  7e-80  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2633  flagellar biosynthetic protein FlhB  40.22 
 
 
355 aa  236  3e-61  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.295644  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2826  flagellar biosynthetic protein FlhB  39.11 
 
 
354 aa  228  2e-58  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.986887  normal  0.270742 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0011  flagellar biosynthetic protein FlhB  36.65 
 
 
355 aa  227  2e-58  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2603  flagellar biosynthetic protein FlhB  38.83 
 
 
354 aa  226  6e-58  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.371847  normal  0.56 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0743  flagellar biosynthetic protein FlhB  34.82 
 
 
381 aa  226  6e-58  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1384  flagellar biosynthesis protein FlhB  34.9 
 
 
360 aa  223  4e-57  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.696508  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1930  flagellar biosynthetic protein FlhB  34.43 
 
 
363 aa  223  4.9999999999999996e-57  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.922236  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1137  flagellar biosynthesis protein FlhB  37.05 
 
 
359 aa  219  6e-56  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5533  flagellar biosynthetic protein FlhB  38.12 
 
 
353 aa  217  2.9999999999999998e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.215661  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0342  flagellar biosynthesis protein FlhB  35.81 
 
 
357 aa  216  7e-55  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00837822  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5492  flagellar biosynthesis protein FlhB  35.39 
 
 
359 aa  214  1.9999999999999998e-54  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.14397  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1522  flagellar biosynthesis protein FlhB  35.61 
 
 
358 aa  213  3.9999999999999995e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.23127  normal  0.258787 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4406  flagellar biosynthesis protein FlhB  36.83 
 
 
357 aa  213  3.9999999999999995e-54  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.202983  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1866  flagellar biosynthesis protein FlhB  33.62 
 
 
376 aa  211  1e-53  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.965675  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1245  flagellar biosynthetic protein FlhB  34.15 
 
 
390 aa  210  3e-53  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.215857  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2575  flagellar biosynthetic protein FlhB  35.34 
 
 
359 aa  210  3e-53  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.011127 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5150  flagellar biosynthetic protein FlhB  35.18 
 
 
353 aa  209  4e-53  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0317747 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1698  flagellar biosynthesis protein FlhB  36 
 
 
357 aa  209  6e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.736983 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1334  flagellar biosynthetic protein FlhB  34.48 
 
 
384 aa  209  7e-53  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3772  flagellar biosynthesis protein FlhB  35.82 
 
 
358 aa  207  2e-52  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0655991  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2821  flagellar biosynthesis protein FlhB  40.93 
 
 
356 aa  206  7e-52  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.117691  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2230  flagellar biosynthetic protein FlhB  35.48 
 
 
355 aa  205  9e-52  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1397  flagellar biosynthesis protein FlhB  36.57 
 
 
359 aa  204  2e-51  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.247493  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0981  flagellar biosynthetic protein FlhB  34.25 
 
 
390 aa  203  3e-51  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0800953 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1129  flagellar biosynthesis protein FlhB  34.77 
 
 
360 aa  201  1.9999999999999998e-50  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2938  flagellar biosynthesis protein FlhB  35.25 
 
 
380 aa  200  3e-50  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0481554  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0357  flagellar biosynthesis protein FlhB  33.33 
 
 
368 aa  199  6e-50  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0380  flagellar biosynthesis protein FlhB  33.33 
 
 
362 aa  199  7.999999999999999e-50  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.441846  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3431  flagellar biosynthetic protein FlhB  36.46 
 
 
378 aa  199  7.999999999999999e-50  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2604  flagellar biosynthesis protein FlhB  31.94 
 
 
383 aa  198  1.0000000000000001e-49  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1519  flagellar biosynthesis protein FlhB  33.06 
 
 
383 aa  197  2.0000000000000003e-49  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0018  flagellar biosynthetic protein FlhB  34.57 
 
 
374 aa  197  2.0000000000000003e-49  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000937461  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1330  flagellar biosynthesis protein FlhB  33.88 
 
 
358 aa  196  4.0000000000000005e-49  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0018  flagellar biosynthetic protein FlhB  34.29 
 
 
374 aa  196  5.000000000000001e-49  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000395256  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1623  flagellar biosynthesis protein FlhB  33.33 
 
 
362 aa  196  6e-49  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1862  flagellar biosynthesis protein FlhB  32.22 
 
 
383 aa  194  2e-48  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.90359  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0155  flagellar biosynthesis protein FlhB  33.43 
 
 
357 aa  193  3e-48  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.795808  normal  0.521978 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0240  flagellar biosynthetic protein FlhB  34.79 
 
 
353 aa  194  3e-48  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.760621  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3441  flagellar biosynthesis protein FlhB  33.99 
 
 
378 aa  193  4e-48  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.456344 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2696  flagellar biosynthetic protein FlhB  31.93 
 
 
373 aa  192  5e-48  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02874  flagellar biosynthesis protein  35.51 
 
 
374 aa  192  6e-48  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2432  flagellar biosynthesis protein FlhB  33.7 
 
 
386 aa  192  9e-48  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3804  flagellar biosynthesis protein FlhB  32.68 
 
 
403 aa  191  1e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0484  flagellar biosynthetic protein FlhB  31.64 
 
 
392 aa  191  1e-47  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0127914  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2030  flagellar biosynthetic protein FlhB  34.9 
 
 
356 aa  191  1e-47  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.9056  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4196  flagellar biosynthesis protein FlhB  33.15 
 
 
354 aa  191  1e-47  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0713  flagellar biosynthetic protein FlhB  32.88 
 
 
379 aa  191  2e-47  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.31011  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2069  flagellar biosynthesis protein FlhB  30.08 
 
 
383 aa  191  2e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00553621 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2334  flagellar biosynthesis protein FlhB  33.98 
 
 
386 aa  190  2.9999999999999997e-47  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.178036  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2074  flagellar biosynthesis protein FlhB  30.08 
 
 
383 aa  190  4e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000897295 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1208  flagellar biosynthesis protein FlhB  30.08 
 
 
383 aa  190  4e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1975  flagellar biosynthetic protein FlhB  33.98 
 
 
378 aa  189  5e-47  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.185057  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2016  flagellar biosynthetic protein FlhB  35 
 
 
387 aa  189  5.999999999999999e-47  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0703  flagellar biosynthetic protein FlhB  32.3 
 
 
354 aa  189  9e-47  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.635027  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1331  flagellar biosynthesis protein FlhB  30.08 
 
 
383 aa  188  1e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.384239  hitchhiker  0.0000000000516194 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0379  flagellar biosynthesis protein FlhB  34.25 
 
 
357 aa  188  1e-46  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1547  flagellar biosynthesis protein FlhB  31.58 
 
 
383 aa  188  1e-46  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2129  flagellar biosynthesis protein FlhB  30.08 
 
 
383 aa  188  1e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000192021 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0130  flagellar biosynthesis protein FlhB  31.84 
 
 
406 aa  187  2e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.561684  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0999  flagellar biosynthesis protein FlhB  31.15 
 
 
357 aa  187  3e-46  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1374  flagellar biosynthesis protein FlhB  34.25 
 
 
377 aa  186  4e-46  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3878  flagellar biosynthesis protein FlhB  34.72 
 
 
378 aa  186  5e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1171  flagellar biosynthetic protein FlhB  33.33 
 
 
383 aa  186  6e-46  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.127204 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45720  flagellar biosynthesis protein FlhB  33.43 
 
 
378 aa  185  8e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1412  flagellar biosynthetic protein FlhB  34.38 
 
 
363 aa  185  1.0000000000000001e-45  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.342211  normal  0.890154 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0481  flagellar biosynthetic protein FlhB  34.32 
 
 
391 aa  185  1.0000000000000001e-45  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2977  flagellar biosynthesis protein FlhB  31.55 
 
 
398 aa  184  2.0000000000000003e-45  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3370  flagellar biosynthesis protein FlhB  32.78 
 
 
398 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00184569  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2154  flagellar biosynthetic protein FlhB  31.02 
 
 
366 aa  184  2.0000000000000003e-45  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2447  flagellar biosynthesis protein FlhB  30.36 
 
 
382 aa  184  2.0000000000000003e-45  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1981  flagellar biosynthesis protein FlhB  33.71 
 
 
378 aa  184  2.0000000000000003e-45  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.764273  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1397  flagellar biosynthetic protein FlhB  33.52 
 
 
363 aa  183  3e-45  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3034  flagellar biosynthetic protein FlhB  33.33 
 
 
374 aa  182  6e-45  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1750  flagellar biosynthesis protein FlhB  31.61 
 
 
382 aa  182  9.000000000000001e-45  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1750  flagellar biosynthesis protein FlhB  31.61 
 
 
382 aa  182  1e-44  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1552  flagellar biosynthesis protein FlhB  32.52 
 
 
379 aa  181  1e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00640595  normal  0.373184 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0249  flagellar biosynthesis protein FlhB  31.75 
 
 
399 aa  181  1e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.190542  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2840  flagellar biosynthesis protein FlhB  31.75 
 
 
399 aa  181  1e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.151701  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0868  flagellar biosynthesis/type III secretory pathway protein  32.16 
 
 
369 aa  182  1e-44  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0267  flagellar biosynthesis protein FlhB  31.75 
 
 
399 aa  181  1e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.110201  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0194  flagellar biosynthesis protein FlhB  32.03 
 
 
399 aa  181  2e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1944  flagellar biosynthetic protein FlhB  33.05 
 
 
381 aa  181  2e-44  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0669  flagellar biosynthesis protein FlhB  33.88 
 
 
350 aa  180  2.9999999999999997e-44  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0757109  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>