More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_0721 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_0721  flagellar biosynthesis protein FlhB  100 
 
 		 361 aa  739    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.366885  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0341  flagellar biosynthesis protein FlhB  61.45 
 
 		 359 aa  479  1e-134  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00619914 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0309  flagellar biosynthesis protein FlhB  60.89 
 
 		 359 aa  479  1e-134  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0246  flagellar biosynthesis protein FlhB  57.26 
 
 		 360 aa  435  1e-121  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.623088  normal  0.4035 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4222  flagellar biosynthesis protein FlhB  48.58 
 
 		 356 aa  327  2.0000000000000001e-88  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0112  flagellar biosynthesis protein FlhB  47.99 
 
 		 356 aa  324  1e-87  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.157288  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0121  flagellar biosynthesis protein FlhB  47.99 
 
 		 356 aa  323  2e-87  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0307  flagellar biosynthesis protein FlhB  48.58 
 
 		 363 aa  323  3e-87  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3217  flagellar biosynthesis protein FlhB  45.87 
 
 		 354 aa  315  6e-85  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.447718 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0616  flagellar biosynthesis protein FlhB  45.87 
 
 		 354 aa  314  9.999999999999999e-85  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.55435 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1093  flagellar biosynthesis protein FlhB  42.82 
 
 		 358 aa  315  9.999999999999999e-85  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.40975 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0648  flagellar biosynthesis protein FlhB  45.58 
 
 		 353 aa  309  5.9999999999999995e-83  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.214387 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0637  flagellar biosynthesis protein FlhB  45.58 
 
 		 353 aa  308  1.0000000000000001e-82  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.111799  normal  0.438226 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2808  flagellar biosynthesis protein FlhB  42.94 
 
 		 360 aa  293  3e-78  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1153  flagellar biosynthesis protein FlhB  44.03 
 
 		 356 aa  293  4e-78  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0022  flagellar biosynthesis protein FlhB  42.24 
 
 		 359 aa  291  1e-77  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1716  flagellar biosynthesis protein FlhB  43.86 
 
 		 353 aa  287  2e-76  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0559282 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2633  flagellar biosynthetic protein FlhB  36.75 
 
 		 355 aa  234  2.0000000000000002e-60  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.295644  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0011  flagellar biosynthetic protein FlhB  37.47 
 
 		 355 aa  229  5e-59  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2603  flagellar biosynthetic protein FlhB  36.18 
 
 		 354 aa  228  2e-58  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.371847  normal  0.56 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1930  flagellar biosynthetic protein FlhB  34.16 
 
 		 363 aa  226  4e-58  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.922236  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2826  flagellar biosynthetic protein FlhB  35.9 
 
 		 354 aa  226  5.0000000000000005e-58  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.986887  normal  0.270742 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1137  flagellar biosynthesis protein FlhB  36.21 
 
 		 359 aa  222  9e-57  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3431  flagellar biosynthetic protein FlhB  38.33 
 
 		 378 aa  219  7e-56  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0743  flagellar biosynthetic protein FlhB  35.52 
 
 		 381 aa  218  2e-55  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1384  flagellar biosynthesis protein FlhB  37.23 
 
 		 360 aa  217  2e-55  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.696508  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4406  flagellar biosynthesis protein FlhB  35.17 
 
 		 357 aa  215  9.999999999999999e-55  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.202983  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3804  flagellar biosynthesis protein FlhB  37.08 
 
 		 403 aa  212  5.999999999999999e-54  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1245  flagellar biosynthetic protein FlhB  35.93 
 
 		 390 aa  210  4e-53  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.215857  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0130  flagellar biosynthesis protein FlhB  36.91 
 
 		 406 aa  209  5e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.561684  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1330  flagellar biosynthesis protein FlhB  35.1 
 
 		 358 aa  207  2e-52  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1522  flagellar biosynthesis protein FlhB  35.65 
 
 		 358 aa  207  3e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.23127  normal  0.258787 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2575  flagellar biosynthetic protein FlhB  34.75 
 
 		 359 aa  206  5e-52  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.011127 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0357  flagellar biosynthesis protein FlhB  34.07 
 
 		 368 aa  205  8e-52  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5492  flagellar biosynthesis protein FlhB  34.86 
 
 		 359 aa  205  9e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.14397  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0380  flagellar biosynthesis protein FlhB  34.07 
 
 		 362 aa  204  1e-51  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.441846  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1163  flagellar biosynthesis protein FlhB  33.43 
 
 		 351 aa  205  1e-51  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1623  flagellar biosynthesis protein FlhB  34.07 
 
 		 362 aa  204  2e-51  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16690  flagellar biosynthetic protein FlhB  33.81 
 
 		 356 aa  203  4e-51  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0981  flagellar biosynthetic protein FlhB  35.04 
 
 		 390 aa  202  6e-51  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0800953 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1698  flagellar biosynthesis protein FlhB  35.61 
 
 		 357 aa  202  7e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.736983 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4196  flagellar biosynthesis protein FlhB  35.96 
 
 		 354 aa  201  1.9999999999999998e-50  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3772  flagellar biosynthesis protein FlhB  36.93 
 
 		 358 aa  200  3e-50  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0655991  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3370  flagellar biosynthesis protein FlhB  36.67 
 
 		 398 aa  200  3.9999999999999996e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00184569  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0868  flagellar biosynthesis/type III secretory pathway protein  34.25 
 
 		 369 aa  199  7e-50  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3094  flagellar biosynthesis protein FlhB  35.01 
 
 		 353 aa  199  9e-50  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3878  flagellar biosynthesis protein FlhB  34.76 
 
 		 378 aa  198  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2938  flagellar biosynthesis protein FlhB  35.33 
 
 		 380 aa  198  1.0000000000000001e-49  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0481554  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2821  flagellar biosynthesis protein FlhB  37.06 
 
 		 356 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.117691  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1397  flagellar biosynthesis protein FlhB  36.49 
 
 		 359 aa  197  2.0000000000000003e-49  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.247493  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0018  flagellar biosynthetic protein FlhB  33.72 
 
 		 374 aa  197  2.0000000000000003e-49  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000937461  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2604  flagellar biosynthesis protein FlhB  35.39 
 
 		 383 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0379  flagellar biosynthesis protein FlhB  33.82 
 
 		 357 aa  197  3e-49  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0713  flagellar biosynthetic protein FlhB  35.29 
 
 		 379 aa  196  4.0000000000000005e-49  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.31011  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0249  flagellar biosynthesis protein FlhB  36.66 
 
 		 399 aa  196  4.0000000000000005e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.190542  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0018  flagellar biosynthetic protein FlhB  33.43 
 
 		 374 aa  196  6e-49  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000395256  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0481  flagellar biosynthetic protein FlhB  36.01 
 
 		 391 aa  196  7e-49  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0342  flagellar biosynthesis protein FlhB  34.7 
 
 		 357 aa  196  7e-49  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00837822  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2840  flagellar biosynthesis protein FlhB  36.39 
 
 		 399 aa  195  9e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.151701  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0267  flagellar biosynthesis protein FlhB  36.39 
 
 		 399 aa  195  9e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.110201  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1862  flagellar biosynthesis protein FlhB  35.39 
 
 		 383 aa  195  1e-48  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.90359  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1750  flagellar biosynthesis protein FlhB  33.05 
 
 		 382 aa  195  1e-48  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1750  flagellar biosynthesis protein FlhB  32.77 
 
 		 382 aa  195  1e-48  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1412  flagellar biosynthetic protein FlhB  33.99 
 
 		 363 aa  194  1e-48  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.342211  normal  0.890154 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2016  flagellar biosynthetic protein FlhB  34.92 
 
 		 387 aa  194  2e-48  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2964  flagellar biosynthesis protein FlhB  45.02 
 
 		 411 aa  194  2e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00775742 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0426  flagellar biosynthesis protein FlhB  34.37 
 
 		 352 aa  194  3e-48  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.888697  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02874  flagellar biosynthesis protein  34.08 
 
 		 374 aa  194  3e-48  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1547  flagellar biosynthesis protein FlhB  35.36 
 
 		 383 aa  193  4e-48  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0484  flagellar biosynthetic protein FlhB  32.49 
 
 		 392 aa  193  4e-48  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0127914  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0703  flagellar biosynthetic protein FlhB  32.86 
 
 		 354 aa  193  4e-48  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.635027  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0175  flagellar biosynthesis protein FlhB  35.44 
 
 		 399 aa  193  5e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.212371 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45720  flagellar biosynthesis protein FlhB  35.23 
 
 		 378 aa  193  5e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0999  flagellar biosynthesis protein FlhB  34.05 
 
 		 357 aa  192  6e-48  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0194  flagellar biosynthesis protein FlhB  34.7 
 
 		 399 aa  191  1e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4066  flagellar biosynthetic protein FlhB  34.07 
 
 		 387 aa  191  2e-47  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4178  flagellar biosynthetic protein FlhB  34.07 
 
 		 387 aa  191  2e-47  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.232408  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0240  flagellar biosynthetic protein FlhB  34.43 
 
 		 353 aa  191  2e-47  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.760621  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1866  flagellar biosynthesis protein FlhB  33.05 
 
 		 376 aa  190  2.9999999999999997e-47  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.965675  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3821  flagellar biosynthesis protein FlhB  32.95 
 
 		 353 aa  190  4e-47  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5150  flagellar biosynthetic protein FlhB  34.01 
 
 		 353 aa  190  4e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0317747 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2230  flagellar biosynthetic protein FlhB  34.21 
 
 		 355 aa  190  4e-47  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1944  flagellar biosynthetic protein FlhB  34.35 
 
 		 381 aa  189  7e-47  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3698  flagellar biosynthesis protein FlhB  34.72 
 
 		 380 aa  189  9e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0239481 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0181  flagellar biosynthesis protein FlhB  33.98 
 
 		 399 aa  188  1e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.824859  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0587  flagellar biosynthesis protein FlhB  32.97 
 
 		 354 aa  188  1e-46  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1515  flagellar biosynthesis protein FlhB  31.58 
 
 		 376 aa  187  2e-46  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.813027  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1334  flagellar biosynthetic protein FlhB  34.2 
 
 		 384 aa  188  2e-46  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5533  flagellar biosynthetic protein FlhB  42.26 
 
 		 353 aa  187  2e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.215661  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1379  flagellar biosynthesis protein FlhB  33.7 
 
 		 377 aa  187  2e-46  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.294814 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1195  flagellar biosynthesis protein FlhB  32.3 
 
 		 377 aa  187  2e-46  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1519  flagellar biosynthesis protein FlhB  34.5 
 
 		 383 aa  187  3e-46  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5615  flagellar biosynthesis protein FlhB  34.84 
 
 		 380 aa  186  4e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.891713  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1394  flagellar biosynthetic FlhB transmembrane protein  33.7 
 
 		 387 aa  186  5e-46  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00896638  normal  0.765457 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2295  flagellar biosynthesis protein FlhB  33.7 
 
 		 376 aa  186  5e-46  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3287  flagellar biosynthesis protein FlhB  31.84 
 
 		 357 aa  186  6e-46  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1129  flagellar biosynthesis protein FlhB  31.43 
 
 		 360 aa  185  1.0000000000000001e-45  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3170  flagellar biosynthesis protein FlhB  36.39 
 
 		 405 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1981  flagellar biosynthesis protein FlhB  32.31 
 
 		 378 aa  185  1.0000000000000001e-45  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.764273  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1975  flagellar biosynthetic protein FlhB  35.39 
 
 		 378 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.185057  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>