More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_2575 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009719  Plav_2575  flagellar biosynthetic protein FlhB  100 
 
 
359 aa  729    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.011127 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4406  flagellar biosynthesis protein FlhB  49.44 
 
 
357 aa  363  3e-99  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.202983  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1930  flagellar biosynthetic protein FlhB  48.18 
 
 
363 aa  352  5.9999999999999994e-96  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.922236  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5492  flagellar biosynthesis protein FlhB  48.33 
 
 
359 aa  350  1e-95  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.14397  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1137  flagellar biosynthesis protein FlhB  48.18 
 
 
359 aa  350  2e-95  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1522  flagellar biosynthesis protein FlhB  50.56 
 
 
358 aa  349  4e-95  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.23127  normal  0.258787 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3772  flagellar biosynthesis protein FlhB  49.58 
 
 
358 aa  341  1e-92  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0655991  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1698  flagellar biosynthesis protein FlhB  48.6 
 
 
357 aa  340  2e-92  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.736983 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2633  flagellar biosynthetic protein FlhB  47.03 
 
 
355 aa  333  3e-90  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.295644  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2603  flagellar biosynthetic protein FlhB  46.91 
 
 
354 aa  330  2e-89  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.371847  normal  0.56 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2826  flagellar biosynthetic protein FlhB  46.63 
 
 
354 aa  329  4e-89  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.986887  normal  0.270742 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1397  flagellar biosynthesis protein FlhB  48.15 
 
 
359 aa  321  9.999999999999999e-87  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.247493  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2230  flagellar biosynthetic protein FlhB  47.11 
 
 
355 aa  315  7e-85  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5533  flagellar biosynthetic protein FlhB  46.69 
 
 
353 aa  307  2.0000000000000002e-82  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.215661  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5150  flagellar biosynthetic protein FlhB  47.28 
 
 
353 aa  293  3e-78  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0317747 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1384  flagellar biosynthesis protein FlhB  41.08 
 
 
360 aa  269  7e-71  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.696508  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2821  flagellar biosynthesis protein FlhB  45.17 
 
 
356 aa  256  6e-67  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.117691  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3217  flagellar biosynthesis protein FlhB  39.14 
 
 
354 aa  254  1.0000000000000001e-66  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.447718 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0011  flagellar biosynthetic protein FlhB  37.96 
 
 
355 aa  242  6e-63  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0981  flagellar biosynthetic protein FlhB  39.5 
 
 
390 aa  241  2e-62  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0800953 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1374  flagellar biosynthesis protein FlhB  36.57 
 
 
377 aa  240  2.9999999999999997e-62  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1195  flagellar biosynthesis protein FlhB  36.19 
 
 
377 aa  240  2.9999999999999997e-62  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1379  flagellar biosynthesis protein FlhB  38.12 
 
 
377 aa  240  2.9999999999999997e-62  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.294814 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3053  flagellar biosynthesis protein FlhB  37.95 
 
 
377 aa  238  9e-62  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0535555 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0637  flagellar biosynthesis protein FlhB  36.96 
 
 
353 aa  238  1e-61  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.111799  normal  0.438226 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1339  flagellar biosynthesis protein FlhB  38.48 
 
 
377 aa  238  1e-61  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0648  flagellar biosynthesis protein FlhB  36.96 
 
 
353 aa  238  2e-61  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.214387 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0342  flagellar biosynthesis protein FlhB  39.66 
 
 
357 aa  236  3e-61  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00837822  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1129  flagellar biosynthesis protein FlhB  36.89 
 
 
360 aa  236  4e-61  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1450  flagellar biosynthesis protein FlhB  36.78 
 
 
376 aa  235  8e-61  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0380  flagellar biosynthesis protein FlhB  38.4 
 
 
362 aa  234  2.0000000000000002e-60  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.441846  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3055  flagellar biosynthesis protein FlhB  36.49 
 
 
376 aa  234  2.0000000000000002e-60  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.247333 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2913  flagellar biosynthesis protein FlhB  36.21 
 
 
376 aa  233  3e-60  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.847075  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0616  flagellar biosynthesis protein FlhB  37.14 
 
 
354 aa  233  4.0000000000000004e-60  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.55435 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2923  flagellar biosynthesis protein FlhB  36.21 
 
 
376 aa  233  4.0000000000000004e-60  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1981  flagellar biosynthesis protein FlhB  38.5 
 
 
378 aa  233  5e-60  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.764273  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2069  flagellar biosynthesis protein FlhB  37.18 
 
 
383 aa  232  6e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00553621 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2074  flagellar biosynthesis protein FlhB  37.18 
 
 
383 aa  232  6e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000897295 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1208  flagellar biosynthesis protein FlhB  37.18 
 
 
383 aa  232  6e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2129  flagellar biosynthesis protein FlhB  37.18 
 
 
383 aa  232  7.000000000000001e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000192021 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1331  flagellar biosynthesis protein FlhB  37.18 
 
 
383 aa  232  8.000000000000001e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.384239  hitchhiker  0.0000000000516194 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0357  flagellar biosynthesis protein FlhB  38.12 
 
 
368 aa  231  1e-59  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0739  flagellar biosynthesis protein FlhB  39.66 
 
 
379 aa  229  4e-59  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3215  flagellar biosynthesis protein FlhB  35.92 
 
 
376 aa  229  6e-59  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1623  flagellar biosynthesis protein FlhB  37.85 
 
 
362 aa  229  6e-59  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2447  flagellar biosynthesis protein FlhB  37.36 
 
 
382 aa  229  7e-59  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2016  flagellar biosynthetic protein FlhB  37.64 
 
 
387 aa  229  7e-59  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45720  flagellar biosynthesis protein FlhB  38.1 
 
 
378 aa  229  7e-59  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2808  flagellar biosynthesis protein FlhB  36.49 
 
 
360 aa  228  1e-58  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1295  flagellar biosynthesis protein FlhB  35.92 
 
 
376 aa  228  1e-58  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.388157  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1362  flagellar biosynthesis protein FlhB  35.92 
 
 
376 aa  228  1e-58  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.873498 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4222  flagellar biosynthesis protein FlhB  39.28 
 
 
356 aa  227  2e-58  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1631  flagellar biosynthesis protein FlhB  36.46 
 
 
377 aa  228  2e-58  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1355  flagellar biosynthesis protein FlhB  35.92 
 
 
376 aa  228  2e-58  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.424725  normal  0.225798 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1334  flagellar biosynthetic protein FlhB  38.38 
 
 
384 aa  227  2e-58  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2284  flagellar biosynthesis protein FlhB  36.96 
 
 
377 aa  228  2e-58  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.562852  normal  0.66393 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1975  flagellar biosynthetic protein FlhB  36.71 
 
 
378 aa  226  6e-58  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.185057  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1330  flagellar biosynthesis protein FlhB  38.19 
 
 
358 aa  226  6e-58  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2334  flagellar biosynthesis protein FlhB  39.28 
 
 
386 aa  226  6e-58  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.178036  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2432  flagellar biosynthesis protein FlhB  39.28 
 
 
386 aa  225  7e-58  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3034  flagellar biosynthetic protein FlhB  35.91 
 
 
374 aa  225  8e-58  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3431  flagellar biosynthetic protein FlhB  39.39 
 
 
378 aa  224  2e-57  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3878  flagellar biosynthesis protein FlhB  37.71 
 
 
378 aa  224  2e-57  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1171  flagellar biosynthetic protein FlhB  38.98 
 
 
383 aa  224  2e-57  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.127204 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2563  flagellar biosynthesis protein FlhB  35.34 
 
 
376 aa  224  2e-57  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.757068  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002828  flagellar biosynthesis protein FlhB  38.23 
 
 
376 aa  223  3e-57  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0240  flagellar biosynthetic protein FlhB  37.11 
 
 
353 aa  223  4e-57  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.760621  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3698  flagellar biosynthesis protein FlhB  39.66 
 
 
380 aa  223  4.9999999999999996e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0239481 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1944  flagellar biosynthetic protein FlhB  36.03 
 
 
381 aa  222  8e-57  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3441  flagellar biosynthesis protein FlhB  37.26 
 
 
378 aa  222  9e-57  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.456344 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2295  flagellar biosynthesis protein FlhB  34.83 
 
 
376 aa  222  9e-57  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3370  flagellar biosynthesis protein FlhB  36.75 
 
 
398 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00184569  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1515  flagellar biosynthesis protein FlhB  34.41 
 
 
376 aa  220  3e-56  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.813027  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16690  flagellar biosynthetic protein FlhB  35.41 
 
 
356 aa  219  3.9999999999999997e-56  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1866  flagellar biosynthesis protein FlhB  35.49 
 
 
376 aa  219  5e-56  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.965675  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1093  flagellar biosynthesis protein FlhB  34.28 
 
 
358 aa  219  6e-56  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.40975 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0426  flagellar biosynthesis protein FlhB  37.47 
 
 
352 aa  219  7.999999999999999e-56  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.888697  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0112  flagellar biosynthesis protein FlhB  36.69 
 
 
356 aa  219  7.999999999999999e-56  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.157288  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5615  flagellar biosynthesis protein FlhB  38.07 
 
 
380 aa  218  8.999999999999998e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.891713  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0868  flagellar biosynthesis/type III secretory pathway protein  35.67 
 
 
369 aa  218  8.999999999999998e-56  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2938  flagellar biosynthesis protein FlhB  36.89 
 
 
380 aa  218  1e-55  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0481554  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2809  flagellar biosynthesis protein FlhB  36.54 
 
 
378 aa  218  1e-55  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.326255  normal  0.0759815 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03148  flagellar biosynthesis protein FlhB  37.5 
 
 
376 aa  218  1e-55  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2604  flagellar biosynthesis protein FlhB  40.5 
 
 
383 aa  217  2e-55  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1153  flagellar biosynthesis protein FlhB  35.9 
 
 
356 aa  217  2e-55  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1716  flagellar biosynthesis protein FlhB  33.24 
 
 
353 aa  217  2.9999999999999998e-55  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0559282 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0121  flagellar biosynthesis protein FlhB  36.41 
 
 
356 aa  216  4e-55  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02874  flagellar biosynthesis protein  37.22 
 
 
374 aa  216  4e-55  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2840  flagellar biosynthesis protein FlhB  37.22 
 
 
399 aa  216  5.9999999999999996e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.151701  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0267  flagellar biosynthesis protein FlhB  37.22 
 
 
399 aa  216  5.9999999999999996e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.110201  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1245  flagellar biosynthetic protein FlhB  35.1 
 
 
390 aa  215  8e-55  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.215857  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3094  flagellar biosynthesis protein FlhB  35.64 
 
 
353 aa  215  8e-55  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0249  flagellar biosynthesis protein FlhB  37.22 
 
 
399 aa  215  9.999999999999999e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.190542  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1412  flagellar biosynthetic protein FlhB  33.62 
 
 
363 aa  215  9.999999999999999e-55  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.342211  normal  0.890154 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0022  flagellar biosynthesis protein FlhB  33.99 
 
 
359 aa  215  9.999999999999999e-55  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2021  flagellar biosynthesis protein FlhB  38.04 
 
 
360 aa  214  1.9999999999999998e-54  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0130  flagellar biosynthesis protein FlhB  36.69 
 
 
406 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.561684  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1862  flagellar biosynthesis protein FlhB  39.45 
 
 
383 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.90359  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0069  flagellar biosynthetic protein FlhB  35.16 
 
 
358 aa  214  1.9999999999999998e-54  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2393  flagellar biosynthetic protein FlhB  38.7 
 
 
354 aa  214  2.9999999999999995e-54  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>