More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_0022 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011666  Msil_0022  flagellar biosynthesis protein FlhB  100 
 
 
359 aa  728    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2808  flagellar biosynthesis protein FlhB  51.57 
 
 
360 aa  388  1e-107  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1093  flagellar biosynthesis protein FlhB  51.87 
 
 
358 aa  389  1e-107  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.40975 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3217  flagellar biosynthesis protein FlhB  50.42 
 
 
354 aa  363  3e-99  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.447718 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0637  flagellar biosynthesis protein FlhB  50.28 
 
 
353 aa  356  2.9999999999999997e-97  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.111799  normal  0.438226 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0648  flagellar biosynthesis protein FlhB  50.28 
 
 
353 aa  356  3.9999999999999996e-97  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.214387 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0616  flagellar biosynthesis protein FlhB  49.29 
 
 
354 aa  348  7e-95  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.55435 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0121  flagellar biosynthesis protein FlhB  48.87 
 
 
356 aa  348  1e-94  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1716  flagellar biosynthesis protein FlhB  47.7 
 
 
353 aa  345  6e-94  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0559282 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0112  flagellar biosynthesis protein FlhB  48.59 
 
 
356 aa  345  1e-93  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.157288  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4222  flagellar biosynthesis protein FlhB  48.31 
 
 
356 aa  342  5e-93  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0307  flagellar biosynthesis protein FlhB  48.98 
 
 
363 aa  325  7e-88  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0309  flagellar biosynthesis protein FlhB  44.76 
 
 
359 aa  313  3.9999999999999997e-84  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0341  flagellar biosynthesis protein FlhB  44.92 
 
 
359 aa  308  6.999999999999999e-83  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00619914 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0246  flagellar biosynthesis protein FlhB  45.69 
 
 
360 aa  307  2.0000000000000002e-82  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.623088  normal  0.4035 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0721  flagellar biosynthesis protein FlhB  42.24 
 
 
361 aa  297  2e-79  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.366885  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1153  flagellar biosynthesis protein FlhB  43.34 
 
 
356 aa  292  5e-78  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1384  flagellar biosynthesis protein FlhB  35.28 
 
 
360 aa  220  3e-56  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.696508  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1930  flagellar biosynthetic protein FlhB  34.18 
 
 
363 aa  218  1e-55  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.922236  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2575  flagellar biosynthetic protein FlhB  34.26 
 
 
359 aa  218  2e-55  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.011127 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2633  flagellar biosynthetic protein FlhB  36.18 
 
 
355 aa  218  2e-55  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.295644  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2603  flagellar biosynthetic protein FlhB  35.33 
 
 
354 aa  216  5.9999999999999996e-55  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.371847  normal  0.56 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2826  flagellar biosynthetic protein FlhB  35.33 
 
 
354 aa  215  8e-55  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.986887  normal  0.270742 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1137  flagellar biosynthesis protein FlhB  34.29 
 
 
359 aa  214  2.9999999999999995e-54  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4406  flagellar biosynthesis protein FlhB  32.66 
 
 
357 aa  211  2e-53  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.202983  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5492  flagellar biosynthesis protein FlhB  33.71 
 
 
359 aa  202  8e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.14397  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2230  flagellar biosynthetic protein FlhB  34.8 
 
 
355 aa  196  4.0000000000000005e-49  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1522  flagellar biosynthesis protein FlhB  33.52 
 
 
358 aa  196  5.000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.23127  normal  0.258787 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1397  flagellar biosynthesis protein FlhB  34 
 
 
359 aa  196  6e-49  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.247493  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0011  flagellar biosynthetic protein FlhB  33.52 
 
 
355 aa  196  6e-49  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3772  flagellar biosynthesis protein FlhB  34.19 
 
 
358 aa  193  4e-48  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0655991  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0240  flagellar biosynthetic protein FlhB  33.33 
 
 
353 aa  192  5e-48  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.760621  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5533  flagellar biosynthetic protein FlhB  34.84 
 
 
353 aa  188  1e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.215661  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1409  flagellar biosynthetic protein FlhB  35.64 
 
 
361 aa  187  3e-46  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0018  flagellar biosynthetic protein FlhB  32.57 
 
 
374 aa  186  7e-46  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000937461  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1698  flagellar biosynthesis protein FlhB  33.24 
 
 
357 aa  186  8e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.736983 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0018  flagellar biosynthetic protein FlhB  32.57 
 
 
374 aa  185  1.0000000000000001e-45  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000395256  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1163  flagellar biosynthesis protein FlhB  31.34 
 
 
351 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0703  flagellar biosynthetic protein FlhB  30.94 
 
 
354 aa  184  2.0000000000000003e-45  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.635027  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3878  flagellar biosynthesis protein FlhB  33.43 
 
 
378 aa  178  1e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5150  flagellar biosynthetic protein FlhB  40 
 
 
353 aa  178  1e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0317747 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1330  flagellar biosynthesis protein FlhB  31.86 
 
 
358 aa  176  6e-43  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45720  flagellar biosynthesis protein FlhB  33.43 
 
 
378 aa  176  7e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1975  flagellar biosynthetic protein FlhB  31.94 
 
 
378 aa  176  8e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.185057  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0658  flagellar biosynthetic protein FlhB  30.75 
 
 
353 aa  175  9e-43  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.622115  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1866  flagellar biosynthesis protein FlhB  33.7 
 
 
376 aa  175  9e-43  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.965675  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4196  flagellar biosynthesis protein FlhB  28.49 
 
 
354 aa  174  1.9999999999999998e-42  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4066  flagellar biosynthetic protein FlhB  30.54 
 
 
387 aa  174  2.9999999999999996e-42  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4178  flagellar biosynthetic protein FlhB  30.54 
 
 
387 aa  174  2.9999999999999996e-42  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.232408  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0380  flagellar biosynthesis protein FlhB  31.61 
 
 
362 aa  172  7.999999999999999e-42  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.441846  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0357  flagellar biosynthesis protein FlhB  31.34 
 
 
368 aa  171  1e-41  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1129  flagellar biosynthesis protein FlhB  29.91 
 
 
360 aa  171  2e-41  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3698  flagellar biosynthesis protein FlhB  31.93 
 
 
380 aa  171  2e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0239481 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3287  flagellar biosynthesis protein FlhB  28.41 
 
 
357 aa  170  4e-41  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1623  flagellar biosynthesis protein FlhB  31.34 
 
 
362 aa  169  9e-41  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0484  flagellar biosynthetic protein FlhB  28.93 
 
 
392 aa  168  1e-40  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0127914  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3441  flagellar biosynthesis protein FlhB  31.2 
 
 
378 aa  168  1e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.456344 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1552  flagellar biosynthesis protein FlhB  32.68 
 
 
379 aa  169  1e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00640595  normal  0.373184 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0342  flagellar biosynthesis protein FlhB  29.86 
 
 
357 aa  169  1e-40  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00837822  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1750  flagellar biosynthesis protein FlhB  29.53 
 
 
382 aa  168  2e-40  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1750  flagellar biosynthesis protein FlhB  29.53 
 
 
382 aa  167  2e-40  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1515  flagellar biosynthesis protein FlhB  28.97 
 
 
376 aa  167  2.9999999999999998e-40  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.813027  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2604  flagellar biosynthesis protein FlhB  32.43 
 
 
383 aa  166  5e-40  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0426  flagellar biosynthesis protein FlhB  29.01 
 
 
352 aa  166  5.9999999999999996e-40  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.888697  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2393  flagellar biosynthetic protein FlhB  28.73 
 
 
354 aa  164  2.0000000000000002e-39  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1245  flagellar biosynthetic protein FlhB  29.69 
 
 
390 aa  164  2.0000000000000002e-39  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.215857  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2030  flagellar biosynthetic protein FlhB  31.16 
 
 
356 aa  164  3e-39  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.9056  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3821  flagellar biosynthesis protein FlhB  28.73 
 
 
353 aa  163  3e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1334  flagellar biosynthetic protein FlhB  29.92 
 
 
384 aa  163  4.0000000000000004e-39  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0332  flagellar biosynthesis protein FlhB  32.94 
 
 
359 aa  163  4.0000000000000004e-39  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3077  flagellar biosynthesis protein  32.97 
 
 
387 aa  163  4.0000000000000004e-39  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.539513 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0981  flagellar biosynthetic protein FlhB  30.61 
 
 
390 aa  163  4.0000000000000004e-39  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0800953 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3905  flagellar biosynthesis protein FlhB  29.01 
 
 
353 aa  162  6e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000447126 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002828  flagellar biosynthesis protein FlhB  27.5 
 
 
376 aa  162  7e-39  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1674  flagellar biosynthetic protein FlhB  31.18 
 
 
360 aa  162  9e-39  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1394  flagellar biosynthetic FlhB transmembrane protein  28.22 
 
 
387 aa  162  1e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00896638  normal  0.765457 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0069  flagellar biosynthetic protein FlhB  31.64 
 
 
358 aa  162  1e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2821  flagellar biosynthesis protein FlhB  33.71 
 
 
356 aa  161  1e-38  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.117691  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0999  flagellar biosynthesis protein FlhB  32.25 
 
 
357 aa  162  1e-38  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0868  flagellar biosynthesis/type III secretory pathway protein  28.49 
 
 
369 aa  162  1e-38  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2696  flagellar biosynthetic protein FlhB  30.94 
 
 
373 aa  161  2e-38  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0743  flagellar biosynthetic protein FlhB  29.66 
 
 
381 aa  160  2e-38  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1397  flagellar biosynthetic protein FlhB  31.43 
 
 
363 aa  161  2e-38  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4412  type III secretion exporter  33.51 
 
 
390 aa  161  2e-38  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2154  flagellar biosynthetic protein FlhB  30.31 
 
 
366 aa  160  3e-38  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1862  flagellar biosynthesis protein FlhB  32.7 
 
 
383 aa  160  4e-38  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.90359  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3094  flagellar biosynthesis protein FlhB  27.32 
 
 
353 aa  160  4e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16690  flagellar biosynthetic protein FlhB  29.05 
 
 
356 aa  160  4e-38  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2021  flagellar biosynthesis protein FlhB  34.73 
 
 
360 aa  160  5e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3370  flagellar biosynthesis protein FlhB  31.45 
 
 
398 aa  159  5e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00184569  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2295  flagellar biosynthesis protein FlhB  29.17 
 
 
376 aa  159  5e-38  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2069  flagellar biosynthesis protein FlhB  29.14 
 
 
383 aa  159  6e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00553621 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1208  flagellar biosynthesis protein FlhB  29.14 
 
 
383 aa  159  6e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2074  flagellar biosynthesis protein FlhB  29.14 
 
 
383 aa  159  6e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000897295 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1331  flagellar biosynthesis protein FlhB  29.14 
 
 
383 aa  159  7e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.384239  hitchhiker  0.0000000000516194 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2129  flagellar biosynthesis protein FlhB  29.14 
 
 
383 aa  159  7e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000192021 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0130  flagellar biosynthesis protein FlhB  31.08 
 
 
406 aa  159  7e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.561684  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2840  flagellar biosynthesis protein FlhB  32.26 
 
 
399 aa  159  7e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.151701  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0267  flagellar biosynthesis protein FlhB  32.26 
 
 
399 aa  159  7e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.110201  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0249  flagellar biosynthesis protein FlhB  32.26 
 
 
399 aa  159  9e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.190542  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>