More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_1975 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004578  PSPTO_1975  flagellar biosynthetic protein FlhB  100 
 
 
378 aa  772    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.185057  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3441  flagellar biosynthesis protein FlhB  94.18 
 
 
378 aa  737    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.456344 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1552  flagellar biosynthesis protein FlhB  69.66 
 
 
379 aa  546  1e-154  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00640595  normal  0.373184 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2809  flagellar biosynthesis protein FlhB  65.34 
 
 
378 aa  503  1e-141  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.326255  normal  0.0759815 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3878  flagellar biosynthesis protein FlhB  63.13 
 
 
378 aa  498  1e-140  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45720  flagellar biosynthesis protein FlhB  63.4 
 
 
378 aa  498  1e-140  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3914  flagellar biosynthesis protein FlhB  66.32 
 
 
380 aa  485  1e-136  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4352  flagellar biosynthesis protein FlhB  66.32 
 
 
380 aa  482  1e-135  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.546846  normal  0.108757 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3678  flagellar biosynthesis protein FlhB  66.32 
 
 
380 aa  483  1e-135  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.10386  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1514  flagellar biosynthesis protein FlhB  65.79 
 
 
380 aa  461  1e-129  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.819465  normal  0.151941 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1981  flagellar biosynthesis protein FlhB  51.47 
 
 
378 aa  411  1e-113  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.764273  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2169  flagellar biosynthesis protein FlhB  52.53 
 
 
376 aa  377  1e-103  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1334  flagellar biosynthetic protein FlhB  46.17 
 
 
384 aa  356  3.9999999999999996e-97  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0981  flagellar biosynthetic protein FlhB  47.67 
 
 
390 aa  349  4e-95  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0800953 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0743  flagellar biosynthetic protein FlhB  46.17 
 
 
381 aa  346  3e-94  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1374  flagellar biosynthesis protein FlhB  45.48 
 
 
377 aa  344  2e-93  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3053  flagellar biosynthesis protein FlhB  45.84 
 
 
377 aa  340  2.9999999999999998e-92  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0535555 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1195  flagellar biosynthesis protein FlhB  43.88 
 
 
377 aa  337  1.9999999999999998e-91  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1631  flagellar biosynthesis protein FlhB  44.41 
 
 
377 aa  335  5.999999999999999e-91  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0713  flagellar biosynthetic protein FlhB  47.25 
 
 
379 aa  334  1e-90  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.31011  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1339  flagellar biosynthesis protein FlhB  43.43 
 
 
377 aa  332  9e-90  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1515  flagellar biosynthesis protein FlhB  44.18 
 
 
376 aa  331  1e-89  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.813027  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1379  flagellar biosynthesis protein FlhB  43.35 
 
 
377 aa  328  8e-89  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.294814 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3215  flagellar biosynthesis protein FlhB  44.35 
 
 
376 aa  327  2.0000000000000001e-88  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1750  flagellar biosynthesis protein FlhB  42.33 
 
 
382 aa  327  2.0000000000000001e-88  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3034  flagellar biosynthetic protein FlhB  42.2 
 
 
374 aa  327  2.0000000000000001e-88  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1355  flagellar biosynthesis protein FlhB  44.63 
 
 
376 aa  327  2.0000000000000001e-88  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.424725  normal  0.225798 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1295  flagellar biosynthesis protein FlhB  44.35 
 
 
376 aa  326  4.0000000000000003e-88  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.388157  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1362  flagellar biosynthesis protein FlhB  44.35 
 
 
376 aa  326  4.0000000000000003e-88  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.873498 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1750  flagellar biosynthesis protein FlhB  42.06 
 
 
382 aa  324  1e-87  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2159  flagellar biosynthetic protein FlhB  44.27 
 
 
377 aa  323  4e-87  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2563  flagellar biosynthesis protein FlhB  44.63 
 
 
376 aa  322  6e-87  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.757068  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1450  flagellar biosynthesis protein FlhB  44.08 
 
 
376 aa  322  8e-87  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3431  flagellar biosynthetic protein FlhB  43.92 
 
 
378 aa  322  9.999999999999999e-87  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1171  flagellar biosynthetic protein FlhB  42.78 
 
 
383 aa  321  9.999999999999999e-87  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.127204 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2295  flagellar biosynthesis protein FlhB  43.2 
 
 
376 aa  321  9.999999999999999e-87  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3055  flagellar biosynthesis protein FlhB  43.8 
 
 
376 aa  320  1.9999999999999998e-86  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.247333 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2913  flagellar biosynthesis protein FlhB  43.53 
 
 
376 aa  318  7e-86  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.847075  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2923  flagellar biosynthesis protein FlhB  43.53 
 
 
376 aa  318  1e-85  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2284  flagellar biosynthesis protein FlhB  44.93 
 
 
377 aa  317  1e-85  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.562852  normal  0.66393 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002828  flagellar biosynthesis protein FlhB  42.25 
 
 
376 aa  315  7e-85  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02874  flagellar biosynthesis protein  43.35 
 
 
374 aa  315  9e-85  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1702  flagellar biosynthesis protein FlhB  43.62 
 
 
376 aa  310  2.9999999999999997e-83  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0481  flagellar biosynthetic protein FlhB  44.29 
 
 
391 aa  308  9e-83  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03148  flagellar biosynthesis protein FlhB  41.98 
 
 
376 aa  307  2.0000000000000002e-82  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1547  flagellar biosynthesis protein FlhB  43.01 
 
 
383 aa  305  6e-82  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1944  flagellar biosynthetic protein FlhB  42.86 
 
 
381 aa  304  1.0000000000000001e-81  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1245  flagellar biosynthetic protein FlhB  42.4 
 
 
390 aa  303  4.0000000000000003e-81  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.215857  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1309  flagellar biosynthesis protein FlhB  43.58 
 
 
392 aa  302  5.000000000000001e-81  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.791915  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3370  flagellar biosynthesis protein FlhB  40.48 
 
 
398 aa  301  1e-80  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00184569  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5615  flagellar biosynthesis protein FlhB  41.78 
 
 
380 aa  300  2e-80  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.891713  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0130  flagellar biosynthesis protein FlhB  40.9 
 
 
406 aa  297  2e-79  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.561684  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3698  flagellar biosynthesis protein FlhB  41.78 
 
 
380 aa  297  2e-79  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0239481 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3804  flagellar biosynthesis protein FlhB  41.16 
 
 
403 aa  295  8e-79  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0092  flagellar biosynthetic protein FlhB  40.27 
 
 
376 aa  293  3e-78  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2938  flagellar biosynthesis protein FlhB  44.2 
 
 
380 aa  291  9e-78  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0481554  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2016  flagellar biosynthetic protein FlhB  40.11 
 
 
387 aa  289  5.0000000000000004e-77  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2840  flagellar biosynthesis protein FlhB  40.21 
 
 
399 aa  288  8e-77  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.151701  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0267  flagellar biosynthesis protein FlhB  40.21 
 
 
399 aa  288  8e-77  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.110201  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0249  flagellar biosynthesis protein FlhB  40.21 
 
 
399 aa  288  2e-76  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.190542  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2447  flagellar biosynthesis protein FlhB  38.69 
 
 
382 aa  286  4e-76  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0175  flagellar biosynthesis protein FlhB  41.07 
 
 
399 aa  283  4.0000000000000003e-75  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.212371 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2069  flagellar biosynthesis protein FlhB  39.62 
 
 
383 aa  280  2e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00553621 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27920  flagellar biosynthetic protein  40.97 
 
 
402 aa  280  2e-74  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0219879  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2074  flagellar biosynthesis protein FlhB  39.62 
 
 
383 aa  280  3e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000897295 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1208  flagellar biosynthesis protein FlhB  39.62 
 
 
383 aa  280  3e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2129  flagellar biosynthesis protein FlhB  39.62 
 
 
383 aa  280  3e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000192021 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1331  flagellar biosynthesis protein FlhB  39.62 
 
 
383 aa  280  4e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.384239  hitchhiker  0.0000000000516194 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0181  flagellar biosynthesis protein FlhB  39.95 
 
 
399 aa  279  5e-74  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.824859  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1519  flagellar biosynthesis protein FlhB  40.11 
 
 
383 aa  277  2e-73  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0194  flagellar biosynthesis protein FlhB  39.68 
 
 
399 aa  277  2e-73  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4066  flagellar biosynthetic protein FlhB  41.01 
 
 
387 aa  275  1.0000000000000001e-72  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0086  flagellar biosynthetic protein FlhB  36.8 
 
 
376 aa  275  1.0000000000000001e-72  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.293777 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4178  flagellar biosynthetic protein FlhB  41.01 
 
 
387 aa  275  1.0000000000000001e-72  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.232408  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1862  flagellar biosynthesis protein FlhB  40.97 
 
 
383 aa  274  2.0000000000000002e-72  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.90359  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3596  flagellar biosynthetic protein FlhB  39.52 
 
 
374 aa  273  3e-72  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.189893  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1394  flagellar biosynthetic FlhB transmembrane protein  39.9 
 
 
387 aa  273  4.0000000000000004e-72  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00896638  normal  0.765457 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3484  flagellar biosynthetic protein FlhB  38.01 
 
 
376 aa  272  7e-72  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.994028  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2964  flagellar biosynthesis protein FlhB  41.24 
 
 
411 aa  271  2e-71  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00775742 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3844  flagellar biosynthesis protein FlhB  39.95 
 
 
401 aa  270  2e-71  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1695  flagellar biosynthesis protein FlhB  39.95 
 
 
401 aa  271  2e-71  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3925  flagellar biosynthesis protein FlhB  39.95 
 
 
401 aa  271  2e-71  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.807758  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2604  flagellar biosynthesis protein FlhB  39.95 
 
 
383 aa  271  2e-71  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3128  flagellar biosynthesis protein FlhB  39.95 
 
 
401 aa  271  2e-71  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3423  flagellar biosynthesis protein FlhB  39.95 
 
 
401 aa  271  2e-71  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3170  flagellar biosynthesis protein FlhB  41.02 
 
 
405 aa  270  2.9999999999999997e-71  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3667  flagellar biosynthetic protein FlhB  38.27 
 
 
376 aa  270  2.9999999999999997e-71  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4140  flagellar biosynthetic protein FlhB  40 
 
 
382 aa  270  2.9999999999999997e-71  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2847  flagellar biosynthesis protein FlhB  40 
 
 
405 aa  270  4e-71  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0063  flagellar biosynthesis protein FlhB  39.73 
 
 
405 aa  269  5e-71  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3987  flagellar biosynthetic protein FlhB  38.01 
 
 
376 aa  268  1e-70  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2334  flagellar biosynthesis protein FlhB  41.03 
 
 
386 aa  265  1e-69  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.178036  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2432  flagellar biosynthesis protein FlhB  41.03 
 
 
386 aa  264  2e-69  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1866  flagellar biosynthesis protein FlhB  39.39 
 
 
376 aa  263  3e-69  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.965675  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001177  flagellar biosynthesis protein FlhB  39.52 
 
 
375 aa  261  1e-68  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01851  flagellar biosynthesis protein B  40.39 
 
 
382 aa  260  3e-68  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1760  flagellar biosynthetic protein FlhB  40.39 
 
 
382 aa  260  3e-68  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.304563  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1975  flagellar biosynthesis protein FlhB  40.39 
 
 
382 aa  260  3e-68  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2112  flagellar biosynthesis protein FlhB  40.39 
 
 
382 aa  260  3e-68  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01840  hypothetical protein  40.39 
 
 
382 aa  260  3e-68  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>