More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_0587 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013223  Dret_0587  flagellar biosynthesis protein FlhB  100 
 
 
354 aa  724    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1163  flagellar biosynthesis protein FlhB  54.89 
 
 
351 aa  392  1e-108  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1412  flagellar biosynthetic protein FlhB  40.23 
 
 
363 aa  288  1e-76  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.342211  normal  0.890154 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1129  flagellar biosynthesis protein FlhB  39.14 
 
 
360 aa  274  1.0000000000000001e-72  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0868  flagellar biosynthesis/type III secretory pathway protein  39.55 
 
 
369 aa  273  4.0000000000000004e-72  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16690  flagellar biosynthetic protein FlhB  39.3 
 
 
356 aa  273  4.0000000000000004e-72  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1245  flagellar biosynthetic protein FlhB  41.31 
 
 
390 aa  271  1e-71  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.215857  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0011  flagellar biosynthetic protein FlhB  40.56 
 
 
355 aa  270  2e-71  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0018  flagellar biosynthetic protein FlhB  40.8 
 
 
374 aa  265  1e-69  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000395256  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0018  flagellar biosynthetic protein FlhB  40.8 
 
 
374 aa  264  2e-69  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000937461  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3821  flagellar biosynthesis protein FlhB  39.09 
 
 
353 aa  259  6e-68  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1316  flagellar biosynthetic protein FlhB  39.14 
 
 
366 aa  258  1e-67  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0484  flagellar biosynthetic protein FlhB  36.59 
 
 
392 aa  257  2e-67  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0127914  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2016  flagellar biosynthetic protein FlhB  43.14 
 
 
387 aa  257  2e-67  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4196  flagellar biosynthesis protein FlhB  39.78 
 
 
354 aa  255  6e-67  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1944  flagellar biosynthetic protein FlhB  39.32 
 
 
381 aa  253  3e-66  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1309  flagellar biosynthesis protein FlhB  39.2 
 
 
392 aa  251  1e-65  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.791915  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0743  flagellar biosynthetic protein FlhB  38.98 
 
 
381 aa  250  2e-65  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3905  flagellar biosynthesis protein FlhB  38.81 
 
 
353 aa  249  4e-65  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000447126 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1547  flagellar biosynthesis protein FlhB  37.46 
 
 
383 aa  245  9.999999999999999e-64  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2393  flagellar biosynthetic protein FlhB  36.75 
 
 
354 aa  245  9.999999999999999e-64  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3804  flagellar biosynthesis protein FlhB  39.83 
 
 
403 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1409  flagellar biosynthetic protein FlhB  38.86 
 
 
361 aa  243  3e-63  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45720  flagellar biosynthesis protein FlhB  39.2 
 
 
378 aa  243  5e-63  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4135  flagellar biosynthetic protein FlhB  38.04 
 
 
350 aa  241  1e-62  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0846766  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1552  flagellar biosynthesis protein FlhB  37.33 
 
 
379 aa  241  1e-62  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00640595  normal  0.373184 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3370  flagellar biosynthesis protein FlhB  39.39 
 
 
398 aa  241  2e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00184569  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0130  flagellar biosynthesis protein FlhB  39.22 
 
 
406 aa  241  2e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.561684  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1981  flagellar biosynthesis protein FlhB  38.89 
 
 
378 aa  240  2e-62  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.764273  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3878  flagellar biosynthesis protein FlhB  38.92 
 
 
378 aa  241  2e-62  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2938  flagellar biosynthesis protein FlhB  41.41 
 
 
380 aa  240  2.9999999999999997e-62  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0481554  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1334  flagellar biosynthetic protein FlhB  40.17 
 
 
384 aa  239  4e-62  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1397  flagellar biosynthetic protein FlhB  39.14 
 
 
363 aa  239  5e-62  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1862  flagellar biosynthesis protein FlhB  39.01 
 
 
383 aa  239  5e-62  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.90359  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0426  flagellar biosynthesis protein FlhB  36.02 
 
 
352 aa  239  6.999999999999999e-62  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.888697  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3094  flagellar biosynthesis protein FlhB  35.13 
 
 
353 aa  238  8e-62  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3287  flagellar biosynthesis protein FlhB  37.05 
 
 
357 aa  236  3e-61  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3698  flagellar biosynthesis protein FlhB  35.81 
 
 
380 aa  236  4e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0239481 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0849  flagellar biosynthetic protein FlhB  37.89 
 
 
377 aa  236  5.0000000000000005e-61  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1391  flagellar biosynthetic protein FlhB  37.29 
 
 
360 aa  236  6e-61  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2604  flagellar biosynthesis protein FlhB  38.19 
 
 
383 aa  235  8e-61  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0175  flagellar biosynthesis protein FlhB  40.17 
 
 
399 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.212371 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2295  flagellar biosynthesis protein FlhB  35.8 
 
 
376 aa  232  7.000000000000001e-60  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1674  flagellar biosynthetic protein FlhB  35.98 
 
 
360 aa  231  1e-59  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1975  flagellar biosynthetic protein FlhB  34.07 
 
 
378 aa  231  2e-59  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.185057  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5615  flagellar biosynthesis protein FlhB  36.19 
 
 
380 aa  231  2e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.891713  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1339  flagellar biosynthesis protein FlhB  38.08 
 
 
377 aa  230  2e-59  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0181  flagellar biosynthesis protein FlhB  39.89 
 
 
399 aa  230  2e-59  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.824859  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1866  flagellar biosynthesis protein FlhB  36.05 
 
 
376 aa  231  2e-59  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.965675  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1631  flagellar biosynthesis protein FlhB  36.34 
 
 
377 aa  229  4e-59  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2840  flagellar biosynthesis protein FlhB  38.83 
 
 
399 aa  229  6e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.151701  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0267  flagellar biosynthesis protein FlhB  38.83 
 
 
399 aa  229  6e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.110201  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0249  flagellar biosynthesis protein FlhB  39.34 
 
 
399 aa  229  6e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.190542  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002828  flagellar biosynthesis protein FlhB  36.67 
 
 
376 aa  229  6e-59  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0194  flagellar biosynthesis protein FlhB  40.17 
 
 
399 aa  229  7e-59  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1195  flagellar biosynthesis protein FlhB  38.98 
 
 
377 aa  228  9e-59  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0981  flagellar biosynthetic protein FlhB  35 
 
 
390 aa  228  1e-58  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0800953 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1171  flagellar biosynthetic protein FlhB  37.08 
 
 
383 aa  228  1e-58  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.127204 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1394  flagellar biosynthetic FlhB transmembrane protein  37.61 
 
 
387 aa  227  2e-58  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00896638  normal  0.765457 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2169  flagellar biosynthesis protein FlhB  36.52 
 
 
376 aa  227  2e-58  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0054  flagellar biosynthesis protein FlhB  35.49 
 
 
390 aa  226  3e-58  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0379  flagellar biosynthesis protein FlhB  36.34 
 
 
357 aa  227  3e-58  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2074  flagellar biosynthesis protein FlhB  36.46 
 
 
383 aa  226  4e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000897295 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1331  flagellar biosynthesis protein FlhB  36.74 
 
 
383 aa  226  4e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.384239  hitchhiker  0.0000000000516194 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2021  flagellar biosynthesis protein FlhB  39.6 
 
 
360 aa  226  4e-58  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2696  flagellar biosynthetic protein FlhB  36.29 
 
 
373 aa  226  4e-58  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1379  flagellar biosynthesis protein FlhB  35.01 
 
 
377 aa  226  4e-58  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.294814 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1208  flagellar biosynthesis protein FlhB  36.46 
 
 
383 aa  226  4e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1519  flagellar biosynthesis protein FlhB  35.81 
 
 
383 aa  226  5.0000000000000005e-58  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2809  flagellar biosynthesis protein FlhB  38.61 
 
 
378 aa  226  6e-58  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.326255  normal  0.0759815 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3472  flagellar biosynthesis protein FlhB  37.82 
 
 
355 aa  226  6e-58  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0713  flagellar biosynthetic protein FlhB  35.07 
 
 
379 aa  226  6e-58  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.31011  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3441  flagellar biosynthesis protein FlhB  34.15 
 
 
378 aa  226  7e-58  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.456344 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1631  flagellar biosynthetic protein FlhB  38.1 
 
 
350 aa  225  8e-58  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2129  flagellar biosynthesis protein FlhB  36.46 
 
 
383 aa  225  9e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000192021 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03148  flagellar biosynthesis protein FlhB  36.94 
 
 
376 aa  224  1e-57  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3053  flagellar biosynthesis protein FlhB  36.24 
 
 
377 aa  224  1e-57  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0535555 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0240  flagellar biosynthetic protein FlhB  36.65 
 
 
353 aa  224  2e-57  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.760621  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4140  flagellar biosynthetic protein FlhB  38.55 
 
 
382 aa  224  2e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3914  flagellar biosynthesis protein FlhB  36.49 
 
 
380 aa  224  2e-57  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2069  flagellar biosynthesis protein FlhB  36.19 
 
 
383 aa  223  3e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00553621 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0342  flagellar biosynthesis protein FlhB  36.75 
 
 
357 aa  223  4e-57  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00837822  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0357  flagellar biosynthesis protein FlhB  34.36 
 
 
368 aa  223  4e-57  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1295  flagellar biosynthesis protein FlhB  36.6 
 
 
376 aa  222  9e-57  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.388157  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1362  flagellar biosynthesis protein FlhB  36.6 
 
 
376 aa  222  9e-57  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.873498 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0380  flagellar biosynthesis protein FlhB  33.52 
 
 
362 aa  221  9.999999999999999e-57  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.441846  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0703  flagellar biosynthetic protein FlhB  33.52 
 
 
354 aa  221  9.999999999999999e-57  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.635027  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0960  flagellar biosynthetic protein FlhB  36.08 
 
 
384 aa  221  9.999999999999999e-57  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1355  flagellar biosynthesis protein FlhB  36.47 
 
 
376 aa  222  9.999999999999999e-57  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.424725  normal  0.225798 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2032  flagellar biosynthetic protein FlhB  34.08 
 
 
381 aa  221  9.999999999999999e-57  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.112007  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4352  flagellar biosynthesis protein FlhB  37.36 
 
 
380 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.546846  normal  0.108757 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3925  flagellar biosynthesis protein FlhB  40 
 
 
401 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.807758  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2563  flagellar biosynthesis protein FlhB  36.23 
 
 
376 aa  221  1.9999999999999999e-56  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.757068  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2334  flagellar biosynthesis protein FlhB  36.51 
 
 
386 aa  220  3e-56  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.178036  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3215  flagellar biosynthesis protein FlhB  37.5 
 
 
376 aa  220  3e-56  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3844  flagellar biosynthesis protein FlhB  39.73 
 
 
401 aa  220  3e-56  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2447  flagellar biosynthesis protein FlhB  36.11 
 
 
382 aa  220  3e-56  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3443  flagellar biosynthesis protein FlhB  37.35 
 
 
324 aa  220  3e-56  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1450  flagellar biosynthesis protein FlhB  36.23 
 
 
376 aa  220  3e-56  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3423  flagellar biosynthesis protein FlhB  39.73 
 
 
401 aa  220  3e-56  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>