More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_4406 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_4406  flagellar biosynthesis protein FlhB  100 
 
 		 357 aa  729    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.202983  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1698  flagellar biosynthesis protein FlhB  79.49 
 
 		 357 aa  570  1e-161  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.736983 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5492  flagellar biosynthesis protein FlhB  73.01 
 
 		 359 aa  555  1e-157  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.14397  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1137  flagellar biosynthesis protein FlhB  70.59 
 
 		 359 aa  541  1e-153  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3772  flagellar biosynthesis protein FlhB  79.21 
 
 		 358 aa  542  1e-153  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0655991  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1522  flagellar biosynthesis protein FlhB  76.2 
 
 		 358 aa  543  1e-153  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.23127  normal  0.258787 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1397  flagellar biosynthesis protein FlhB  70.59 
 
 		 359 aa  496  1e-139  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.247493  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2826  flagellar biosynthetic protein FlhB  49.58 
 
 		 354 aa  377  1e-103  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.986887  normal  0.270742 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2603  flagellar biosynthetic protein FlhB  49.29 
 
 		 354 aa  374  1e-102  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.371847  normal  0.56 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2633  flagellar biosynthetic protein FlhB  48.7 
 
 		 355 aa  369  1e-101  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.295644  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2575  flagellar biosynthetic protein FlhB  49.44 
 
 		 359 aa  363  3e-99  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.011127 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2230  flagellar biosynthetic protein FlhB  48.08 
 
 		 355 aa  335  9e-91  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1930  flagellar biosynthetic protein FlhB  44.23 
 
 		 363 aa  333  2e-90  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.922236  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5533  flagellar biosynthetic protein FlhB  48.41 
 
 		 353 aa  318  7e-86  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.215661  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5150  flagellar biosynthetic protein FlhB  49.57 
 
 		 353 aa  308  1.0000000000000001e-82  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0317747 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1384  flagellar biosynthesis protein FlhB  42.22 
 
 		 360 aa  279  7e-74  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.696508  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2821  flagellar biosynthesis protein FlhB  44.44 
 
 		 356 aa  248  9e-65  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.117691  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2808  flagellar biosynthesis protein FlhB  38.12 
 
 		 360 aa  244  1.9999999999999999e-63  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1866  flagellar biosynthesis protein FlhB  38.31 
 
 		 376 aa  237  2e-61  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.965675  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2393  flagellar biosynthetic protein FlhB  39.17 
 
 		 354 aa  234  2.0000000000000002e-60  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0981  flagellar biosynthetic protein FlhB  37.94 
 
 		 390 aa  234  2.0000000000000002e-60  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0800953 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1674  flagellar biosynthetic protein FlhB  37.82 
 
 		 360 aa  234  2.0000000000000002e-60  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1163  flagellar biosynthesis protein FlhB  37.75 
 
 		 351 aa  232  6e-60  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1129  flagellar biosynthesis protein FlhB  38.9 
 
 		 360 aa  231  2e-59  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0011  flagellar biosynthetic protein FlhB  38.07 
 
 		 355 aa  231  2e-59  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3217  flagellar biosynthesis protein FlhB  36.75 
 
 		 354 aa  231  2e-59  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.447718 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2016  flagellar biosynthetic protein FlhB  40.45 
 
 		 387 aa  229  8e-59  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2069  flagellar biosynthesis protein FlhB  39.44 
 
 		 383 aa  227  2e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00553621 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0484  flagellar biosynthetic protein FlhB  39.22 
 
 		 392 aa  228  2e-58  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0127914  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1208  flagellar biosynthesis protein FlhB  39.44 
 
 		 383 aa  226  4e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2074  flagellar biosynthesis protein FlhB  39.44 
 
 		 383 aa  226  4e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000897295 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2129  flagellar biosynthesis protein FlhB  39.66 
 
 		 383 aa  226  5.0000000000000005e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000192021 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1331  flagellar biosynthesis protein FlhB  39.66 
 
 		 383 aa  226  6e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.384239  hitchhiker  0.0000000000516194 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2328  type III secretion exporter  38.74 
 
 		 363 aa  224  1e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.645604  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2447  flagellar biosynthesis protein FlhB  39.66 
 
 		 382 aa  225  1e-57  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1981  flagellar biosynthesis protein FlhB  39.45 
 
 		 378 aa  225  1e-57  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.764273  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1245  flagellar biosynthetic protein FlhB  37.96 
 
 		 390 aa  223  4e-57  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.215857  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2809  flagellar biosynthesis protein FlhB  39.67 
 
 		 378 aa  223  4e-57  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.326255  normal  0.0759815 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02874  flagellar biosynthesis protein  37.67 
 
 		 374 aa  223  4.9999999999999996e-57  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0868  flagellar biosynthesis/type III secretory pathway protein  37.57 
 
 		 369 aa  223  4.9999999999999996e-57  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1374  flagellar biosynthesis protein FlhB  39.13 
 
 		 377 aa  223  4.9999999999999996e-57  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1379  flagellar biosynthesis protein FlhB  37.33 
 
 		 377 aa  223  6e-57  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.294814 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5615  flagellar biosynthesis protein FlhB  38.46 
 
 		 380 aa  222  9.999999999999999e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.891713  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0637  flagellar biosynthesis protein FlhB  34.38 
 
 		 353 aa  221  9.999999999999999e-57  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.111799  normal  0.438226 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4222  flagellar biosynthesis protein FlhB  38.02 
 
 		 356 aa  221  9.999999999999999e-57  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3878  flagellar biosynthesis protein FlhB  39.67 
 
 		 378 aa  220  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0648  flagellar biosynthesis protein FlhB  33.9 
 
 		 353 aa  221  1.9999999999999999e-56  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.214387 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3804  flagellar biosynthesis protein FlhB  37.64 
 
 		 403 aa  220  3e-56  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0739  flagellar biosynthesis protein FlhB  41.19 
 
 		 379 aa  220  3e-56  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1515  flagellar biosynthesis protein FlhB  33.9 
 
 		 376 aa  220  3.9999999999999997e-56  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.813027  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45720  flagellar biosynthesis protein FlhB  39.67 
 
 		 378 aa  220  3.9999999999999997e-56  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0341  flagellar biosynthesis protein FlhB  35.73 
 
 		 359 aa  219  5e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00619914 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0069  flagellar biosynthetic protein FlhB  36.23 
 
 		 358 aa  219  5e-56  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4352  flagellar biosynthesis protein FlhB  38.06 
 
 		 380 aa  219  6e-56  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.546846  normal  0.108757 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2334  flagellar biosynthesis protein FlhB  38.42 
 
 		 386 aa  219  6e-56  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.178036  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1944  flagellar biosynthetic protein FlhB  36.91 
 
 		 381 aa  219  6e-56  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1547  flagellar biosynthesis protein FlhB  38.83 
 
 		 383 aa  219  6e-56  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0130  flagellar biosynthesis protein FlhB  37.64 
 
 		 406 aa  218  8.999999999999998e-56  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.561684  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0616  flagellar biosynthesis protein FlhB  33.52 
 
 		 354 aa  218  1e-55  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.55435 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2432  flagellar biosynthesis protein FlhB  38.42 
 
 		 386 aa  218  2e-55  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0112  flagellar biosynthesis protein FlhB  36.77 
 
 		 356 aa  216  4e-55  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.157288  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0309  flagellar biosynthesis protein FlhB  35.45 
 
 		 359 aa  216  5e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1339  flagellar biosynthesis protein FlhB  36.46 
 
 		 377 aa  216  5e-55  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3698  flagellar biosynthesis protein FlhB  37.89 
 
 		 380 aa  216  5e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0239481 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3431  flagellar biosynthetic protein FlhB  36.64 
 
 		 378 aa  216  5.9999999999999996e-55  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0121  flagellar biosynthesis protein FlhB  36.77 
 
 		 356 aa  216  7e-55  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2696  flagellar biosynthetic protein FlhB  36.83 
 
 		 373 aa  216  7e-55  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1195  flagellar biosynthesis protein FlhB  35.85 
 
 		 377 aa  215  7e-55  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3914  flagellar biosynthesis protein FlhB  37.22 
 
 		 380 aa  215  9.999999999999999e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0721  flagellar biosynthesis protein FlhB  35.17 
 
 		 361 aa  215  9.999999999999999e-55  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.366885  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2295  flagellar biosynthesis protein FlhB  35.34 
 
 		 376 aa  214  1.9999999999999998e-54  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3215  flagellar biosynthesis protein FlhB  37.22 
 
 		 376 aa  214  1.9999999999999998e-54  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1631  flagellar biosynthesis protein FlhB  36.11 
 
 		 377 aa  213  2.9999999999999995e-54  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0789  flagellar biosynthetic protein FlhB  36.23 
 
 		 374 aa  213  2.9999999999999995e-54  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000340873  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0426  flagellar biosynthesis protein FlhB  36.86 
 
 		 352 aa  213  3.9999999999999995e-54  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.888697  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0018  flagellar biosynthetic protein FlhB  37.22 
 
 		 374 aa  213  4.9999999999999996e-54  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000937461  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3678  flagellar biosynthesis protein FlhB  37.57 
 
 		 380 aa  213  4.9999999999999996e-54  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.10386  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3053  flagellar biosynthesis protein FlhB  35.83 
 
 		 377 aa  213  4.9999999999999996e-54  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0535555 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06204  flagellar biosynthesis protein FlhB  37.43 
 
 		 376 aa  212  7e-54  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.236866  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0018  flagellar biosynthetic protein FlhB  37.22 
 
 		 374 aa  212  7e-54  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000395256  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0743  flagellar biosynthetic protein FlhB  37.05 
 
 		 381 aa  212  7e-54  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00962  flagellar biosynthesis protein FlhB  37.43 
 
 		 376 aa  212  7e-54  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.118534  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4140  flagellar biosynthetic protein FlhB  38.24 
 
 		 382 aa  212  9e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0342  flagellar biosynthesis protein FlhB  36.94 
 
 		 357 aa  212  9e-54  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00837822  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2604  flagellar biosynthesis protein FlhB  36.69 
 
 		 383 aa  212  9e-54  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1862  flagellar biosynthesis protein FlhB  35.85 
 
 		 383 aa  211  1e-53  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.90359  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1334  flagellar biosynthetic protein FlhB  38.04 
 
 		 384 aa  211  1e-53  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1307  flagellar biosynthesis protein FlhB  40.11 
 
 		 382 aa  211  2e-53  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0569687 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3034  flagellar biosynthetic protein FlhB  34.17 
 
 		 374 aa  211  2e-53  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1295  flagellar biosynthesis protein FlhB  36.94 
 
 		 376 aa  211  2e-53  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.388157  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1362  flagellar biosynthesis protein FlhB  36.94 
 
 		 376 aa  211  2e-53  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.873498 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1355  flagellar biosynthesis protein FlhB  36.74 
 
 		 376 aa  210  2e-53  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.424725  normal  0.225798 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2284  flagellar biosynthesis protein FlhB  38.38 
 
 		 377 aa  211  2e-53  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.562852  normal  0.66393 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002828  flagellar biosynthesis protein FlhB  36.52 
 
 		 376 aa  210  3e-53  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2617  flagellar biosynthesis protein FlhB  40.11 
 
 		 382 aa  210  3e-53  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000137265 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1171  flagellar biosynthetic protein FlhB  39.5 
 
 		 383 aa  210  4e-53  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.127204 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1412  flagellar biosynthetic protein FlhB  34.73 
 
 		 363 aa  209  4e-53  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.342211  normal  0.890154 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3370  flagellar biosynthesis protein FlhB  36.83 
 
 		 398 aa  209  6e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00184569  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1760  flagellar biosynthetic protein FlhB  39.83 
 
 		 382 aa  209  7e-53  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.304563  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1093  flagellar biosynthesis protein FlhB  34.62 
 
 		 358 aa  209  7e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.40975 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>