More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_1515 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003910  CPS_1515  flagellar biosynthesis protein FlhB  100 
 
 
376 aa  772    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.813027  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1374  flagellar biosynthesis protein FlhB  53.05 
 
 
377 aa  421  1e-116  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1195  flagellar biosynthesis protein FlhB  50.93 
 
 
377 aa  420  1e-116  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3215  flagellar biosynthesis protein FlhB  51.37 
 
 
376 aa  413  1e-114  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3053  flagellar biosynthesis protein FlhB  51.46 
 
 
377 aa  411  1e-114  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0535555 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2913  flagellar biosynthesis protein FlhB  51.92 
 
 
376 aa  414  1e-114  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.847075  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3055  flagellar biosynthesis protein FlhB  51.92 
 
 
376 aa  412  1e-114  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.247333 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1450  flagellar biosynthesis protein FlhB  51.92 
 
 
376 aa  412  1e-114  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1295  flagellar biosynthesis protein FlhB  51.65 
 
 
376 aa  412  1e-114  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.388157  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1362  flagellar biosynthesis protein FlhB  51.65 
 
 
376 aa  412  1e-114  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.873498 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1355  flagellar biosynthesis protein FlhB  51.92 
 
 
376 aa  414  1e-114  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.424725  normal  0.225798 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1379  flagellar biosynthesis protein FlhB  50.13 
 
 
377 aa  410  1e-113  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.294814 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2563  flagellar biosynthesis protein FlhB  50.82 
 
 
376 aa  409  1e-113  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.757068  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2923  flagellar biosynthesis protein FlhB  51.65 
 
 
376 aa  410  1e-113  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1631  flagellar biosynthesis protein FlhB  49.6 
 
 
377 aa  407  1.0000000000000001e-112  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1339  flagellar biosynthesis protein FlhB  49.34 
 
 
377 aa  403  1e-111  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2284  flagellar biosynthesis protein FlhB  50.66 
 
 
377 aa  385  1e-106  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.562852  normal  0.66393 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2295  flagellar biosynthesis protein FlhB  48.8 
 
 
376 aa  384  1e-105  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3034  flagellar biosynthetic protein FlhB  48.12 
 
 
374 aa  382  1e-105  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02874  flagellar biosynthesis protein  48.39 
 
 
374 aa  378  1e-104  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002828  flagellar biosynthesis protein FlhB  47.87 
 
 
376 aa  369  1e-101  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1702  flagellar biosynthesis protein FlhB  48.4 
 
 
376 aa  362  6e-99  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03148  flagellar biosynthesis protein FlhB  47.87 
 
 
376 aa  359  5e-98  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1552  flagellar biosynthesis protein FlhB  45.48 
 
 
379 aa  356  3.9999999999999996e-97  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00640595  normal  0.373184 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45720  flagellar biosynthesis protein FlhB  46.28 
 
 
378 aa  355  5.999999999999999e-97  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2809  flagellar biosynthesis protein FlhB  47.23 
 
 
378 aa  354  2e-96  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.326255  normal  0.0759815 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3878  flagellar biosynthesis protein FlhB  46.01 
 
 
378 aa  351  1e-95  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1975  flagellar biosynthetic protein FlhB  44.18 
 
 
378 aa  331  1e-89  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.185057  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3431  flagellar biosynthetic protein FlhB  42.78 
 
 
378 aa  331  1e-89  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1981  flagellar biosynthesis protein FlhB  42.33 
 
 
378 aa  330  2e-89  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.764273  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2169  flagellar biosynthesis protein FlhB  45.36 
 
 
376 aa  326  4.0000000000000003e-88  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1334  flagellar biosynthetic protein FlhB  42.74 
 
 
384 aa  325  7e-88  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3441  flagellar biosynthesis protein FlhB  43.39 
 
 
378 aa  325  1e-87  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.456344 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3678  flagellar biosynthesis protein FlhB  45.79 
 
 
380 aa  324  1e-87  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.10386  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3914  flagellar biosynthesis protein FlhB  44.74 
 
 
380 aa  318  7e-86  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2159  flagellar biosynthetic protein FlhB  41.49 
 
 
377 aa  318  7e-86  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1171  flagellar biosynthetic protein FlhB  41.6 
 
 
383 aa  317  2e-85  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.127204 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4352  flagellar biosynthesis protein FlhB  44.21 
 
 
380 aa  317  3e-85  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.546846  normal  0.108757 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1514  flagellar biosynthesis protein FlhB  44.74 
 
 
380 aa  313  2.9999999999999996e-84  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.819465  normal  0.151941 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0743  flagellar biosynthetic protein FlhB  43.95 
 
 
381 aa  311  2e-83  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0713  flagellar biosynthetic protein FlhB  42.52 
 
 
379 aa  309  5e-83  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.31011  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0981  flagellar biosynthetic protein FlhB  42.18 
 
 
390 aa  308  8e-83  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0800953 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1750  flagellar biosynthesis protein FlhB  39.84 
 
 
382 aa  297  3e-79  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1750  flagellar biosynthesis protein FlhB  39.58 
 
 
382 aa  295  8e-79  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1944  flagellar biosynthetic protein FlhB  38.71 
 
 
381 aa  286  4e-76  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0481  flagellar biosynthetic protein FlhB  41.08 
 
 
391 aa  281  9e-75  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1866  flagellar biosynthesis protein FlhB  38.13 
 
 
376 aa  281  1e-74  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.965675  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1245  flagellar biosynthetic protein FlhB  39.58 
 
 
390 aa  273  3e-72  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.215857  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1331  flagellar biosynthesis protein FlhB  37.77 
 
 
383 aa  272  7e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.384239  hitchhiker  0.0000000000516194 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2069  flagellar biosynthesis protein FlhB  37.77 
 
 
383 aa  271  1e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00553621 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2074  flagellar biosynthesis protein FlhB  37.77 
 
 
383 aa  271  1e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000897295 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2129  flagellar biosynthesis protein FlhB  37.77 
 
 
383 aa  271  1e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000192021 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1208  flagellar biosynthesis protein FlhB  37.77 
 
 
383 aa  271  1e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2604  flagellar biosynthesis protein FlhB  37.77 
 
 
383 aa  271  2e-71  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1862  flagellar biosynthesis protein FlhB  37.23 
 
 
383 aa  266  5e-70  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.90359  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1547  flagellar biosynthesis protein FlhB  37.37 
 
 
383 aa  265  1e-69  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2447  flagellar biosynthesis protein FlhB  37.47 
 
 
382 aa  264  2e-69  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2938  flagellar biosynthesis protein FlhB  40.05 
 
 
380 aa  263  3e-69  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0481554  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16690  flagellar biosynthetic protein FlhB  40.55 
 
 
356 aa  261  2e-68  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0086  flagellar biosynthetic protein FlhB  35.81 
 
 
376 aa  260  3e-68  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.293777 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2432  flagellar biosynthesis protein FlhB  37.47 
 
 
386 aa  259  6e-68  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2334  flagellar biosynthesis protein FlhB  37.47 
 
 
386 aa  258  2e-67  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.178036  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3667  flagellar biosynthetic protein FlhB  36.24 
 
 
376 aa  256  4e-67  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001177  flagellar biosynthesis protein FlhB  36.54 
 
 
375 aa  256  5e-67  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3484  flagellar biosynthetic protein FlhB  36.15 
 
 
376 aa  256  5e-67  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.994028  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0092  flagellar biosynthetic protein FlhB  36.7 
 
 
376 aa  254  2.0000000000000002e-66  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04964  flagellar biosynthesis pathway, component FlhB  35.64 
 
 
375 aa  254  2.0000000000000002e-66  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3596  flagellar biosynthetic protein FlhB  38.78 
 
 
374 aa  254  2.0000000000000002e-66  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.189893  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5615  flagellar biosynthesis protein FlhB  34.49 
 
 
380 aa  253  3e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.891713  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27920  flagellar biosynthetic protein  37.14 
 
 
402 aa  253  3e-66  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0219879  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0484  flagellar biosynthetic protein FlhB  35.88 
 
 
392 aa  253  6e-66  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0127914  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1309  flagellar biosynthesis protein FlhB  34.14 
 
 
392 aa  251  1e-65  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.791915  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1129  flagellar biosynthesis protein FlhB  37.46 
 
 
360 aa  250  3e-65  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2016  flagellar biosynthetic protein FlhB  38.79 
 
 
387 aa  250  4e-65  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0357  flagellar biosynthesis protein FlhB  37.14 
 
 
368 aa  248  9e-65  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00962  flagellar biosynthesis protein FlhB  39.78 
 
 
376 aa  248  1e-64  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.118534  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06204  flagellar biosynthesis protein FlhB  39.78 
 
 
376 aa  248  1e-64  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.236866  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1519  flagellar biosynthesis protein FlhB  36.79 
 
 
383 aa  247  3e-64  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0868  flagellar biosynthesis/type III secretory pathway protein  38.06 
 
 
369 aa  246  4.9999999999999997e-64  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0380  flagellar biosynthesis protein FlhB  37.43 
 
 
362 aa  245  8e-64  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.441846  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0011  flagellar biosynthetic protein FlhB  37.71 
 
 
355 aa  245  9e-64  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3987  flagellar biosynthetic protein FlhB  34.22 
 
 
376 aa  244  1.9999999999999999e-63  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3370  flagellar biosynthesis protein FlhB  34.32 
 
 
398 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00184569  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1623  flagellar biosynthesis protein FlhB  37.4 
 
 
362 aa  243  5e-63  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3698  flagellar biosynthesis protein FlhB  34.76 
 
 
380 aa  242  7.999999999999999e-63  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0239481 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1307  flagellar biosynthesis protein FlhB  36.7 
 
 
382 aa  241  2e-62  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0569687 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3804  flagellar biosynthesis protein FlhB  33.6 
 
 
403 aa  240  2.9999999999999997e-62  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1394  flagellar biosynthetic FlhB transmembrane protein  32.89 
 
 
387 aa  240  4e-62  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00896638  normal  0.765457 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0130  flagellar biosynthesis protein FlhB  33.42 
 
 
406 aa  239  6.999999999999999e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.561684  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01851  flagellar biosynthesis protein B  36.44 
 
 
382 aa  237  2e-61  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01840  hypothetical protein  36.44 
 
 
382 aa  237  2e-61  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1975  flagellar biosynthesis protein FlhB  36.44 
 
 
382 aa  237  2e-61  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1752  flagellar biosynthesis protein FlhB  36.44 
 
 
382 aa  237  2e-61  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1760  flagellar biosynthetic protein FlhB  36.44 
 
 
382 aa  237  3e-61  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.304563  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4066  flagellar biosynthetic protein FlhB  33.16 
 
 
387 aa  237  3e-61  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4178  flagellar biosynthetic protein FlhB  33.16 
 
 
387 aa  237  3e-61  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.232408  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2112  flagellar biosynthesis protein FlhB  36.44 
 
 
382 aa  237  3e-61  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1412  flagellar biosynthetic protein FlhB  34.55 
 
 
363 aa  236  5.0000000000000005e-61  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.342211  normal  0.890154 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0342  flagellar biosynthesis protein FlhB  38.76 
 
 
357 aa  235  9e-61  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00837822  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1330  flagellar biosynthesis protein FlhB  38.59 
 
 
358 aa  235  9e-61  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>