More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_1093 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007925  RPC_1093  flagellar biosynthesis protein FlhB  100 
 
 
358 aa  706    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.40975 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3217  flagellar biosynthesis protein FlhB  57.02 
 
 
354 aa  416  9.999999999999999e-116  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.447718 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0648  flagellar biosynthesis protein FlhB  54.47 
 
 
353 aa  390  1e-107  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.214387 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0637  flagellar biosynthesis protein FlhB  54.47 
 
 
353 aa  390  1e-107  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.111799  normal  0.438226 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0616  flagellar biosynthesis protein FlhB  53.98 
 
 
354 aa  391  1e-107  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.55435 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0022  flagellar biosynthesis protein FlhB  51.87 
 
 
359 aa  379  1e-104  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1716  flagellar biosynthesis protein FlhB  50.14 
 
 
353 aa  370  1e-101  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0559282 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2808  flagellar biosynthesis protein FlhB  46.89 
 
 
360 aa  364  1e-99  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0112  flagellar biosynthesis protein FlhB  48.59 
 
 
356 aa  348  6e-95  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.157288  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0341  flagellar biosynthesis protein FlhB  50 
 
 
359 aa  348  8e-95  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00619914 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0121  flagellar biosynthesis protein FlhB  48.59 
 
 
356 aa  348  1e-94  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4222  flagellar biosynthesis protein FlhB  48.02 
 
 
356 aa  346  4e-94  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0309  flagellar biosynthesis protein FlhB  48 
 
 
359 aa  342  9e-93  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1153  flagellar biosynthesis protein FlhB  45.3 
 
 
356 aa  326  5e-88  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0246  flagellar biosynthesis protein FlhB  46.72 
 
 
360 aa  322  6e-87  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.623088  normal  0.4035 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0307  flagellar biosynthesis protein FlhB  49.13 
 
 
363 aa  320  1.9999999999999998e-86  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0721  flagellar biosynthesis protein FlhB  42.82 
 
 
361 aa  315  9.999999999999999e-85  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.366885  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1384  flagellar biosynthesis protein FlhB  37.47 
 
 
360 aa  235  1.0000000000000001e-60  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.696508  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2575  flagellar biosynthetic protein FlhB  34.28 
 
 
359 aa  219  6e-56  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.011127 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1930  flagellar biosynthetic protein FlhB  36.74 
 
 
363 aa  218  1e-55  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.922236  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2603  flagellar biosynthetic protein FlhB  36.06 
 
 
354 aa  215  7e-55  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.371847  normal  0.56 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1137  flagellar biosynthesis protein FlhB  37.16 
 
 
359 aa  215  9.999999999999999e-55  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2633  flagellar biosynthetic protein FlhB  36.54 
 
 
355 aa  214  9.999999999999999e-55  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.295644  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0011  flagellar biosynthetic protein FlhB  34.82 
 
 
355 aa  213  2.9999999999999995e-54  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2826  flagellar biosynthetic protein FlhB  35.49 
 
 
354 aa  213  5.999999999999999e-54  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.986887  normal  0.270742 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4406  flagellar biosynthesis protein FlhB  34.62 
 
 
357 aa  209  7e-53  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.202983  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5492  flagellar biosynthesis protein FlhB  34.7 
 
 
359 aa  209  7e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.14397  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0999  flagellar biosynthesis protein FlhB  34.25 
 
 
357 aa  204  2e-51  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0380  flagellar biosynthesis protein FlhB  34.53 
 
 
362 aa  200  3e-50  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.441846  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1698  flagellar biosynthesis protein FlhB  33.24 
 
 
357 aa  200  3e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.736983 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3772  flagellar biosynthesis protein FlhB  33.24 
 
 
358 aa  200  3.9999999999999996e-50  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0655991  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1522  flagellar biosynthesis protein FlhB  35.21 
 
 
358 aa  200  3.9999999999999996e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.23127  normal  0.258787 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1397  flagellar biosynthesis protein FlhB  35.85 
 
 
359 aa  199  7e-50  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.247493  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0357  flagellar biosynthesis protein FlhB  33.89 
 
 
368 aa  199  9e-50  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1330  flagellar biosynthesis protein FlhB  33.89 
 
 
358 aa  197  2.0000000000000003e-49  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1412  flagellar biosynthetic protein FlhB  33.15 
 
 
363 aa  196  4.0000000000000005e-49  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.342211  normal  0.890154 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3443  type III secretion exporter  36.29 
 
 
358 aa  196  6e-49  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.942918 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45720  flagellar biosynthesis protein FlhB  36.03 
 
 
378 aa  196  6e-49  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1409  flagellar biosynthetic protein FlhB  41.35 
 
 
361 aa  195  8.000000000000001e-49  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3441  flagellar biosynthesis protein FlhB  33.61 
 
 
378 aa  195  9e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.456344 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1623  flagellar biosynthesis protein FlhB  34.17 
 
 
362 aa  194  2e-48  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0342  flagellar biosynthesis protein FlhB  33.61 
 
 
357 aa  194  2e-48  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00837822  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0240  flagellar biosynthetic protein FlhB  33.06 
 
 
353 aa  193  4e-48  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.760621  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3878  flagellar biosynthesis protein FlhB  35.85 
 
 
378 aa  193  4e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2230  flagellar biosynthetic protein FlhB  35.29 
 
 
355 aa  192  9e-48  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1975  flagellar biosynthetic protein FlhB  32.51 
 
 
378 aa  192  1e-47  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.185057  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3287  flagellar biosynthesis protein FlhB  30.97 
 
 
357 aa  191  1e-47  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0743  flagellar biosynthetic protein FlhB  31.86 
 
 
381 aa  189  4e-47  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1129  flagellar biosynthesis protein FlhB  32.48 
 
 
360 aa  190  4e-47  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0018  flagellar biosynthetic protein FlhB  33.43 
 
 
374 aa  189  4e-47  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000395256  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0703  flagellar biosynthetic protein FlhB  29.66 
 
 
354 aa  189  5e-47  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.635027  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3821  flagellar biosynthesis protein FlhB  33.71 
 
 
353 aa  189  5.999999999999999e-47  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0018  flagellar biosynthetic protein FlhB  33.43 
 
 
374 aa  189  5.999999999999999e-47  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000937461  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5533  flagellar biosynthetic protein FlhB  35.85 
 
 
353 aa  189  7e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.215661  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1552  flagellar biosynthesis protein FlhB  35.07 
 
 
379 aa  188  1e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00640595  normal  0.373184 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5150  flagellar biosynthetic protein FlhB  35.47 
 
 
353 aa  187  2e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0317747 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1163  flagellar biosynthesis protein FlhB  32.18 
 
 
351 aa  187  2e-46  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4196  flagellar biosynthesis protein FlhB  33.24 
 
 
354 aa  187  2e-46  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3431  flagellar biosynthetic protein FlhB  32.97 
 
 
378 aa  186  4e-46  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1866  flagellar biosynthesis protein FlhB  32.59 
 
 
376 aa  186  5e-46  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.965675  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3094  flagellar biosynthesis protein FlhB  32.03 
 
 
353 aa  186  7e-46  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2809  flagellar biosynthesis protein FlhB  33.7 
 
 
378 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.326255  normal  0.0759815 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0426  flagellar biosynthesis protein FlhB  31.92 
 
 
352 aa  184  3e-45  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.888697  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0658  flagellar biosynthetic protein FlhB  32.58 
 
 
353 aa  183  3e-45  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.622115  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3034  flagellar biosynthetic protein FlhB  33.51 
 
 
374 aa  183  3e-45  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3905  flagellar biosynthesis protein FlhB  33.71 
 
 
353 aa  182  8.000000000000001e-45  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000447126 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1171  flagellar biosynthetic protein FlhB  33.06 
 
 
383 aa  181  2e-44  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.127204 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2604  flagellar biosynthesis protein FlhB  33.05 
 
 
383 aa  180  2.9999999999999997e-44  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16690  flagellar biosynthetic protein FlhB  31.03 
 
 
356 aa  180  4e-44  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1750  flagellar biosynthesis protein FlhB  30.45 
 
 
382 aa  180  4e-44  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1750  flagellar biosynthesis protein FlhB  30.45 
 
 
382 aa  179  4.999999999999999e-44  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02874  flagellar biosynthesis protein  33.88 
 
 
374 aa  179  5.999999999999999e-44  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2393  flagellar biosynthetic protein FlhB  31.65 
 
 
354 aa  179  5.999999999999999e-44  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0406  type III secretion exporter  29.92 
 
 
367 aa  179  7e-44  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.715015  normal  0.880519 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1862  flagellar biosynthesis protein FlhB  33.33 
 
 
383 aa  179  9e-44  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.90359  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0484  flagellar biosynthetic protein FlhB  31.01 
 
 
392 aa  177  2e-43  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0127914  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3370  flagellar biosynthesis protein FlhB  35.56 
 
 
398 aa  177  2e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00184569  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0379  flagellar biosynthesis protein FlhB  31.71 
 
 
357 aa  177  3e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0868  flagellar biosynthesis/type III secretory pathway protein  31.36 
 
 
369 aa  177  3e-43  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0332  flagellar biosynthesis protein FlhB  32.95 
 
 
359 aa  176  4e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2696  flagellar biosynthetic protein FlhB  30.06 
 
 
373 aa  176  5e-43  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0981  flagellar biosynthetic protein FlhB  32.61 
 
 
390 aa  176  5e-43  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0800953 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0155  flagellar biosynthesis protein FlhB  32.07 
 
 
357 aa  176  5e-43  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.795808  normal  0.521978 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2432  flagellar biosynthesis protein FlhB  32.6 
 
 
386 aa  176  6e-43  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3804  flagellar biosynthesis protein FlhB  33.88 
 
 
403 aa  176  6e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2334  flagellar biosynthesis protein FlhB  32.6 
 
 
386 aa  175  8e-43  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.178036  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0130  flagellar biosynthesis protein FlhB  33.88 
 
 
406 aa  176  8e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.561684  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2015  flagellar biosynthesis protein FlhB  32.19 
 
 
356 aa  175  9e-43  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0713  flagellar biosynthetic protein FlhB  32.05 
 
 
379 aa  175  9e-43  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.31011  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0481  flagellar biosynthetic protein FlhB  33.15 
 
 
391 aa  175  9.999999999999999e-43  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1515  flagellar biosynthesis protein FlhB  32.77 
 
 
376 aa  174  1.9999999999999998e-42  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.813027  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002828  flagellar biosynthesis protein FlhB  32.29 
 
 
376 aa  173  2.9999999999999996e-42  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2129  flagellar biosynthesis protein FlhB  29.72 
 
 
383 aa  173  3.9999999999999995e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000192021 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2032  flagellar biosynthetic protein FlhB  32.29 
 
 
381 aa  173  3.9999999999999995e-42  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.112007  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2069  flagellar biosynthesis protein FlhB  29.72 
 
 
383 aa  173  3.9999999999999995e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00553621 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1208  flagellar biosynthesis protein FlhB  29.72 
 
 
383 aa  173  3.9999999999999995e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2074  flagellar biosynthesis protein FlhB  29.72 
 
 
383 aa  173  3.9999999999999995e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000897295 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1331  flagellar biosynthesis protein FlhB  29.72 
 
 
383 aa  173  3.9999999999999995e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.384239  hitchhiker  0.0000000000516194 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0669  flagellar biosynthesis protein FlhB  30.85 
 
 
350 aa  172  5.999999999999999e-42  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0757109  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2295  flagellar biosynthesis protein FlhB  30.14 
 
 
376 aa  172  5.999999999999999e-42  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>