More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_3443 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011365  Gdia_3443  type III secretion exporter  100 
 
 
358 aa  729    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.942918 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1384  flagellar biosynthesis protein FlhB  39.67 
 
 
360 aa  235  7e-61  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.696508  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0380  flagellar biosynthesis protein FlhB  34.5 
 
 
362 aa  229  4e-59  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.441846  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0342  flagellar biosynthesis protein FlhB  36.63 
 
 
357 aa  227  2e-58  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00837822  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0357  flagellar biosynthesis protein FlhB  34.21 
 
 
368 aa  227  3e-58  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2633  flagellar biosynthetic protein FlhB  37.64 
 
 
355 aa  224  1e-57  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.295644  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1623  flagellar biosynthesis protein FlhB  34.21 
 
 
362 aa  221  9.999999999999999e-57  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2603  flagellar biosynthetic protein FlhB  37.43 
 
 
354 aa  218  8.999999999999998e-56  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.371847  normal  0.56 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2826  flagellar biosynthetic protein FlhB  37.15 
 
 
354 aa  216  2.9999999999999998e-55  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.986887  normal  0.270742 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1866  flagellar biosynthesis protein FlhB  35.1 
 
 
376 aa  215  8e-55  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.965675  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2575  flagellar biosynthetic protein FlhB  35.23 
 
 
359 aa  215  9e-55  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.011127 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1930  flagellar biosynthetic protein FlhB  38.54 
 
 
363 aa  214  9.999999999999999e-55  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.922236  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1330  flagellar biosynthesis protein FlhB  34.94 
 
 
358 aa  213  3.9999999999999995e-54  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4406  flagellar biosynthesis protein FlhB  38.4 
 
 
357 aa  213  3.9999999999999995e-54  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.202983  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1129  flagellar biosynthesis protein FlhB  35.45 
 
 
360 aa  211  2e-53  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1093  flagellar biosynthesis protein FlhB  36.29 
 
 
358 aa  209  6e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.40975 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0011  flagellar biosynthetic protein FlhB  35.67 
 
 
355 aa  208  1e-52  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1163  flagellar biosynthesis protein FlhB  36.31 
 
 
351 aa  207  2e-52  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0713  flagellar biosynthetic protein FlhB  36.71 
 
 
379 aa  207  2e-52  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.31011  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16690  flagellar biosynthetic protein FlhB  31.53 
 
 
356 aa  207  3e-52  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1195  flagellar biosynthesis protein FlhB  36.24 
 
 
377 aa  207  3e-52  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0453  type III secretion system protein HrcU  38.25 
 
 
352 aa  206  5e-52  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.959251  normal  0.0822049 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2334  flagellar biosynthesis protein FlhB  37.36 
 
 
386 aa  205  1e-51  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.178036  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1137  flagellar biosynthesis protein FlhB  35.67 
 
 
359 aa  204  2e-51  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2432  flagellar biosynthesis protein FlhB  37.36 
 
 
386 aa  204  2e-51  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2696  flagellar biosynthetic protein FlhB  32.68 
 
 
373 aa  204  3e-51  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1522  flagellar biosynthesis protein FlhB  36.18 
 
 
358 aa  201  9.999999999999999e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.23127  normal  0.258787 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1412  flagellar biosynthetic protein FlhB  32.29 
 
 
363 aa  201  1.9999999999999998e-50  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.342211  normal  0.890154 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5615  flagellar biosynthesis protein FlhB  36.01 
 
 
380 aa  201  1.9999999999999998e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.891713  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0743  flagellar biosynthetic protein FlhB  33.06 
 
 
381 aa  201  1.9999999999999998e-50  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0669  flagellar biosynthesis protein FlhB  33.15 
 
 
350 aa  201  1.9999999999999998e-50  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0757109  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0018  flagellar biosynthetic protein FlhB  34.46 
 
 
374 aa  199  5e-50  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000937461  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2230  flagellar biosynthetic protein FlhB  35.94 
 
 
355 aa  199  5e-50  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0999  flagellar biosynthesis protein FlhB  34.88 
 
 
357 aa  199  6e-50  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0018  flagellar biosynthetic protein FlhB  34.46 
 
 
374 aa  199  7.999999999999999e-50  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000395256  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1245  flagellar biosynthetic protein FlhB  34.92 
 
 
390 aa  197  2.0000000000000003e-49  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.215857  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1547  flagellar biosynthesis protein FlhB  33.69 
 
 
383 aa  197  2.0000000000000003e-49  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1339  flagellar biosynthesis protein FlhB  35.52 
 
 
377 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1981  flagellar biosynthesis protein FlhB  34.43 
 
 
378 aa  197  2.0000000000000003e-49  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.764273  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4135  flagellar biosynthetic protein FlhB  34.94 
 
 
350 aa  197  3e-49  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0846766  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5492  flagellar biosynthesis protein FlhB  35.46 
 
 
359 aa  196  4.0000000000000005e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.14397  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2809  flagellar biosynthesis protein FlhB  33.78 
 
 
378 aa  196  5.000000000000001e-49  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.326255  normal  0.0759815 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0309  flagellar biosynthesis protein FlhB  34.76 
 
 
359 aa  196  6e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5533  flagellar biosynthetic protein FlhB  37.08 
 
 
353 aa  195  1e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.215661  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2393  flagellar biosynthetic protein FlhB  34.99 
 
 
354 aa  194  1e-48  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1674  flagellar biosynthetic protein FlhB  33.71 
 
 
360 aa  194  2e-48  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3034  flagellar biosynthetic protein FlhB  35.39 
 
 
374 aa  193  4e-48  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1397  flagellar biosynthesis protein FlhB  35.25 
 
 
359 aa  192  6e-48  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.247493  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1334  flagellar biosynthetic protein FlhB  36.13 
 
 
384 aa  192  7e-48  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2808  flagellar biosynthesis protein FlhB  33.88 
 
 
360 aa  192  7e-48  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0341  flagellar biosynthesis protein FlhB  35.84 
 
 
359 aa  192  9e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00619914 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1698  flagellar biosynthesis protein FlhB  34.56 
 
 
357 aa  192  1e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.736983 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2447  flagellar biosynthesis protein FlhB  35.26 
 
 
382 aa  192  1e-47  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0981  flagellar biosynthetic protein FlhB  33.98 
 
 
390 aa  191  1e-47  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0800953 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1862  flagellar biosynthesis protein FlhB  34.44 
 
 
383 aa  191  1e-47  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.90359  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1631  flagellar biosynthesis protein FlhB  32.34 
 
 
377 aa  191  2e-47  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3772  flagellar biosynthesis protein FlhB  35.23 
 
 
358 aa  190  2.9999999999999997e-47  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0655991  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2069  flagellar biosynthesis protein FlhB  34.97 
 
 
383 aa  190  2.9999999999999997e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00553621 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2074  flagellar biosynthesis protein FlhB  34.97 
 
 
383 aa  190  4e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000897295 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1208  flagellar biosynthesis protein FlhB  34.97 
 
 
383 aa  190  4e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3698  flagellar biosynthesis protein FlhB  37.92 
 
 
380 aa  189  4e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0239481 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0240  flagellar biosynthetic protein FlhB  32.38 
 
 
353 aa  189  4e-47  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.760621  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0484  flagellar biosynthetic protein FlhB  32.76 
 
 
392 aa  189  5e-47  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0127914  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1552  flagellar biosynthesis protein FlhB  34.43 
 
 
379 aa  189  5e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00640595  normal  0.373184 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1397  flagellar biosynthetic protein FlhB  33.52 
 
 
363 aa  189  5e-47  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1515  flagellar biosynthesis protein FlhB  30.79 
 
 
376 aa  189  5.999999999999999e-47  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.813027  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5640  type III secretion system protein HrcU  34.22 
 
 
352 aa  189  7e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.122414 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002828  flagellar biosynthesis protein FlhB  34.99 
 
 
376 aa  189  8e-47  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0703  flagellar biosynthetic protein FlhB  31.09 
 
 
354 aa  188  1e-46  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.635027  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45720  flagellar biosynthesis protein FlhB  34.54 
 
 
378 aa  188  1e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2284  flagellar biosynthesis protein FlhB  33.8 
 
 
377 aa  188  1e-46  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.562852  normal  0.66393 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2295  flagellar biosynthesis protein FlhB  32.97 
 
 
376 aa  188  2e-46  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2563  flagellar biosynthesis protein FlhB  34.05 
 
 
376 aa  187  2e-46  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.757068  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2129  flagellar biosynthesis protein FlhB  34.7 
 
 
383 aa  187  2e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000192021 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5857  type III secretion system protein HrcU  33.92 
 
 
352 aa  187  2e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1374  flagellar biosynthesis protein FlhB  32.24 
 
 
377 aa  187  2e-46  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1519  flagellar biosynthesis protein FlhB  34.28 
 
 
383 aa  187  3e-46  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2604  flagellar biosynthesis protein FlhB  33.62 
 
 
383 aa  187  3e-46  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1331  flagellar biosynthesis protein FlhB  34.7 
 
 
383 aa  187  3e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.384239  hitchhiker  0.0000000000516194 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3053  flagellar biosynthesis protein FlhB  31.77 
 
 
377 aa  186  4e-46  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0535555 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03148  flagellar biosynthesis protein FlhB  32.4 
 
 
376 aa  186  7e-46  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3878  flagellar biosynthesis protein FlhB  33.98 
 
 
378 aa  186  7e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1379  flagellar biosynthesis protein FlhB  31.16 
 
 
377 aa  185  8e-46  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.294814 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3217  flagellar biosynthesis protein FlhB  36.19 
 
 
354 aa  185  9e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.447718 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3431  flagellar biosynthetic protein FlhB  33.42 
 
 
378 aa  185  1.0000000000000001e-45  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1355  flagellar biosynthesis protein FlhB  34.33 
 
 
376 aa  184  1.0000000000000001e-45  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.424725  normal  0.225798 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1450  flagellar biosynthesis protein FlhB  32.5 
 
 
376 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0849  flagellar biosynthetic protein FlhB  34.07 
 
 
377 aa  184  2.0000000000000003e-45  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3055  flagellar biosynthesis protein FlhB  32.5 
 
 
376 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.247333 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2129  type III secretion exporter  35.47 
 
 
335 aa  184  3e-45  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0130  flagellar biosynthesis protein FlhB  37.7 
 
 
406 aa  184  3e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.561684  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1295  flagellar biosynthesis protein FlhB  34.06 
 
 
376 aa  183  4.0000000000000006e-45  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.388157  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1362  flagellar biosynthesis protein FlhB  34.06 
 
 
376 aa  183  4.0000000000000006e-45  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.873498 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1702  flagellar biosynthesis protein FlhB  33.06 
 
 
376 aa  183  5.0000000000000004e-45  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0112  flagellar biosynthesis protein FlhB  34.44 
 
 
356 aa  182  5.0000000000000004e-45  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.157288  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4222  flagellar biosynthesis protein FlhB  33.24 
 
 
356 aa  183  5.0000000000000004e-45  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3804  flagellar biosynthesis protein FlhB  35.83 
 
 
403 aa  183  5.0000000000000004e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0246  flagellar biosynthesis protein FlhB  33.52 
 
 
360 aa  182  6e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.623088  normal  0.4035 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1171  flagellar biosynthetic protein FlhB  34.07 
 
 
383 aa  182  7e-45  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.127204 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0121  flagellar biosynthesis protein FlhB  34.44 
 
 
356 aa  182  9.000000000000001e-45  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>