More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr7_1362 on replicon NC_008322
Organism: Shewanella sp. MR-7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_3215  flagellar biosynthesis protein FlhB  97.34 
 
 		 376 aa  734    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3055  flagellar biosynthesis protein FlhB  89.1 
 
 		 376 aa  682    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.247333 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2913  flagellar biosynthesis protein FlhB  89.1 
 
 		 376 aa  682    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.847075  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2923  flagellar biosynthesis protein FlhB  89.1 
 
 		 376 aa  683    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1295  flagellar biosynthesis protein FlhB  100 
 
 		 376 aa  771    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.388157  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1362  flagellar biosynthesis protein FlhB  100 
 
 		 376 aa  771    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.873498 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1355  flagellar biosynthesis protein FlhB  99.2 
 
 		 376 aa  766    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.424725  normal  0.225798 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2563  flagellar biosynthesis protein FlhB  93.09 
 
 		 376 aa  706    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.757068  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1450  flagellar biosynthesis protein FlhB  89.36 
 
 		 376 aa  684    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1195  flagellar biosynthesis protein FlhB  76.13 
 
 		 377 aa  624  1e-177  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1631  flagellar biosynthesis protein FlhB  76.39 
 
 		 377 aa  615  1e-175  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1339  flagellar biosynthesis protein FlhB  75.07 
 
 		 377 aa  613  9.999999999999999e-175  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1374  flagellar biosynthesis protein FlhB  74.54 
 
 		 377 aa  611  9.999999999999999e-175  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3053  flagellar biosynthesis protein FlhB  74.54 
 
 		 377 aa  607  9.999999999999999e-173  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0535555 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1379  flagellar biosynthesis protein FlhB  73.19 
 
 		 377 aa  594  1e-169  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.294814 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2284  flagellar biosynthesis protein FlhB  74.01 
 
 		 377 aa  555  1e-157  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.562852  normal  0.66393 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2295  flagellar biosynthesis protein FlhB  54.13 
 
 		 376 aa  438  9.999999999999999e-123  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1515  flagellar biosynthesis protein FlhB  51.86 
 
 		 376 aa  429  1e-119  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.813027  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002828  flagellar biosynthesis protein FlhB  55.32 
 
 		 376 aa  426  1e-118  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03148  flagellar biosynthesis protein FlhB  55.32 
 
 		 376 aa  417  9.999999999999999e-116  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1702  flagellar biosynthesis protein FlhB  54.79 
 
 		 376 aa  412  1e-114  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1981  flagellar biosynthesis protein FlhB  50.4 
 
 		 378 aa  392  1e-108  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.764273  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3034  flagellar biosynthetic protein FlhB  48.25 
 
 		 374 aa  390  1e-107  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2809  flagellar biosynthesis protein FlhB  47.75 
 
 		 378 aa  369  1e-101  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.326255  normal  0.0759815 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02874  flagellar biosynthesis protein  46.36 
 
 		 374 aa  365  1e-100  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3878  flagellar biosynthesis protein FlhB  46.95 
 
 		 378 aa  362  4e-99  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1334  flagellar biosynthetic protein FlhB  49.46 
 
 		 384 aa  362  7.0000000000000005e-99  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1552  flagellar biosynthesis protein FlhB  44.83 
 
 		 379 aa  359  4e-98  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00640595  normal  0.373184 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45720  flagellar biosynthesis protein FlhB  46.68 
 
 		 378 aa  357  2.9999999999999997e-97  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2169  flagellar biosynthesis protein FlhB  49.47 
 
 		 376 aa  353  2e-96  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0981  flagellar biosynthetic protein FlhB  47.75 
 
 		 390 aa  349  4e-95  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0800953 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3678  flagellar biosynthesis protein FlhB  47.35 
 
 		 380 aa  345  6e-94  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.10386  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3431  flagellar biosynthetic protein FlhB  45.09 
 
 		 378 aa  344  2e-93  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4352  flagellar biosynthesis protein FlhB  47.62 
 
 		 380 aa  342  8e-93  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.546846  normal  0.108757 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2159  flagellar biosynthetic protein FlhB  46.42 
 
 		 377 aa  337  9.999999999999999e-92  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3914  flagellar biosynthesis protein FlhB  46.3 
 
 		 380 aa  336  3.9999999999999995e-91  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1975  flagellar biosynthetic protein FlhB  44.15 
 
 		 378 aa  335  1e-90  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.185057  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1514  flagellar biosynthesis protein FlhB  46.56 
 
 		 380 aa  331  2e-89  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.819465  normal  0.151941 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1171  flagellar biosynthetic protein FlhB  45.45 
 
 		 383 aa  329  5.0000000000000004e-89  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.127204 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0743  flagellar biosynthetic protein FlhB  45.62 
 
 		 381 aa  325  6e-88  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3441  flagellar biosynthesis protein FlhB  43.35 
 
 		 378 aa  325  1e-87  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.456344 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1750  flagellar biosynthesis protein FlhB  44.24 
 
 		 382 aa  321  9.999999999999999e-87  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1944  flagellar biosynthetic protein FlhB  42.26 
 
 		 381 aa  320  1.9999999999999998e-86  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1750  flagellar biosynthesis protein FlhB  43.97 
 
 		 382 aa  319  5e-86  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5615  flagellar biosynthesis protein FlhB  43.85 
 
 		 380 aa  311  2e-83  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.891713  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1245  flagellar biosynthetic protein FlhB  43.47 
 
 		 390 aa  308  9e-83  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.215857  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3698  flagellar biosynthesis protein FlhB  42.67 
 
 		 380 aa  308  1.0000000000000001e-82  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0239481 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0713  flagellar biosynthetic protein FlhB  43.88 
 
 		 379 aa  305  8.000000000000001e-82  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.31011  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1547  flagellar biosynthesis protein FlhB  42.25 
 
 		 383 aa  304  2.0000000000000002e-81  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0481  flagellar biosynthetic protein FlhB  46.17 
 
 		 391 aa  303  3.0000000000000004e-81  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1862  flagellar biosynthesis protein FlhB  42.78 
 
 		 383 aa  301  1e-80  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.90359  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2604  flagellar biosynthesis protein FlhB  41.71 
 
 		 383 aa  299  4e-80  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2016  flagellar biosynthetic protein FlhB  43.47 
 
 		 387 aa  298  1e-79  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1208  flagellar biosynthesis protein FlhB  40.91 
 
 		 383 aa  295  7e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2074  flagellar biosynthesis protein FlhB  40.91 
 
 		 383 aa  295  7e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000897295 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2334  flagellar biosynthesis protein FlhB  42.25 
 
 		 386 aa  294  2e-78  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.178036  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2069  flagellar biosynthesis protein FlhB  40.91 
 
 		 383 aa  293  2e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00553621 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2129  flagellar biosynthesis protein FlhB  40.64 
 
 		 383 aa  293  4e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000192021 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1331  flagellar biosynthesis protein FlhB  40.64 
 
 		 383 aa  293  4e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.384239  hitchhiker  0.0000000000516194 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3370  flagellar biosynthesis protein FlhB  41.44 
 
 		 398 aa  292  7e-78  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00184569  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2938  flagellar biosynthesis protein FlhB  43.05 
 
 		 380 aa  291  2e-77  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0481554  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2432  flagellar biosynthesis protein FlhB  41.71 
 
 		 386 aa  291  2e-77  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1519  flagellar biosynthesis protein FlhB  42.25 
 
 		 383 aa  289  6e-77  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1394  flagellar biosynthetic FlhB transmembrane protein  39.52 
 
 		 387 aa  288  7e-77  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00896638  normal  0.765457 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1866  flagellar biosynthesis protein FlhB  39.34 
 
 		 376 aa  288  1e-76  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.965675  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3804  flagellar biosynthesis protein FlhB  39.95 
 
 		 403 aa  285  8e-76  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4066  flagellar biosynthetic protein FlhB  39.79 
 
 		 387 aa  285  1.0000000000000001e-75  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2977  flagellar biosynthesis protein FlhB  40.21 
 
 		 398 aa  285  1.0000000000000001e-75  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4178  flagellar biosynthetic protein FlhB  39.79 
 
 		 387 aa  285  1.0000000000000001e-75  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.232408  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0130  flagellar biosynthesis protein FlhB  39.04 
 
 		 406 aa  283  3.0000000000000004e-75  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.561684  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2840  flagellar biosynthesis protein FlhB  41.18 
 
 		 399 aa  282  8.000000000000001e-75  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.151701  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0267  flagellar biosynthesis protein FlhB  41.18 
 
 		 399 aa  282  8.000000000000001e-75  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.110201  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0249  flagellar biosynthesis protein FlhB  41.18 
 
 		 399 aa  280  2e-74  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.190542  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2447  flagellar biosynthesis protein FlhB  39.04 
 
 		 382 aa  280  3e-74  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4140  flagellar biosynthetic protein FlhB  39.63 
 
 		 382 aa  277  2e-73  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27920  flagellar biosynthetic protein  39.95 
 
 		 402 aa  277  2e-73  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0219879  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0086  flagellar biosynthetic protein FlhB  37.33 
 
 		 376 aa  277  2e-73  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.293777 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04964  flagellar biosynthesis pathway, component FlhB  39.36 
 
 		 375 aa  275  1.0000000000000001e-72  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0181  flagellar biosynthesis protein FlhB  40.91 
 
 		 399 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.824859  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0175  flagellar biosynthesis protein FlhB  41.18 
 
 		 399 aa  273  4.0000000000000004e-72  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.212371 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0194  flagellar biosynthesis protein FlhB  40.64 
 
 		 399 aa  272  6e-72  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3596  flagellar biosynthetic protein FlhB  41.3 
 
 		 374 aa  272  7e-72  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.189893  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0092  flagellar biosynthetic protein FlhB  37.23 
 
 		 376 aa  272  9e-72  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1309  flagellar biosynthesis protein FlhB  38.31 
 
 		 392 aa  271  1e-71  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.791915  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3170  flagellar biosynthesis protein FlhB  41.71 
 
 		 405 aa  271  1e-71  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001177  flagellar biosynthesis protein FlhB  38.83 
 
 		 375 aa  271  1e-71  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3128  flagellar biosynthesis protein FlhB  41.71 
 
 		 401 aa  271  2e-71  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3925  flagellar biosynthesis protein FlhB  41.71 
 
 		 401 aa  270  2e-71  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.807758  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1695  flagellar biosynthesis protein FlhB  41.71 
 
 		 401 aa  271  2e-71  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3423  flagellar biosynthesis protein FlhB  41.71 
 
 		 401 aa  271  2e-71  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3844  flagellar biosynthesis protein FlhB  41.71 
 
 		 401 aa  270  2.9999999999999997e-71  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2847  flagellar biosynthesis protein FlhB  41.44 
 
 		 405 aa  268  8e-71  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0063  flagellar biosynthesis protein FlhB  41.18 
 
 		 405 aa  268  8.999999999999999e-71  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01851  flagellar biosynthesis protein B  41.18 
 
 		 382 aa  262  6e-69  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1975  flagellar biosynthesis protein FlhB  41.18 
 
 		 382 aa  262  6e-69  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01840  hypothetical protein  41.18 
 
 		 382 aa  262  6e-69  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3484  flagellar biosynthetic protein FlhB  37.5 
 
 		 376 aa  262  6e-69  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.994028  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1752  flagellar biosynthesis protein FlhB  41.18 
 
 		 382 aa  262  6e-69  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1760  flagellar biosynthetic protein FlhB  41.18 
 
 		 382 aa  262  6.999999999999999e-69  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.304563  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2112  flagellar biosynthesis protein FlhB  41.18 
 
 		 382 aa  262  6.999999999999999e-69  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>