More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_3678 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002947  PP_4352  flagellar biosynthesis protein FlhB  91.32 
 
 
380 aa  671    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.546846  normal  0.108757 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1514  flagellar biosynthesis protein FlhB  93.95 
 
 
380 aa  666    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.819465  normal  0.151941 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3914  flagellar biosynthesis protein FlhB  92.63 
 
 
380 aa  683    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3678  flagellar biosynthesis protein FlhB  100 
 
 
380 aa  766    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.10386  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1552  flagellar biosynthesis protein FlhB  72.37 
 
 
379 aa  580  1e-164  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00640595  normal  0.373184 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2809  flagellar biosynthesis protein FlhB  71.05 
 
 
378 aa  534  1e-150  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.326255  normal  0.0759815 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1975  flagellar biosynthetic protein FlhB  66.32 
 
 
378 aa  525  1e-148  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.185057  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3441  flagellar biosynthesis protein FlhB  66.84 
 
 
378 aa  526  1e-148  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.456344 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3878  flagellar biosynthesis protein FlhB  68.07 
 
 
378 aa  527  1e-148  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45720  flagellar biosynthesis protein FlhB  68.34 
 
 
378 aa  525  1e-148  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1981  flagellar biosynthesis protein FlhB  53.85 
 
 
378 aa  416  9.999999999999999e-116  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.764273  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2169  flagellar biosynthesis protein FlhB  53.05 
 
 
376 aa  372  1e-102  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1195  flagellar biosynthesis protein FlhB  49.21 
 
 
377 aa  373  1e-102  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1374  flagellar biosynthesis protein FlhB  48.68 
 
 
377 aa  369  1e-101  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1334  flagellar biosynthetic protein FlhB  50.4 
 
 
384 aa  369  1e-101  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3053  flagellar biosynthesis protein FlhB  47.35 
 
 
377 aa  366  1e-100  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0535555 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1631  flagellar biosynthesis protein FlhB  48.68 
 
 
377 aa  363  2e-99  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1379  flagellar biosynthesis protein FlhB  47.09 
 
 
377 aa  362  4e-99  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.294814 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2295  flagellar biosynthesis protein FlhB  48.15 
 
 
376 aa  361  1e-98  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1355  flagellar biosynthesis protein FlhB  47.67 
 
 
376 aa  358  7e-98  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.424725  normal  0.225798 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1750  flagellar biosynthesis protein FlhB  46.58 
 
 
382 aa  358  9e-98  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1750  flagellar biosynthesis protein FlhB  46.32 
 
 
382 aa  357  9.999999999999999e-98  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1702  flagellar biosynthesis protein FlhB  48.81 
 
 
376 aa  357  1.9999999999999998e-97  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1295  flagellar biosynthesis protein FlhB  47.4 
 
 
376 aa  357  1.9999999999999998e-97  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.388157  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1362  flagellar biosynthesis protein FlhB  47.4 
 
 
376 aa  357  1.9999999999999998e-97  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.873498 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2563  flagellar biosynthesis protein FlhB  48.22 
 
 
376 aa  355  5e-97  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.757068  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1450  flagellar biosynthesis protein FlhB  47.53 
 
 
376 aa  356  5e-97  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3215  flagellar biosynthesis protein FlhB  46.98 
 
 
376 aa  355  1e-96  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3055  flagellar biosynthesis protein FlhB  47.25 
 
 
376 aa  354  1e-96  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.247333 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002828  flagellar biosynthesis protein FlhB  48.68 
 
 
376 aa  355  1e-96  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1339  flagellar biosynthesis protein FlhB  47.09 
 
 
377 aa  353  2e-96  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2913  flagellar biosynthesis protein FlhB  47.25 
 
 
376 aa  353  2.9999999999999997e-96  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.847075  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2923  flagellar biosynthesis protein FlhB  46.98 
 
 
376 aa  351  8.999999999999999e-96  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03148  flagellar biosynthesis protein FlhB  48.95 
 
 
376 aa  351  1e-95  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2284  flagellar biosynthesis protein FlhB  48.54 
 
 
377 aa  349  5e-95  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.562852  normal  0.66393 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1515  flagellar biosynthesis protein FlhB  45.79 
 
 
376 aa  348  1e-94  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.813027  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0981  flagellar biosynthetic protein FlhB  48.51 
 
 
390 aa  347  2e-94  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0800953 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3034  flagellar biosynthetic protein FlhB  46.4 
 
 
374 aa  345  8e-94  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0743  flagellar biosynthetic protein FlhB  46.32 
 
 
381 aa  340  2.9999999999999998e-92  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1171  flagellar biosynthetic protein FlhB  46.67 
 
 
383 aa  339  5e-92  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.127204 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02874  flagellar biosynthesis protein  47.12 
 
 
374 aa  338  7e-92  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3431  flagellar biosynthetic protein FlhB  45.91 
 
 
378 aa  329  6e-89  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2159  flagellar biosynthetic protein FlhB  46.58 
 
 
377 aa  325  9e-88  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0713  flagellar biosynthetic protein FlhB  46.15 
 
 
379 aa  322  6e-87  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.31011  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1547  flagellar biosynthesis protein FlhB  45.04 
 
 
383 aa  319  5e-86  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0092  flagellar biosynthetic protein FlhB  42.67 
 
 
376 aa  315  9.999999999999999e-85  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1944  flagellar biosynthetic protein FlhB  45.79 
 
 
381 aa  314  9.999999999999999e-85  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3804  flagellar biosynthesis protein FlhB  44.21 
 
 
403 aa  313  1.9999999999999998e-84  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0086  flagellar biosynthetic protein FlhB  41.6 
 
 
376 aa  311  1e-83  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.293777 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2069  flagellar biosynthesis protein FlhB  46.4 
 
 
383 aa  310  4e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00553621 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0130  flagellar biosynthesis protein FlhB  43.42 
 
 
406 aa  309  5e-83  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.561684  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2074  flagellar biosynthesis protein FlhB  45.99 
 
 
383 aa  308  6.999999999999999e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000897295 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1208  flagellar biosynthesis protein FlhB  45.99 
 
 
383 aa  308  6.999999999999999e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2016  flagellar biosynthetic protein FlhB  44.44 
 
 
387 aa  308  1.0000000000000001e-82  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1331  flagellar biosynthesis protein FlhB  46.13 
 
 
383 aa  307  2.0000000000000002e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.384239  hitchhiker  0.0000000000516194 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1245  flagellar biosynthetic protein FlhB  44.95 
 
 
390 aa  307  2.0000000000000002e-82  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.215857  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3370  flagellar biosynthesis protein FlhB  43.95 
 
 
398 aa  307  2.0000000000000002e-82  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00184569  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2129  flagellar biosynthesis protein FlhB  46.13 
 
 
383 aa  307  2.0000000000000002e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000192021 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1519  flagellar biosynthesis protein FlhB  43.55 
 
 
383 aa  299  5e-80  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2938  flagellar biosynthesis protein FlhB  45.31 
 
 
380 aa  296  4e-79  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0481554  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2840  flagellar biosynthesis protein FlhB  43.16 
 
 
399 aa  294  2e-78  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.151701  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0267  flagellar biosynthesis protein FlhB  43.16 
 
 
399 aa  294  2e-78  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.110201  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0249  flagellar biosynthesis protein FlhB  43.16 
 
 
399 aa  293  3e-78  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.190542  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1309  flagellar biosynthesis protein FlhB  43.47 
 
 
392 aa  293  3e-78  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.791915  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27920  flagellar biosynthetic protein  44.24 
 
 
402 aa  290  2e-77  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0219879  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3698  flagellar biosynthesis protein FlhB  41.76 
 
 
380 aa  289  5.0000000000000004e-77  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0239481 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3667  flagellar biosynthetic protein FlhB  41.13 
 
 
376 aa  289  6e-77  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2447  flagellar biosynthesis protein FlhB  41.62 
 
 
382 aa  288  2e-76  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3484  flagellar biosynthetic protein FlhB  39.58 
 
 
376 aa  286  2.9999999999999996e-76  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.994028  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0481  flagellar biosynthetic protein FlhB  43.48 
 
 
391 aa  286  5e-76  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3987  flagellar biosynthetic protein FlhB  39.52 
 
 
376 aa  285  8e-76  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0181  flagellar biosynthesis protein FlhB  42.52 
 
 
399 aa  282  7.000000000000001e-75  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.824859  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2604  flagellar biosynthesis protein FlhB  42.28 
 
 
383 aa  282  8.000000000000001e-75  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2977  flagellar biosynthesis protein FlhB  44.86 
 
 
398 aa  281  1e-74  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4178  flagellar biosynthetic protein FlhB  43.16 
 
 
387 aa  281  2e-74  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.232408  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4066  flagellar biosynthetic protein FlhB  43.16 
 
 
387 aa  281  2e-74  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0175  flagellar biosynthesis protein FlhB  42.74 
 
 
399 aa  280  3e-74  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.212371 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0194  flagellar biosynthesis protein FlhB  42.26 
 
 
399 aa  280  3e-74  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3925  flagellar biosynthesis protein FlhB  42.93 
 
 
401 aa  279  5e-74  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.807758  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1862  flagellar biosynthesis protein FlhB  42.09 
 
 
383 aa  279  5e-74  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.90359  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1695  flagellar biosynthesis protein FlhB  43.43 
 
 
401 aa  279  6e-74  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3128  flagellar biosynthesis protein FlhB  43.43 
 
 
401 aa  279  6e-74  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3423  flagellar biosynthesis protein FlhB  43.43 
 
 
401 aa  279  6e-74  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2847  flagellar biosynthesis protein FlhB  42.59 
 
 
405 aa  278  8e-74  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5615  flagellar biosynthesis protein FlhB  41.49 
 
 
380 aa  278  9e-74  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.891713  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0063  flagellar biosynthesis protein FlhB  42.82 
 
 
405 aa  278  9e-74  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3844  flagellar biosynthesis protein FlhB  43.16 
 
 
401 aa  278  1e-73  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1394  flagellar biosynthetic FlhB transmembrane protein  42.11 
 
 
387 aa  277  2e-73  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00896638  normal  0.765457 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3170  flagellar biosynthesis protein FlhB  42.33 
 
 
405 aa  276  5e-73  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2334  flagellar biosynthesis protein FlhB  41.49 
 
 
386 aa  272  6e-72  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.178036  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2617  flagellar biosynthesis protein FlhB  44.35 
 
 
382 aa  271  1e-71  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000137265 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01851  flagellar biosynthesis protein B  44.35 
 
 
382 aa  271  2e-71  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1760  flagellar biosynthetic protein FlhB  44.35 
 
 
382 aa  271  2e-71  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.304563  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1307  flagellar biosynthesis protein FlhB  44.35 
 
 
382 aa  271  2e-71  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0569687 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2112  flagellar biosynthesis protein FlhB  44.35 
 
 
382 aa  271  2e-71  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1752  flagellar biosynthesis protein FlhB  44.35 
 
 
382 aa  271  2e-71  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2964  flagellar biosynthesis protein FlhB  42.97 
 
 
411 aa  271  2e-71  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00775742 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1975  flagellar biosynthesis protein FlhB  44.35 
 
 
382 aa  271  2e-71  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01840  hypothetical protein  44.35 
 
 
382 aa  271  2e-71  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1866  flagellar biosynthesis protein FlhB  40.38 
 
 
376 aa  270  4e-71  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.965675  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>