More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_2008 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013174  Jden_2008  type III secretion exporter  100 
 
 		 380 aa  768    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31030  flagellar biosynthesis pathway, component FlhB  61.13 
 
 		 422 aa  413  1e-114  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2973  type III secretion exporter  55.52 
 
 		 359 aa  325  9e-88  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1669  type III secretion exporter  45.4 
 
 		 360 aa  299  5e-80  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.058762  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2328  type III secretion exporter  42.05 
 
 		 363 aa  295  7e-79  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.645604  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0959  type III secretion exporter  41.55 
 
 		 377 aa  283  3.0000000000000004e-75  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0740  type III secretion exporter  43.06 
 
 		 381 aa  259  5.0000000000000005e-68  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0860  type III secretion exporter  40.56 
 
 		 391 aa  236  6e-61  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.311747  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3370  flagellar biosynthesis protein FlhB  37.79 
 
 		 398 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00184569  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3804  flagellar biosynthesis protein FlhB  36.55 
 
 		 403 aa  207  3e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0130  flagellar biosynthesis protein FlhB  36.29 
 
 		 406 aa  206  7e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.561684  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1930  flagellar biosynthetic protein FlhB  35.96 
 
 		 363 aa  203  3e-51  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.922236  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1245  flagellar biosynthetic protein FlhB  35.64 
 
 		 390 aa  202  6e-51  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.215857  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0240  flagellar biosynthetic protein FlhB  37.25 
 
 		 353 aa  201  9.999999999999999e-51  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.760621  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2840  flagellar biosynthesis protein FlhB  38.26 
 
 		 399 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.151701  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0267  flagellar biosynthesis protein FlhB  38.26 
 
 		 399 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.110201  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0249  flagellar biosynthesis protein FlhB  38.26 
 
 		 399 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.190542  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0011  flagellar biosynthetic protein FlhB  35.11 
 
 		 355 aa  200  3e-50  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0194  flagellar biosynthesis protein FlhB  36.98 
 
 		 399 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27920  flagellar biosynthetic protein  35.75 
 
 		 402 aa  198  1.0000000000000001e-49  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0219879  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0181  flagellar biosynthesis protein FlhB  37.2 
 
 		 399 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.824859  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0380  flagellar biosynthesis protein FlhB  34.21 
 
 		 362 aa  197  2.0000000000000003e-49  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.441846  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1547  flagellar biosynthesis protein FlhB  34.48 
 
 		 383 aa  196  5.000000000000001e-49  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3053  flagellar biosynthesis protein FlhB  36.69 
 
 		 377 aa  196  5.000000000000001e-49  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0535555 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1623  flagellar biosynthesis protein FlhB  34.21 
 
 		 362 aa  196  6e-49  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0357  flagellar biosynthesis protein FlhB  33.63 
 
 		 368 aa  196  6e-49  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3431  flagellar biosynthetic protein FlhB  33.42 
 
 		 378 aa  196  8.000000000000001e-49  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1334  flagellar biosynthetic protein FlhB  36.46 
 
 		 384 aa  195  9e-49  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2604  flagellar biosynthesis protein FlhB  36.19 
 
 		 383 aa  195  1e-48  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1981  flagellar biosynthesis protein FlhB  37.08 
 
 		 378 aa  195  1e-48  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.764273  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1750  flagellar biosynthesis protein FlhB  34.07 
 
 		 382 aa  194  2e-48  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1750  flagellar biosynthesis protein FlhB  34.07 
 
 		 382 aa  194  2e-48  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1412  flagellar biosynthetic protein FlhB  34.36 
 
 		 363 aa  194  2e-48  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.342211  normal  0.890154 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2016  flagellar biosynthetic protein FlhB  35.51 
 
 		 387 aa  194  2e-48  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3698  flagellar biosynthesis protein FlhB  37.24 
 
 		 380 aa  194  2e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0239481 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1330  flagellar biosynthesis protein FlhB  36.78 
 
 		 358 aa  194  3e-48  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1631  flagellar biosynthesis protein FlhB  35.64 
 
 		 377 aa  193  4e-48  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1862  flagellar biosynthesis protein FlhB  36.93 
 
 		 383 aa  192  6e-48  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.90359  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0669  flagellar biosynthesis protein FlhB  36.16 
 
 		 350 aa  192  1e-47  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0757109  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2334  flagellar biosynthesis protein FlhB  34.45 
 
 		 386 aa  191  2e-47  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.178036  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3128  flagellar biosynthesis protein FlhB  37.8 
 
 		 401 aa  191  2e-47  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1309  flagellar biosynthesis protein FlhB  33.42 
 
 		 392 aa  191  2e-47  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.791915  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1695  flagellar biosynthesis protein FlhB  37.8 
 
 		 401 aa  191  2e-47  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3423  flagellar biosynthesis protein FlhB  37.8 
 
 		 401 aa  191  2e-47  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1515  flagellar biosynthesis protein FlhB  33.33 
 
 		 376 aa  190  2.9999999999999997e-47  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.813027  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2432  flagellar biosynthesis protein FlhB  34.19 
 
 		 386 aa  190  4e-47  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3925  flagellar biosynthesis protein FlhB  37.8 
 
 		 401 aa  190  4e-47  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.807758  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2154  flagellar biosynthetic protein FlhB  32.58 
 
 		 366 aa  190  4e-47  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0063  flagellar biosynthesis protein FlhB  37.8 
 
 		 405 aa  189  5e-47  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0175  flagellar biosynthesis protein FlhB  35.68 
 
 		 399 aa  189  5e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.212371 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1163  flagellar biosynthesis protein FlhB  35.04 
 
 		 351 aa  189  5.999999999999999e-47  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3844  flagellar biosynthesis protein FlhB  37.53 
 
 		 401 aa  189  7e-47  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1195  flagellar biosynthesis protein FlhB  35.8 
 
 		 377 aa  189  8e-47  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4066  flagellar biosynthetic protein FlhB  33.25 
 
 		 387 aa  188  1e-46  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4178  flagellar biosynthetic protein FlhB  33.25 
 
 		 387 aa  188  1e-46  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.232408  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2847  flagellar biosynthesis protein FlhB  37.53 
 
 		 405 aa  189  1e-46  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1379  flagellar biosynthesis protein FlhB  36.07 
 
 		 377 aa  188  1e-46  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.294814 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5615  flagellar biosynthesis protein FlhB  34.04 
 
 		 380 aa  187  2e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.891713  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1552  flagellar biosynthesis protein FlhB  34.74 
 
 		 379 aa  186  4e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00640595  normal  0.373184 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2393  flagellar biosynthetic protein FlhB  32.86 
 
 		 354 aa  186  5e-46  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1944  flagellar biosynthetic protein FlhB  32.29 
 
 		 381 aa  186  5e-46  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2938  flagellar biosynthesis protein FlhB  34.96 
 
 		 380 aa  186  6e-46  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0481554  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2169  flagellar biosynthesis protein FlhB  34.14 
 
 		 376 aa  186  6e-46  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0981  flagellar biosynthetic protein FlhB  33.77 
 
 		 390 aa  186  6e-46  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0800953 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16690  flagellar biosynthetic protein FlhB  32.47 
 
 		 356 aa  186  8e-46  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3170  flagellar biosynthesis protein FlhB  37 
 
 		 405 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0999  flagellar biosynthesis protein FlhB  34.38 
 
 		 357 aa  184  2.0000000000000003e-45  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1374  flagellar biosynthesis protein FlhB  35.13 
 
 		 377 aa  184  3e-45  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002828  flagellar biosynthesis protein FlhB  34.37 
 
 		 376 aa  183  4.0000000000000006e-45  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2964  flagellar biosynthesis protein FlhB  36.19 
 
 		 411 aa  183  5.0000000000000004e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00775742 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1394  flagellar biosynthetic FlhB transmembrane protein  33.76 
 
 		 387 aa  182  7e-45  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00896638  normal  0.765457 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2295  flagellar biosynthesis protein FlhB  32.1 
 
 		 376 aa  182  8.000000000000001e-45  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0713  flagellar biosynthetic protein FlhB  34.29 
 
 		 379 aa  182  1e-44  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.31011  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0342  flagellar biosynthesis protein FlhB  34.67 
 
 		 357 aa  181  2e-44  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00837822  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1208  flagellar biosynthesis protein FlhB  32.72 
 
 		 383 aa  180  2.9999999999999997e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2074  flagellar biosynthesis protein FlhB  32.72 
 
 		 383 aa  180  2.9999999999999997e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000897295 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4406  flagellar biosynthesis protein FlhB  34.64 
 
 		 357 aa  180  2.9999999999999997e-44  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.202983  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1331  flagellar biosynthesis protein FlhB  32.72 
 
 		 383 aa  180  4e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.384239  hitchhiker  0.0000000000516194 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2069  flagellar biosynthesis protein FlhB  32.72 
 
 		 383 aa  180  4e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00553621 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2129  flagellar biosynthesis protein FlhB  32.72 
 
 		 383 aa  180  4e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000192021 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03148  flagellar biosynthesis protein FlhB  33.8 
 
 		 376 aa  179  4.999999999999999e-44  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02874  flagellar biosynthesis protein  35.29 
 
 		 374 aa  180  4.999999999999999e-44  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2808  flagellar biosynthesis protein FlhB  34.97 
 
 		 360 aa  179  7e-44  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3772  flagellar biosynthesis protein FlhB  35.33 
 
 		 358 aa  179  8e-44  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0655991  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4135  flagellar biosynthetic protein FlhB  33.52 
 
 		 350 aa  179  9e-44  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0846766  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1522  flagellar biosynthesis protein FlhB  34.76 
 
 		 358 aa  178  1e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.23127  normal  0.258787 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1171  flagellar biosynthetic protein FlhB  32.89 
 
 		 383 aa  178  1e-43  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.127204 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3878  flagellar biosynthesis protein FlhB  35.38 
 
 		 378 aa  177  2e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0332  flagellar biosynthesis protein FlhB  32.76 
 
 		 359 aa  177  2e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1137  flagellar biosynthesis protein FlhB  33.8 
 
 		 359 aa  177  3e-43  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45720  flagellar biosynthesis protein FlhB  34.09 
 
 		 378 aa  177  3e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1339  flagellar biosynthesis protein FlhB  35.45 
 
 		 377 aa  177  4e-43  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0658  flagellar biosynthetic protein FlhB  32.58 
 
 		 353 aa  176  5e-43  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.622115  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1866  flagellar biosynthesis protein FlhB  34.25 
 
 		 376 aa  176  6e-43  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.965675  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5492  flagellar biosynthesis protein FlhB  33.24 
 
 		 359 aa  176  7e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.14397  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1631  flagellar biosynthetic protein FlhB  33.92 
 
 		 350 aa  176  8e-43  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1384  flagellar biosynthesis protein FlhB  34.38 
 
 		 360 aa  176  9e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.696508  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0484  flagellar biosynthetic protein FlhB  33.98 
 
 		 392 aa  175  9.999999999999999e-43  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0127914  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3441  flagellar biosynthesis protein FlhB  32.78 
 
 		 378 aa  175  9.999999999999999e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.456344 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0379  flagellar biosynthesis protein FlhB  35.59 
 
 		 357 aa  175  9.999999999999999e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>