More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acel_0860 on replicon NC_008578
Organism: Acidothermus cellulolyticus 11B



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008578  Acel_0860  type III secretion exporter  100 
 
 
391 aa  763    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.311747  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2328  type III secretion exporter  46.99 
 
 
363 aa  323  2e-87  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.645604  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0740  type III secretion exporter  46.34 
 
 
381 aa  301  1e-80  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0959  type III secretion exporter  43.94 
 
 
377 aa  295  1e-78  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31030  flagellar biosynthesis pathway, component FlhB  42.07 
 
 
422 aa  286  5e-76  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1669  type III secretion exporter  43.7 
 
 
360 aa  283  4.0000000000000003e-75  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.058762  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2008  type III secretion exporter  40.56 
 
 
380 aa  255  8e-67  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2973  type III secretion exporter  43.54 
 
 
359 aa  254  2.0000000000000002e-66  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2069  flagellar biosynthesis protein FlhB  37.44 
 
 
383 aa  222  8e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00553621 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1412  flagellar biosynthetic protein FlhB  36.39 
 
 
363 aa  222  9e-57  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.342211  normal  0.890154 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1245  flagellar biosynthetic protein FlhB  37.8 
 
 
390 aa  221  9.999999999999999e-57  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.215857  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2074  flagellar biosynthesis protein FlhB  37.44 
 
 
383 aa  221  1.9999999999999999e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000897295 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1208  flagellar biosynthesis protein FlhB  37.44 
 
 
383 aa  221  1.9999999999999999e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2129  flagellar biosynthesis protein FlhB  37.44 
 
 
383 aa  221  1.9999999999999999e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000192021 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1331  flagellar biosynthesis protein FlhB  37.44 
 
 
383 aa  220  3e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.384239  hitchhiker  0.0000000000516194 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1334  flagellar biosynthetic protein FlhB  42.45 
 
 
384 aa  218  2e-55  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1195  flagellar biosynthesis protein FlhB  37.26 
 
 
377 aa  216  5e-55  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1750  flagellar biosynthesis protein FlhB  37.43 
 
 
382 aa  216  5.9999999999999996e-55  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0484  flagellar biosynthetic protein FlhB  35.47 
 
 
392 aa  216  7e-55  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0127914  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1750  flagellar biosynthesis protein FlhB  37.43 
 
 
382 aa  215  9e-55  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1674  flagellar biosynthetic protein FlhB  35.2 
 
 
360 aa  214  9.999999999999999e-55  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0713  flagellar biosynthetic protein FlhB  38.36 
 
 
379 aa  213  2.9999999999999995e-54  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.31011  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2154  flagellar biosynthetic protein FlhB  33.33 
 
 
366 aa  212  1e-53  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1129  flagellar biosynthesis protein FlhB  36.83 
 
 
360 aa  211  1e-53  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1981  flagellar biosynthesis protein FlhB  37.67 
 
 
378 aa  212  1e-53  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.764273  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2447  flagellar biosynthesis protein FlhB  37.37 
 
 
382 aa  209  6e-53  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0981  flagellar biosynthetic protein FlhB  36.75 
 
 
390 aa  209  9e-53  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0800953 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1409  flagellar biosynthetic protein FlhB  37.36 
 
 
361 aa  208  1e-52  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0011  flagellar biosynthetic protein FlhB  36.67 
 
 
355 aa  208  1e-52  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0069  flagellar biosynthetic protein FlhB  37.71 
 
 
358 aa  207  2e-52  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1374  flagellar biosynthesis protein FlhB  36.07 
 
 
377 aa  206  6e-52  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1862  flagellar biosynthesis protein FlhB  35.86 
 
 
383 aa  206  7e-52  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.90359  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1379  flagellar biosynthesis protein FlhB  35.28 
 
 
377 aa  206  7e-52  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.294814 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2334  flagellar biosynthesis protein FlhB  36.07 
 
 
386 aa  206  8e-52  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.178036  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2393  flagellar biosynthetic protein FlhB  34.96 
 
 
354 aa  205  1e-51  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0357  flagellar biosynthesis protein FlhB  34.25 
 
 
368 aa  205  1e-51  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3053  flagellar biosynthesis protein FlhB  34.88 
 
 
377 aa  204  2e-51  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0535555 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0743  flagellar biosynthetic protein FlhB  34.89 
 
 
381 aa  204  3e-51  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1547  flagellar biosynthesis protein FlhB  35.05 
 
 
383 aa  204  3e-51  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0380  flagellar biosynthesis protein FlhB  33.7 
 
 
362 aa  203  4e-51  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.441846  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1330  flagellar biosynthesis protein FlhB  34.73 
 
 
358 aa  203  4e-51  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2696  flagellar biosynthetic protein FlhB  34.48 
 
 
373 aa  203  4e-51  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2432  flagellar biosynthesis protein FlhB  35.98 
 
 
386 aa  203  5e-51  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2604  flagellar biosynthesis protein FlhB  34.85 
 
 
383 aa  203  5e-51  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3370  flagellar biosynthesis protein FlhB  39.02 
 
 
398 aa  202  7e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00184569  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3804  flagellar biosynthesis protein FlhB  39.68 
 
 
403 aa  202  7e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0130  flagellar biosynthesis protein FlhB  38.77 
 
 
406 aa  202  8e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.561684  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1930  flagellar biosynthetic protein FlhB  35.91 
 
 
363 aa  201  9.999999999999999e-51  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.922236  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01851  flagellar biosynthesis protein B  38.81 
 
 
382 aa  201  1.9999999999999998e-50  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1760  flagellar biosynthetic protein FlhB  38.81 
 
 
382 aa  201  1.9999999999999998e-50  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.304563  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2032  flagellar biosynthetic protein FlhB  36.18 
 
 
381 aa  201  1.9999999999999998e-50  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.112007  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01840  hypothetical protein  38.81 
 
 
382 aa  201  1.9999999999999998e-50  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2617  flagellar biosynthesis protein FlhB  38.81 
 
 
382 aa  201  1.9999999999999998e-50  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000137265 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0240  flagellar biosynthetic protein FlhB  34.55 
 
 
353 aa  201  1.9999999999999998e-50  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.760621  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1519  flagellar biosynthesis protein FlhB  35.39 
 
 
383 aa  201  1.9999999999999998e-50  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1752  flagellar biosynthesis protein FlhB  38.81 
 
 
382 aa  201  1.9999999999999998e-50  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1975  flagellar biosynthesis protein FlhB  38.81 
 
 
382 aa  201  1.9999999999999998e-50  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2112  flagellar biosynthesis protein FlhB  38.81 
 
 
382 aa  201  1.9999999999999998e-50  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1515  flagellar biosynthesis protein FlhB  32.98 
 
 
376 aa  200  3e-50  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.813027  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1307  flagellar biosynthesis protein FlhB  38.54 
 
 
382 aa  201  3e-50  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0569687 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1623  flagellar biosynthesis protein FlhB  33.88 
 
 
362 aa  200  3e-50  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1944  flagellar biosynthetic protein FlhB  35 
 
 
381 aa  199  5e-50  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16690  flagellar biosynthetic protein FlhB  34 
 
 
356 aa  199  5e-50  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1339  flagellar biosynthesis protein FlhB  34.88 
 
 
377 aa  199  7e-50  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5615  flagellar biosynthesis protein FlhB  37.37 
 
 
380 aa  199  1.0000000000000001e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.891713  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3698  flagellar biosynthesis protein FlhB  38.71 
 
 
380 aa  197  2.0000000000000003e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0239481 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1866  flagellar biosynthesis protein FlhB  37.22 
 
 
376 aa  197  4.0000000000000005e-49  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.965675  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2964  flagellar biosynthesis protein FlhB  41.13 
 
 
411 aa  196  5.000000000000001e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00775742 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0249  flagellar biosynthesis protein FlhB  39.57 
 
 
399 aa  196  5.000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.190542  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1631  flagellar biosynthesis protein FlhB  34.7 
 
 
377 aa  196  7e-49  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2840  flagellar biosynthesis protein FlhB  39.57 
 
 
399 aa  196  7e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.151701  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0267  flagellar biosynthesis protein FlhB  39.57 
 
 
399 aa  196  7e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.110201  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2938  flagellar biosynthesis protein FlhB  37.9 
 
 
380 aa  195  1e-48  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0481554  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4406  flagellar biosynthesis protein FlhB  36.46 
 
 
357 aa  195  1e-48  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.202983  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3034  flagellar biosynthetic protein FlhB  34.92 
 
 
374 aa  194  2e-48  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2295  flagellar biosynthesis protein FlhB  32.79 
 
 
376 aa  194  3e-48  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0481  flagellar biosynthetic protein FlhB  35.33 
 
 
391 aa  194  3e-48  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27920  flagellar biosynthetic protein  37.5 
 
 
402 aa  193  4e-48  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0219879  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1702  flagellar biosynthesis protein FlhB  34.76 
 
 
376 aa  192  7e-48  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0181  flagellar biosynthesis protein FlhB  39.13 
 
 
399 aa  191  1e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.824859  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002828  flagellar biosynthesis protein FlhB  35.92 
 
 
376 aa  191  1e-47  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2030  flagellar biosynthetic protein FlhB  38.59 
 
 
356 aa  191  2e-47  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.9056  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03148  flagellar biosynthesis protein FlhB  34.79 
 
 
376 aa  191  2e-47  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1295  flagellar biosynthesis protein FlhB  35.36 
 
 
376 aa  191  2e-47  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.388157  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1362  flagellar biosynthesis protein FlhB  35.36 
 
 
376 aa  191  2e-47  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.873498 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1171  flagellar biosynthetic protein FlhB  36.19 
 
 
383 aa  190  2.9999999999999997e-47  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.127204 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2563  flagellar biosynthesis protein FlhB  34.92 
 
 
376 aa  191  2.9999999999999997e-47  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.757068  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2923  flagellar biosynthesis protein FlhB  34.45 
 
 
376 aa  191  2.9999999999999997e-47  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02874  flagellar biosynthesis protein  35.73 
 
 
374 aa  190  4e-47  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0194  flagellar biosynthesis protein FlhB  38.48 
 
 
399 aa  189  5e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1355  flagellar biosynthesis protein FlhB  35.18 
 
 
376 aa  189  5.999999999999999e-47  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.424725  normal  0.225798 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2809  flagellar biosynthesis protein FlhB  33.78 
 
 
378 aa  189  7e-47  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.326255  normal  0.0759815 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2913  flagellar biosynthesis protein FlhB  33.89 
 
 
376 aa  189  8e-47  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.847075  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2159  flagellar biosynthetic protein FlhB  36.83 
 
 
377 aa  189  8e-47  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1163  flagellar biosynthesis protein FlhB  37.4 
 
 
351 aa  189  8e-47  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3878  flagellar biosynthesis protein FlhB  35.96 
 
 
378 aa  189  1e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0658  flagellar biosynthetic protein FlhB  34.37 
 
 
353 aa  188  2e-46  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.622115  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1450  flagellar biosynthesis protein FlhB  34.17 
 
 
376 aa  188  2e-46  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3423  flagellar biosynthesis protein FlhB  40.37 
 
 
401 aa  188  2e-46  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3055  flagellar biosynthesis protein FlhB  34.17 
 
 
376 aa  188  2e-46  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.247333 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>