More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_1669 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_1669  type III secretion exporter  100 
 
 		 360 aa  722    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.058762  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2328  type III secretion exporter  49.72 
 
 		 363 aa  331  1e-89  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.645604  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31030  flagellar biosynthesis pathway, component FlhB  47.28 
 
 		 422 aa  311  1e-83  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0959  type III secretion exporter  47.18 
 
 		 377 aa  310  2e-83  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0740  type III secretion exporter  47.35 
 
 		 381 aa  302  6.000000000000001e-81  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2008  type III secretion exporter  45.4 
 
 		 380 aa  298  7e-80  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2973  type III secretion exporter  44.38 
 
 		 359 aa  274  1.0000000000000001e-72  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0860  type III secretion exporter  43.7 
 
 		 391 aa  253  5.000000000000001e-66  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.311747  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0011  flagellar biosynthetic protein FlhB  39.48 
 
 		 355 aa  224  2e-57  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4406  flagellar biosynthesis protein FlhB  37.46 
 
 		 357 aa  213  3.9999999999999995e-54  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.202983  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0380  flagellar biosynthesis protein FlhB  36.18 
 
 		 362 aa  207  2e-52  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.441846  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1331  flagellar biosynthesis protein FlhB  39.15 
 
 		 383 aa  204  2e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.384239  hitchhiker  0.0000000000516194 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1208  flagellar biosynthesis protein FlhB  39.49 
 
 		 383 aa  204  2e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2074  flagellar biosynthesis protein FlhB  39.49 
 
 		 383 aa  204  2e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000897295 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2069  flagellar biosynthesis protein FlhB  39.49 
 
 		 383 aa  203  3e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00553621 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2129  flagellar biosynthesis protein FlhB  39.15 
 
 		 383 aa  203  3e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000192021 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0357  flagellar biosynthesis protein FlhB  35.61 
 
 		 368 aa  203  3e-51  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0130  flagellar biosynthesis protein FlhB  39.03 
 
 		 406 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.561684  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0018  flagellar biosynthetic protein FlhB  35.43 
 
 		 374 aa  201  9.999999999999999e-51  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000937461  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0018  flagellar biosynthetic protein FlhB  35.43 
 
 		 374 aa  201  1.9999999999999998e-50  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000395256  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1866  flagellar biosynthesis protein FlhB  36.52 
 
 		 376 aa  201  1.9999999999999998e-50  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.965675  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2938  flagellar biosynthesis protein FlhB  39.71 
 
 		 380 aa  201  1.9999999999999998e-50  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0481554  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1412  flagellar biosynthetic protein FlhB  33.99 
 
 		 363 aa  201  1.9999999999999998e-50  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.342211  normal  0.890154 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2575  flagellar biosynthetic protein FlhB  36.08 
 
 		 359 aa  201  1.9999999999999998e-50  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.011127 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3804  flagellar biosynthesis protein FlhB  37.82 
 
 		 403 aa  200  3e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16690  flagellar biosynthetic protein FlhB  34.87 
 
 		 356 aa  199  7e-50  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1623  flagellar biosynthesis protein FlhB  35.9 
 
 		 362 aa  199  7.999999999999999e-50  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2604  flagellar biosynthesis protein FlhB  37.22 
 
 		 383 aa  198  1.0000000000000001e-49  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2154  flagellar biosynthetic protein FlhB  32.19 
 
 		 366 aa  197  2.0000000000000003e-49  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3772  flagellar biosynthesis protein FlhB  36.62 
 
 		 358 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0655991  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27920  flagellar biosynthetic protein  35.67 
 
 		 402 aa  198  2.0000000000000003e-49  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0219879  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2447  flagellar biosynthesis protein FlhB  37.78 
 
 		 382 aa  197  3e-49  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1409  flagellar biosynthetic protein FlhB  35.98 
 
 		 361 aa  196  4.0000000000000005e-49  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1129  flagellar biosynthesis protein FlhB  36.06 
 
 		 360 aa  196  7e-49  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0658  flagellar biosynthetic protein FlhB  36.34 
 
 		 353 aa  196  7e-49  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.622115  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3431  flagellar biosynthetic protein FlhB  37.22 
 
 		 378 aa  195  8.000000000000001e-49  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1307  flagellar biosynthesis protein FlhB  39.55 
 
 		 382 aa  195  1e-48  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0569687 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2334  flagellar biosynthesis protein FlhB  37.5 
 
 		 386 aa  195  1e-48  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.178036  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1862  flagellar biosynthesis protein FlhB  36.47 
 
 		 383 aa  194  2e-48  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.90359  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1330  flagellar biosynthesis protein FlhB  35.47 
 
 		 358 aa  194  2e-48  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2432  flagellar biosynthesis protein FlhB  37.78 
 
 		 386 aa  193  3e-48  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2393  flagellar biosynthetic protein FlhB  35.85 
 
 		 354 aa  194  3e-48  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01851  flagellar biosynthesis protein B  39.55 
 
 		 382 aa  193  4e-48  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1760  flagellar biosynthetic protein FlhB  39.55 
 
 		 382 aa  193  4e-48  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.304563  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1975  flagellar biosynthesis protein FlhB  39.55 
 
 		 382 aa  193  4e-48  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01840  hypothetical protein  39.55 
 
 		 382 aa  193  4e-48  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2112  flagellar biosynthesis protein FlhB  39.55 
 
 		 382 aa  193  4e-48  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1752  flagellar biosynthesis protein FlhB  39.55 
 
 		 382 aa  193  4e-48  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1944  flagellar biosynthetic protein FlhB  34.75 
 
 		 381 aa  192  1e-47  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1519  flagellar biosynthesis protein FlhB  37.71 
 
 		 383 aa  191  1e-47  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2617  flagellar biosynthesis protein FlhB  39.27 
 
 		 382 aa  191  1e-47  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000137265 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1245  flagellar biosynthetic protein FlhB  38.07 
 
 		 390 aa  191  2e-47  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.215857  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0240  flagellar biosynthetic protein FlhB  36.34 
 
 		 353 aa  191  2e-47  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.760621  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3370  flagellar biosynthesis protein FlhB  37.19 
 
 		 398 aa  190  2.9999999999999997e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00184569  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5492  flagellar biosynthesis protein FlhB  34.58 
 
 		 359 aa  189  4e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.14397  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1698  flagellar biosynthesis protein FlhB  36.75 
 
 		 357 aa  190  4e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.736983 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1547  flagellar biosynthesis protein FlhB  35.04 
 
 		 383 aa  189  4e-47  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1930  flagellar biosynthetic protein FlhB  33.24 
 
 		 363 aa  189  4e-47  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.922236  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0484  flagellar biosynthetic protein FlhB  35.59 
 
 		 392 aa  189  5.999999999999999e-47  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0127914  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1334  flagellar biosynthetic protein FlhB  37.57 
 
 		 384 aa  189  9e-47  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0743  flagellar biosynthetic protein FlhB  35.07 
 
 		 381 aa  188  1e-46  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0069  flagellar biosynthetic protein FlhB  35.03 
 
 		 358 aa  188  1e-46  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5615  flagellar biosynthesis protein FlhB  36.99 
 
 		 380 aa  188  2e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.891713  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1522  flagellar biosynthesis protein FlhB  35.13 
 
 		 358 aa  187  2e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.23127  normal  0.258787 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1674  flagellar biosynthetic protein FlhB  35.28 
 
 		 360 aa  188  2e-46  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0868  flagellar biosynthesis/type III secretory pathway protein  35.11 
 
 		 369 aa  186  5e-46  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0342  flagellar biosynthesis protein FlhB  34.78 
 
 		 357 aa  186  5e-46  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00837822  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0181  flagellar biosynthesis protein FlhB  37.89 
 
 		 399 aa  185  9e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.824859  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1316  flagellar biosynthetic protein FlhB  35.92 
 
 		 366 aa  185  1.0000000000000001e-45  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1137  flagellar biosynthesis protein FlhB  34.57 
 
 		 359 aa  184  1.0000000000000001e-45  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0669  flagellar biosynthesis protein FlhB  34.28 
 
 		 350 aa  185  1.0000000000000001e-45  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0757109  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4196  flagellar biosynthesis protein FlhB  33.71 
 
 		 354 aa  185  1.0000000000000001e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3821  flagellar biosynthesis protein FlhB  32.66 
 
 		 353 aa  184  2.0000000000000003e-45  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2840  flagellar biosynthesis protein FlhB  36.91 
 
 		 399 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.151701  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0267  flagellar biosynthesis protein FlhB  36.91 
 
 		 399 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.110201  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0249  flagellar biosynthesis protein FlhB  36.91 
 
 		 399 aa  184  3e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.190542  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0713  flagellar biosynthetic protein FlhB  34.97 
 
 		 379 aa  184  3e-45  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.31011  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0194  flagellar biosynthesis protein FlhB  37.61 
 
 		 399 aa  183  3e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2030  flagellar biosynthetic protein FlhB  36.21 
 
 		 356 aa  183  4.0000000000000006e-45  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.9056  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1515  flagellar biosynthesis protein FlhB  34.26 
 
 		 376 aa  183  5.0000000000000004e-45  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.813027  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0175  flagellar biosynthesis protein FlhB  37.78 
 
 		 399 aa  182  5.0000000000000004e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.212371 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1975  flagellar biosynthetic protein FlhB  36.16 
 
 		 378 aa  182  6e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.185057  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3698  flagellar biosynthesis protein FlhB  36.1 
 
 		 380 aa  182  6e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0239481 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1394  flagellar biosynthetic FlhB transmembrane protein  34.93 
 
 		 387 aa  182  1e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00896638  normal  0.765457 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3441  flagellar biosynthesis protein FlhB  34.63 
 
 		 378 aa  181  1e-44  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.456344 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0214  flagellar biosynthesis protein FlhB  39.13 
 
 		 379 aa  181  1e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.772571  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0332  flagellar biosynthesis protein FlhB  33.43 
 
 		 359 aa  182  1e-44  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1384  flagellar biosynthesis protein FlhB  36.54 
 
 		 360 aa  181  2e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.696508  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2808  flagellar biosynthesis protein FlhB  31.5 
 
 		 360 aa  180  2.9999999999999997e-44  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0242  flagellar biosynthesis protein FlhB  32.58 
 
 		 377 aa  180  2.9999999999999997e-44  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.33455  normal  0.0187302 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2964  flagellar biosynthesis protein FlhB  39.02 
 
 		 411 aa  179  4.999999999999999e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00775742 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0739  flagellar biosynthesis protein FlhB  35.47 
 
 		 379 aa  179  7e-44  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3094  flagellar biosynthesis protein FlhB  32.56 
 
 		 353 aa  179  7e-44  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1981  flagellar biosynthesis protein FlhB  36.41 
 
 		 378 aa  179  7e-44  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.764273  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0623  flagellar biosynthesis protein FlhB  32.49 
 
 		 377 aa  179  8e-44  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0703  flagellar biosynthetic protein FlhB  33.53 
 
 		 354 aa  179  8e-44  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.635027  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1171  flagellar biosynthetic protein FlhB  34.97 
 
 		 383 aa  179  9e-44  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.127204 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1379  flagellar biosynthesis protein FlhB  34.28 
 
 		 377 aa  179  9e-44  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.294814 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2016  flagellar biosynthetic protein FlhB  34.56 
 
 		 387 aa  179  9e-44  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4140  flagellar biosynthetic protein FlhB  38.18 
 
 		 382 aa  178  1e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>