More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpsIP31758_0623 on replicon NC_009708
Organism: Yersinia pseudotuberculosis IP 31758



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009708  YpsIP31758_0623  flagellar biosynthesis protein FlhB  100 
 
 
377 aa  770    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0703  flagellar biosynthesis protein FlhB  98.09 
 
 
377 aa  737    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.246065  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0242  flagellar biosynthesis protein FlhB  98.14 
 
 
377 aa  759    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.33455  normal  0.0187302 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0242  flagellar biosynthesis protein FlhB  49.73 
 
 
379 aa  412  1e-114  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3390  flagellar biosynthesis protein FlhB  48.94 
 
 
379 aa  407  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4645  flagellar biosynthesis protein FlhB  41.98 
 
 
379 aa  319  3.9999999999999996e-86  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.223751  normal  0.675327 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0213  flagellar biosynthesis protein FlhB  43.39 
 
 
379 aa  306  5.0000000000000004e-82  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.687218  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0164  flagellar biosynthesis protein FlhB  43.09 
 
 
379 aa  303  3.0000000000000004e-81  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4425  flagellar biosynthesis protein FlhB  43.36 
 
 
377 aa  303  3.0000000000000004e-81  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.790893 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2809  flagellar biosynthesis protein FlhB  40.05 
 
 
378 aa  270  2.9999999999999997e-71  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.326255  normal  0.0759815 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001177  flagellar biosynthesis protein FlhB  40.58 
 
 
375 aa  267  2e-70  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04964  flagellar biosynthesis pathway, component FlhB  39.48 
 
 
375 aa  258  2e-67  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0092  flagellar biosynthetic protein FlhB  37.53 
 
 
376 aa  256  3e-67  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1944  flagellar biosynthetic protein FlhB  37.47 
 
 
381 aa  255  9e-67  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1552  flagellar biosynthesis protein FlhB  37.37 
 
 
379 aa  254  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00640595  normal  0.373184 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0086  flagellar biosynthetic protein FlhB  36 
 
 
376 aa  253  3e-66  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.293777 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3596  flagellar biosynthetic protein FlhB  39.95 
 
 
374 aa  251  2e-65  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.189893  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3987  flagellar biosynthetic protein FlhB  37.83 
 
 
376 aa  250  3e-65  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1339  flagellar biosynthesis protein FlhB  37.5 
 
 
377 aa  250  3e-65  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3914  flagellar biosynthesis protein FlhB  40.96 
 
 
380 aa  249  5e-65  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3484  flagellar biosynthetic protein FlhB  37.4 
 
 
376 aa  249  6e-65  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.994028  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3678  flagellar biosynthesis protein FlhB  40.43 
 
 
380 aa  249  7e-65  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.10386  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3667  flagellar biosynthetic protein FlhB  37.82 
 
 
376 aa  249  8e-65  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1374  flagellar biosynthesis protein FlhB  36.34 
 
 
377 aa  248  1e-64  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3441  flagellar biosynthesis protein FlhB  37.63 
 
 
378 aa  248  2e-64  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.456344 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0981  flagellar biosynthetic protein FlhB  38.32 
 
 
390 aa  248  2e-64  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0800953 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1450  flagellar biosynthesis protein FlhB  36.9 
 
 
376 aa  244  9.999999999999999e-64  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3055  flagellar biosynthesis protein FlhB  36.9 
 
 
376 aa  244  9.999999999999999e-64  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.247333 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45720  flagellar biosynthesis protein FlhB  37.4 
 
 
378 aa  245  9.999999999999999e-64  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0743  flagellar biosynthetic protein FlhB  35.53 
 
 
381 aa  243  3e-63  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1195  flagellar biosynthesis protein FlhB  35.89 
 
 
377 aa  243  3e-63  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3878  flagellar biosynthesis protein FlhB  37.14 
 
 
378 aa  243  3e-63  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1975  flagellar biosynthetic protein FlhB  36.46 
 
 
378 aa  243  3.9999999999999997e-63  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.185057  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2923  flagellar biosynthesis protein FlhB  36.9 
 
 
376 aa  242  7.999999999999999e-63  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4352  flagellar biosynthesis protein FlhB  39.63 
 
 
380 aa  241  1e-62  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.546846  normal  0.108757 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3034  flagellar biosynthetic protein FlhB  35.77 
 
 
374 aa  241  1e-62  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2563  flagellar biosynthesis protein FlhB  36.57 
 
 
376 aa  241  2e-62  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.757068  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1866  flagellar biosynthesis protein FlhB  35.85 
 
 
376 aa  241  2e-62  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.965675  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1295  flagellar biosynthesis protein FlhB  36.57 
 
 
376 aa  241  2e-62  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.388157  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1362  flagellar biosynthesis protein FlhB  36.57 
 
 
376 aa  241  2e-62  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.873498 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2913  flagellar biosynthesis protein FlhB  36.34 
 
 
376 aa  240  2e-62  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.847075  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1355  flagellar biosynthesis protein FlhB  36.57 
 
 
376 aa  241  2e-62  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.424725  normal  0.225798 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3215  flagellar biosynthesis protein FlhB  36.29 
 
 
376 aa  240  2.9999999999999997e-62  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1379  flagellar biosynthesis protein FlhB  35.26 
 
 
377 aa  239  4e-62  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.294814 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1514  flagellar biosynthesis protein FlhB  39.63 
 
 
380 aa  238  2e-61  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.819465  normal  0.151941 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1631  flagellar biosynthesis protein FlhB  35.79 
 
 
377 aa  237  3e-61  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002828  flagellar biosynthesis protein FlhB  37.5 
 
 
376 aa  236  3e-61  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2169  flagellar biosynthesis protein FlhB  37.43 
 
 
376 aa  236  4e-61  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1515  flagellar biosynthesis protein FlhB  37.27 
 
 
376 aa  233  6e-60  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.813027  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3053  flagellar biosynthesis protein FlhB  34.51 
 
 
377 aa  232  8.000000000000001e-60  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0535555 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2295  flagellar biosynthesis protein FlhB  37.73 
 
 
376 aa  231  2e-59  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2334  flagellar biosynthesis protein FlhB  36.1 
 
 
386 aa  230  3e-59  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.178036  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1750  flagellar biosynthesis protein FlhB  38.1 
 
 
382 aa  229  5e-59  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1981  flagellar biosynthesis protein FlhB  34.4 
 
 
378 aa  229  5e-59  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.764273  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2432  flagellar biosynthesis protein FlhB  36.36 
 
 
386 aa  229  5e-59  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2159  flagellar biosynthetic protein FlhB  36.03 
 
 
377 aa  229  8e-59  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1750  flagellar biosynthesis protein FlhB  37.83 
 
 
382 aa  228  1e-58  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3431  flagellar biosynthetic protein FlhB  36.1 
 
 
378 aa  228  2e-58  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2284  flagellar biosynthesis protein FlhB  35.79 
 
 
377 aa  228  2e-58  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.562852  normal  0.66393 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03148  flagellar biosynthesis protein FlhB  37.24 
 
 
376 aa  226  5.0000000000000005e-58  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1334  flagellar biosynthetic protein FlhB  35.17 
 
 
384 aa  226  7e-58  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1702  flagellar biosynthesis protein FlhB  36.27 
 
 
376 aa  224  2e-57  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1171  flagellar biosynthetic protein FlhB  38.03 
 
 
383 aa  224  3e-57  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.127204 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5615  flagellar biosynthesis protein FlhB  34.75 
 
 
380 aa  223  4e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.891713  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02874  flagellar biosynthesis protein  34.82 
 
 
374 aa  223  4e-57  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1394  flagellar biosynthetic FlhB transmembrane protein  34.97 
 
 
387 aa  221  1.9999999999999999e-56  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00896638  normal  0.765457 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0484  flagellar biosynthetic protein FlhB  36.69 
 
 
392 aa  220  1.9999999999999999e-56  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0127914  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3698  flagellar biosynthesis protein FlhB  34.21 
 
 
380 aa  220  3.9999999999999997e-56  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0239481 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3370  flagellar biosynthesis protein FlhB  33.51 
 
 
398 aa  219  6e-56  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00184569  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2016  flagellar biosynthetic protein FlhB  33.07 
 
 
387 aa  219  6e-56  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2447  flagellar biosynthesis protein FlhB  33.25 
 
 
382 aa  218  1e-55  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1245  flagellar biosynthetic protein FlhB  33.87 
 
 
390 aa  218  2e-55  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.215857  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0713  flagellar biosynthetic protein FlhB  35.6 
 
 
379 aa  217  2.9999999999999998e-55  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.31011  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16690  flagellar biosynthetic protein FlhB  35.29 
 
 
356 aa  216  4e-55  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00962  flagellar biosynthesis protein FlhB  35.31 
 
 
376 aa  216  5.9999999999999996e-55  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.118534  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06204  flagellar biosynthesis protein FlhB  35.31 
 
 
376 aa  216  5.9999999999999996e-55  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.236866  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1519  flagellar biosynthesis protein FlhB  34.47 
 
 
383 aa  216  7e-55  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1547  flagellar biosynthesis protein FlhB  34.37 
 
 
383 aa  215  9.999999999999999e-55  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2840  flagellar biosynthesis protein FlhB  33.24 
 
 
399 aa  215  9.999999999999999e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.151701  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0267  flagellar biosynthesis protein FlhB  33.24 
 
 
399 aa  215  9.999999999999999e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.110201  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1862  flagellar biosynthesis protein FlhB  34.95 
 
 
383 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.90359  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3804  flagellar biosynthesis protein FlhB  32.47 
 
 
403 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0249  flagellar biosynthesis protein FlhB  33.24 
 
 
399 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.190542  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0130  flagellar biosynthesis protein FlhB  32.63 
 
 
406 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.561684  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2604  flagellar biosynthesis protein FlhB  35.28 
 
 
383 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2977  flagellar biosynthesis protein FlhB  36.11 
 
 
398 aa  212  7.999999999999999e-54  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0175  flagellar biosynthesis protein FlhB  33.16 
 
 
399 aa  211  1e-53  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.212371 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0481  flagellar biosynthetic protein FlhB  34.78 
 
 
391 aa  211  2e-53  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2069  flagellar biosynthesis protein FlhB  32.22 
 
 
383 aa  210  4e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00553621 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4140  flagellar biosynthetic protein FlhB  33.07 
 
 
382 aa  210  4e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4066  flagellar biosynthetic protein FlhB  34.21 
 
 
387 aa  209  6e-53  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4178  flagellar biosynthetic protein FlhB  34.21 
 
 
387 aa  209  6e-53  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.232408  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2938  flagellar biosynthesis protein FlhB  34.12 
 
 
380 aa  209  7e-53  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0481554  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2074  flagellar biosynthesis protein FlhB  32.22 
 
 
383 aa  209  8e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000897295 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1208  flagellar biosynthesis protein FlhB  32.22 
 
 
383 aa  209  8e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1331  flagellar biosynthesis protein FlhB  32.82 
 
 
383 aa  209  9e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.384239  hitchhiker  0.0000000000516194 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2129  flagellar biosynthesis protein FlhB  32.82 
 
 
383 aa  209  9e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000192021 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1163  flagellar biosynthesis protein FlhB  33.99 
 
 
351 aa  207  3e-52  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0011  flagellar biosynthetic protein FlhB  34.84 
 
 
355 aa  205  9e-52  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0018  flagellar biosynthetic protein FlhB  34.08 
 
 
374 aa  205  1e-51  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000937461  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>