More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YPK_0703 on replicon NC_010465
Organism: Yersinia pseudotuberculosis YPIII



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010465  YPK_0703  flagellar biosynthesis protein FlhB  100 
 
 		 377 aa  768    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.246065  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0623  flagellar biosynthesis protein FlhB  97.88 
 
 		 377 aa  756    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0242  flagellar biosynthesis protein FlhB  99.73 
 
 		 377 aa  767    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.33455  normal  0.0187302 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0242  flagellar biosynthesis protein FlhB  50.27 
 
 		 379 aa  410  1e-113  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3390  flagellar biosynthesis protein FlhB  49.47 
 
 		 379 aa  406  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4645  flagellar biosynthesis protein FlhB  42.55 
 
 		 379 aa  318  7e-86  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.223751  normal  0.675327 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0213  flagellar biosynthesis protein FlhB  43.62 
 
 		 379 aa  303  3.0000000000000004e-81  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.687218  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4425  flagellar biosynthesis protein FlhB  43.28 
 
 		 377 aa  301  1e-80  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.790893 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0164  flagellar biosynthesis protein FlhB  42.9 
 
 		 379 aa  300  2e-80  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2809  flagellar biosynthesis protein FlhB  40.58 
 
 		 378 aa  270  2e-71  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.326255  normal  0.0759815 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001177  flagellar biosynthesis protein FlhB  40.52 
 
 		 375 aa  264  2e-69  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0092  flagellar biosynthetic protein FlhB  38.58 
 
 		 376 aa  261  1e-68  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04964  flagellar biosynthesis pathway, component FlhB  39.48 
 
 		 375 aa  256  4e-67  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1552  flagellar biosynthesis protein FlhB  37.67 
 
 		 379 aa  254  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00640595  normal  0.373184 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0086  flagellar biosynthetic protein FlhB  36.87 
 
 		 376 aa  254  2.0000000000000002e-66  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.293777 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1944  flagellar biosynthetic protein FlhB  37.07 
 
 		 381 aa  253  5.000000000000001e-66  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3484  flagellar biosynthetic protein FlhB  37.77 
 
 		 376 aa  251  1e-65  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.994028  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3987  flagellar biosynthetic protein FlhB  38.62 
 
 		 376 aa  251  1e-65  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3914  flagellar biosynthesis protein FlhB  41.49 
 
 		 380 aa  250  3e-65  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3596  flagellar biosynthetic protein FlhB  39.01 
 
 		 374 aa  249  5e-65  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.189893  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3441  flagellar biosynthesis protein FlhB  37.86 
 
 		 378 aa  249  6e-65  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.456344 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3678  flagellar biosynthesis protein FlhB  40.96 
 
 		 380 aa  248  9e-65  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.10386  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1339  flagellar biosynthesis protein FlhB  38.04 
 
 		 377 aa  248  9e-65  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0743  flagellar biosynthetic protein FlhB  35.62 
 
 		 381 aa  248  1e-64  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3667  flagellar biosynthetic protein FlhB  37.47 
 
 		 376 aa  248  1e-64  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0981  flagellar biosynthetic protein FlhB  37.63 
 
 		 390 aa  248  2e-64  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0800953 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45720  flagellar biosynthesis protein FlhB  37.93 
 
 		 378 aa  247  2e-64  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3878  flagellar biosynthesis protein FlhB  37.67 
 
 		 378 aa  246  6e-64  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3055  flagellar biosynthesis protein FlhB  36.29 
 
 		 376 aa  245  6.999999999999999e-64  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.247333 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1450  flagellar biosynthesis protein FlhB  36.29 
 
 		 376 aa  246  6.999999999999999e-64  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1975  flagellar biosynthetic protein FlhB  37.34 
 
 		 378 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.185057  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1866  flagellar biosynthesis protein FlhB  36.41 
 
 		 376 aa  244  1.9999999999999999e-63  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.965675  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1374  flagellar biosynthesis protein FlhB  35.81 
 
 		 377 aa  244  1.9999999999999999e-63  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3034  flagellar biosynthetic protein FlhB  36.36 
 
 		 374 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2923  flagellar biosynthesis protein FlhB  36.29 
 
 		 376 aa  243  5e-63  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4352  flagellar biosynthesis protein FlhB  39.47 
 
 		 380 aa  242  1e-62  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.546846  normal  0.108757 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2913  flagellar biosynthesis protein FlhB  35.71 
 
 		 376 aa  241  1e-62  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.847075  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1295  flagellar biosynthesis protein FlhB  36.86 
 
 		 376 aa  241  1e-62  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.388157  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1362  flagellar biosynthesis protein FlhB  36.86 
 
 		 376 aa  241  1e-62  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.873498 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1355  flagellar biosynthesis protein FlhB  36.86 
 
 		 376 aa  242  1e-62  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.424725  normal  0.225798 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3215  flagellar biosynthesis protein FlhB  36.57 
 
 		 376 aa  241  2e-62  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2563  flagellar biosynthesis protein FlhB  36.57 
 
 		 376 aa  241  2e-62  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.757068  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2169  flagellar biosynthesis protein FlhB  37.43 
 
 		 376 aa  241  2e-62  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1195  flagellar biosynthesis protein FlhB  35.87 
 
 		 377 aa  239  5e-62  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1379  flagellar biosynthesis protein FlhB  35.44 
 
 		 377 aa  238  1e-61  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.294814 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1515  flagellar biosynthesis protein FlhB  39.35 
 
 		 376 aa  236  6e-61  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.813027  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002828  flagellar biosynthesis protein FlhB  37.5 
 
 		 376 aa  236  6e-61  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1514  flagellar biosynthesis protein FlhB  40.16 
 
 		 380 aa  236  6e-61  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.819465  normal  0.151941 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1631  flagellar biosynthesis protein FlhB  35.97 
 
 		 377 aa  235  8e-61  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1981  flagellar biosynthesis protein FlhB  34.67 
 
 		 378 aa  233  5e-60  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.764273  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1750  flagellar biosynthesis protein FlhB  38.36 
 
 		 382 aa  232  7.000000000000001e-60  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2295  flagellar biosynthesis protein FlhB  37.98 
 
 		 376 aa  232  7.000000000000001e-60  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3431  flagellar biosynthetic protein FlhB  36.36 
 
 		 378 aa  232  8.000000000000001e-60  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2334  flagellar biosynthesis protein FlhB  36.88 
 
 		 386 aa  230  2e-59  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.178036  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1750  flagellar biosynthesis protein FlhB  38.1 
 
 		 382 aa  231  2e-59  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2432  flagellar biosynthesis protein FlhB  36.88 
 
 		 386 aa  230  3e-59  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3053  flagellar biosynthesis protein FlhB  34.51 
 
 		 377 aa  229  4e-59  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0535555 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2284  flagellar biosynthesis protein FlhB  36.07 
 
 		 377 aa  229  8e-59  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.562852  normal  0.66393 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2159  flagellar biosynthetic protein FlhB  35.43 
 
 		 377 aa  226  7e-58  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5615  flagellar biosynthesis protein FlhB  34.75 
 
 		 380 aa  225  1e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.891713  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1171  flagellar biosynthetic protein FlhB  37.85 
 
 		 383 aa  224  1e-57  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.127204 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3698  flagellar biosynthesis protein FlhB  35.26 
 
 		 380 aa  225  1e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0239481 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03148  flagellar biosynthesis protein FlhB  37.5 
 
 		 376 aa  224  1e-57  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1394  flagellar biosynthetic FlhB transmembrane protein  35.23 
 
 		 387 aa  223  3e-57  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00896638  normal  0.765457 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3370  flagellar biosynthesis protein FlhB  34.05 
 
 		 398 aa  224  3e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00184569  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1702  flagellar biosynthesis protein FlhB  36.27 
 
 		 376 aa  223  4e-57  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02874  flagellar biosynthesis protein  35 
 
 		 374 aa  221  9.999999999999999e-57  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1334  flagellar biosynthetic protein FlhB  35.17 
 
 		 384 aa  221  9.999999999999999e-57  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00962  flagellar biosynthesis protein FlhB  35.59 
 
 		 376 aa  219  7e-56  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.118534  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06204  flagellar biosynthesis protein FlhB  35.59 
 
 		 376 aa  219  7e-56  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.236866  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3804  flagellar biosynthesis protein FlhB  33.16 
 
 		 403 aa  219  7.999999999999999e-56  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2840  flagellar biosynthesis protein FlhB  33.78 
 
 		 399 aa  219  7.999999999999999e-56  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.151701  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0267  flagellar biosynthesis protein FlhB  33.78 
 
 		 399 aa  219  7.999999999999999e-56  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.110201  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0249  flagellar biosynthesis protein FlhB  33.78 
 
 		 399 aa  218  1e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.190542  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0130  flagellar biosynthesis protein FlhB  33.16 
 
 		 406 aa  218  1e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.561684  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2016  flagellar biosynthetic protein FlhB  33.25 
 
 		 387 aa  218  1e-55  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0484  flagellar biosynthetic protein FlhB  36.59 
 
 		 392 aa  217  2e-55  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0127914  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0175  flagellar biosynthesis protein FlhB  34.05 
 
 		 399 aa  216  5e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.212371 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0713  flagellar biosynthetic protein FlhB  35.04 
 
 		 379 aa  215  8e-55  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.31011  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1245  flagellar biosynthetic protein FlhB  34.46 
 
 		 390 aa  215  9.999999999999999e-55  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.215857  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1519  flagellar biosynthesis protein FlhB  34.47 
 
 		 383 aa  215  9.999999999999999e-55  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1862  flagellar biosynthesis protein FlhB  35.43 
 
 		 383 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.90359  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0481  flagellar biosynthetic protein FlhB  35.31 
 
 		 391 aa  214  2.9999999999999995e-54  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16690  flagellar biosynthetic protein FlhB  34.73 
 
 		 356 aa  213  3.9999999999999995e-54  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2447  flagellar biosynthesis protein FlhB  32.73 
 
 		 382 aa  213  4.9999999999999996e-54  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2938  flagellar biosynthesis protein FlhB  34.65 
 
 		 380 aa  211  1e-53  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0481554  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1547  flagellar biosynthesis protein FlhB  34.03 
 
 		 383 aa  211  1e-53  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2604  flagellar biosynthesis protein FlhB  35.18 
 
 		 383 aa  212  1e-53  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4178  flagellar biosynthetic protein FlhB  34.47 
 
 		 387 aa  211  2e-53  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.232408  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4066  flagellar biosynthetic protein FlhB  34.47 
 
 		 387 aa  211  2e-53  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0181  flagellar biosynthesis protein FlhB  33.24 
 
 		 399 aa  209  7e-53  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.824859  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2977  flagellar biosynthesis protein FlhB  35.41 
 
 		 398 aa  208  1e-52  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4140  flagellar biosynthetic protein FlhB  33.42 
 
 		 382 aa  207  2e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0194  flagellar biosynthesis protein FlhB  32.97 
 
 		 399 aa  207  2e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0011  flagellar biosynthetic protein FlhB  34.86 
 
 		 355 aa  207  3e-52  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2069  flagellar biosynthesis protein FlhB  32.21 
 
 		 383 aa  207  3e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00553621 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2074  flagellar biosynthesis protein FlhB  32.21 
 
 		 383 aa  206  6e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000897295 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1208  flagellar biosynthesis protein FlhB  32.21 
 
 		 383 aa  206  6e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2154  flagellar biosynthetic protein FlhB  35.56 
 
 		 366 aa  206  6e-52  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2129  flagellar biosynthesis protein FlhB  32.82 
 
 		 383 aa  206  7e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000192021 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>