More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_4425 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_4425  flagellar biosynthesis protein FlhB  100 
 
 		 377 aa  764    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.790893 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4645  flagellar biosynthesis protein FlhB  44.53 
 
 		 379 aa  339  5e-92  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.223751  normal  0.675327 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0164  flagellar biosynthesis protein FlhB  47.33 
 
 		 379 aa  337  2.9999999999999997e-91  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0213  flagellar biosynthesis protein FlhB  47.06 
 
 		 379 aa  336  3.9999999999999995e-91  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.687218  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0242  flagellar biosynthesis protein FlhB  43.9 
 
 		 379 aa  328  9e-89  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0242  flagellar biosynthesis protein FlhB  43.55 
 
 		 377 aa  327  3e-88  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.33455  normal  0.0187302 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0623  flagellar biosynthesis protein FlhB  43.36 
 
 		 377 aa  326  4.0000000000000003e-88  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3390  flagellar biosynthesis protein FlhB  42.82 
 
 		 379 aa  323  4e-87  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0703  flagellar biosynthesis protein FlhB  43.37 
 
 		 377 aa  316  4e-85  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.246065  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0086  flagellar biosynthetic protein FlhB  42.09 
 
 		 376 aa  312  4.999999999999999e-84  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.293777 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0092  flagellar biosynthetic protein FlhB  41.67 
 
 		 376 aa  306  5.0000000000000004e-82  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3667  flagellar biosynthetic protein FlhB  41.91 
 
 		 376 aa  305  7e-82  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04964  flagellar biosynthesis pathway, component FlhB  45.36 
 
 		 375 aa  301  1e-80  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3484  flagellar biosynthetic protein FlhB  41.18 
 
 		 376 aa  296  3e-79  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.994028  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001177  flagellar biosynthesis protein FlhB  44.56 
 
 		 375 aa  294  1e-78  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3987  flagellar biosynthetic protein FlhB  40.54 
 
 		 376 aa  293  3e-78  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1374  flagellar biosynthesis protein FlhB  40.94 
 
 		 377 aa  287  2e-76  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1379  flagellar biosynthesis protein FlhB  41.36 
 
 		 377 aa  287  2e-76  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.294814 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3053  flagellar biosynthesis protein FlhB  40.98 
 
 		 377 aa  285  7e-76  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0535555 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1552  flagellar biosynthesis protein FlhB  41.11 
 
 		 379 aa  285  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00640595  normal  0.373184 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3596  flagellar biosynthetic protein FlhB  43.24 
 
 		 374 aa  278  2e-73  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.189893  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1195  flagellar biosynthesis protein FlhB  39.84 
 
 		 377 aa  276  6e-73  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1981  flagellar biosynthesis protein FlhB  41.04 
 
 		 378 aa  275  7e-73  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.764273  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1339  flagellar biosynthesis protein FlhB  39.84 
 
 		 377 aa  274  2.0000000000000002e-72  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1631  flagellar biosynthesis protein FlhB  39.75 
 
 		 377 aa  273  5.000000000000001e-72  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2295  flagellar biosynthesis protein FlhB  39.42 
 
 		 376 aa  271  2e-71  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002828  flagellar biosynthesis protein FlhB  39.47 
 
 		 376 aa  268  1e-70  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1702  flagellar biosynthesis protein FlhB  39.73 
 
 		 376 aa  268  2e-70  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2809  flagellar biosynthesis protein FlhB  40.74 
 
 		 378 aa  266  2.9999999999999995e-70  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.326255  normal  0.0759815 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3698  flagellar biosynthesis protein FlhB  39.05 
 
 		 380 aa  265  7e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0239481 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3441  flagellar biosynthesis protein FlhB  39.74 
 
 		 378 aa  264  2e-69  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.456344 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2169  flagellar biosynthesis protein FlhB  38.56 
 
 		 376 aa  262  6e-69  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1295  flagellar biosynthesis protein FlhB  38.69 
 
 		 376 aa  261  2e-68  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.388157  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1362  flagellar biosynthesis protein FlhB  38.69 
 
 		 376 aa  261  2e-68  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.873498 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1975  flagellar biosynthetic protein FlhB  38.7 
 
 		 378 aa  260  3e-68  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.185057  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45720  flagellar biosynthesis protein FlhB  40 
 
 		 378 aa  260  3e-68  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1355  flagellar biosynthesis protein FlhB  38.69 
 
 		 376 aa  260  3e-68  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.424725  normal  0.225798 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2284  flagellar biosynthesis protein FlhB  39.43 
 
 		 377 aa  259  7e-68  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.562852  normal  0.66393 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03148  flagellar biosynthesis protein FlhB  38.87 
 
 		 376 aa  259  7e-68  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0981  flagellar biosynthetic protein FlhB  40.21 
 
 		 390 aa  258  8e-68  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0800953 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2563  flagellar biosynthesis protein FlhB  38.15 
 
 		 376 aa  258  1e-67  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.757068  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3215  flagellar biosynthesis protein FlhB  38.42 
 
 		 376 aa  258  1e-67  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0743  flagellar biosynthetic protein FlhB  39.43 
 
 		 381 aa  258  1e-67  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3878  flagellar biosynthesis protein FlhB  40 
 
 		 378 aa  258  1e-67  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2447  flagellar biosynthesis protein FlhB  38.24 
 
 		 382 aa  258  2e-67  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2159  flagellar biosynthetic protein FlhB  39.3 
 
 		 377 aa  256  5e-67  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1862  flagellar biosynthesis protein FlhB  39.31 
 
 		 383 aa  255  7e-67  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.90359  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1547  flagellar biosynthesis protein FlhB  39.58 
 
 		 383 aa  255  7e-67  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5615  flagellar biosynthesis protein FlhB  38.99 
 
 		 380 aa  254  2.0000000000000002e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.891713  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1450  flagellar biosynthesis protein FlhB  37.06 
 
 		 376 aa  253  3e-66  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3055  flagellar biosynthesis protein FlhB  37.06 
 
 		 376 aa  253  4.0000000000000004e-66  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.247333 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2604  flagellar biosynthesis protein FlhB  38.56 
 
 		 383 aa  252  8.000000000000001e-66  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1515  flagellar biosynthesis protein FlhB  37.7 
 
 		 376 aa  251  1e-65  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.813027  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1519  flagellar biosynthesis protein FlhB  38.95 
 
 		 383 aa  251  1e-65  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1171  flagellar biosynthetic protein FlhB  40.42 
 
 		 383 aa  251  1e-65  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.127204 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1750  flagellar biosynthesis protein FlhB  37.82 
 
 		 382 aa  251  2e-65  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2074  flagellar biosynthesis protein FlhB  37.9 
 
 		 383 aa  250  3e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000897295 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1750  flagellar biosynthesis protein FlhB  37.56 
 
 		 382 aa  250  3e-65  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1208  flagellar biosynthesis protein FlhB  37.9 
 
 		 383 aa  250  3e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2923  flagellar biosynthesis protein FlhB  36.51 
 
 		 376 aa  250  3e-65  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2069  flagellar biosynthesis protein FlhB  37.9 
 
 		 383 aa  250  4e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00553621 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2129  flagellar biosynthesis protein FlhB  37.9 
 
 		 383 aa  249  5e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000192021 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1331  flagellar biosynthesis protein FlhB  37.9 
 
 		 383 aa  249  5e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.384239  hitchhiker  0.0000000000516194 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2913  flagellar biosynthesis protein FlhB  36.24 
 
 		 376 aa  249  7e-65  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.847075  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2334  flagellar biosynthesis protein FlhB  39.14 
 
 		 386 aa  248  1e-64  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.178036  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1334  flagellar biosynthetic protein FlhB  37.3 
 
 		 384 aa  247  2e-64  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2432  flagellar biosynthesis protein FlhB  39.1 
 
 		 386 aa  247  3e-64  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3034  flagellar biosynthetic protein FlhB  36.65 
 
 		 374 aa  246  4e-64  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3678  flagellar biosynthesis protein FlhB  39.1 
 
 		 380 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.10386  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1944  flagellar biosynthetic protein FlhB  35.73 
 
 		 381 aa  244  1.9999999999999999e-63  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3431  flagellar biosynthetic protein FlhB  37.53 
 
 		 378 aa  243  5e-63  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3914  flagellar biosynthesis protein FlhB  38.62 
 
 		 380 aa  242  7e-63  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4352  flagellar biosynthesis protein FlhB  39.15 
 
 		 380 aa  242  9e-63  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.546846  normal  0.108757 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1866  flagellar biosynthesis protein FlhB  35.94 
 
 		 376 aa  241  1e-62  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.965675  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0484  flagellar biosynthetic protein FlhB  36.71 
 
 		 392 aa  238  1e-61  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0127914  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2016  flagellar biosynthetic protein FlhB  37.31 
 
 		 387 aa  238  1e-61  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4178  flagellar biosynthetic protein FlhB  37.53 
 
 		 387 aa  237  2e-61  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.232408  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4066  flagellar biosynthetic protein FlhB  37.53 
 
 		 387 aa  237  2e-61  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0713  flagellar biosynthetic protein FlhB  36.41 
 
 		 379 aa  238  2e-61  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.31011  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2938  flagellar biosynthesis protein FlhB  38.01 
 
 		 380 aa  237  3e-61  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0481554  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1514  flagellar biosynthesis protein FlhB  38.1 
 
 		 380 aa  235  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.819465  normal  0.151941 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3804  flagellar biosynthesis protein FlhB  37.27 
 
 		 403 aa  235  1.0000000000000001e-60  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1245  flagellar biosynthetic protein FlhB  36.46 
 
 		 390 aa  234  2.0000000000000002e-60  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.215857  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3370  flagellar biosynthesis protein FlhB  36.34 
 
 		 398 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00184569  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4140  flagellar biosynthetic protein FlhB  38.58 
 
 		 382 aa  234  2.0000000000000002e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1760  flagellar biosynthetic protein FlhB  37.63 
 
 		 382 aa  233  4.0000000000000004e-60  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.304563  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2112  flagellar biosynthesis protein FlhB  37.63 
 
 		 382 aa  233  4.0000000000000004e-60  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1307  flagellar biosynthesis protein FlhB  36.81 
 
 		 382 aa  233  5e-60  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0569687 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01851  flagellar biosynthesis protein B  37.63 
 
 		 382 aa  232  7.000000000000001e-60  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01840  hypothetical protein  37.63 
 
 		 382 aa  232  7.000000000000001e-60  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1975  flagellar biosynthesis protein FlhB  37.63 
 
 		 382 aa  232  7.000000000000001e-60  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1752  flagellar biosynthesis protein FlhB  37.63 
 
 		 382 aa  232  7.000000000000001e-60  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27920  flagellar biosynthetic protein  36.04 
 
 		 402 aa  232  8.000000000000001e-60  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0219879  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02874  flagellar biosynthesis protein  37.8 
 
 		 374 aa  232  8.000000000000001e-60  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0130  flagellar biosynthesis protein FlhB  36.98 
 
 		 406 aa  232  9e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.561684  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2617  flagellar biosynthesis protein FlhB  37.63 
 
 		 382 aa  232  1e-59  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000137265 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3844  flagellar biosynthesis protein FlhB  37.93 
 
 		 401 aa  231  2e-59  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2847  flagellar biosynthesis protein FlhB  37.93 
 
 		 405 aa  231  2e-59  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0063  flagellar biosynthesis protein FlhB  37.4 
 
 		 405 aa  230  2e-59  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3128  flagellar biosynthesis protein FlhB  37.93 
 
 		 401 aa  230  3e-59  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>