More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YPK_3899 on replicon NC_010465
Organism: Yersinia pseudotuberculosis YPIII



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010465  YPK_3899  secretion system apparatus protein SsaU  100 
 
 		 355 aa  727    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3811  secretion system apparatus protein SsaU  99.15 
 
 		 356 aa  724    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3926  secretion system apparatus protein SsaU  99.44 
 
 		 355 aa  724    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2281  secretion system apparatus protein SsaU  49.71 
 
 		 349 aa  355  8.999999999999999e-97  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0436639  normal  0.672371 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1977  secretion system apparatus protein SsaU  51.3 
 
 		 349 aa  351  8.999999999999999e-96  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1518  secretion system apparatus protein SsaU  49 
 
 		 352 aa  347  2e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.00925486  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1532  secretion system apparatus protein SsaU  49.15 
 
 		 352 aa  345  5e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.371934  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1555  secretion system apparatus protein SsaU  49.15 
 
 		 352 aa  345  5e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1921  secretion system apparatus protein SsaU  49.15 
 
 		 352 aa  345  6e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.133432  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1752  secretion system apparatus protein SsaU  49.15 
 
 		 352 aa  345  8e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00000000152464  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5071  secretion system apparatus protein SsaU  40.99 
 
 		 345 aa  290  3e-77  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.796147  normal  0.0581283 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01723  Type III secretory pathway, component EscU  36.21 
 
 		 349 aa  220  3e-56  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010157  YpAngola_B0048  type III secretion appartus protein YscU  35.99 
 
 		 354 aa  218  2e-55  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000158953  normal  1 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3011  YscD family type III secretion protein  35.61 
 
 		 346 aa  215  8e-55  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.859866  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003359  type III secretion inner membrane protein HrpY  36.18 
 
 		 351 aa  214  1.9999999999999998e-54  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2412  type III secretion protein, YscU/HrpY family  35.01 
 
 		 346 aa  211  1e-53  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42660  translocation protein in type III secretion  37.9 
 
 		 349 aa  201  9.999999999999999e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0453  type III secretion system protein HrcU  34.28 
 
 		 352 aa  195  8.000000000000001e-49  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.959251  normal  0.0822049 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1882  type III secretion protein, YscU/HrpY family  31.49 
 
 		 361 aa  191  2e-47  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1129  flagellar biosynthesis protein FlhB  34.77 
 
 		 360 aa  187  2e-46  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1205  type III secretion protein HrcU  33.99 
 
 		 359 aa  187  3e-46  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.322672  normal  0.485565 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03402  type III secretion system protein HrcU  34.96 
 
 		 359 aa  187  3e-46  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2215  type III secretion protein, YscU/HrpY family  31.87 
 
 		 359 aa  186  5e-46  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0049  YscU/HrpY family type III secretion protein  34.19 
 
 		 359 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1392  type III secretion protein HrcU  34.38 
 
 		 359 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2393  flagellar biosynthetic protein FlhB  34.93 
 
 		 354 aa  182  8.000000000000001e-45  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16690  flagellar biosynthetic protein FlhB  33.63 
 
 		 356 aa  178  1e-43  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0484  flagellar biosynthetic protein FlhB  31.53 
 
 		 392 aa  177  2e-43  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0127914  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0868  flagellar biosynthesis/type III secretory pathway protein  30.61 
 
 		 369 aa  177  4e-43  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0849  flagellar biosynthetic protein FlhB  33.82 
 
 		 377 aa  175  8e-43  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0018  flagellar biosynthetic protein FlhB  30.52 
 
 		 374 aa  173  3.9999999999999995e-42  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000937461  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0018  flagellar biosynthetic protein FlhB  30.23 
 
 		 374 aa  172  9e-42  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000395256  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1334  flagellar biosynthetic protein FlhB  31.98 
 
 		 384 aa  172  1e-41  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5857  type III secretion system protein HrcU  31.88 
 
 		 352 aa  171  1e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0864  type III secretion system protein HrcU  34.77 
 
 		 357 aa  171  2e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00479024 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5640  type III secretion system protein HrcU  31.88 
 
 		 352 aa  171  2e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.122414 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2154  flagellar biosynthetic protein FlhB  33.8 
 
 		 366 aa  170  3e-41  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5440  type III secretion exporter  35.26 
 
 		 343 aa  169  5e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.368429  normal  0.0650452 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1412  flagellar biosynthetic protein FlhB  33.05 
 
 		 363 aa  169  1e-40  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.342211  normal  0.890154 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1981  flagellar biosynthesis protein FlhB  32.31 
 
 		 378 aa  168  1e-40  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.764273  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3750  type III secretion exporter  35.06 
 
 		 343 aa  167  2e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0233858 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1749  flagellar biosynthetic protein FlhB  32.01 
 
 		 359 aa  167  2e-40  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0426  flagellar biosynthesis protein FlhB  33.72 
 
 		 352 aa  167  2.9999999999999998e-40  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.888697  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0703  flagellar biosynthetic protein FlhB  31.22 
 
 		 354 aa  166  5e-40  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.635027  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1674  flagellar biosynthetic protein FlhB  32.11 
 
 		 360 aa  165  1.0000000000000001e-39  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0366  type III secretion system protein  31.03 
 
 		 360 aa  165  1.0000000000000001e-39  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0680  type III secretion system protein HrcU  34.73 
 
 		 399 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0663628  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0713  flagellar biosynthetic protein FlhB  31.2 
 
 		 379 aa  165  1.0000000000000001e-39  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.31011  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5932  type III secretion system protein HrcU  33.8 
 
 		 357 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.897512  normal  0.0426598 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0069  flagellar biosynthetic protein FlhB  32.47 
 
 		 358 aa  164  2.0000000000000002e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2199  type III secretion system protein HrcU  34.73 
 
 		 420 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.706014  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0743  flagellar biosynthetic protein FlhB  30.17 
 
 		 381 aa  164  2.0000000000000002e-39  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1547  flagellar biosynthesis protein FlhB  30.86 
 
 		 383 aa  163  3e-39  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2159  flagellar biosynthetic protein FlhB  30.83 
 
 		 377 aa  164  3e-39  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3094  flagellar biosynthesis protein FlhB  33.24 
 
 		 353 aa  163  3e-39  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2282  type III secretion system protein HrcU  34.73 
 
 		 420 aa  164  3e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.58403  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1631  type III secretion system protein HrcU  34.73 
 
 		 360 aa  163  5.0000000000000005e-39  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.882123  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1904  type III secretion system protein HrcU  31.52 
 
 		 352 aa  162  1e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0427  type III secretion system protein HrcU  31.52 
 
 		 352 aa  162  1e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0498216  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3522  type III secretion exporter  35.34 
 
 		 343 aa  162  1e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4844  type III secretion exporter  35.34 
 
 		 343 aa  162  1e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000249034  normal  0.515016 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1996  type III secretion system protein HrcU  31.23 
 
 		 352 aa  161  2e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.920837  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1397  flagellar biosynthetic protein FlhB  32.46 
 
 		 363 aa  161  2e-38  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1339  flagellar biosynthesis protein FlhB  30.83 
 
 		 377 aa  160  2e-38  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0960  flagellar biosynthetic protein FlhB  32.37 
 
 		 384 aa  161  2e-38  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0011  flagellar biosynthetic protein FlhB  31.64 
 
 		 355 aa  160  2e-38  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3609  flagellar biosynthesis protein FlhB  29.38 
 
 		 348 aa  160  3e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0634  type III secretion system protein HrcU  34.43 
 
 		 420 aa  160  4e-38  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2032  flagellar biosynthetic protein FlhB  31.01 
 
 		 381 aa  160  4e-38  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.112007  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1954  type III secretion system protein HrcU  34.43 
 
 		 420 aa  160  4e-38  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1391  flagellar biosynthetic protein FlhB  30.41 
 
 		 360 aa  159  9e-38  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0742  type III secretion exporter  34.6 
 
 		 343 aa  158  1e-37  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.205529  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2021  flagellar biosynthesis protein FlhB  33.73 
 
 		 360 aa  158  1e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1195  flagellar biosynthesis protein FlhB  29.56 
 
 		 377 aa  158  1e-37  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0332  flagellar biosynthesis protein FlhB  31.56 
 
 		 359 aa  158  2e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1930  flagellar biosynthetic protein FlhB  33.88 
 
 		 363 aa  157  2e-37  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.922236  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3053  flagellar biosynthesis protein FlhB  31.36 
 
 		 377 aa  157  3e-37  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0535555 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0130  flagellar biosynthesis protein FlhB  31.9 
 
 		 406 aa  157  3e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.561684  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3804  flagellar biosynthesis protein FlhB  31.75 
 
 		 403 aa  156  4e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1592  flagellar biosynthesis protein FlhB  28.98 
 
 		 348 aa  156  5.0000000000000005e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0379  flagellar biosynthesis protein FlhB  31.53 
 
 		 357 aa  156  5.0000000000000005e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2923  flagellar biosynthesis protein FlhB  30.58 
 
 		 379 aa  155  8e-37  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.37481  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1735  flagellar biosynthesis protein FlhB  29 
 
 		 348 aa  155  1e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.736219  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0959  type III secretion exporter  28.53 
 
 		 377 aa  155  1e-36  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4135  flagellar biosynthetic protein FlhB  31.44 
 
 		 350 aa  155  1e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0846766  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3821  flagellar biosynthesis protein FlhB  31.36 
 
 		 353 aa  154  2e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1592  flagellar biosynthesis protein FlhB  27.84 
 
 		 348 aa  154  2e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1556  flagellar biosynthesis protein FlhB  27.84 
 
 		 348 aa  154  2e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1545  flagellar biosynthesis protein FlhB  27.84 
 
 		 348 aa  154  2e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1715  flagellar biosynthetic protein FlhB  27.84 
 
 		 348 aa  154  2e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1766  flagellar biosynthesis protein FlhB  27.84 
 
 		 348 aa  154  2e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3698  flagellar biosynthesis protein FlhB  30.58 
 
 		 380 aa  154  2e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0239481 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1639  type III secretion exporter  32.77 
 
 		 351 aa  154  2e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0658  flagellar biosynthetic protein FlhB  30.29 
 
 		 353 aa  154  2.9999999999999998e-36  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.622115  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3370  flagellar biosynthesis protein FlhB  32.09 
 
 		 398 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00184569  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2955  flagellar biosynthesis protein FlhB  30.4 
 
 		 363 aa  154  2.9999999999999998e-36  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.111273 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0750  type III secretion system protein HrcU  33.24 
 
 		 360 aa  153  4e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0905461  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2015  flagellar biosynthesis protein FlhB  30.4 
 
 		 356 aa  153  5e-36  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0342  flagellar biosynthesis protein FlhB  29.65 
 
 		 357 aa  152  5.9999999999999996e-36  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00837822  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2016  flagellar biosynthetic protein FlhB  31.73 
 
 		 387 aa  152  8e-36  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>