More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen2424_4844 on replicon NC_008543
Organism: Burkholderia cenocepacia HI2424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010515  Bcenmc03_5440  type III secretion exporter  98.83 
 
 
343 aa  680    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.368429  normal  0.0650452 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3750  type III secretion exporter  92.11 
 
 
343 aa  645    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0233858 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3522  type III secretion exporter  100 
 
 
343 aa  686    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4844  type III secretion exporter  100 
 
 
343 aa  686    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000249034  normal  0.515016 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4741  type III secretion exporter  90.96 
 
 
343 aa  590  1e-167  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.908956  normal  0.834614 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4219  type III secretion exporter  90.64 
 
 
343 aa  586  1e-166  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.104818  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2412  type III secretion protein, YscU/HrpY family  33.72 
 
 
346 aa  178  9e-44  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3011  YscD family type III secretion protein  33.72 
 
 
346 aa  174  1.9999999999999998e-42  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.859866  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3899  secretion system apparatus protein SsaU  35.55 
 
 
355 aa  171  1e-41  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3811  secretion system apparatus protein SsaU  35.55 
 
 
356 aa  171  2e-41  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3926  secretion system apparatus protein SsaU  35.26 
 
 
355 aa  168  1e-40  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003359  type III secretion inner membrane protein HrpY  33.43 
 
 
351 aa  167  2.9999999999999998e-40  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03402  type III secretion system protein HrcU  33.24 
 
 
359 aa  164  2.0000000000000002e-39  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01723  Type III secretory pathway, component EscU  31.21 
 
 
349 aa  158  1e-37  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1977  secretion system apparatus protein SsaU  32.47 
 
 
349 aa  153  5e-36  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0453  type III secretion system protein HrcU  34.21 
 
 
352 aa  151  1e-35  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.959251  normal  0.0822049 
 
 
-
 
NC_002620  TC0366  type III secretion system protein  30.37 
 
 
360 aa  150  2e-35  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2281  secretion system apparatus protein SsaU  31.99 
 
 
349 aa  150  4e-35  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0436639  normal  0.672371 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16690  flagellar biosynthetic protein FlhB  34.19 
 
 
356 aa  149  5e-35  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1129  flagellar biosynthesis protein FlhB  31.81 
 
 
360 aa  147  2.0000000000000003e-34  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5071  secretion system apparatus protein SsaU  28.78 
 
 
345 aa  145  9e-34  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.796147  normal  0.0581283 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0242  flagellar biosynthesis protein FlhB  29.71 
 
 
377 aa  144  2e-33  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.33455  normal  0.0187302 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0703  flagellar biosynthetic protein FlhB  28.19 
 
 
354 aa  144  3e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.635027  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2393  flagellar biosynthetic protein FlhB  30.03 
 
 
354 aa  143  5e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1749  flagellar biosynthetic protein FlhB  32.84 
 
 
359 aa  142  9.999999999999999e-33  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0623  flagellar biosynthesis protein FlhB  28.86 
 
 
377 aa  141  1.9999999999999998e-32  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5857  type III secretion system protein HrcU  30.45 
 
 
352 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1631  type III secretion system protein HrcU  33.83 
 
 
360 aa  140  3e-32  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.882123  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0680  type III secretion system protein HrcU  33.83 
 
 
399 aa  140  3e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0663628  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5640  type III secretion system protein HrcU  30.45 
 
 
352 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.122414 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2199  type III secretion system protein HrcU  33.83 
 
 
420 aa  139  4.999999999999999e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.706014  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2282  type III secretion system protein HrcU  33.83 
 
 
420 aa  140  4.999999999999999e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.58403  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1412  flagellar biosynthetic protein FlhB  27.41 
 
 
363 aa  139  7e-32  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.342211  normal  0.890154 
 
 
-
 
NC_010157  YpAngola_B0048  type III secretion appartus protein YscU  28.91 
 
 
354 aa  138  1e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000158953  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0703  flagellar biosynthesis protein FlhB  29.28 
 
 
377 aa  138  1e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.246065  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0743  flagellar biosynthetic protein FlhB  30.7 
 
 
381 aa  137  2e-31  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0634  type III secretion system protein HrcU  33.83 
 
 
420 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1954  type III secretion system protein HrcU  33.83 
 
 
420 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1384  flagellar biosynthesis protein FlhB  32.08 
 
 
360 aa  137  4e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.696508  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1904  type III secretion system protein HrcU  33.43 
 
 
352 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0427  type III secretion system protein HrcU  33.43 
 
 
352 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0498216  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1996  type III secretion system protein HrcU  33.43 
 
 
352 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.920837  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1930  flagellar biosynthetic protein FlhB  32.1 
 
 
363 aa  133  3e-30  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.922236  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5932  type III secretion system protein HrcU  34.49 
 
 
357 aa  133  3.9999999999999996e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.897512  normal  0.0426598 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0750  type III secretion system protein HrcU  33.14 
 
 
360 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0905461  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0740  type III secretion exporter  33.04 
 
 
381 aa  130  2.0000000000000002e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0380  flagellar biosynthesis protein FlhB  27.75 
 
 
362 aa  130  3e-29  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.441846  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2328  type III secretion exporter  30.7 
 
 
363 aa  130  3e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.645604  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1330  flagellar biosynthesis protein FlhB  26.93 
 
 
358 aa  130  3e-29  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2575  flagellar biosynthetic protein FlhB  30.52 
 
 
359 aa  130  4.0000000000000003e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.011127 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0658  flagellar biosynthetic protein FlhB  28.99 
 
 
353 aa  130  4.0000000000000003e-29  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.622115  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0864  type III secretion system protein HrcU  30.29 
 
 
357 aa  129  6e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00479024 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2603  flagellar biosynthetic protein FlhB  28.41 
 
 
354 aa  129  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.371847  normal  0.56 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0357  flagellar biosynthesis protein FlhB  25.88 
 
 
368 aa  128  1.0000000000000001e-28  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2215  type III secretion protein, YscU/HrpY family  29.36 
 
 
359 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0332  flagellar biosynthesis protein FlhB  27.6 
 
 
359 aa  129  1.0000000000000001e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2826  flagellar biosynthetic protein FlhB  28.15 
 
 
354 aa  128  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.986887  normal  0.270742 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1674  flagellar biosynthetic protein FlhB  28.94 
 
 
360 aa  127  2.0000000000000002e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2633  flagellar biosynthetic protein FlhB  28.41 
 
 
355 aa  127  3e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.295644  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0011  flagellar biosynthetic protein FlhB  26.63 
 
 
355 aa  127  3e-28  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0669  flagellar biosynthesis protein FlhB  28.74 
 
 
350 aa  126  4.0000000000000003e-28  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0757109  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1944  flagellar biosynthetic protein FlhB  30.83 
 
 
381 aa  126  5e-28  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42660  translocation protein in type III secretion  30.99 
 
 
349 aa  126  7e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3431  flagellar biosynthetic protein FlhB  28.9 
 
 
378 aa  125  1e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1623  flagellar biosynthesis protein FlhB  27.78 
 
 
362 aa  124  2e-27  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0130  flagellar biosynthesis protein FlhB  30.79 
 
 
406 aa  124  2e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.561684  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4135  flagellar biosynthetic protein FlhB  29.97 
 
 
350 aa  124  3e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0846766  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2955  flagellar biosynthesis protein FlhB  29.83 
 
 
363 aa  124  3e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.111273 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2261  type III secretion exporter  33.14 
 
 
365 aa  123  4e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.242916  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0342  flagellar biosynthesis protein FlhB  26.32 
 
 
357 aa  123  5e-27  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00837822  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0018  flagellar biosynthetic protein FlhB  29.21 
 
 
374 aa  122  6e-27  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000937461  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0379  flagellar biosynthesis protein FlhB  30.32 
 
 
357 aa  122  7e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1397  flagellar biosynthetic protein FlhB  27.59 
 
 
363 aa  122  9.999999999999999e-27  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0018  flagellar biosynthetic protein FlhB  28.93 
 
 
374 aa  121  9.999999999999999e-27  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000395256  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2626  flagellar biosynthesis protein FlhB  32.19 
 
 
368 aa  122  9.999999999999999e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.447547 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3804  flagellar biosynthesis protein FlhB  30.21 
 
 
403 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1163  flagellar biosynthesis protein FlhB  28.69 
 
 
351 aa  120  3e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3698  flagellar biosynthesis protein FlhB  31.12 
 
 
380 aa  120  3e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0239481 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0713  flagellar biosynthetic protein FlhB  29.23 
 
 
379 aa  120  3e-26  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.31011  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1518  secretion system apparatus protein SsaU  27.91 
 
 
352 aa  120  3.9999999999999996e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.00925486  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1752  secretion system apparatus protein SsaU  27.25 
 
 
352 aa  119  4.9999999999999996e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00000000152464  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1334  flagellar biosynthetic protein FlhB  31.93 
 
 
384 aa  120  4.9999999999999996e-26  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4406  flagellar biosynthesis protein FlhB  29.89 
 
 
357 aa  119  6e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.202983  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3596  flagellar biosynthetic protein FlhB  26.16 
 
 
374 aa  119  6e-26  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.189893  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3094  flagellar biosynthesis protein FlhB  29.24 
 
 
353 aa  119  7e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1522  flagellar biosynthesis protein FlhB  30.68 
 
 
358 aa  119  7.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.23127  normal  0.258787 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0868  flagellar biosynthesis/type III secretory pathway protein  29.6 
 
 
369 aa  119  7.999999999999999e-26  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0959  type III secretion exporter  29.31 
 
 
377 aa  119  9.999999999999999e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0484  flagellar biosynthetic protein FlhB  27.14 
 
 
392 aa  119  9.999999999999999e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0127914  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2069  flagellar biosynthesis protein FlhB  30.21 
 
 
383 aa  117  1.9999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00553621 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1137  flagellar biosynthesis protein FlhB  28.65 
 
 
359 aa  118  1.9999999999999998e-25  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1532  secretion system apparatus protein SsaU  27.83 
 
 
352 aa  117  3e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.371934  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1921  secretion system apparatus protein SsaU  27.83 
 
 
352 aa  117  3e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.133432  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1208  flagellar biosynthesis protein FlhB  30.21 
 
 
383 aa  117  3e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1555  secretion system apparatus protein SsaU  27.83 
 
 
352 aa  117  3e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2074  flagellar biosynthesis protein FlhB  30.21 
 
 
383 aa  117  3e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000897295 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3370  flagellar biosynthesis protein FlhB  30.43 
 
 
398 aa  116  3.9999999999999997e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00184569  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1866  flagellar biosynthesis protein FlhB  30.03 
 
 
376 aa  117  3.9999999999999997e-25  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.965675  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3772  flagellar biosynthesis protein FlhB  30.7 
 
 
358 aa  116  5e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0655991  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2129  flagellar biosynthesis protein FlhB  30.21 
 
 
383 aa  116  6e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000192021 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>