More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1106A_A2199 on replicon NC_009078
Organism: Burkholderia pseudomallei 1106a



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006349  BMAA1631  type III secretion system protein HrcU  99.44 
 
 		 360 aa  713    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.882123  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0680  type III secretion system protein HrcU  99.75 
 
 		 399 aa  792    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0663628  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2199  type III secretion system protein HrcU  100 
 
 		 420 aa  832    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.706014  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1954  type III secretion system protein HrcU  99.05 
 
 		 420 aa  822    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0634  type III secretion system protein HrcU  99.05 
 
 		 420 aa  822    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2282  type III secretion system protein HrcU  99.52 
 
 		 420 aa  828    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.58403  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0750  type III secretion system protein HrcU  90 
 
 		 360 aa  608  1e-173  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0905461  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1904  type III secretion system protein HrcU  47.85 
 
 		 352 aa  335  1e-90  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0427  type III secretion system protein HrcU  47.85 
 
 		 352 aa  335  1e-90  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0498216  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1996  type III secretion system protein HrcU  47.56 
 
 		 352 aa  334  2e-90  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.920837  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03402  type III secretion system protein HrcU  45.09 
 
 		 359 aa  323  4e-87  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5857  type III secretion system protein HrcU  48.72 
 
 		 352 aa  322  8e-87  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5640  type III secretion system protein HrcU  48.84 
 
 		 352 aa  321  1.9999999999999998e-86  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.122414 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0864  type III secretion system protein HrcU  48.12 
 
 		 357 aa  289  7e-77  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00479024 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0453  type III secretion system protein HrcU  43.97 
 
 		 352 aa  280  3e-74  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.959251  normal  0.0822049 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5932  type III secretion system protein HrcU  44.54 
 
 		 357 aa  265  1e-69  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.897512  normal  0.0426598 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0342  flagellar biosynthesis protein FlhB  35.47 
 
 		 357 aa  204  2e-51  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00837822  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0011  flagellar biosynthetic protein FlhB  34.83 
 
 		 355 aa  203  5e-51  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01723  Type III secretory pathway, component EscU  37.85 
 
 		 349 aa  203  6e-51  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003359  type III secretion inner membrane protein HrpY  36.67 
 
 		 351 aa  195  1e-48  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3011  YscD family type III secretion protein  35.24 
 
 		 346 aa  195  1e-48  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.859866  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2412  type III secretion protein, YscU/HrpY family  35.61 
 
 		 346 aa  192  8e-48  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1623  flagellar biosynthesis protein FlhB  33.8 
 
 		 362 aa  191  2e-47  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0357  flagellar biosynthesis protein FlhB  34.09 
 
 		 368 aa  191  2.9999999999999997e-47  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0380  flagellar biosynthesis protein FlhB  33.24 
 
 		 362 aa  189  7e-47  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.441846  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0743  flagellar biosynthetic protein FlhB  34.08 
 
 		 381 aa  188  2e-46  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0999  flagellar biosynthesis protein FlhB  34.9 
 
 		 357 aa  186  7e-46  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3811  secretion system apparatus protein SsaU  35.45 
 
 		 356 aa  183  5.0000000000000004e-45  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3899  secretion system apparatus protein SsaU  35.45 
 
 		 355 aa  182  7e-45  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010157  YpAngola_B0048  type III secretion appartus protein YscU  34.84 
 
 		 354 aa  182  8.000000000000001e-45  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000158953  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0240  flagellar biosynthetic protein FlhB  34.02 
 
 		 353 aa  181  1e-44  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.760621  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1384  flagellar biosynthesis protein FlhB  33.15 
 
 		 360 aa  182  1e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.696508  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1330  flagellar biosynthesis protein FlhB  33.71 
 
 		 358 aa  181  2e-44  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3926  secretion system apparatus protein SsaU  35.16 
 
 		 355 aa  180  2.9999999999999997e-44  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2159  flagellar biosynthetic protein FlhB  33.99 
 
 		 377 aa  181  2.9999999999999997e-44  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0713  flagellar biosynthetic protein FlhB  34.72 
 
 		 379 aa  180  2.9999999999999997e-44  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.31011  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3819  type III secretion exporter  33.24 
 
 		 390 aa  180  4e-44  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.414984 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0703  flagellar biosynthetic protein FlhB  32.65 
 
 		 354 aa  179  8e-44  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.635027  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3092  type III secretion exporter  33.24 
 
 		 390 aa  179  9e-44  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.677478  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1882  type III secretion protein, YscU/HrpY family  32.36 
 
 		 361 aa  178  1e-43  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2281  secretion system apparatus protein SsaU  35.2 
 
 		 349 aa  178  1e-43  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0436639  normal  0.672371 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4412  type III secretion exporter  33.05 
 
 		 390 aa  178  2e-43  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1163  flagellar biosynthesis protein FlhB  32.96 
 
 		 351 aa  177  3e-43  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2393  flagellar biosynthetic protein FlhB  32.95 
 
 		 354 aa  176  5e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1674  flagellar biosynthetic protein FlhB  33.97 
 
 		 360 aa  176  6e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1977  secretion system apparatus protein SsaU  34.08 
 
 		 349 aa  176  7e-43  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1930  flagellar biosynthetic protein FlhB  34.07 
 
 		 363 aa  175  1.9999999999999998e-42  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.922236  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0484  flagellar biosynthetic protein FlhB  33.05 
 
 		 392 aa  173  6.999999999999999e-42  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0127914  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1129  flagellar biosynthesis protein FlhB  34.37 
 
 		 360 aa  172  7.999999999999999e-42  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0849  flagellar biosynthetic protein FlhB  32.19 
 
 		 377 aa  171  2e-41  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2696  flagellar biosynthetic protein FlhB  30.98 
 
 		 373 aa  171  2e-41  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3821  flagellar biosynthesis protein FlhB  33.24 
 
 		 353 aa  171  3e-41  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2215  type III secretion protein, YscU/HrpY family  31.82 
 
 		 359 aa  171  3e-41  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0981  flagellar biosynthetic protein FlhB  32.78 
 
 		 390 aa  171  3e-41  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0800953 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1752  secretion system apparatus protein SsaU  34.17 
 
 		 352 aa  169  7e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00000000152464  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1921  secretion system apparatus protein SsaU  34.17 
 
 		 352 aa  169  8e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.133432  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3034  flagellar biosynthetic protein FlhB  33.24 
 
 		 374 aa  169  8e-41  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1555  secretion system apparatus protein SsaU  34.17 
 
 		 352 aa  169  1e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1334  flagellar biosynthetic protein FlhB  32.39 
 
 		 384 aa  168  1e-40  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2154  flagellar biosynthetic protein FlhB  30.99 
 
 		 366 aa  169  1e-40  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1532  secretion system apparatus protein SsaU  34.17 
 
 		 352 aa  169  1e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.371934  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1518  secretion system apparatus protein SsaU  34.17 
 
 		 352 aa  168  2e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.00925486  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3390  flagellar biosynthesis protein FlhB  32.21 
 
 		 379 aa  167  2.9999999999999998e-40  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1397  flagellar biosynthetic protein FlhB  31.52 
 
 		 363 aa  167  2.9999999999999998e-40  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1245  flagellar biosynthetic protein FlhB  33.43 
 
 		 390 aa  166  5e-40  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.215857  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0018  flagellar biosynthetic protein FlhB  31.9 
 
 		 374 aa  166  5.9999999999999996e-40  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000937461  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4137  surface presentation of antigens protein SpaS  28.97 
 
 		 373 aa  166  5.9999999999999996e-40  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000465227 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3370  flagellar biosynthesis protein FlhB  35.1 
 
 		 398 aa  166  6.9999999999999995e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00184569  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0959  type III secretion exporter  36.22 
 
 		 377 aa  165  1.0000000000000001e-39  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3905  flagellar biosynthesis protein FlhB  32.42 
 
 		 353 aa  166  1.0000000000000001e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000447126 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16690  flagellar biosynthetic protein FlhB  32.17 
 
 		 356 aa  164  2.0000000000000002e-39  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0018  flagellar biosynthetic protein FlhB  31.61 
 
 		 374 aa  165  2.0000000000000002e-39  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000395256  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1944  flagellar biosynthetic protein FlhB  34.56 
 
 		 381 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3217  flagellar biosynthesis protein FlhB  34.47 
 
 		 354 aa  164  3e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.447718 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2030  flagellar biosynthetic protein FlhB  34.38 
 
 		 356 aa  164  3e-39  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.9056  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1702  flagellar biosynthesis protein FlhB  32.96 
 
 		 376 aa  164  3e-39  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0242  flagellar biosynthesis protein FlhB  31.65 
 
 		 379 aa  164  3e-39  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45720  flagellar biosynthesis protein FlhB  34.42 
 
 		 378 aa  163  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0426  flagellar biosynthesis protein FlhB  32.77 
 
 		 352 aa  163  6e-39  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.888697  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3053  flagellar biosynthesis protein FlhB  32.04 
 
 		 377 aa  162  8.000000000000001e-39  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0535555 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0049  YscU/HrpY family type III secretion protein  34.37 
 
 		 359 aa  162  8.000000000000001e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2069  flagellar biosynthesis protein FlhB  30.33 
 
 		 383 aa  162  1e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00553621 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2074  flagellar biosynthesis protein FlhB  30.33 
 
 		 383 aa  162  1e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000897295 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1515  flagellar biosynthesis protein FlhB  31.25 
 
 		 376 aa  162  1e-38  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.813027  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1208  flagellar biosynthesis protein FlhB  30.33 
 
 		 383 aa  162  1e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3441  flagellar biosynthesis protein FlhB  32.41 
 
 		 378 aa  162  1e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.456344 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3804  flagellar biosynthesis protein FlhB  32.1 
 
 		 403 aa  162  1e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1866  flagellar biosynthesis protein FlhB  30.86 
 
 		 376 aa  162  1e-38  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.965675  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3431  flagellar biosynthetic protein FlhB  30.62 
 
 		 378 aa  161  2e-38  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1547  flagellar biosynthesis protein FlhB  30.51 
 
 		 383 aa  161  2e-38  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2129  flagellar biosynthesis protein FlhB  30.33 
 
 		 383 aa  161  2e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000192021 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1339  flagellar biosynthesis protein FlhB  30.97 
 
 		 377 aa  161  2e-38  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3698  flagellar biosynthesis protein FlhB  34.71 
 
 		 380 aa  160  3e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0239481 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1975  flagellar biosynthetic protein FlhB  32.01 
 
 		 378 aa  160  4e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.185057  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0616  flagellar biosynthesis protein FlhB  32.57 
 
 		 354 aa  160  4e-38  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.55435 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2016  flagellar biosynthetic protein FlhB  33.43 
 
 		 387 aa  160  4e-38  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1195  flagellar biosynthesis protein FlhB  31.48 
 
 		 377 aa  160  4e-38  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1331  flagellar biosynthesis protein FlhB  30.33 
 
 		 383 aa  160  4e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.384239  hitchhiker  0.0000000000516194 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02874  flagellar biosynthesis protein  33.15 
 
 		 374 aa  160  5e-38  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0130  flagellar biosynthesis protein FlhB  32.86 
 
 		 406 aa  159  6e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.561684  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>