More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1106A_A1904 on replicon NC_009078
Organism: Burkholderia pseudomallei 1106a



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007435  BURPS1710b_A0427  type III secretion system protein HrcU  100 
 
 		 352 aa  706    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0498216  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1996  type III secretion system protein HrcU  99.72 
 
 		 352 aa  706    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.920837  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1904  type III secretion system protein HrcU  100 
 
 		 352 aa  706    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5640  type III secretion system protein HrcU  46.97 
 
 		 352 aa  323  4e-87  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.122414 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5857  type III secretion system protein HrcU  46.4 
 
 		 352 aa  320  3e-86  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0864  type III secretion system protein HrcU  50 
 
 		 357 aa  313  3.9999999999999997e-84  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00479024 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2199  type III secretion system protein HrcU  46.99 
 
 		 420 aa  312  4.999999999999999e-84  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.706014  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0680  type III secretion system protein HrcU  46.85 
 
 		 399 aa  312  6.999999999999999e-84  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0663628  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2282  type III secretion system protein HrcU  46.99 
 
 		 420 aa  311  1e-83  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.58403  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0750  type III secretion system protein HrcU  47.31 
 
 		 360 aa  311  2e-83  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0905461  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03402  type III secretion system protein HrcU  45.22 
 
 		 359 aa  307  1.0000000000000001e-82  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1631  type III secretion system protein HrcU  46.55 
 
 		 360 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.882123  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1954  type III secretion system protein HrcU  46.39 
 
 		 420 aa  305  6e-82  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0634  type III secretion system protein HrcU  46.39 
 
 		 420 aa  305  6e-82  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0453  type III secretion system protein HrcU  42.48 
 
 		 352 aa  271  2e-71  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.959251  normal  0.0822049 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5932  type III secretion system protein HrcU  44.7 
 
 		 357 aa  266  4e-70  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.897512  normal  0.0426598 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0357  flagellar biosynthesis protein FlhB  35.38 
 
 		 368 aa  212  9e-54  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0380  flagellar biosynthesis protein FlhB  35.28 
 
 		 362 aa  211  1e-53  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.441846  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1623  flagellar biosynthesis protein FlhB  35.48 
 
 		 362 aa  211  2e-53  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003359  type III secretion inner membrane protein HrpY  35.33 
 
 		 351 aa  203  4e-51  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01723  Type III secretory pathway, component EscU  35.96 
 
 		 349 aa  198  1.0000000000000001e-49  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1330  flagellar biosynthesis protein FlhB  34.38 
 
 		 358 aa  196  4.0000000000000005e-49  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0999  flagellar biosynthesis protein FlhB  34.81 
 
 		 357 aa  195  9e-49  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1866  flagellar biosynthesis protein FlhB  35.8 
 
 		 376 aa  190  2.9999999999999997e-47  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.965675  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0342  flagellar biosynthesis protein FlhB  32.87 
 
 		 357 aa  190  2.9999999999999997e-47  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00837822  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0240  flagellar biosynthetic protein FlhB  33.62 
 
 		 353 aa  189  5.999999999999999e-47  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.760621  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00962  flagellar biosynthesis protein FlhB  34.86 
 
 		 376 aa  186  5e-46  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.118534  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06204  flagellar biosynthesis protein FlhB  34.86 
 
 		 376 aa  186  5e-46  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.236866  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0743  flagellar biosynthetic protein FlhB  34.8 
 
 		 381 aa  185  1.0000000000000001e-45  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0011  flagellar biosynthetic protein FlhB  32.76 
 
 		 355 aa  184  3e-45  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2412  type III secretion protein, YscU/HrpY family  34.17 
 
 		 346 aa  182  6e-45  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3431  flagellar biosynthetic protein FlhB  34.73 
 
 		 378 aa  182  1e-44  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3011  YscD family type III secretion protein  34.08 
 
 		 346 aa  181  2e-44  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.859866  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0703  flagellar biosynthetic protein FlhB  33.14 
 
 		 354 aa  179  4.999999999999999e-44  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.635027  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1163  flagellar biosynthesis protein FlhB  32.86 
 
 		 351 aa  179  4.999999999999999e-44  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010157  YpAngola_B0048  type III secretion appartus protein YscU  32.39 
 
 		 354 aa  179  5.999999999999999e-44  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000158953  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0740  type III secretion exporter  35.06 
 
 		 381 aa  177  3e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4412  type III secretion exporter  31.87 
 
 		 390 aa  177  3e-43  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2604  flagellar biosynthesis protein FlhB  34.01 
 
 		 383 aa  175  9.999999999999999e-43  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0426  flagellar biosynthesis protein FlhB  30.36 
 
 		 352 aa  174  1.9999999999999998e-42  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.888697  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2393  flagellar biosynthetic protein FlhB  34.01 
 
 		 354 aa  173  2.9999999999999996e-42  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1944  flagellar biosynthetic protein FlhB  33.33 
 
 		 381 aa  173  3.9999999999999995e-42  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3821  flagellar biosynthesis protein FlhB  32.11 
 
 		 353 aa  172  9e-42  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1862  flagellar biosynthesis protein FlhB  34.01 
 
 		 383 aa  171  2e-41  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.90359  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3819  type III secretion exporter  32.46 
 
 		 390 aa  170  3e-41  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.414984 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3092  type III secretion exporter  32.46 
 
 		 390 aa  170  4e-41  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.677478  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0366  type III secretion system protein  31.44 
 
 		 360 aa  168  1e-40  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2295  flagellar biosynthesis protein FlhB  33.52 
 
 		 376 aa  168  1e-40  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1515  flagellar biosynthesis protein FlhB  31.96 
 
 		 376 aa  167  2e-40  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.813027  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3899  secretion system apparatus protein SsaU  31.52 
 
 		 355 aa  167  2e-40  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3804  flagellar biosynthesis protein FlhB  32.46 
 
 		 403 aa  167  2e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3811  secretion system apparatus protein SsaU  31.81 
 
 		 356 aa  168  2e-40  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1129  flagellar biosynthesis protein FlhB  29.28 
 
 		 360 aa  167  2.9999999999999998e-40  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02874  flagellar biosynthesis protein  33.33 
 
 		 374 aa  167  2.9999999999999998e-40  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3926  secretion system apparatus protein SsaU  31.81 
 
 		 355 aa  167  2.9999999999999998e-40  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0242  flagellar biosynthesis protein FlhB  29.95 
 
 		 377 aa  166  4e-40  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.33455  normal  0.0187302 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0669  flagellar biosynthesis protein FlhB  31.05 
 
 		 350 aa  166  4e-40  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0757109  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3698  flagellar biosynthesis protein FlhB  34.01 
 
 		 380 aa  166  5e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0239481 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2215  type III secretion protein, YscU/HrpY family  32.16 
 
 		 359 aa  166  5.9999999999999996e-40  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1245  flagellar biosynthetic protein FlhB  33.14 
 
 		 390 aa  166  5.9999999999999996e-40  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.215857  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1977  secretion system apparatus protein SsaU  33.05 
 
 		 349 aa  166  5.9999999999999996e-40  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1882  type III secretion protein, YscU/HrpY family  31.04 
 
 		 361 aa  166  6.9999999999999995e-40  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1930  flagellar biosynthetic protein FlhB  30.42 
 
 		 363 aa  166  6.9999999999999995e-40  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.922236  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0130  flagellar biosynthesis protein FlhB  32.46 
 
 		 406 aa  166  8e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.561684  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3034  flagellar biosynthetic protein FlhB  33.06 
 
 		 374 aa  166  8e-40  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1374  flagellar biosynthesis protein FlhB  31.03 
 
 		 377 aa  165  8e-40  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1547  flagellar biosynthesis protein FlhB  32.11 
 
 		 383 aa  165  1.0000000000000001e-39  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0658  flagellar biosynthetic protein FlhB  30.17 
 
 		 353 aa  165  1.0000000000000001e-39  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.622115  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1631  flagellar biosynthesis protein FlhB  31.3 
 
 		 377 aa  165  1.0000000000000001e-39  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0623  flagellar biosynthesis protein FlhB  29.72 
 
 		 377 aa  165  1.0000000000000001e-39  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3905  flagellar biosynthesis protein FlhB  33.33 
 
 		 353 aa  164  2.0000000000000002e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000447126 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1339  flagellar biosynthesis protein FlhB  30.52 
 
 		 377 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001177  flagellar biosynthesis protein FlhB  30.06 
 
 		 375 aa  164  2.0000000000000002e-39  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0981  flagellar biosynthetic protein FlhB  32.46 
 
 		 390 aa  164  2.0000000000000002e-39  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0800953 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1195  flagellar biosynthesis protein FlhB  33.62 
 
 		 377 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0959  type III secretion exporter  33.81 
 
 		 377 aa  164  2.0000000000000002e-39  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04964  flagellar biosynthesis pathway, component FlhB  30.66 
 
 		 375 aa  164  3e-39  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5615  flagellar biosynthesis protein FlhB  32.49 
 
 		 380 aa  163  4.0000000000000004e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.891713  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1518  secretion system apparatus protein SsaU  31.81 
 
 		 352 aa  162  5.0000000000000005e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.00925486  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1384  flagellar biosynthesis protein FlhB  33.05 
 
 		 360 aa  162  6e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.696508  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1555  secretion system apparatus protein SsaU  31.16 
 
 		 352 aa  161  1e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1532  secretion system apparatus protein SsaU  31.16 
 
 		 352 aa  161  1e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.371934  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42660  translocation protein in type III secretion  32.29 
 
 		 349 aa  162  1e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1921  secretion system apparatus protein SsaU  30.88 
 
 		 352 aa  161  2e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.133432  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2281  secretion system apparatus protein SsaU  33.05 
 
 		 349 aa  160  2e-38  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0436639  normal  0.672371 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2016  flagellar biosynthetic protein FlhB  32.76 
 
 		 387 aa  161  2e-38  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1519  flagellar biosynthesis protein FlhB  30.62 
 
 		 383 aa  160  2e-38  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002828  flagellar biosynthesis protein FlhB  34.08 
 
 		 376 aa  160  3e-38  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2159  flagellar biosynthetic protein FlhB  32.28 
 
 		 377 aa  160  3e-38  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1379  flagellar biosynthesis protein FlhB  31.52 
 
 		 377 aa  160  3e-38  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.294814 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1674  flagellar biosynthetic protein FlhB  28.94 
 
 		 360 aa  160  3e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1752  secretion system apparatus protein SsaU  31.16 
 
 		 352 aa  160  4e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00000000152464  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0868  flagellar biosynthesis/type III secretory pathway protein  30.57 
 
 		 369 aa  160  4e-38  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2432  flagellar biosynthesis protein FlhB  32.29 
 
 		 386 aa  160  4e-38  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2129  flagellar biosynthesis protein FlhB  28.41 
 
 		 383 aa  159  5e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000192021 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3094  flagellar biosynthesis protein FlhB  30.14 
 
 		 353 aa  159  7e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2334  flagellar biosynthesis protein FlhB  32.29 
 
 		 386 aa  159  7e-38  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.178036  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3390  flagellar biosynthesis protein FlhB  29.63 
 
 		 379 aa  159  9e-38  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1331  flagellar biosynthesis protein FlhB  28.41 
 
 		 383 aa  159  9e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.384239  hitchhiker  0.0000000000516194 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0332  flagellar biosynthesis protein FlhB  32.76 
 
 		 359 aa  159  9e-38  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>