More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal195_2281 on replicon NC_009997
Organism: Shewanella baltica OS195



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009997  Sbal195_2281  secretion system apparatus protein SsaU  100 
 
 		 349 aa  717    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0436639  normal  0.672371 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1977  secretion system apparatus protein SsaU  96.56 
 
 		 349 aa  693    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3926  secretion system apparatus protein SsaU  50 
 
 		 355 aa  357  9.999999999999999e-98  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3899  secretion system apparatus protein SsaU  49.71 
 
 		 355 aa  355  7.999999999999999e-97  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3811  secretion system apparatus protein SsaU  49.42 
 
 		 356 aa  354  1e-96  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1518  secretion system apparatus protein SsaU  47.29 
 
 		 352 aa  325  7e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.00925486  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1752  secretion system apparatus protein SsaU  46.7 
 
 		 352 aa  323  4e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00000000152464  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1921  secretion system apparatus protein SsaU  46.57 
 
 		 352 aa  322  8e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.133432  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1555  secretion system apparatus protein SsaU  46.57 
 
 		 352 aa  321  9.999999999999999e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1532  secretion system apparatus protein SsaU  46.57 
 
 		 352 aa  321  9.999999999999999e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.371934  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5071  secretion system apparatus protein SsaU  41.16 
 
 		 345 aa  304  2.0000000000000002e-81  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.796147  normal  0.0581283 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003359  type III secretion inner membrane protein HrpY  37.46 
 
 		 351 aa  236  4e-61  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01723  Type III secretory pathway, component EscU  35.69 
 
 		 349 aa  230  3e-59  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3011  YscD family type III secretion protein  33.91 
 
 		 346 aa  212  7.999999999999999e-54  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.859866  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2412  type III secretion protein, YscU/HrpY family  33.91 
 
 		 346 aa  212  9e-54  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42660  translocation protein in type III secretion  36.57 
 
 		 349 aa  208  1e-52  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010157  YpAngola_B0048  type III secretion appartus protein YscU  35.61 
 
 		 354 aa  207  2e-52  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000158953  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0868  flagellar biosynthesis/type III secretory pathway protein  35.53 
 
 		 369 aa  196  6e-49  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1882  type III secretion protein, YscU/HrpY family  32.77 
 
 		 361 aa  195  1e-48  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0703  flagellar biosynthetic protein FlhB  33.53 
 
 		 354 aa  192  9e-48  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.635027  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1129  flagellar biosynthesis protein FlhB  33.33 
 
 		 360 aa  189  5e-47  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16690  flagellar biosynthetic protein FlhB  34.02 
 
 		 356 aa  189  7e-47  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2215  type III secretion protein, YscU/HrpY family  32.28 
 
 		 359 aa  188  9e-47  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03402  type III secretion system protein HrcU  35.57 
 
 		 359 aa  188  1e-46  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1412  flagellar biosynthetic protein FlhB  33.33 
 
 		 363 aa  184  1.0000000000000001e-45  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.342211  normal  0.890154 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2393  flagellar biosynthetic protein FlhB  35.24 
 
 		 354 aa  184  2.0000000000000003e-45  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1631  flagellar biosynthetic protein FlhB  35.31 
 
 		 350 aa  181  1e-44  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0011  flagellar biosynthetic protein FlhB  34.37 
 
 		 355 aa  182  1e-44  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0453  type III secretion system protein HrcU  34.87 
 
 		 352 aa  180  2.9999999999999997e-44  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.959251  normal  0.0822049 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1384  flagellar biosynthesis protein FlhB  34.29 
 
 		 360 aa  178  1e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.696508  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1330  flagellar biosynthesis protein FlhB  34.86 
 
 		 358 aa  177  2e-43  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0713  flagellar biosynthetic protein FlhB  34.09 
 
 		 379 aa  177  2e-43  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.31011  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1674  flagellar biosynthetic protein FlhB  33.43 
 
 		 360 aa  177  3e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0342  flagellar biosynthesis protein FlhB  33.33 
 
 		 357 aa  175  8e-43  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00837822  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4135  flagellar biosynthetic protein FlhB  32.48 
 
 		 350 aa  175  9e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0846766  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1339  flagellar biosynthesis protein FlhB  33.43 
 
 		 377 aa  174  9.999999999999999e-43  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0366  type III secretion system protein  32.8 
 
 		 360 aa  172  5e-42  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0750  type III secretion system protein HrcU  35.75 
 
 		 360 aa  172  5e-42  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0905461  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2284  flagellar biosynthesis protein FlhB  32.67 
 
 		 377 aa  173  5e-42  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.562852  normal  0.66393 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0379  flagellar biosynthesis protein FlhB  35.04 
 
 		 357 aa  171  2e-41  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0484  flagellar biosynthetic protein FlhB  31.61 
 
 		 392 aa  171  2e-41  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0127914  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1944  flagellar biosynthetic protein FlhB  32.49 
 
 		 381 aa  171  2e-41  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3053  flagellar biosynthesis protein FlhB  32.1 
 
 		 377 aa  170  3e-41  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0535555 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5932  type III secretion system protein HrcU  33.52 
 
 		 357 aa  170  3e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.897512  normal  0.0426598 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1195  flagellar biosynthesis protein FlhB  32.28 
 
 		 377 aa  170  4e-41  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1379  flagellar biosynthesis protein FlhB  31.62 
 
 		 377 aa  169  5e-41  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.294814 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0960  flagellar biosynthetic protein FlhB  33.14 
 
 		 384 aa  167  2e-40  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1631  flagellar biosynthesis protein FlhB  33.62 
 
 		 377 aa  167  2e-40  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0049  YscU/HrpY family type III secretion protein  33.33 
 
 		 359 aa  166  4e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1930  flagellar biosynthetic protein FlhB  32.47 
 
 		 363 aa  167  4e-40  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.922236  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1397  flagellar biosynthetic protein FlhB  35.14 
 
 		 363 aa  166  8e-40  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1334  flagellar biosynthetic protein FlhB  32.46 
 
 		 384 aa  165  1.0000000000000001e-39  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0380  flagellar biosynthesis protein FlhB  31.09 
 
 		 362 aa  164  2.0000000000000002e-39  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.441846  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0018  flagellar biosynthetic protein FlhB  32.77 
 
 		 374 aa  164  2.0000000000000002e-39  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000395256  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1245  flagellar biosynthetic protein FlhB  32.29 
 
 		 390 aa  164  2.0000000000000002e-39  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.215857  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0018  flagellar biosynthetic protein FlhB  32.77 
 
 		 374 aa  164  2.0000000000000002e-39  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000937461  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0658  flagellar biosynthetic protein FlhB  32.44 
 
 		 353 aa  164  2.0000000000000002e-39  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.622115  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2154  flagellar biosynthetic protein FlhB  30.97 
 
 		 366 aa  164  2.0000000000000002e-39  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0069  flagellar biosynthetic protein FlhB  31.98 
 
 		 358 aa  163  3e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1392  type III secretion protein HrcU  31.73 
 
 		 359 aa  163  5.0000000000000005e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1547  flagellar biosynthesis protein FlhB  33.61 
 
 		 383 aa  163  5.0000000000000005e-39  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1374  flagellar biosynthesis protein FlhB  30.52 
 
 		 377 aa  163  5.0000000000000005e-39  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0981  flagellar biosynthetic protein FlhB  32.47 
 
 		 390 aa  163  5.0000000000000005e-39  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0800953 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1391  flagellar biosynthetic protein FlhB  32.1 
 
 		 360 aa  163  5.0000000000000005e-39  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2015  flagellar biosynthesis protein FlhB  32.96 
 
 		 356 aa  162  7e-39  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45720  flagellar biosynthesis protein FlhB  34.39 
 
 		 378 aa  162  8.000000000000001e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2074  flagellar biosynthesis protein FlhB  31.64 
 
 		 383 aa  161  1e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000897295 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1208  flagellar biosynthesis protein FlhB  31.64 
 
 		 383 aa  161  1e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5857  type III secretion system protein HrcU  33.24 
 
 		 352 aa  161  1e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2069  flagellar biosynthesis protein FlhB  31.64 
 
 		 383 aa  161  2e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00553621 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2826  flagellar biosynthetic protein FlhB  32.2 
 
 		 354 aa  160  2e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.986887  normal  0.270742 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0240  flagellar biosynthetic protein FlhB  32.08 
 
 		 353 aa  160  2e-38  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.760621  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0357  flagellar biosynthesis protein FlhB  30.79 
 
 		 368 aa  161  2e-38  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1519  flagellar biosynthesis protein FlhB  32.67 
 
 		 383 aa  160  3e-38  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5640  type III secretion system protein HrcU  32.95 
 
 		 352 aa  160  3e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.122414 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1749  flagellar biosynthetic protein FlhB  30.46 
 
 		 359 aa  160  4e-38  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0332  flagellar biosynthesis protein FlhB  32.36 
 
 		 359 aa  160  4e-38  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2603  flagellar biosynthetic protein FlhB  32.2 
 
 		 354 aa  159  5e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.371847  normal  0.56 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0427  type III secretion system protein HrcU  32 
 
 		 352 aa  159  7e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0498216  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1904  type III secretion system protein HrcU  32 
 
 		 352 aa  159  7e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0426  flagellar biosynthesis protein FlhB  31.88 
 
 		 352 aa  159  8e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.888697  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2129  flagellar biosynthesis protein FlhB  31.36 
 
 		 383 aa  159  8e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000192021 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2032  flagellar biosynthetic protein FlhB  32.87 
 
 		 381 aa  159  8e-38  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.112007  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3878  flagellar biosynthesis protein FlhB  33.82 
 
 		 378 aa  159  8e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3055  flagellar biosynthesis protein FlhB  28.82 
 
 		 376 aa  159  8e-38  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.247333 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1331  flagellar biosynthesis protein FlhB  31.62 
 
 		 383 aa  159  9e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.384239  hitchhiker  0.0000000000516194 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1394  flagellar biosynthetic FlhB transmembrane protein  31.86 
 
 		 387 aa  159  1e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00896638  normal  0.765457 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1996  type III secretion system protein HrcU  32 
 
 		 352 aa  159  1e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.920837  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0743  flagellar biosynthetic protein FlhB  32.75 
 
 		 381 aa  158  1e-37  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1623  flagellar biosynthesis protein FlhB  30.79 
 
 		 362 aa  159  1e-37  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1450  flagellar biosynthesis protein FlhB  28.82 
 
 		 376 aa  159  1e-37  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2021  flagellar biosynthesis protein FlhB  33.33 
 
 		 360 aa  157  2e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0680  type III secretion system protein HrcU  34.2 
 
 		 399 aa  157  2e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0663628  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3431  flagellar biosynthetic protein FlhB  31.39 
 
 		 378 aa  157  2e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2282  type III secretion system protein HrcU  33.33 
 
 		 420 aa  157  2e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.58403  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1316  flagellar biosynthetic protein FlhB  31.09 
 
 		 366 aa  158  2e-37  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1163  flagellar biosynthesis protein FlhB  31.01 
 
 		 351 aa  157  3e-37  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2199  type III secretion system protein HrcU  34.2 
 
 		 420 aa  157  3e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.706014  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1631  type III secretion system protein HrcU  33.33 
 
 		 360 aa  157  4e-37  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.882123  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4137  surface presentation of antigens protein SpaS  29.3 
 
 		 373 aa  157  4e-37  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000465227 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>