More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_3011 on replicon NC_008741
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008741  Dvul_3011  YscD family type III secretion protein  100 
 
 		 346 aa  711    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.859866  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2412  type III secretion protein, YscU/HrpY family  85.55 
 
 		 346 aa  623  1e-177  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01723  Type III secretory pathway, component EscU  43.8 
 
 		 349 aa  299  4e-80  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003359  type III secretion inner membrane protein HrpY  40.99 
 
 		 351 aa  284  1.0000000000000001e-75  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42660  translocation protein in type III secretion  40.23 
 
 		 349 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010157  YpAngola_B0048  type III secretion appartus protein YscU  35.1 
 
 		 354 aa  241  2e-62  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000158953  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2393  flagellar biosynthetic protein FlhB  37.64 
 
 		 354 aa  217  2e-55  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0868  flagellar biosynthesis/type III secretory pathway protein  33.99 
 
 		 369 aa  217  2e-55  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3926  secretion system apparatus protein SsaU  35.91 
 
 		 355 aa  218  2e-55  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0484  flagellar biosynthetic protein FlhB  33.81 
 
 		 392 aa  216  4e-55  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0127914  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3811  secretion system apparatus protein SsaU  35.61 
 
 		 356 aa  216  5.9999999999999996e-55  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3899  secretion system apparatus protein SsaU  35.61 
 
 		 355 aa  215  8e-55  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0011  flagellar biosynthetic protein FlhB  34.29 
 
 		 355 aa  214  1.9999999999999998e-54  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2281  secretion system apparatus protein SsaU  33.91 
 
 		 349 aa  212  7.999999999999999e-54  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0436639  normal  0.672371 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0018  flagellar biosynthetic protein FlhB  35.71 
 
 		 374 aa  206  3e-52  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000937461  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1977  secretion system apparatus protein SsaU  33.05 
 
 		 349 aa  206  4e-52  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5640  type III secretion system protein HrcU  36.83 
 
 		 352 aa  206  5e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.122414 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5857  type III secretion system protein HrcU  36.83 
 
 		 352 aa  206  5e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1412  flagellar biosynthetic protein FlhB  34.39 
 
 		 363 aa  204  1e-51  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.342211  normal  0.890154 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0018  flagellar biosynthetic protein FlhB  35.43 
 
 		 374 aa  205  1e-51  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000395256  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1674  flagellar biosynthetic protein FlhB  32.66 
 
 		 360 aa  204  2e-51  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4196  flagellar biosynthesis protein FlhB  35.43 
 
 		 354 aa  204  2e-51  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1930  flagellar biosynthetic protein FlhB  36.1 
 
 		 363 aa  203  4e-51  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.922236  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1752  secretion system apparatus protein SsaU  34.31 
 
 		 352 aa  202  8e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00000000152464  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1555  secretion system apparatus protein SsaU  34.02 
 
 		 352 aa  202  9e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1532  secretion system apparatus protein SsaU  34.02 
 
 		 352 aa  202  9e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.371934  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1921  secretion system apparatus protein SsaU  34.02 
 
 		 352 aa  201  9.999999999999999e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.133432  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1129  flagellar biosynthesis protein FlhB  33.72 
 
 		 360 aa  201  1.9999999999999998e-50  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1518  secretion system apparatus protein SsaU  34.31 
 
 		 352 aa  200  3e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.00925486  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5071  secretion system apparatus protein SsaU  31.61 
 
 		 345 aa  199  7.999999999999999e-50  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.796147  normal  0.0581283 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16690  flagellar biosynthetic protein FlhB  34.31 
 
 		 356 aa  198  1.0000000000000001e-49  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2154  flagellar biosynthetic protein FlhB  32.08 
 
 		 366 aa  196  4.0000000000000005e-49  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1623  flagellar biosynthesis protein FlhB  33.24 
 
 		 362 aa  194  2e-48  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1316  flagellar biosynthetic protein FlhB  35.98 
 
 		 366 aa  194  2e-48  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0357  flagellar biosynthesis protein FlhB  32.66 
 
 		 368 aa  194  2e-48  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1397  flagellar biosynthetic protein FlhB  33.24 
 
 		 363 aa  193  3e-48  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0453  type III secretion system protein HrcU  36.06 
 
 		 352 aa  193  4e-48  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.959251  normal  0.0822049 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0380  flagellar biosynthesis protein FlhB  32.66 
 
 		 362 aa  193  5e-48  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.441846  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3053  flagellar biosynthesis protein FlhB  32.86 
 
 		 377 aa  193  5e-48  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0535555 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3804  flagellar biosynthesis protein FlhB  36.41 
 
 		 403 aa  192  6e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0426  flagellar biosynthesis protein FlhB  32.96 
 
 		 352 aa  192  7e-48  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.888697  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1882  type III secretion protein, YscU/HrpY family  30.37 
 
 		 361 aa  192  8e-48  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0054  flagellar biosynthesis protein FlhB  31.7 
 
 		 390 aa  192  1e-47  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2696  flagellar biosynthetic protein FlhB  34.38 
 
 		 373 aa  192  1e-47  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03402  type III secretion system protein HrcU  34.76 
 
 		 359 aa  191  1e-47  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0130  flagellar biosynthesis protein FlhB  36.83 
 
 		 406 aa  191  2e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.561684  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4135  flagellar biosynthetic protein FlhB  32.66 
 
 		 350 aa  191  2e-47  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0846766  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1631  flagellar biosynthesis protein FlhB  33.53 
 
 		 377 aa  191  2e-47  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3094  flagellar biosynthesis protein FlhB  32.27 
 
 		 353 aa  190  2.9999999999999997e-47  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0703  flagellar biosynthetic protein FlhB  34.37 
 
 		 354 aa  189  5e-47  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.635027  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3370  flagellar biosynthesis protein FlhB  35.28 
 
 		 398 aa  189  5.999999999999999e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00184569  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1392  type III secretion protein HrcU  33.52 
 
 		 359 aa  187  2e-46  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1208  flagellar biosynthesis protein FlhB  33.24 
 
 		 383 aa  187  2e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2074  flagellar biosynthesis protein FlhB  33.24 
 
 		 383 aa  187  2e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000897295 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0981  flagellar biosynthetic protein FlhB  35.75 
 
 		 390 aa  188  2e-46  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0800953 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2069  flagellar biosynthesis protein FlhB  33.24 
 
 		 383 aa  187  2e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00553621 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2129  flagellar biosynthesis protein FlhB  33.24 
 
 		 383 aa  187  3e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000192021 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1331  flagellar biosynthesis protein FlhB  33.24 
 
 		 383 aa  186  4e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.384239  hitchhiker  0.0000000000516194 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1339  flagellar biosynthesis protein FlhB  32.09 
 
 		 377 aa  186  4e-46  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0049  YscU/HrpY family type III secretion protein  34.67 
 
 		 359 aa  186  4e-46  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1981  flagellar biosynthesis protein FlhB  33.33 
 
 		 378 aa  186  5e-46  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.764273  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5932  type III secretion system protein HrcU  36 
 
 		 357 aa  186  7e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.897512  normal  0.0426598 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1195  flagellar biosynthesis protein FlhB  31.14 
 
 		 377 aa  186  7e-46  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0669  flagellar biosynthesis protein FlhB  32.1 
 
 		 350 aa  185  9e-46  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0757109  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1379  flagellar biosynthesis protein FlhB  32.76 
 
 		 377 aa  185  1.0000000000000001e-45  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.294814 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0342  flagellar biosynthesis protein FlhB  33.62 
 
 		 357 aa  185  1.0000000000000001e-45  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00837822  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0366  type III secretion system protein  31.9 
 
 		 360 aa  184  2.0000000000000003e-45  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3609  flagellar biosynthesis protein FlhB  30.09 
 
 		 348 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2295  flagellar biosynthesis protein FlhB  30.88 
 
 		 376 aa  184  2.0000000000000003e-45  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45720  flagellar biosynthesis protein FlhB  35.33 
 
 		 378 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3878  flagellar biosynthesis protein FlhB  34.57 
 
 		 378 aa  184  3e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1334  flagellar biosynthetic protein FlhB  33.24 
 
 		 384 aa  184  3e-45  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2215  type III secretion protein, YscU/HrpY family  32.29 
 
 		 359 aa  183  3e-45  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2032  flagellar biosynthetic protein FlhB  33.81 
 
 		 381 aa  183  4.0000000000000006e-45  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.112007  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0379  flagellar biosynthesis protein FlhB  35.51 
 
 		 357 aa  183  4.0000000000000006e-45  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2913  flagellar biosynthesis protein FlhB  31.58 
 
 		 376 aa  182  7e-45  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.847075  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1245  flagellar biosynthetic protein FlhB  32.38 
 
 		 390 aa  182  9.000000000000001e-45  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.215857  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1515  flagellar biosynthesis protein FlhB  32.57 
 
 		 376 aa  182  1e-44  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.813027  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1450  flagellar biosynthesis protein FlhB  31.58 
 
 		 376 aa  181  2e-44  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1735  flagellar biosynthesis protein FlhB  29.51 
 
 		 348 aa  180  2e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.736219  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3287  flagellar biosynthesis protein FlhB  33.71 
 
 		 357 aa  181  2e-44  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1592  flagellar biosynthesis protein FlhB  29.51 
 
 		 348 aa  181  2e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3055  flagellar biosynthesis protein FlhB  31.58 
 
 		 376 aa  181  2e-44  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.247333 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1384  flagellar biosynthesis protein FlhB  30.06 
 
 		 348 aa  180  2.9999999999999997e-44  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.226295  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1205  type III secretion protein HrcU  32.95 
 
 		 359 aa  179  4e-44  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.322672  normal  0.485565 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2447  flagellar biosynthesis protein FlhB  30.57 
 
 		 382 aa  179  4.999999999999999e-44  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1844  flagellar biosynthesis protein FlhB  29.19 
 
 		 348 aa  179  4.999999999999999e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0972714  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002828  flagellar biosynthesis protein FlhB  32.77 
 
 		 376 aa  179  4.999999999999999e-44  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2575  flagellar biosynthetic protein FlhB  34.19 
 
 		 359 aa  179  4.999999999999999e-44  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.011127 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1592  flagellar biosynthesis protein FlhB  28.9 
 
 		 348 aa  179  7e-44  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1556  flagellar biosynthesis protein FlhB  28.9 
 
 		 348 aa  179  7e-44  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1545  flagellar biosynthesis protein FlhB  28.9 
 
 		 348 aa  179  7e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1715  flagellar biosynthetic protein FlhB  28.9 
 
 		 348 aa  179  7e-44  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1766  flagellar biosynthesis protein FlhB  28.9 
 
 		 348 aa  179  7e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3821  flagellar biosynthesis protein FlhB  32.21 
 
 		 353 aa  179  8e-44  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4406  flagellar biosynthesis protein FlhB  32.57 
 
 		 357 aa  178  1e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.202983  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1330  flagellar biosynthesis protein FlhB  32.28 
 
 		 358 aa  178  1e-43  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1944  flagellar biosynthetic protein FlhB  31.43 
 
 		 381 aa  178  1e-43  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2923  flagellar biosynthesis protein FlhB  31.29 
 
 		 376 aa  178  1e-43  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3423  flagellar biosynthesis protein FlhB  35 
 
 		 401 aa  178  1e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>