More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_1205 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007005  Psyr_1205  type III secretion protein HrcU  100 
 
 		 359 aa  731    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.322672  normal  0.485565 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1392  type III secretion protein HrcU  85.52 
 
 		 359 aa  628  1e-179  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0049  YscU/HrpY family type III secretion protein  69.38 
 
 		 359 aa  506  9.999999999999999e-143  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1882  type III secretion protein, YscU/HrpY family  53.45 
 
 		 361 aa  382  1e-105  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2215  type III secretion protein, YscU/HrpY family  52.35 
 
 		 359 aa  355  5.999999999999999e-97  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01723  Type III secretory pathway, component EscU  34.86 
 
 		 349 aa  204  3e-51  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003359  type III secretion inner membrane protein HrpY  34.29 
 
 		 351 aa  201  1.9999999999999998e-50  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3926  secretion system apparatus protein SsaU  34.28 
 
 		 355 aa  193  4e-48  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3899  secretion system apparatus protein SsaU  33.99 
 
 		 355 aa  191  1e-47  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3811  secretion system apparatus protein SsaU  33.71 
 
 		 356 aa  189  5.999999999999999e-47  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3011  YscD family type III secretion protein  32.95 
 
 		 346 aa  187  3e-46  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.859866  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2412  type III secretion protein, YscU/HrpY family  32.08 
 
 		 346 aa  184  2.0000000000000003e-45  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010157  YpAngola_B0048  type III secretion appartus protein YscU  32.75 
 
 		 354 aa  182  8.000000000000001e-45  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000158953  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2393  flagellar biosynthetic protein FlhB  33.14 
 
 		 354 aa  181  1e-44  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0453  type III secretion system protein HrcU  34.82 
 
 		 352 aa  180  2.9999999999999997e-44  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.959251  normal  0.0822049 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03402  type III secretion system protein HrcU  33.99 
 
 		 359 aa  175  9.999999999999999e-43  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5071  secretion system apparatus protein SsaU  32.67 
 
 		 345 aa  168  1e-40  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.796147  normal  0.0581283 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0018  flagellar biosynthetic protein FlhB  32.58 
 
 		 374 aa  167  2.9999999999999998e-40  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000937461  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0018  flagellar biosynthetic protein FlhB  32.58 
 
 		 374 aa  166  5e-40  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000395256  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42660  translocation protein in type III secretion  34.41 
 
 		 349 aa  166  5e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0864  type III secretion system protein HrcU  33.33 
 
 		 357 aa  164  2.0000000000000002e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00479024 
 
 
-
 
NC_002620  TC0366  type III secretion system protein  30.75 
 
 		 360 aa  162  8.000000000000001e-39  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1977  secretion system apparatus protein SsaU  30.31 
 
 		 349 aa  160  2e-38  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1129  flagellar biosynthesis protein FlhB  31.83 
 
 		 360 aa  160  3e-38  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0868  flagellar biosynthesis/type III secretory pathway protein  30.99 
 
 		 369 aa  160  3e-38  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0703  flagellar biosynthetic protein FlhB  30.59 
 
 		 354 aa  159  5e-38  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.635027  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1862  flagellar biosynthesis protein FlhB  33.7 
 
 		 383 aa  159  7e-38  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.90359  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2604  flagellar biosynthesis protein FlhB  33.24 
 
 		 383 aa  159  9e-38  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2281  secretion system apparatus protein SsaU  30.22 
 
 		 349 aa  159  1e-37  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0436639  normal  0.672371 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16690  flagellar biosynthetic protein FlhB  31.41 
 
 		 356 aa  157  4e-37  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0959  type III secretion exporter  32.19 
 
 		 377 aa  155  9e-37  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1518  secretion system apparatus protein SsaU  28.74 
 
 		 352 aa  154  2.9999999999999998e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.00925486  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0427  type III secretion system protein HrcU  30.9 
 
 		 352 aa  153  4e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0498216  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1904  type III secretion system protein HrcU  30.9 
 
 		 352 aa  153  4e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1996  type III secretion system protein HrcU  30.9 
 
 		 352 aa  153  4e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.920837  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0069  flagellar biosynthetic protein FlhB  32.09 
 
 		 358 aa  153  5.9999999999999996e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1752  secretion system apparatus protein SsaU  28.74 
 
 		 352 aa  152  1e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00000000152464  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1555  secretion system apparatus protein SsaU  28.86 
 
 		 352 aa  152  1e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5640  type III secretion system protein HrcU  30.06 
 
 		 352 aa  152  1e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.122414 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1532  secretion system apparatus protein SsaU  28.86 
 
 		 352 aa  152  1e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.371934  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1921  secretion system apparatus protein SsaU  28.86 
 
 		 352 aa  152  1e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.133432  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1379  flagellar biosynthesis protein FlhB  30.97 
 
 		 377 aa  151  2e-35  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.294814 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0484  flagellar biosynthetic protein FlhB  30.11 
 
 		 392 aa  151  2e-35  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0127914  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1749  flagellar biosynthetic protein FlhB  31.12 
 
 		 359 aa  150  2e-35  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5857  type III secretion system protein HrcU  29.77 
 
 		 352 aa  151  2e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4645  flagellar biosynthesis protein FlhB  30.7 
 
 		 379 aa  150  3e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.223751  normal  0.675327 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2154  flagellar biosynthetic protein FlhB  30.94 
 
 		 366 aa  150  3e-35  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3053  flagellar biosynthesis protein FlhB  30.99 
 
 		 377 aa  150  4e-35  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0535555 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1674  flagellar biosynthetic protein FlhB  29.75 
 
 		 360 aa  150  4e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1547  flagellar biosynthesis protein FlhB  31.92 
 
 		 383 aa  149  7e-35  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1374  flagellar biosynthesis protein FlhB  32.87 
 
 		 377 aa  149  8e-35  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0214  flagellar biosynthesis protein FlhB  34.97 
 
 		 379 aa  148  1.0000000000000001e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.772571  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0743  flagellar biosynthetic protein FlhB  32.49 
 
 		 381 aa  148  1.0000000000000001e-34  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1519  flagellar biosynthesis protein FlhB  33.06 
 
 		 383 aa  148  1.0000000000000001e-34  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0011  flagellar biosynthetic protein FlhB  32.66 
 
 		 355 aa  148  1.0000000000000001e-34  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0426  flagellar biosynthesis protein FlhB  30.86 
 
 		 352 aa  148  2.0000000000000003e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.888697  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2447  flagellar biosynthesis protein FlhB  33.71 
 
 		 382 aa  147  2.0000000000000003e-34  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0981  flagellar biosynthetic protein FlhB  32.08 
 
 		 390 aa  148  2.0000000000000003e-34  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0800953 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1515  flagellar biosynthesis protein FlhB  29.38 
 
 		 376 aa  147  3e-34  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.813027  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0680  type III secretion system protein HrcU  30.61 
 
 		 399 aa  147  4.0000000000000006e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0663628  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2295  flagellar biosynthesis protein FlhB  32.58 
 
 		 376 aa  147  4.0000000000000006e-34  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1631  type III secretion system protein HrcU  31.41 
 
 		 360 aa  146  5e-34  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.882123  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1334  flagellar biosynthetic protein FlhB  32.87 
 
 		 384 aa  146  5e-34  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0750  type III secretion system protein HrcU  31.68 
 
 		 360 aa  146  5e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0905461  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1844  flagellar biosynthesis protein FlhB  31.15 
 
 		 348 aa  146  5e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0972714  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2199  type III secretion system protein HrcU  30.61 
 
 		 420 aa  146  6e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.706014  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0713  flagellar biosynthetic protein FlhB  33.33 
 
 		 379 aa  146  7.0000000000000006e-34  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.31011  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1384  flagellar biosynthesis protein FlhB  29.87 
 
 		 348 aa  145  8.000000000000001e-34  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.226295  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2282  type III secretion system protein HrcU  31.41 
 
 		 420 aa  145  8.000000000000001e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.58403  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1592  flagellar biosynthesis protein FlhB  29.91 
 
 		 348 aa  145  9e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1556  flagellar biosynthesis protein FlhB  29.91 
 
 		 348 aa  145  9e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1545  flagellar biosynthesis protein FlhB  29.91 
 
 		 348 aa  145  9e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1715  flagellar biosynthetic protein FlhB  29.91 
 
 		 348 aa  145  9e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1866  flagellar biosynthesis protein FlhB  32.19 
 
 		 376 aa  145  9e-34  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.965675  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1766  flagellar biosynthesis protein FlhB  29.91 
 
 		 348 aa  145  9e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1631  flagellar biosynthesis protein FlhB  29.51 
 
 		 377 aa  145  1e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4406  flagellar biosynthesis protein FlhB  31.52 
 
 		 357 aa  145  1e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.202983  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2021  flagellar biosynthesis protein FlhB  32.7 
 
 		 360 aa  144  2e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0092  flagellar biosynthetic protein FlhB  31.5 
 
 		 376 aa  144  3e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1735  flagellar biosynthesis protein FlhB  29.63 
 
 		 348 aa  144  3e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.736219  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2069  flagellar biosynthesis protein FlhB  33.05 
 
 		 383 aa  144  3e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00553621 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2074  flagellar biosynthesis protein FlhB  33.05 
 
 		 383 aa  143  4e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000897295 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1208  flagellar biosynthesis protein FlhB  33.05 
 
 		 383 aa  143  4e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2129  flagellar biosynthesis protein FlhB  33.15 
 
 		 383 aa  143  5e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000192021 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3484  flagellar biosynthetic protein FlhB  30.64 
 
 		 376 aa  143  5e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.994028  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1339  flagellar biosynthesis protein FlhB  31.34 
 
 		 377 aa  143  5e-33  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1331  flagellar biosynthesis protein FlhB  33.05 
 
 		 383 aa  143  5e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.384239  hitchhiker  0.0000000000516194 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1592  flagellar biosynthesis protein FlhB  30.19 
 
 		 348 aa  143  5e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3370  flagellar biosynthesis protein FlhB  30.81 
 
 		 398 aa  143  6e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00184569  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3609  flagellar biosynthesis protein FlhB  28.74 
 
 		 348 aa  143  6e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1384  flagellar biosynthesis protein FlhB  31.14 
 
 		 360 aa  142  7e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.696508  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0634  type III secretion system protein HrcU  31.12 
 
 		 420 aa  142  9e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1954  type III secretion system protein HrcU  31.12 
 
 		 420 aa  142  9e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1195  flagellar biosynthesis protein FlhB  30.03 
 
 		 377 aa  142  9.999999999999999e-33  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01851  flagellar biosynthesis protein B  32.39 
 
 		 382 aa  141  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1752  flagellar biosynthesis protein FlhB  32.39 
 
 		 382 aa  141  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01840  hypothetical protein  32.39 
 
 		 382 aa  141  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1975  flagellar biosynthesis protein FlhB  32.39 
 
 		 382 aa  141  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1981  flagellar biosynthesis protein FlhB  32.69 
 
 		 378 aa  141  1.9999999999999998e-32  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.764273  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2112  flagellar biosynthesis protein FlhB  32.39 
 
 		 382 aa  141  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>