More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_2955 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008044  TM1040_2955  flagellar biosynthesis protein FlhB  100 
 
 
363 aa  738    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.111273 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3256  flagellar biosynthesis protein FlhB  46.94 
 
 
362 aa  335  1e-90  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4188  flagellar biosynthesis protein FlhB  44.85 
 
 
362 aa  297  1e-79  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2611  flagellar biosynthesis protein FlhB  45.89 
 
 
359 aa  278  1e-73  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0659978 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2626  flagellar biosynthesis protein FlhB  44.48 
 
 
368 aa  274  2.0000000000000002e-72  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.447547 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2981  flagellar biosynthesis protein FlhB  44.23 
 
 
359 aa  246  4.9999999999999997e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.760938 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1322  flagellar biosynthesis protein FlhB  44.57 
 
 
359 aa  246  4.9999999999999997e-64  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1384  flagellar biosynthesis protein FlhB  37.84 
 
 
360 aa  219  5e-56  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.696508  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1930  flagellar biosynthetic protein FlhB  36.19 
 
 
363 aa  202  7e-51  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.922236  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1137  flagellar biosynthesis protein FlhB  32.45 
 
 
359 aa  187  4e-46  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5492  flagellar biosynthesis protein FlhB  36.16 
 
 
359 aa  186  5e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.14397  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4406  flagellar biosynthesis protein FlhB  35.33 
 
 
357 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.202983  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1331  flagellar biosynthesis protein FlhB  31.97 
 
 
383 aa  184  2.0000000000000003e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.384239  hitchhiker  0.0000000000516194 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2129  flagellar biosynthesis protein FlhB  31.97 
 
 
383 aa  184  3e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000192021 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2575  flagellar biosynthetic protein FlhB  35.46 
 
 
359 aa  182  5.0000000000000004e-45  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.011127 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2603  flagellar biosynthetic protein FlhB  34.25 
 
 
354 aa  182  7e-45  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.371847  normal  0.56 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2826  flagellar biosynthetic protein FlhB  34.25 
 
 
354 aa  182  9.000000000000001e-45  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.986887  normal  0.270742 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2069  flagellar biosynthesis protein FlhB  31.97 
 
 
383 aa  182  1e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00553621 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2074  flagellar biosynthesis protein FlhB  31.97 
 
 
383 aa  182  1e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000897295 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1208  flagellar biosynthesis protein FlhB  31.97 
 
 
383 aa  182  1e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3772  flagellar biosynthesis protein FlhB  34.35 
 
 
358 aa  179  5.999999999999999e-44  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0655991  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3217  flagellar biosynthesis protein FlhB  34.76 
 
 
354 aa  179  5.999999999999999e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.447718 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0743  flagellar biosynthetic protein FlhB  31.46 
 
 
381 aa  178  1e-43  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2633  flagellar biosynthetic protein FlhB  33.42 
 
 
355 aa  177  2e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.295644  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2230  flagellar biosynthetic protein FlhB  35.01 
 
 
355 aa  177  3e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2393  flagellar biosynthetic protein FlhB  31.18 
 
 
354 aa  176  4e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2328  type III secretion exporter  34.25 
 
 
363 aa  176  5e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.645604  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2447  flagellar biosynthesis protein FlhB  31.84 
 
 
382 aa  176  7e-43  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2432  flagellar biosynthesis protein FlhB  31.25 
 
 
386 aa  175  9e-43  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1307  flagellar biosynthesis protein FlhB  32.78 
 
 
382 aa  175  9.999999999999999e-43  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0569687 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2334  flagellar biosynthesis protein FlhB  31.52 
 
 
386 aa  175  9.999999999999999e-43  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.178036  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1522  flagellar biosynthesis protein FlhB  34.34 
 
 
358 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.23127  normal  0.258787 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1245  flagellar biosynthetic protein FlhB  33.33 
 
 
390 aa  173  2.9999999999999996e-42  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.215857  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2617  flagellar biosynthesis protein FlhB  33.33 
 
 
382 aa  174  2.9999999999999996e-42  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000137265 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1760  flagellar biosynthetic protein FlhB  33.06 
 
 
382 aa  173  3.9999999999999995e-42  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.304563  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2112  flagellar biosynthesis protein FlhB  33.06 
 
 
382 aa  173  3.9999999999999995e-42  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0130  flagellar biosynthesis protein FlhB  33.7 
 
 
406 aa  173  3.9999999999999995e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.561684  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1698  flagellar biosynthesis protein FlhB  33.51 
 
 
357 aa  172  5.999999999999999e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.736983 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01851  flagellar biosynthesis protein B  33.06 
 
 
382 aa  172  6.999999999999999e-42  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2808  flagellar biosynthesis protein FlhB  31.07 
 
 
360 aa  172  6.999999999999999e-42  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1752  flagellar biosynthesis protein FlhB  33.06 
 
 
382 aa  172  6.999999999999999e-42  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1975  flagellar biosynthesis protein FlhB  33.06 
 
 
382 aa  172  6.999999999999999e-42  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01840  hypothetical protein  33.06 
 
 
382 aa  172  6.999999999999999e-42  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1334  flagellar biosynthetic protein FlhB  33.61 
 
 
384 aa  172  7.999999999999999e-42  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0379  flagellar biosynthesis protein FlhB  29.89 
 
 
357 aa  172  9e-42  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0721  flagellar biosynthesis protein FlhB  29.78 
 
 
361 aa  171  1e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.366885  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1631  flagellar biosynthesis protein FlhB  33.15 
 
 
377 aa  172  1e-41  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0018  flagellar biosynthetic protein FlhB  31.55 
 
 
374 aa  171  1e-41  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000937461  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1397  flagellar biosynthesis protein FlhB  33.43 
 
 
359 aa  171  3e-41  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.247493  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0018  flagellar biosynthetic protein FlhB  31.27 
 
 
374 aa  170  3e-41  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000395256  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1866  flagellar biosynthesis protein FlhB  32.16 
 
 
376 aa  170  3e-41  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.965675  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1379  flagellar biosynthesis protein FlhB  31.3 
 
 
377 aa  170  3e-41  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.294814 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5615  flagellar biosynthesis protein FlhB  32.32 
 
 
380 aa  169  5e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.891713  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3804  flagellar biosynthesis protein FlhB  33.7 
 
 
403 aa  169  5e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1981  flagellar biosynthesis protein FlhB  33.33 
 
 
378 aa  170  5e-41  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.764273  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3053  flagellar biosynthesis protein FlhB  30.85 
 
 
377 aa  169  6e-41  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0535555 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16690  flagellar biosynthetic protein FlhB  33.14 
 
 
356 aa  168  1e-40  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3094  flagellar biosynthesis protein FlhB  31.59 
 
 
353 aa  167  2e-40  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3698  flagellar biosynthesis protein FlhB  34.14 
 
 
380 aa  167  2e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0239481 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4178  flagellar biosynthetic protein FlhB  32.88 
 
 
387 aa  167  2e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.232408  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4066  flagellar biosynthetic protein FlhB  32.88 
 
 
387 aa  167  2e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31030  flagellar biosynthesis pathway, component FlhB  30.89 
 
 
422 aa  167  4e-40  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4222  flagellar biosynthesis protein FlhB  33.43 
 
 
356 aa  166  5e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3821  flagellar biosynthesis protein FlhB  29.61 
 
 
353 aa  166  8e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1515  flagellar biosynthesis protein FlhB  30.47 
 
 
376 aa  165  9e-40  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.813027  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1093  flagellar biosynthesis protein FlhB  31.49 
 
 
358 aa  165  9e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.40975 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4645  flagellar biosynthesis protein FlhB  32.12 
 
 
379 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.223751  normal  0.675327 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3370  flagellar biosynthesis protein FlhB  32.97 
 
 
398 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00184569  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0669  flagellar biosynthesis protein FlhB  32.49 
 
 
350 aa  165  1.0000000000000001e-39  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0757109  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0981  flagellar biosynthetic protein FlhB  31.05 
 
 
390 aa  165  1.0000000000000001e-39  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0800953 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0484  flagellar biosynthetic protein FlhB  30.83 
 
 
392 aa  165  1.0000000000000001e-39  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0127914  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3431  flagellar biosynthetic protein FlhB  31.23 
 
 
378 aa  165  1.0000000000000001e-39  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0426  flagellar biosynthesis protein FlhB  31.2 
 
 
352 aa  164  2.0000000000000002e-39  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.888697  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2604  flagellar biosynthesis protein FlhB  30.47 
 
 
383 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2030  flagellar biosynthetic protein FlhB  31.77 
 
 
356 aa  164  2.0000000000000002e-39  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.9056  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0309  flagellar biosynthesis protein FlhB  31.56 
 
 
359 aa  164  3e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2159  flagellar biosynthetic protein FlhB  33.52 
 
 
377 aa  163  4.0000000000000004e-39  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0959  type III secretion exporter  31.32 
 
 
377 aa  163  4.0000000000000004e-39  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0341  flagellar biosynthesis protein FlhB  33.33 
 
 
359 aa  163  4.0000000000000004e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00619914 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0249  flagellar biosynthesis protein FlhB  33.42 
 
 
399 aa  162  6e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.190542  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27920  flagellar biosynthetic protein  32.8 
 
 
402 aa  162  7e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0219879  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1944  flagellar biosynthetic protein FlhB  29.78 
 
 
381 aa  162  7e-39  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1394  flagellar biosynthetic FlhB transmembrane protein  31.15 
 
 
387 aa  162  8.000000000000001e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00896638  normal  0.765457 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2169  flagellar biosynthesis protein FlhB  32.57 
 
 
376 aa  162  8.000000000000001e-39  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2977  flagellar biosynthesis protein FlhB  29.64 
 
 
398 aa  162  9e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0112  flagellar biosynthesis protein FlhB  34.14 
 
 
356 aa  162  9e-39  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.157288  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0054  flagellar biosynthesis protein FlhB  30.52 
 
 
390 aa  162  1e-38  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0121  flagellar biosynthesis protein FlhB  34.14 
 
 
356 aa  161  1e-38  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06204  flagellar biosynthesis protein FlhB  32.15 
 
 
376 aa  161  1e-38  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.236866  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1195  flagellar biosynthesis protein FlhB  29.32 
 
 
377 aa  162  1e-38  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00962  flagellar biosynthesis protein FlhB  32.15 
 
 
376 aa  161  1e-38  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.118534  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1171  flagellar biosynthetic protein FlhB  30.11 
 
 
383 aa  161  1e-38  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.127204 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1862  flagellar biosynthesis protein FlhB  28.77 
 
 
383 aa  161  2e-38  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.90359  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1750  flagellar biosynthesis protein FlhB  27.78 
 
 
382 aa  161  2e-38  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1750  flagellar biosynthesis protein FlhB  27.78 
 
 
382 aa  161  2e-38  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2840  flagellar biosynthesis protein FlhB  33.15 
 
 
399 aa  161  2e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.151701  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1450  flagellar biosynthesis protein FlhB  31.92 
 
 
376 aa  160  2e-38  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0267  flagellar biosynthesis protein FlhB  33.15 
 
 
399 aa  161  2e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.110201  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2284  flagellar biosynthesis protein FlhB  33.15 
 
 
377 aa  161  2e-38  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.562852  normal  0.66393 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1316  flagellar biosynthetic protein FlhB  33.7 
 
 
366 aa  161  2e-38  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>