More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_1322 on replicon NC_007493
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007493  RSP_1322  flagellar biosynthesis protein FlhB  100 
 
 
359 aa  707    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2981  flagellar biosynthesis protein FlhB  99.16 
 
 
359 aa  702    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.760938 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2611  flagellar biosynthesis protein FlhB  70.11 
 
 
359 aa  449  1e-125  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0659978 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3256  flagellar biosynthesis protein FlhB  49.16 
 
 
362 aa  334  2e-90  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4188  flagellar biosynthesis protein FlhB  47.44 
 
 
362 aa  315  6e-85  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2955  flagellar biosynthesis protein FlhB  44.57 
 
 
363 aa  315  9.999999999999999e-85  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.111273 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2626  flagellar biosynthesis protein FlhB  43.7 
 
 
368 aa  265  8e-70  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.447547 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1930  flagellar biosynthetic protein FlhB  37.9 
 
 
363 aa  219  3.9999999999999997e-56  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.922236  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1384  flagellar biosynthesis protein FlhB  35.89 
 
 
360 aa  218  1e-55  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.696508  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4406  flagellar biosynthesis protein FlhB  35.89 
 
 
357 aa  213  4.9999999999999996e-54  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.202983  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5492  flagellar biosynthesis protein FlhB  37.36 
 
 
359 aa  202  5e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.14397  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1137  flagellar biosynthesis protein FlhB  35.41 
 
 
359 aa  202  9.999999999999999e-51  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2575  flagellar biosynthetic protein FlhB  36.73 
 
 
359 aa  201  1.9999999999999998e-50  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.011127 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2604  flagellar biosynthesis protein FlhB  36.11 
 
 
383 aa  199  5e-50  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1698  flagellar biosynthesis protein FlhB  34.99 
 
 
357 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.736983 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3772  flagellar biosynthesis protein FlhB  36.24 
 
 
358 aa  195  1e-48  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0655991  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1862  flagellar biosynthesis protein FlhB  35.29 
 
 
383 aa  194  3e-48  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.90359  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2633  flagellar biosynthetic protein FlhB  36.64 
 
 
355 aa  192  1e-47  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.295644  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2393  flagellar biosynthetic protein FlhB  32.86 
 
 
354 aa  191  2e-47  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0484  flagellar biosynthetic protein FlhB  33.8 
 
 
392 aa  191  2e-47  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0127914  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2603  flagellar biosynthetic protein FlhB  35.6 
 
 
354 aa  190  4e-47  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.371847  normal  0.56 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2230  flagellar biosynthetic protein FlhB  37.64 
 
 
355 aa  189  5.999999999999999e-47  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1522  flagellar biosynthesis protein FlhB  34.54 
 
 
358 aa  189  5.999999999999999e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.23127  normal  0.258787 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2826  flagellar biosynthetic protein FlhB  35.33 
 
 
354 aa  188  1e-46  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.986887  normal  0.270742 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1330  flagellar biosynthesis protein FlhB  32.79 
 
 
358 aa  187  2e-46  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1334  flagellar biosynthetic protein FlhB  35.51 
 
 
384 aa  187  3e-46  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4135  flagellar biosynthetic protein FlhB  32.48 
 
 
350 aa  187  3e-46  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0846766  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2432  flagellar biosynthesis protein FlhB  35.93 
 
 
386 aa  187  4e-46  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1547  flagellar biosynthesis protein FlhB  33.52 
 
 
383 aa  186  5e-46  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2334  flagellar biosynthesis protein FlhB  35.83 
 
 
386 aa  186  5e-46  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.178036  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16690  flagellar biosynthetic protein FlhB  31.43 
 
 
356 aa  184  1.0000000000000001e-45  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0658  flagellar biosynthetic protein FlhB  33.52 
 
 
353 aa  185  1.0000000000000001e-45  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.622115  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5615  flagellar biosynthesis protein FlhB  37.05 
 
 
380 aa  184  2.0000000000000003e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.891713  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0743  flagellar biosynthetic protein FlhB  31.83 
 
 
381 aa  184  2.0000000000000003e-45  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0380  flagellar biosynthesis protein FlhB  33.95 
 
 
362 aa  182  6e-45  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.441846  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1981  flagellar biosynthesis protein FlhB  33.69 
 
 
378 aa  182  7e-45  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.764273  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0959  type III secretion exporter  34.3 
 
 
377 aa  181  2e-44  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2074  flagellar biosynthesis protein FlhB  31.25 
 
 
383 aa  181  2e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000897295 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2069  flagellar biosynthesis protein FlhB  31.25 
 
 
383 aa  181  2e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00553621 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0868  flagellar biosynthesis/type III secretory pathway protein  33.24 
 
 
369 aa  181  2e-44  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1208  flagellar biosynthesis protein FlhB  31.25 
 
 
383 aa  181  2e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2129  flagellar biosynthesis protein FlhB  31.25 
 
 
383 aa  180  2.9999999999999997e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000192021 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1331  flagellar biosynthesis protein FlhB  31.25 
 
 
383 aa  180  2.9999999999999997e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.384239  hitchhiker  0.0000000000516194 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0011  flagellar biosynthetic protein FlhB  31.39 
 
 
355 aa  180  2.9999999999999997e-44  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0357  flagellar biosynthesis protein FlhB  33.7 
 
 
368 aa  181  2.9999999999999997e-44  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1623  flagellar biosynthesis protein FlhB  33.88 
 
 
362 aa  179  4.999999999999999e-44  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1674  flagellar biosynthetic protein FlhB  31.62 
 
 
360 aa  179  4.999999999999999e-44  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0341  flagellar biosynthesis protein FlhB  33.91 
 
 
359 aa  179  4.999999999999999e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00619914 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0069  flagellar biosynthetic protein FlhB  34.62 
 
 
358 aa  179  4.999999999999999e-44  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2030  flagellar biosynthetic protein FlhB  37.11 
 
 
356 aa  178  1e-43  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.9056  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1515  flagellar biosynthesis protein FlhB  31.9 
 
 
376 aa  177  2e-43  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.813027  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2808  flagellar biosynthesis protein FlhB  31.27 
 
 
360 aa  177  2e-43  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1866  flagellar biosynthesis protein FlhB  33.89 
 
 
376 aa  177  2e-43  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.965675  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1409  flagellar biosynthetic protein FlhB  36.93 
 
 
361 aa  177  3e-43  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1519  flagellar biosynthesis protein FlhB  33.33 
 
 
383 aa  177  3e-43  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0018  flagellar biosynthetic protein FlhB  32.58 
 
 
374 aa  177  3e-43  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000395256  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3698  flagellar biosynthesis protein FlhB  35.83 
 
 
380 aa  177  3e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0239481 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1245  flagellar biosynthetic protein FlhB  33.33 
 
 
390 aa  177  4e-43  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.215857  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0999  flagellar biosynthesis protein FlhB  31.23 
 
 
357 aa  177  4e-43  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1374  flagellar biosynthesis protein FlhB  31.87 
 
 
377 aa  176  4e-43  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2977  flagellar biosynthesis protein FlhB  32.86 
 
 
398 aa  176  5e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0018  flagellar biosynthetic protein FlhB  32.58 
 
 
374 aa  176  5e-43  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000937461  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3034  flagellar biosynthetic protein FlhB  32.34 
 
 
374 aa  175  9e-43  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1316  flagellar biosynthetic protein FlhB  37.01 
 
 
366 aa  175  9.999999999999999e-43  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0130  flagellar biosynthesis protein FlhB  36.65 
 
 
406 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.561684  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0309  flagellar biosynthesis protein FlhB  33.33 
 
 
359 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0342  flagellar biosynthesis protein FlhB  32.6 
 
 
357 aa  174  1.9999999999999998e-42  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00837822  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2447  flagellar biosynthesis protein FlhB  31.79 
 
 
382 aa  172  5.999999999999999e-42  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1129  flagellar biosynthesis protein FlhB  31.03 
 
 
360 aa  172  7.999999999999999e-42  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2617  flagellar biosynthesis protein FlhB  32.79 
 
 
382 aa  172  7.999999999999999e-42  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000137265 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4140  flagellar biosynthetic protein FlhB  36.62 
 
 
382 aa  172  7.999999999999999e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3804  flagellar biosynthesis protein FlhB  34.27 
 
 
403 aa  172  9e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1760  flagellar biosynthetic protein FlhB  32.52 
 
 
382 aa  172  1e-41  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.304563  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27920  flagellar biosynthetic protein  34.9 
 
 
402 aa  172  1e-41  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0219879  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2112  flagellar biosynthesis protein FlhB  32.52 
 
 
382 aa  172  1e-41  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0453  type III secretion system protein HrcU  31.36 
 
 
352 aa  171  1e-41  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.959251  normal  0.0822049 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01851  flagellar biosynthesis protein B  32.52 
 
 
382 aa  171  2e-41  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0637  flagellar biosynthesis protein FlhB  33.33 
 
 
353 aa  171  2e-41  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.111799  normal  0.438226 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1752  flagellar biosynthesis protein FlhB  32.52 
 
 
382 aa  171  2e-41  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1307  flagellar biosynthesis protein FlhB  32.34 
 
 
382 aa  171  2e-41  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0569687 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3217  flagellar biosynthesis protein FlhB  35.59 
 
 
354 aa  171  2e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.447718 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0721  flagellar biosynthesis protein FlhB  31.84 
 
 
361 aa  171  2e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.366885  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1975  flagellar biosynthesis protein FlhB  32.52 
 
 
382 aa  171  2e-41  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01840  hypothetical protein  32.52 
 
 
382 aa  171  2e-41  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5150  flagellar biosynthetic protein FlhB  36.75 
 
 
353 aa  171  2e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0317747 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0648  flagellar biosynthesis protein FlhB  33.33 
 
 
353 aa  170  3e-41  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.214387 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0703  flagellar biosynthetic protein FlhB  31.01 
 
 
354 aa  170  3e-41  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.635027  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1944  flagellar biosynthetic protein FlhB  30.53 
 
 
381 aa  170  3e-41  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0246  flagellar biosynthesis protein FlhB  31.96 
 
 
360 aa  171  3e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.623088  normal  0.4035 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2016  flagellar biosynthetic protein FlhB  33.15 
 
 
387 aa  169  5e-41  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0713  flagellar biosynthetic protein FlhB  32.6 
 
 
379 aa  169  6e-41  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.31011  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1397  flagellar biosynthesis protein FlhB  35.58 
 
 
359 aa  169  7e-41  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.247493  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3055  flagellar biosynthesis protein FlhB  32.77 
 
 
376 aa  169  7e-41  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.247333 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1450  flagellar biosynthesis protein FlhB  32.77 
 
 
376 aa  169  9e-41  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0981  flagellar biosynthetic protein FlhB  33.33 
 
 
390 aa  169  9e-41  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0800953 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2295  flagellar biosynthesis protein FlhB  31.93 
 
 
376 aa  168  1e-40  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5533  flagellar biosynthetic protein FlhB  42.39 
 
 
353 aa  168  1e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.215661  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1195  flagellar biosynthesis protein FlhB  32 
 
 
377 aa  168  2e-40  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2696  flagellar biosynthetic protein FlhB  28.73 
 
 
373 aa  167  2e-40  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2913  flagellar biosynthesis protein FlhB  32.21 
 
 
376 aa  167  2.9999999999999998e-40  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.847075  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>