More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_3256 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_3256  flagellar biosynthesis protein FlhB  100 
 
 		 362 aa  729    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2955  flagellar biosynthesis protein FlhB  46.94 
 
 		 363 aa  335  1e-90  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.111273 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4188  flagellar biosynthesis protein FlhB  48.47 
 
 		 362 aa  308  6.999999999999999e-83  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2611  flagellar biosynthesis protein FlhB  50.57 
 
 		 359 aa  290  2e-77  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0659978 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1322  flagellar biosynthesis protein FlhB  49.72 
 
 		 359 aa  271  1e-71  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2981  flagellar biosynthesis protein FlhB  49.43 
 
 		 359 aa  271  2e-71  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.760938 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2626  flagellar biosynthesis protein FlhB  41.76 
 
 		 368 aa  231  2e-59  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.447547 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1384  flagellar biosynthesis protein FlhB  36.01 
 
 		 360 aa  212  9e-54  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.696508  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4406  flagellar biosynthesis protein FlhB  37.57 
 
 		 357 aa  205  1e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.202983  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1930  flagellar biosynthetic protein FlhB  33.86 
 
 		 363 aa  197  3e-49  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.922236  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1334  flagellar biosynthetic protein FlhB  36.26 
 
 		 384 aa  186  7e-46  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1522  flagellar biosynthesis protein FlhB  34.54 
 
 		 358 aa  181  1e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.23127  normal  0.258787 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5492  flagellar biosynthesis protein FlhB  32.24 
 
 		 359 aa  182  1e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.14397  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2575  flagellar biosynthetic protein FlhB  35.46 
 
 		 359 aa  181  1e-44  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.011127 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1374  flagellar biosynthesis protein FlhB  32.87 
 
 		 377 aa  179  5.999999999999999e-44  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1698  flagellar biosynthesis protein FlhB  34.76 
 
 		 357 aa  178  1e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.736983 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1316  flagellar biosynthetic protein FlhB  34.17 
 
 		 366 aa  178  2e-43  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0743  flagellar biosynthetic protein FlhB  32.31 
 
 		 381 aa  177  2e-43  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2808  flagellar biosynthesis protein FlhB  31.91 
 
 		 360 aa  177  3e-43  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1631  flagellar biosynthesis protein FlhB  33.15 
 
 		 377 aa  176  7e-43  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1866  flagellar biosynthesis protein FlhB  33.8 
 
 		 376 aa  175  9.999999999999999e-43  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.965675  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3772  flagellar biosynthesis protein FlhB  33.71 
 
 		 358 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0655991  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1137  flagellar biosynthesis protein FlhB  32.87 
 
 		 359 aa  173  5e-42  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3217  flagellar biosynthesis protein FlhB  32.66 
 
 		 354 aa  172  7.999999999999999e-42  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.447718 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3878  flagellar biosynthesis protein FlhB  35.21 
 
 		 378 aa  170  3e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0011  flagellar biosynthetic protein FlhB  32.29 
 
 		 355 aa  170  3e-41  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4222  flagellar biosynthesis protein FlhB  34.55 
 
 		 356 aa  169  5e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1379  flagellar biosynthesis protein FlhB  31.44 
 
 		 377 aa  169  6e-41  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.294814 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45720  flagellar biosynthesis protein FlhB  34.93 
 
 		 378 aa  169  6e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1339  flagellar biosynthesis protein FlhB  33.43 
 
 		 377 aa  169  8e-41  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0981  flagellar biosynthetic protein FlhB  33.97 
 
 		 390 aa  168  1e-40  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0800953 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1750  flagellar biosynthesis protein FlhB  30.05 
 
 		 382 aa  167  2e-40  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3053  flagellar biosynthesis protein FlhB  31.77 
 
 		 377 aa  168  2e-40  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0535555 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1330  flagellar biosynthesis protein FlhB  34.08 
 
 		 358 aa  167  2e-40  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16690  flagellar biosynthetic protein FlhB  31.09 
 
 		 356 aa  167  2e-40  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1750  flagellar biosynthesis protein FlhB  30.05 
 
 		 382 aa  167  2.9999999999999998e-40  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0721  flagellar biosynthesis protein FlhB  32.34 
 
 		 361 aa  167  2.9999999999999998e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.366885  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1547  flagellar biosynthesis protein FlhB  32.51 
 
 		 383 aa  167  2.9999999999999998e-40  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0069  flagellar biosynthetic protein FlhB  33.33 
 
 		 358 aa  166  5e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3431  flagellar biosynthetic protein FlhB  32.32 
 
 		 378 aa  166  5.9999999999999996e-40  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2334  flagellar biosynthesis protein FlhB  32.07 
 
 		 386 aa  166  6.9999999999999995e-40  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.178036  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0018  flagellar biosynthetic protein FlhB  36.02 
 
 		 374 aa  165  1.0000000000000001e-39  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000937461  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1981  flagellar biosynthesis protein FlhB  30.36 
 
 		 378 aa  165  1.0000000000000001e-39  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.764273  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1409  flagellar biosynthetic protein FlhB  39.3 
 
 		 361 aa  164  2.0000000000000002e-39  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1623  flagellar biosynthesis protein FlhB  33.42 
 
 		 362 aa  164  3e-39  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0018  flagellar biosynthetic protein FlhB  35.63 
 
 		 374 aa  163  4.0000000000000004e-39  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000395256  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2169  flagellar biosynthesis protein FlhB  32.49 
 
 		 376 aa  163  5.0000000000000005e-39  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2432  flagellar biosynthesis protein FlhB  31.79 
 
 		 386 aa  162  6e-39  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0380  flagellar biosynthesis protein FlhB  32.97 
 
 		 362 aa  162  8.000000000000001e-39  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.441846  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0112  flagellar biosynthesis protein FlhB  33.71 
 
 		 356 aa  162  8.000000000000001e-39  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.157288  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0357  flagellar biosynthesis protein FlhB  32.88 
 
 		 368 aa  162  8.000000000000001e-39  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1515  flagellar biosynthesis protein FlhB  31.79 
 
 		 376 aa  162  1e-38  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.813027  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0309  flagellar biosynthesis protein FlhB  31.28 
 
 		 359 aa  162  1e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0341  flagellar biosynthesis protein FlhB  30.73 
 
 		 359 aa  162  1e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00619914 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0616  flagellar biosynthesis protein FlhB  33.05 
 
 		 354 aa  161  2e-38  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.55435 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1093  flagellar biosynthesis protein FlhB  32.14 
 
 		 358 aa  161  2e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.40975 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0130  flagellar biosynthesis protein FlhB  31.42 
 
 		 406 aa  161  2e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.561684  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0121  flagellar biosynthesis protein FlhB  33.43 
 
 		 356 aa  160  3e-38  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1519  flagellar biosynthesis protein FlhB  31 
 
 		 383 aa  160  3e-38  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2393  flagellar biosynthetic protein FlhB  30.06 
 
 		 354 aa  160  3e-38  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0246  flagellar biosynthesis protein FlhB  32.51 
 
 		 360 aa  160  4e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.623088  normal  0.4035 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1944  flagellar biosynthetic protein FlhB  35.86 
 
 		 381 aa  159  6e-38  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0342  flagellar biosynthesis protein FlhB  31.38 
 
 		 357 aa  159  6e-38  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00837822  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3804  flagellar biosynthesis protein FlhB  31.59 
 
 		 403 aa  159  8e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1129  flagellar biosynthesis protein FlhB  30.66 
 
 		 360 aa  159  8e-38  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2328  type III secretion exporter  34.08 
 
 		 363 aa  159  1e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.645604  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2604  flagellar biosynthesis protein FlhB  31.78 
 
 		 383 aa  158  1e-37  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1195  flagellar biosynthesis protein FlhB  28.73 
 
 		 377 aa  158  1e-37  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0648  flagellar biosynthesis protein FlhB  32.19 
 
 		 353 aa  158  1e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.214387 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0637  flagellar biosynthesis protein FlhB  32.19 
 
 		 353 aa  158  1e-37  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.111799  normal  0.438226 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4135  flagellar biosynthetic protein FlhB  30.99 
 
 		 350 aa  157  2e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0846766  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2821  flagellar biosynthesis protein FlhB  34.73 
 
 		 356 aa  157  4e-37  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.117691  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2840  flagellar biosynthesis protein FlhB  33.9 
 
 		 399 aa  156  5.0000000000000005e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.151701  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0267  flagellar biosynthesis protein FlhB  33.9 
 
 		 399 aa  156  5.0000000000000005e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.110201  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1331  flagellar biosynthesis protein FlhB  32.12 
 
 		 383 aa  156  6e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.384239  hitchhiker  0.0000000000516194 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2129  flagellar biosynthesis protein FlhB  32.12 
 
 		 383 aa  156  6e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000192021 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1295  flagellar biosynthesis protein FlhB  31.4 
 
 		 376 aa  155  7e-37  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.388157  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1362  flagellar biosynthesis protein FlhB  31.4 
 
 		 376 aa  155  7e-37  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.873498 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0426  flagellar biosynthesis protein FlhB  29.97 
 
 		 352 aa  155  8e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.888697  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3370  flagellar biosynthesis protein FlhB  33.62 
 
 		 398 aa  155  8e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00184569  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001177  flagellar biosynthesis protein FlhB  33.8 
 
 		 375 aa  155  1e-36  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1171  flagellar biosynthetic protein FlhB  33.62 
 
 		 383 aa  155  1e-36  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.127204 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1355  flagellar biosynthesis protein FlhB  31.4 
 
 		 376 aa  155  1e-36  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.424725  normal  0.225798 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2284  flagellar biosynthesis protein FlhB  29.97 
 
 		 377 aa  155  1e-36  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.562852  normal  0.66393 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0959  type III secretion exporter  30.91 
 
 		 377 aa  155  1e-36  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0249  flagellar biosynthesis protein FlhB  33.62 
 
 		 399 aa  155  1e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.190542  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0587  flagellar biosynthesis protein FlhB  34.01 
 
 		 354 aa  154  2e-36  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2069  flagellar biosynthesis protein FlhB  31.84 
 
 		 383 aa  154  2e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00553621 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1631  flagellar biosynthetic protein FlhB  30.73 
 
 		 350 aa  154  2e-36  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1208  flagellar biosynthesis protein FlhB  31.84 
 
 		 383 aa  154  2.9999999999999998e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1669  type III secretion exporter  31.55 
 
 		 360 aa  154  2.9999999999999998e-36  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.058762  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2074  flagellar biosynthesis protein FlhB  31.84 
 
 		 383 aa  154  2.9999999999999998e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000897295 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3215  flagellar biosynthesis protein FlhB  30.85 
 
 		 376 aa  153  4e-36  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2563  flagellar biosynthesis protein FlhB  32.12 
 
 		 376 aa  153  4e-36  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.757068  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0999  flagellar biosynthesis protein FlhB  31.87 
 
 		 357 aa  153  4e-36  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2230  flagellar biosynthetic protein FlhB  32.37 
 
 		 355 aa  153  4e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0713  flagellar biosynthetic protein FlhB  31.28 
 
 		 379 aa  153  5e-36  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.31011  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5615  flagellar biosynthesis protein FlhB  32.58 
 
 		 380 aa  153  5e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.891713  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1397  flagellar biosynthesis protein FlhB  33.52 
 
 		 359 aa  153  5e-36  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.247493  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2633  flagellar biosynthetic protein FlhB  30.25 
 
 		 355 aa  153  5e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.295644  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>