More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE0054 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002967  TDE0054  flagellar biosynthesis protein FlhB  100 
 
 
390 aa  793    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0278  flagellar biosynthesis protein FlhB  40.63 
 
 
372 aa  255  1.0000000000000001e-66  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1129  flagellar biosynthesis protein FlhB  35.73 
 
 
360 aa  242  7e-63  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0183  flagellar biosynthetic protein FlhB  39.22 
 
 
399 aa  241  1e-62  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000532262  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0484  flagellar biosynthetic protein FlhB  36.46 
 
 
392 aa  236  5.0000000000000005e-61  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0127914  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0018  flagellar biosynthetic protein FlhB  37.13 
 
 
374 aa  226  4e-58  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000937461  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0018  flagellar biosynthetic protein FlhB  36.86 
 
 
374 aa  225  9e-58  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000395256  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0379  flagellar biosynthesis protein FlhB  33.99 
 
 
357 aa  217  2.9999999999999998e-55  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0849  flagellar biosynthetic protein FlhB  36.11 
 
 
377 aa  216  5.9999999999999996e-55  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1409  flagellar biosynthetic protein FlhB  35.07 
 
 
361 aa  213  3.9999999999999995e-54  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2393  flagellar biosynthetic protein FlhB  32.48 
 
 
354 aa  210  3e-53  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1163  flagellar biosynthesis protein FlhB  33.15 
 
 
351 aa  210  4e-53  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0011  flagellar biosynthetic protein FlhB  32.87 
 
 
355 aa  210  4e-53  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0155  flagellar biosynthesis protein FlhB  34.29 
 
 
357 aa  209  5e-53  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.795808  normal  0.521978 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0426  flagellar biosynthesis protein FlhB  35.21 
 
 
352 aa  208  1e-52  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.888697  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16690  flagellar biosynthetic protein FlhB  36.34 
 
 
356 aa  207  2e-52  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1412  flagellar biosynthetic protein FlhB  33.52 
 
 
363 aa  208  2e-52  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.342211  normal  0.890154 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1930  flagellar biosynthetic protein FlhB  32.87 
 
 
363 aa  207  2e-52  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.922236  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1245  flagellar biosynthetic protein FlhB  33.33 
 
 
390 aa  203  4e-51  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.215857  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0587  flagellar biosynthesis protein FlhB  35.49 
 
 
354 aa  203  4e-51  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4196  flagellar biosynthesis protein FlhB  34.56 
 
 
354 aa  203  5e-51  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0669  flagellar biosynthesis protein FlhB  35.1 
 
 
350 aa  202  7e-51  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0757109  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1631  flagellar biosynthetic protein FlhB  34.47 
 
 
350 aa  201  1.9999999999999998e-50  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0868  flagellar biosynthesis/type III secretory pathway protein  32.87 
 
 
369 aa  201  1.9999999999999998e-50  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3287  flagellar biosynthesis protein FlhB  35.2 
 
 
357 aa  200  3e-50  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0380  flagellar biosynthesis protein FlhB  33.61 
 
 
362 aa  199  7e-50  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.441846  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1137  flagellar biosynthesis protein FlhB  35.47 
 
 
359 aa  198  1.0000000000000001e-49  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3698  flagellar biosynthesis protein FlhB  33.43 
 
 
380 aa  199  1.0000000000000001e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0239481 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2575  flagellar biosynthetic protein FlhB  32.13 
 
 
359 aa  198  1.0000000000000001e-49  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.011127 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0240  flagellar biosynthetic protein FlhB  33.05 
 
 
353 aa  197  2.0000000000000003e-49  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.760621  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0357  flagellar biosynthesis protein FlhB  33.33 
 
 
368 aa  197  3e-49  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1623  flagellar biosynthesis protein FlhB  34.7 
 
 
362 aa  197  4.0000000000000005e-49  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2015  flagellar biosynthesis protein FlhB  31.37 
 
 
356 aa  196  8.000000000000001e-49  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5492  flagellar biosynthesis protein FlhB  33.8 
 
 
359 aa  196  9e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.14397  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1316  flagellar biosynthetic protein FlhB  31.13 
 
 
366 aa  195  1e-48  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2032  flagellar biosynthetic protein FlhB  33.98 
 
 
381 aa  194  2e-48  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.112007  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0342  flagellar biosynthesis protein FlhB  34.63 
 
 
357 aa  193  3e-48  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00837822  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2696  flagellar biosynthetic protein FlhB  36.14 
 
 
373 aa  194  3e-48  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5615  flagellar biosynthesis protein FlhB  33.24 
 
 
380 aa  193  4e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.891713  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0703  flagellar biosynthetic protein FlhB  34.27 
 
 
354 aa  192  6e-48  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.635027  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0332  flagellar biosynthesis protein FlhB  32.68 
 
 
359 aa  192  7e-48  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3472  flagellar biosynthesis protein FlhB  34.65 
 
 
355 aa  192  8e-48  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3094  flagellar biosynthesis protein FlhB  33.61 
 
 
353 aa  192  8e-48  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0960  flagellar biosynthetic protein FlhB  33.98 
 
 
384 aa  192  8e-48  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2021  flagellar biosynthesis protein FlhB  33.15 
 
 
360 aa  192  9e-48  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27920  flagellar biosynthetic protein  32.17 
 
 
402 aa  191  1e-47  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0219879  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3011  YscD family type III secretion protein  31.7 
 
 
346 aa  192  1e-47  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.859866  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1674  flagellar biosynthetic protein FlhB  32.32 
 
 
360 aa  191  2e-47  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0789  flagellar biosynthetic protein FlhB  30.93 
 
 
374 aa  191  2e-47  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000340873  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0130  flagellar biosynthesis protein FlhB  35.56 
 
 
406 aa  191  2e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.561684  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2016  flagellar biosynthetic protein FlhB  32.49 
 
 
387 aa  190  4e-47  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0069  flagellar biosynthetic protein FlhB  31.9 
 
 
358 aa  189  5e-47  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2069  flagellar biosynthesis protein FlhB  31.79 
 
 
383 aa  190  5e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00553621 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3804  flagellar biosynthesis protein FlhB  35.42 
 
 
403 aa  189  5.999999999999999e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4406  flagellar biosynthesis protein FlhB  31.27 
 
 
357 aa  189  9e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.202983  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1384  flagellar biosynthesis protein FlhB  33.73 
 
 
348 aa  189  9e-47  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.226295  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2154  flagellar biosynthetic protein FlhB  32.5 
 
 
366 aa  188  1e-46  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1330  flagellar biosynthesis protein FlhB  34.17 
 
 
358 aa  188  2e-46  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1735  flagellar biosynthesis protein FlhB  33.73 
 
 
348 aa  188  2e-46  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.736219  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1208  flagellar biosynthesis protein FlhB  31.52 
 
 
383 aa  188  2e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1397  flagellar biosynthesis protein FlhB  35.49 
 
 
359 aa  188  2e-46  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.247493  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2074  flagellar biosynthesis protein FlhB  31.52 
 
 
383 aa  188  2e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000897295 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2604  flagellar biosynthesis protein FlhB  33.42 
 
 
383 aa  187  3e-46  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1547  flagellar biosynthesis protein FlhB  33.24 
 
 
383 aa  186  4e-46  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2412  type III secretion protein, YscU/HrpY family  30.26 
 
 
346 aa  186  4e-46  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1331  flagellar biosynthesis protein FlhB  31.52 
 
 
383 aa  186  5e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.384239  hitchhiker  0.0000000000516194 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2129  flagellar biosynthesis protein FlhB  31.52 
 
 
383 aa  186  6e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000192021 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1592  flagellar biosynthesis protein FlhB  32.86 
 
 
348 aa  186  6e-46  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2633  flagellar biosynthetic protein FlhB  31.12 
 
 
355 aa  185  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.295644  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1592  flagellar biosynthesis protein FlhB  33.43 
 
 
348 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1556  flagellar biosynthesis protein FlhB  33.43 
 
 
348 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1545  flagellar biosynthesis protein FlhB  33.43 
 
 
348 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3370  flagellar biosynthesis protein FlhB  34.43 
 
 
398 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00184569  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1715  flagellar biosynthetic protein FlhB  33.43 
 
 
348 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1195  flagellar biosynthesis protein FlhB  31.13 
 
 
377 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1766  flagellar biosynthesis protein FlhB  33.43 
 
 
348 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3821  flagellar biosynthesis protein FlhB  30.08 
 
 
353 aa  184  2.0000000000000003e-45  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1981  flagellar biosynthesis protein FlhB  32.29 
 
 
378 aa  184  2.0000000000000003e-45  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.764273  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3609  flagellar biosynthesis protein FlhB  33.43 
 
 
348 aa  184  3e-45  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2826  flagellar biosynthetic protein FlhB  30.92 
 
 
354 aa  183  4.0000000000000006e-45  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.986887  normal  0.270742 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2617  flagellar biosynthesis protein FlhB  32.25 
 
 
382 aa  183  5.0000000000000004e-45  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000137265 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1862  flagellar biosynthesis protein FlhB  32.89 
 
 
383 aa  182  8.000000000000001e-45  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.90359  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01851  flagellar biosynthesis protein B  31.98 
 
 
382 aa  182  9.000000000000001e-45  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01840  hypothetical protein  31.98 
 
 
382 aa  182  9.000000000000001e-45  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1975  flagellar biosynthesis protein FlhB  31.98 
 
 
382 aa  182  9.000000000000001e-45  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1752  flagellar biosynthesis protein FlhB  31.98 
 
 
382 aa  182  9.000000000000001e-45  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1760  flagellar biosynthetic protein FlhB  31.98 
 
 
382 aa  182  1e-44  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.304563  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2112  flagellar biosynthesis protein FlhB  31.98 
 
 
382 aa  182  1e-44  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2447  flagellar biosynthesis protein FlhB  31.44 
 
 
382 aa  182  1e-44  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3905  flagellar biosynthesis protein FlhB  30.64 
 
 
353 aa  182  1e-44  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000447126 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2603  flagellar biosynthetic protein FlhB  30.64 
 
 
354 aa  181  2e-44  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.371847  normal  0.56 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1384  flagellar biosynthesis protein FlhB  31.58 
 
 
360 aa  181  2e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.696508  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2334  flagellar biosynthesis protein FlhB  30.14 
 
 
386 aa  181  2e-44  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.178036  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1844  flagellar biosynthesis protein FlhB  33.13 
 
 
348 aa  181  2e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0972714  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1307  flagellar biosynthesis protein FlhB  31.71 
 
 
382 aa  181  2e-44  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0569687 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2432  flagellar biosynthesis protein FlhB  30.14 
 
 
386 aa  180  2.9999999999999997e-44  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2295  flagellar biosynthesis protein FlhB  31.16 
 
 
376 aa  180  2.9999999999999997e-44  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3217  flagellar biosynthesis protein FlhB  31.18 
 
 
354 aa  181  2.9999999999999997e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.447718 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3170  flagellar biosynthesis protein FlhB  36.02 
 
 
405 aa  180  4e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1698  flagellar biosynthesis protein FlhB  33.05 
 
 
357 aa  180  4e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.736983 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>