More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SNSL254_A3092 on replicon NC_011080
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011205  SeD_A3197  surface presentation of antigens protein SpaS  100 
 
 
356 aa  724    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3092  surface presentation of antigens protein SpaS  100 
 
 
356 aa  724    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000792926 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3077  surface presentation of antigens protein SpaS  100 
 
 
356 aa  724    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3040  surface presentation of antigens protein SpaS  100 
 
 
356 aa  724    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.110418 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3009  surface presentation of antigens protein SpaS  99.44 
 
 
356 aa  721    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4137  surface presentation of antigens protein SpaS  54.44 
 
 
373 aa  388  1e-107  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000465227 
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0190  surface presentation of antigens protein SpaS  49.12 
 
 
342 aa  339  5e-92  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0839  surface presentation of antigens protein SpaS  45.19 
 
 
381 aa  293  2e-78  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1533  surface presentation of antigens protein SpaS  45.61 
 
 
411 aa  293  4e-78  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0751  surface presentation of antigens protein SpaS  45.61 
 
 
411 aa  293  4e-78  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.149273  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2071  surface presentation of antigens protein SpaS  45.61 
 
 
411 aa  293  4e-78  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.086614  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0573  surface presentation of antigens protein SpaS  45.61 
 
 
411 aa  292  5e-78  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.406609  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2076  surface presentation of antigens protein SpaS  45.61 
 
 
411 aa  292  5e-78  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2164  surface presentation of antigens protein SpaS  44.41 
 
 
406 aa  292  6e-78  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3181  FlhB/HrpN/YscU/SpaS family protein  48.29 
 
 
243 aa  221  1.9999999999999999e-56  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010157  YpAngola_B0048  type III secretion appartus protein YscU  34.1 
 
 
354 aa  195  1e-48  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000158953  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003359  type III secretion inner membrane protein HrpY  30.77 
 
 
351 aa  184  2.0000000000000003e-45  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01723  Type III secretory pathway, component EscU  29.83 
 
 
349 aa  181  2e-44  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42660  translocation protein in type III secretion  32.46 
 
 
349 aa  176  5e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03402  type III secretion system protein HrcU  28.73 
 
 
359 aa  162  7e-39  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2281  secretion system apparatus protein SsaU  31.29 
 
 
349 aa  158  1e-37  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0436639  normal  0.672371 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5071  secretion system apparatus protein SsaU  31.21 
 
 
345 aa  157  3e-37  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.796147  normal  0.0581283 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2412  type III secretion protein, YscU/HrpY family  29.14 
 
 
346 aa  157  4e-37  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1904  type III secretion system protein HrcU  28.1 
 
 
352 aa  154  2e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0427  type III secretion system protein HrcU  28.1 
 
 
352 aa  154  2e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0498216  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1996  type III secretion system protein HrcU  28.1 
 
 
352 aa  154  2e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.920837  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1977  secretion system apparatus protein SsaU  30.7 
 
 
349 aa  152  1e-35  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0743  flagellar biosynthetic protein FlhB  29.28 
 
 
381 aa  149  7e-35  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3811  secretion system apparatus protein SsaU  28.96 
 
 
356 aa  148  1.0000000000000001e-34  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0366  type III secretion system protein  32.68 
 
 
360 aa  148  1.0000000000000001e-34  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3899  secretion system apparatus protein SsaU  28.96 
 
 
355 aa  148  1.0000000000000001e-34  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3011  YscD family type III secretion protein  28.93 
 
 
346 aa  149  1.0000000000000001e-34  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.859866  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3926  secretion system apparatus protein SsaU  28.96 
 
 
355 aa  148  2.0000000000000003e-34  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3014  hypothetical protein  66.67 
 
 
120 aa  142  9.999999999999999e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000371086  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1882  type III secretion protein, YscU/HrpY family  29.62 
 
 
361 aa  140  1.9999999999999998e-32  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0713  flagellar biosynthetic protein FlhB  29.72 
 
 
379 aa  140  3.9999999999999997e-32  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.31011  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0453  type III secretion system protein HrcU  27.25 
 
 
352 aa  140  4.999999999999999e-32  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.959251  normal  0.0822049 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2393  flagellar biosynthetic protein FlhB  28.37 
 
 
354 aa  139  1e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1205  type III secretion protein HrcU  27.12 
 
 
359 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.322672  normal  0.485565 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5640  type III secretion system protein HrcU  28.05 
 
 
352 aa  137  4e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.122414 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0868  flagellar biosynthesis/type III secretory pathway protein  27.01 
 
 
369 aa  136  6.0000000000000005e-31  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5857  type III secretion system protein HrcU  27.74 
 
 
352 aa  136  6.0000000000000005e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0864  type III secretion system protein HrcU  29.59 
 
 
357 aa  135  9.999999999999999e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00479024 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1552  flagellar biosynthesis protein FlhB  29.63 
 
 
379 aa  134  3e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00640595  normal  0.373184 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1752  secretion system apparatus protein SsaU  30 
 
 
352 aa  133  6e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00000000152464  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1866  flagellar biosynthesis protein FlhB  27.08 
 
 
376 aa  132  1.0000000000000001e-29  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.965675  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1392  type III secretion protein HrcU  28.29 
 
 
359 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0332  flagellar biosynthesis protein FlhB  30.33 
 
 
359 aa  132  1.0000000000000001e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0750  type III secretion system protein HrcU  28.73 
 
 
360 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0905461  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0357  flagellar biosynthesis protein FlhB  26.67 
 
 
368 aa  132  1.0000000000000001e-29  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0380  flagellar biosynthesis protein FlhB  26.67 
 
 
362 aa  131  2.0000000000000002e-29  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.441846  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1412  flagellar biosynthetic protein FlhB  28.62 
 
 
363 aa  131  2.0000000000000002e-29  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.342211  normal  0.890154 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1555  secretion system apparatus protein SsaU  29.71 
 
 
352 aa  131  2.0000000000000002e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1532  secretion system apparatus protein SsaU  29.71 
 
 
352 aa  131  2.0000000000000002e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.371934  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1518  secretion system apparatus protein SsaU  30.77 
 
 
352 aa  131  2.0000000000000002e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.00925486  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1391  flagellar biosynthetic protein FlhB  27.52 
 
 
360 aa  131  2.0000000000000002e-29  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1921  secretion system apparatus protein SsaU  29.71 
 
 
352 aa  130  3e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.133432  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2809  flagellar biosynthesis protein FlhB  27.71 
 
 
378 aa  130  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.326255  normal  0.0759815 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0342  flagellar biosynthesis protein FlhB  27.13 
 
 
357 aa  129  6e-29  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00837822  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1623  flagellar biosynthesis protein FlhB  26.72 
 
 
362 aa  129  6e-29  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2215  type III secretion protein, YscU/HrpY family  26.85 
 
 
359 aa  129  8.000000000000001e-29  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0426  flagellar biosynthesis protein FlhB  27.41 
 
 
352 aa  128  2.0000000000000002e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.888697  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0049  YscU/HrpY family type III secretion protein  28.29 
 
 
359 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4406  flagellar biosynthesis protein FlhB  27.03 
 
 
357 aa  128  2.0000000000000002e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.202983  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1930  flagellar biosynthetic protein FlhB  27 
 
 
363 aa  127  2.0000000000000002e-28  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.922236  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16690  flagellar biosynthetic protein FlhB  26.87 
 
 
356 aa  127  4.0000000000000003e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1163  flagellar biosynthesis protein FlhB  28.66 
 
 
351 aa  126  6e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1674  flagellar biosynthetic protein FlhB  26.4 
 
 
360 aa  126  7e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1735  flagellar biosynthesis protein FlhB  27.71 
 
 
348 aa  125  8.000000000000001e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.736219  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0011  flagellar biosynthetic protein FlhB  25.86 
 
 
355 aa  125  8.000000000000001e-28  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1592  flagellar biosynthesis protein FlhB  27.14 
 
 
348 aa  125  1e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1556  flagellar biosynthesis protein FlhB  27.14 
 
 
348 aa  125  1e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1545  flagellar biosynthesis protein FlhB  27.14 
 
 
348 aa  125  1e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1766  flagellar biosynthesis protein FlhB  27.14 
 
 
348 aa  125  1e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1715  flagellar biosynthetic protein FlhB  27.14 
 
 
348 aa  125  1e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1384  flagellar biosynthesis protein FlhB  27.53 
 
 
348 aa  125  1e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.226295  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1592  flagellar biosynthesis protein FlhB  27.53 
 
 
348 aa  125  2e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3441  flagellar biosynthesis protein FlhB  27.91 
 
 
378 aa  124  2e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.456344 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0658  flagellar biosynthetic protein FlhB  30.58 
 
 
353 aa  124  2e-27  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.622115  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3609  flagellar biosynthesis protein FlhB  27.53 
 
 
348 aa  125  2e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1844  flagellar biosynthesis protein FlhB  27.64 
 
 
348 aa  124  2e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0972714  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1975  flagellar biosynthetic protein FlhB  26.44 
 
 
378 aa  123  5e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.185057  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0155  flagellar biosynthesis protein FlhB  26.78 
 
 
357 aa  122  7e-27  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.795808  normal  0.521978 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1397  flagellar biosynthetic protein FlhB  29.71 
 
 
363 aa  122  8e-27  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0680  type III secretion system protein HrcU  27 
 
 
399 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0663628  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2199  type III secretion system protein HrcU  27 
 
 
420 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.706014  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2282  type III secretion system protein HrcU  27 
 
 
420 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.58403  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0240  flagellar biosynthetic protein FlhB  29.23 
 
 
353 aa  121  1.9999999999999998e-26  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.760621  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1631  type III secretion system protein HrcU  27 
 
 
360 aa  120  4.9999999999999996e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.882123  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1339  flagellar biosynthesis protein FlhB  26.15 
 
 
377 aa  120  4.9999999999999996e-26  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0018  flagellar biosynthetic protein FlhB  25.79 
 
 
374 aa  120  4.9999999999999996e-26  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000937461  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1750  flagellar biosynthesis protein FlhB  27.3 
 
 
382 aa  119  9e-26  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1195  flagellar biosynthesis protein FlhB  26.96 
 
 
377 aa  119  9e-26  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1750  flagellar biosynthesis protein FlhB  26.99 
 
 
382 aa  119  9.999999999999999e-26  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0341  flagellar biosynthesis protein FlhB  28.79 
 
 
359 aa  119  9.999999999999999e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00619914 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0043  type III secretion exporter  30.63 
 
 
352 aa  119  9.999999999999999e-26  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5932  type III secretion system protein HrcU  26.85 
 
 
357 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.897512  normal  0.0426598 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0018  flagellar biosynthetic protein FlhB  25.47 
 
 
374 aa  118  9.999999999999999e-26  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000395256  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1515  flagellar biosynthesis protein FlhB  26.33 
 
 
376 aa  118  1.9999999999999998e-25  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.813027  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0634  type III secretion system protein HrcU  27 
 
 
420 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>