More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BT9727_2049 on replicon NC_005957
Organism: Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_005957  BT9727_2049  RpiR family transcriptional regulator  100 
 
 		 129 aa  255  2e-67  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.176905  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2047  RpiR family transcriptional regulator  97.67 
 
 		 176 aa  249  7e-66  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.573042  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2110  RpiR family transcriptional regulator  94.57 
 
 		 129 aa  243  6e-64  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.365003  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2295  RpiR family transcriptional regulator  94.53 
 
 		 284 aa  242  9.999999999999999e-64  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.651664  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3077  transcriptional regulator, RpiR family  94.53 
 
 		 284 aa  241  1.9999999999999999e-63  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000143664 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2246  transcriptional regulator, RpiR family  93.75 
 
 		 284 aa  240  6e-63  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2377  transcriptional regulator, RpiR family  92.19 
 
 		 170 aa  236  8e-62  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.202782  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2088  RpiR family transcriptional regulator  90.62 
 
 		 284 aa  231  2.0000000000000002e-60  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0949278  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1662  RpiR family transcriptional regulator  86.72 
 
 		 284 aa  224  3e-58  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.574027  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2292  transcriptional regulator, RpiR family  100 
 
 		 112 aa  218  3e-56  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000761492 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1776  transcriptional regulator, RpiR family  50 
 
 		 281 aa  130  6.999999999999999e-30  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35980  transcriptional regulator, RpiR family  39.37 
 
 		 333 aa  105  3e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.309329  normal  0.261129 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4022  transcriptional regulator, RpiR family  39.02 
 
 		 320 aa  102  2e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0204031  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0269  transcriptional regulator, RpiR family  37.01 
 
 		 304 aa  99.8  1e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.409833  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0168  RpiR family transcriptional regulator  36.72 
 
 		 280 aa  99.4  2e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.057217  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2323  putative transcriptional regulator  41.46 
 
 		 315 aa  96.7  1e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1993  transcriptional regulator, RpiR family  35.66 
 
 		 280 aa  96.3  1e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0475  transcriptional regulator, RpiR family  39.02 
 
 		 327 aa  92.8  1e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.227753  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3960  RpiR family transcriptional regulator  35.9 
 
 		 304 aa  92.4  2e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.162661  normal  0.59815 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2498  transcriptional regulator  34.38 
 
 		 282 aa  89  2e-17  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1394  transcriptional regulator, RpiR family  37.82 
 
 		 285 aa  87.8  4e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0784467  normal  0.640102 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4516  transcriptional regulator, RpiR family  35.43 
 
 		 322 aa  87.4  5e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.937314 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0250  DNA-binding transcriptional repressor RpiR  31.78 
 
 		 287 aa  87.8  5e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2756  transcriptional regulator, RpiR family  36.75 
 
 		 298 aa  87.4  6e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.688512  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7367  DNA-binding transcriptional repressor RpiR  31.78 
 
 		 291 aa  87.4  7e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.276033  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3209  RpiR family transcriptional regulator  39.05 
 
 		 320 aa  84  7e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0550  transcriptional regulator  35.94 
 
 		 284 aa  82  0.000000000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00967802  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2984  sugar isomerase (SIS)  38.1 
 
 		 319 aa  82.8  0.000000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.389067 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5684  putative transcriptional regulator, RpiR family  38.05 
 
 		 299 aa  82  0.000000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0287132  normal  0.474804 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1162  RpiR family transcriptional regulator  36.72 
 
 		 270 aa  79.7  0.00000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.164823  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1524  transcriptional regulator  33.59 
 
 		 282 aa  80.1  0.00000000000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03961  DNA-binding transcriptional repressor  33.9 
 
 		 296 aa  79.3  0.00000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3902  transcriptional regulator, RpiR family  33.9 
 
 		 296 aa  79.3  0.00000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3937  DNA-binding transcriptional repressor RpiR  33.9 
 
 		 296 aa  79.3  0.00000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4555  DNA-binding transcriptional repressor RpiR  33.9 
 
 		 296 aa  79.3  0.00000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03921  hypothetical protein  33.9 
 
 		 296 aa  79.3  0.00000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2083  RpiR family transcriptional regulator  33.05 
 
 		 285 aa  77.8  0.00000000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0788875 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0696  RpiR family transcriptional regulator  34.51 
 
 		 289 aa  77.4  0.00000000000006  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000925251  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2584  hypothetical protein  39.09 
 
 		 282 aa  77  0.00000000000009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3657  transcriptional regulator, RpiR family  39.83 
 
 		 285 aa  76.6  0.00000000000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2563  RpiR family transcriptional regulator  39.83 
 
 		 285 aa  76.6  0.0000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02327  predicted DNA-binding transcriptional regulator  39.83 
 
 		 285 aa  76.6  0.0000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1234  transcriptional regulator, RpiR family  39.83 
 
 		 285 aa  76.6  0.0000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2713  RpiR family transcriptional regulator  39.83 
 
 		 285 aa  76.6  0.0000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1050  transcriptional regulator, RpiR family  36.64 
 
 		 272 aa  76.6  0.0000000000001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1252  RpiR family transcriptional regulator  39.83 
 
 		 285 aa  76.6  0.0000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.102619 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02288  hypothetical protein  39.83 
 
 		 285 aa  76.6  0.0000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3507  transcriptional regulator, RpiR family  35.04 
 
 		 342 aa  75.9  0.0000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0619346 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2433  transcriptional regulator, RpiR family  33.04 
 
 		 282 aa  75.9  0.0000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000784459  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1799  RpiR family transcriptional regulator  33.61 
 
 		 309 aa  75.5  0.0000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0151884  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1522  transcriptional regulator, RpiR family  35.29 
 
 		 301 aa  75.5  0.0000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0181901  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0588  RpiR family transcriptional regulator  32.81 
 
 		 273 aa  74.3  0.0000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.189062  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2582  RpiR family transcriptional regulator  38.98 
 
 		 285 aa  74.3  0.0000000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2799  transcriptional regulator, RpiR family  38.98 
 
 		 285 aa  74.3  0.0000000000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.576789  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0894  transcriptional regulator  38.46 
 
 		 289 aa  73.9  0.0000000000006  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001002  transcriptional regulator RpiR family  39.64 
 
 		 283 aa  73.6  0.0000000000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3371  transcriptional regulator, RpiR family  32.81 
 
 		 281 aa  73.6  0.0000000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0964604  hitchhiker  0.00000000707391 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2771  RpiR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 292 aa  72.8  0.000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00114132 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1406  RpiR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 292 aa  72.8  0.000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1297  RpiR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 292 aa  72.8  0.000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2581  RpiR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 278 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0624506  hitchhiker  0.000000255705 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1547  RpiR family transcriptional regulator  39.18 
 
 		 296 aa  72.4  0.000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2853  transcriptional regulator, RpiR family  30.47 
 
 		 316 aa  72.4  0.000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.543302 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4018  RpiR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 284 aa  72  0.000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.772645  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1216  RpiR family transcriptional regulator  35.16 
 
 		 334 aa  70.5  0.000000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.3152  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1223  RpiR family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 339 aa  70.5  0.000000000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.809611  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3444  RpiR family transcriptional regulator  35.16 
 
 		 332 aa  70.5  0.000000000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3444  RpiR family transcriptional regulator  35.16 
 
 		 339 aa  70.5  0.000000000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3409  RpiR family transcriptional regulator  35.16 
 
 		 332 aa  70.5  0.000000000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.977628  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2634  RpiR family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 332 aa  70.1  0.000000000009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2447  RpiR family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 332 aa  70.1  0.000000000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2753  transcriptional regulator, RpiR family  38.1 
 
 		 304 aa  70.1  0.000000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0365  RpiR family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 332 aa  70.1  0.000000000009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0593  RpiR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 280 aa  70.1  0.00000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000590128  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3745  RpiR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 282 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.767556 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0607  RpiR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 280 aa  70.1  0.00000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.173614  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0176  RpiR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 282 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0626  RpiR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 282 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0182  RpiR family transcriptional regulator  34.31 
 
 		 279 aa  70.1  0.00000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0554  RpiR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 282 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.335525  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2045  putative transcriptional regulator, RpiR family  38.39 
 
 		 291 aa  70.1  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0580  RpiR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 282 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.658912  normal  0.89076 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1686  transcriptional regulator  41.18 
 
 		 272 aa  69.7  0.00000000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0801516  hitchhiker  0.000000000302216 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0659  RpiR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 282 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.78991  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0179  RpiR family transcriptional regulator  34.31 
 
 		 279 aa  69.3  0.00000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.912597  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4054  RpiR family transcriptional regulator  33.88 
 
 		 287 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.544392  normal  0.902505 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2136  transcriptional regulator, RpiR family  30.77 
 
 		 284 aa  68.6  0.00000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.000000108566  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3122  RpiR family transcriptional regulator  33.93 
 
 		 282 aa  67  0.00000000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6069  RpiR family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 312 aa  66.2  0.0000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.961945 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7211  transcriptional regulator, RpiR family  33.9 
 
 		 287 aa  66.2  0.0000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.84474  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0423  RpiR family transcriptional regulator  33.9 
 
 		 287 aa  66.2  0.0000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1122  RpiR family transcriptional regulator  32.71 
 
 		 285 aa  66.2  0.0000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1355  transcriptional regulator  38.61 
 
 		 273 aa  66.6  0.0000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.906845  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3388  RpiR family transcriptional regulator  32.03 
 
 		 284 aa  66.2  0.0000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0662  RpiR family transcriptional regulator  31.5 
 
 		 303 aa  66.2  0.0000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0898  HTH-type transcriptional regulator, rpiR family  31.37 
 
 		 292 aa  65.9  0.0000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.679683  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3662  putative DNA-binding transcriptional regulator  32.77 
 
 		 282 aa  65.1  0.0000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2767  RpiR family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 312 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1348  transcriptional regulator, RpiR family  33.62 
 
 		 307 aa  65.1  0.0000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.478547  normal  0.506779 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2741  RpiR family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 312 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>