More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BCAH820_2292 on replicon NC_011773
Organism: Bacillus cereus AH820



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011773  BCAH820_2292  transcriptional regulator, RpiR family  100 
 
 		 112 aa  218  1.9999999999999999e-56  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000761492 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2049  RpiR family transcriptional regulator  100 
 
 		 129 aa  218  3e-56  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.176905  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2047  RpiR family transcriptional regulator  98.21 
 
 		 176 aa  214  2.9999999999999998e-55  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.573042  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2110  RpiR family transcriptional regulator  94.64 
 
 		 129 aa  208  2e-53  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.365003  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2295  RpiR family transcriptional regulator  94.59 
 
 		 284 aa  206  9e-53  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.651664  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3077  transcriptional regulator, RpiR family  94.59 
 
 		 284 aa  205  1e-52  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000143664 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2246  transcriptional regulator, RpiR family  93.69 
 
 		 284 aa  204  4e-52  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2377  transcriptional regulator, RpiR family  91.89 
 
 		 170 aa  200  7e-51  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.202782  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2088  RpiR family transcriptional regulator  90.09 
 
 		 284 aa  196  1.0000000000000001e-49  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0949278  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1662  RpiR family transcriptional regulator  85.59 
 
 		 284 aa  188  2e-47  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.574027  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1776  transcriptional regulator, RpiR family  50.45 
 
 		 281 aa  111  3e-24  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35980  transcriptional regulator, RpiR family  41.28 
 
 		 333 aa  98.6  3e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.309329  normal  0.261129 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4022  transcriptional regulator, RpiR family  40 
 
 		 320 aa  91.7  3e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0204031  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2323  putative transcriptional regulator  42.86 
 
 		 315 aa  88.6  2e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3960  RpiR family transcriptional regulator  35.78 
 
 		 304 aa  87.8  4e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.162661  normal  0.59815 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0269  transcriptional regulator, RpiR family  37.61 
 
 		 304 aa  87.8  5e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.409833  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1993  transcriptional regulator, RpiR family  36.45 
 
 		 280 aa  85.9  2e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4516  transcriptional regulator, RpiR family  37.61 
 
 		 322 aa  84.3  5e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.937314 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1394  transcriptional regulator, RpiR family  41 
 
 		 285 aa  82.4  0.000000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0784467  normal  0.640102 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0475  transcriptional regulator, RpiR family  40.95 
 
 		 327 aa  82.8  0.000000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.227753  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0168  RpiR family transcriptional regulator  35.78 
 
 		 280 aa  81.3  0.000000000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.057217  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2756  transcriptional regulator, RpiR family  37.14 
 
 		 298 aa  81.6  0.000000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.688512  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0250  DNA-binding transcriptional repressor RpiR  33.04 
 
 		 287 aa  78.6  0.00000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7367  DNA-binding transcriptional repressor RpiR  32.14 
 
 		 291 aa  76.6  0.0000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.276033  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3209  RpiR family transcriptional regulator  40.86 
 
 		 320 aa  74.7  0.0000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2984  sugar isomerase (SIS)  40.23 
 
 		 319 aa  73.9  0.0000000000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.389067 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2498  transcriptional regulator  34.23 
 
 		 282 aa  72.4  0.000000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1162  RpiR family transcriptional regulator  37.84 
 
 		 270 aa  71.2  0.000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.164823  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2713  RpiR family transcriptional regulator  44.79 
 
 		 285 aa  70.9  0.000000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1252  RpiR family transcriptional regulator  44.79 
 
 		 285 aa  70.9  0.000000000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.102619 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2563  RpiR family transcriptional regulator  44.79 
 
 		 285 aa  70.9  0.000000000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3657  transcriptional regulator, RpiR family  44.79 
 
 		 285 aa  70.9  0.000000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02327  predicted DNA-binding transcriptional regulator  44.79 
 
 		 285 aa  70.5  0.000000000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1234  transcriptional regulator, RpiR family  44.79 
 
 		 285 aa  70.5  0.000000000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02288  hypothetical protein  44.79 
 
 		 285 aa  70.5  0.000000000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5684  putative transcriptional regulator, RpiR family  37.23 
 
 		 299 aa  69.7  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0287132  normal  0.474804 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3507  transcriptional regulator, RpiR family  38.54 
 
 		 342 aa  69.3  0.00000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0619346 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2582  RpiR family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 285 aa  68.2  0.00000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2045  putative transcriptional regulator, RpiR family  39.77 
 
 		 291 aa  68.6  0.00000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2799  transcriptional regulator, RpiR family  43.75 
 
 		 285 aa  68.2  0.00000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.576789  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2853  transcriptional regulator, RpiR family  31.82 
 
 		 316 aa  67  0.00000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.543302 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0550  transcriptional regulator  35.14 
 
 		 284 aa  67  0.00000000008  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00967802  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1522  transcriptional regulator, RpiR family  36.27 
 
 		 301 aa  66.2  0.0000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0181901  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1524  transcriptional regulator  34.23 
 
 		 282 aa  65.9  0.0000000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1122  RpiR family transcriptional regulator  34.65 
 
 		 285 aa  65.1  0.0000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1547  RpiR family transcriptional regulator  41.25 
 
 		 296 aa  65.5  0.0000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1050  transcriptional regulator, RpiR family  35.71 
 
 		 272 aa  65.1  0.0000000003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1799  RpiR family transcriptional regulator  34.95 
 
 		 309 aa  65.1  0.0000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0151884  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0696  RpiR family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 289 aa  64.7  0.0000000004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000925251  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0894  transcriptional regulator  40 
 
 		 289 aa  64.7  0.0000000004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07056  hypothetical protein  43.82 
 
 		 109 aa  64.3  0.0000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2584  hypothetical protein  40.91 
 
 		 282 aa  63.2  0.000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0593  RpiR family transcriptional regulator  36.14 
 
 		 280 aa  63.2  0.000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000590128  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0607  RpiR family transcriptional regulator  36.14 
 
 		 280 aa  63.2  0.000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.173614  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0588  RpiR family transcriptional regulator  33.64 
 
 		 273 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.189062  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2433  transcriptional regulator, RpiR family  32.65 
 
 		 282 aa  63.2  0.000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000784459  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03961  DNA-binding transcriptional repressor  35.96 
 
 		 296 aa  62.4  0.000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3902  transcriptional regulator, RpiR family  35.96 
 
 		 296 aa  62.4  0.000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03921  hypothetical protein  35.96 
 
 		 296 aa  62.4  0.000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6069  RpiR family transcriptional regulator  36.04 
 
 		 312 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.961945 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4555  DNA-binding transcriptional repressor RpiR  35.96 
 
 		 296 aa  62.4  0.000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3937  DNA-binding transcriptional repressor RpiR  35.96 
 
 		 296 aa  62.4  0.000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3371  transcriptional regulator, RpiR family  33.33 
 
 		 281 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0964604  hitchhiker  0.00000000707391 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2753  transcriptional regulator, RpiR family  40.91 
 
 		 304 aa  61.6  0.000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0092  RpiR family transcriptional regulator  34.23 
 
 		 287 aa  61.6  0.000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2767  RpiR family transcriptional regulator  36.04 
 
 		 312 aa  61.2  0.000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2129  RpiR family transcriptional regulator  36.04 
 
 		 312 aa  60.8  0.000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2741  RpiR family transcriptional regulator  36.04 
 
 		 312 aa  60.8  0.000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2136  transcriptional regulator, RpiR family  33.73 
 
 		 284 aa  60.5  0.000000008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.000000108566  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4771  putative RpiR family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 301 aa  60.1  0.000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.978774  normal  0.852816 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0969  DNA-binding transcriptional regulator HexR  33.66 
 
 		 284 aa  60.5  0.000000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001002  transcriptional regulator RpiR family  41.57 
 
 		 283 aa  60.5  0.000000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0292  transcriptional regulator, RpiR family  38 
 
 		 282 aa  59.7  0.00000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000000128623  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2658  RpiR family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 324 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4021  RpiR family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 306 aa  60.1  0.00000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.766323  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3036  RpiR family transcriptional regulator  35.8 
 
 		 293 aa  59.7  0.00000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.627986 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2791  RpiR family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 324 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2581  RpiR family transcriptional regulator  31.53 
 
 		 278 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0624506  hitchhiker  0.000000255705 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3409  RpiR family transcriptional regulator  36.04 
 
 		 332 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.977628  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1223  RpiR family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 339 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.809611  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2447  RpiR family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 332 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3444  RpiR family transcriptional regulator  36.04 
 
 		 339 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0365  RpiR family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 332 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1216  RpiR family transcriptional regulator  36.04 
 
 		 334 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.3152  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3444  RpiR family transcriptional regulator  36.04 
 
 		 332 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0770  transcriptional regulator, RpiR family  37.5 
 
 		 296 aa  58.9  0.00000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.000975666  hitchhiker  0.00454433 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3564  RpiR family transcriptional regulator  34.88 
 
 		 284 aa  58.9  0.00000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.536409  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2634  RpiR family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 332 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0626  RpiR family transcriptional regulator  31.53 
 
 		 282 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1406  RpiR family transcriptional regulator  34.12 
 
 		 292 aa  58.5  0.00000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2771  RpiR family transcriptional regulator  34.12 
 
 		 292 aa  58.5  0.00000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00114132 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0176  RpiR family transcriptional regulator  31.53 
 
 		 282 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1297  RpiR family transcriptional regulator  34.12 
 
 		 292 aa  58.5  0.00000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0659  RpiR family transcriptional regulator  31.53 
 
 		 282 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.78991  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4054  RpiR family transcriptional regulator  34.31 
 
 		 287 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.544392  normal  0.902505 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3745  RpiR family transcriptional regulator  31.53 
 
 		 282 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.767556 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2031  DNA-binding transcriptional regulator HexR  31.43 
 
 		 284 aa  58.2  0.00000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0294963  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0580  RpiR family transcriptional regulator  31.53 
 
 		 282 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.658912  normal  0.89076 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0554  RpiR family transcriptional regulator  31.53 
 
 		 282 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.335525  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1686  transcriptional regulator  44.58 
 
 		 272 aa  58.2  0.00000004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0801516  hitchhiker  0.000000000302216 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>