More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BAS2110 on replicon NC_005945
Organism: Bacillus anthracis str. Sterne



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_005945  BAS2110  RpiR family transcriptional regulator  100 
 
 		 129 aa  256  5.0000000000000005e-68  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.365003  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2049  RpiR family transcriptional regulator  94.57 
 
 		 129 aa  243  6e-64  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.176905  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2047  RpiR family transcriptional regulator  93.8 
 
 		 176 aa  241  3e-63  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.573042  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2295  RpiR family transcriptional regulator  90.62 
 
 		 284 aa  233  5.0000000000000005e-61  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.651664  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3077  transcriptional regulator, RpiR family  90.62 
 
 		 284 aa  233  7e-61  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000143664 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2246  transcriptional regulator, RpiR family  89.84 
 
 		 284 aa  231  2.0000000000000002e-60  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2377  transcriptional regulator, RpiR family  88.28 
 
 		 170 aa  227  3e-59  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.202782  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2088  RpiR family transcriptional regulator  86.72 
 
 		 284 aa  223  7e-58  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0949278  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1662  RpiR family transcriptional regulator  82.81 
 
 		 284 aa  216  1e-55  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.574027  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2292  transcriptional regulator, RpiR family  94.64 
 
 		 112 aa  208  2e-53  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000761492 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1776  transcriptional regulator, RpiR family  48.44 
 
 		 281 aa  123  8.000000000000001e-28  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35980  transcriptional regulator, RpiR family  39.37 
 
 		 333 aa  102  2e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.309329  normal  0.261129 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4022  transcriptional regulator, RpiR family  38.21 
 
 		 320 aa  98.6  2e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0204031  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0269  transcriptional regulator, RpiR family  37.01 
 
 		 304 aa  97.4  5e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.409833  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0168  RpiR family transcriptional regulator  35.16 
 
 		 280 aa  93.6  9e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.057217  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2323  putative transcriptional regulator  39.84 
 
 		 315 aa  91.7  3e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3960  RpiR family transcriptional regulator  35.04 
 
 		 304 aa  91.3  5e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.162661  normal  0.59815 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2498  transcriptional regulator  33.59 
 
 		 282 aa  88.2  3e-17  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0475  transcriptional regulator, RpiR family  37.4 
 
 		 327 aa  87.8  5e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.227753  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1993  transcriptional regulator, RpiR family  32.56 
 
 		 280 aa  86.3  1e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4516  transcriptional regulator, RpiR family  35.43 
 
 		 322 aa  85.1  3e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.937314 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0250  DNA-binding transcriptional repressor RpiR  31.01 
 
 		 287 aa  83.6  9e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3209  RpiR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 320 aa  83.2  0.000000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1394  transcriptional regulator, RpiR family  36.13 
 
 		 285 aa  82.8  0.000000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0784467  normal  0.640102 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2756  transcriptional regulator, RpiR family  34.75 
 
 		 298 aa  82  0.000000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.688512  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2984  sugar isomerase (SIS)  37.14 
 
 		 319 aa  81.6  0.000000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.389067 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7367  DNA-binding transcriptional repressor RpiR  30.23 
 
 		 291 aa  81.6  0.000000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.276033  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0550  transcriptional regulator  35.16 
 
 		 284 aa  80.1  0.000000000000008  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00967802  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1524  transcriptional regulator  32.81 
 
 		 282 aa  78.2  0.00000000000004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5684  putative transcriptional regulator, RpiR family  36.28 
 
 		 299 aa  77.4  0.00000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0287132  normal  0.474804 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2083  RpiR family transcriptional regulator  33.05 
 
 		 285 aa  74.7  0.0000000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0788875 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1162  RpiR family transcriptional regulator  35.16 
 
 		 270 aa  73.9  0.0000000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.164823  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3507  transcriptional regulator, RpiR family  35.04 
 
 		 342 aa  73.6  0.0000000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0619346 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03961  DNA-binding transcriptional repressor  32.2 
 
 		 296 aa  73.6  0.0000000000009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3902  transcriptional regulator, RpiR family  32.2 
 
 		 296 aa  73.6  0.0000000000009  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03921  hypothetical protein  32.2 
 
 		 296 aa  73.6  0.0000000000009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4555  DNA-binding transcriptional repressor RpiR  32.2 
 
 		 296 aa  73.6  0.0000000000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3937  DNA-binding transcriptional repressor RpiR  32.2 
 
 		 296 aa  73.6  0.0000000000009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2433  transcriptional regulator, RpiR family  32.17 
 
 		 282 aa  72  0.000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000784459  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2853  transcriptional regulator, RpiR family  30.47 
 
 		 316 aa  72  0.000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.543302 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1522  transcriptional regulator, RpiR family  34.45 
 
 		 301 aa  71.2  0.000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0181901  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0894  transcriptional regulator  38.46 
 
 		 289 aa  71.2  0.000000000004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0696  RpiR family transcriptional regulator  32.74 
 
 		 289 aa  70.9  0.000000000006  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000925251  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1799  RpiR family transcriptional regulator  31.93 
 
 		 309 aa  70.9  0.000000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0151884  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0588  RpiR family transcriptional regulator  32.03 
 
 		 273 aa  70.5  0.000000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.189062  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1252  RpiR family transcriptional regulator  38.14 
 
 		 285 aa  70.1  0.000000000009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.102619 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3657  transcriptional regulator, RpiR family  38.14 
 
 		 285 aa  70.1  0.000000000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2563  RpiR family transcriptional regulator  38.14 
 
 		 285 aa  70.1  0.000000000009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02327  predicted DNA-binding transcriptional regulator  38.14 
 
 		 285 aa  70.1  0.00000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1234  transcriptional regulator, RpiR family  38.14 
 
 		 285 aa  70.1  0.00000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02288  hypothetical protein  38.14 
 
 		 285 aa  70.1  0.00000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2713  RpiR family transcriptional regulator  38.14 
 
 		 285 aa  70.1  0.00000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3371  transcriptional regulator, RpiR family  32.03 
 
 		 281 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0964604  hitchhiker  0.00000000707391 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1216  RpiR family transcriptional regulator  35.16 
 
 		 334 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.3152  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1050  transcriptional regulator, RpiR family  34.35 
 
 		 272 aa  69.3  0.00000000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3409  RpiR family transcriptional regulator  35.16 
 
 		 332 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.977628  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2447  RpiR family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 332 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0365  RpiR family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 332 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3444  RpiR family transcriptional regulator  35.16 
 
 		 339 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2581  RpiR family transcriptional regulator  30.47 
 
 		 278 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0624506  hitchhiker  0.000000255705 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3444  RpiR family transcriptional regulator  35.16 
 
 		 332 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1223  RpiR family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 339 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.809611  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2634  RpiR family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 332 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2771  RpiR family transcriptional regulator  34.31 
 
 		 292 aa  68.2  0.00000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00114132 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2582  RpiR family transcriptional regulator  37.29 
 
 		 285 aa  67.8  0.00000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1297  RpiR family transcriptional regulator  34.31 
 
 		 292 aa  68.2  0.00000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1406  RpiR family transcriptional regulator  34.31 
 
 		 292 aa  68.2  0.00000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2799  transcriptional regulator, RpiR family  37.29 
 
 		 285 aa  67.4  0.00000000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.576789  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2753  transcriptional regulator, RpiR family  38.1 
 
 		 304 aa  67  0.00000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3745  RpiR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 282 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.767556 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1547  RpiR family transcriptional regulator  37.11 
 
 		 296 aa  66.2  0.0000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0580  RpiR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 282 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.658912  normal  0.89076 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0176  RpiR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 282 aa  66.2  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0626  RpiR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 282 aa  66.2  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0554  RpiR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 282 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.335525  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0659  RpiR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 282 aa  66.2  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.78991  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2045  putative transcriptional regulator, RpiR family  36.7 
 
 		 291 aa  65.5  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2584  hypothetical protein  34.55 
 
 		 282 aa  65.9  0.0000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4018  RpiR family transcriptional regulator  33.04 
 
 		 284 aa  64.7  0.0000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.772645  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4054  RpiR family transcriptional regulator  33.06 
 
 		 287 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.544392  normal  0.902505 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0607  RpiR family transcriptional regulator  32.67 
 
 		 280 aa  63.9  0.0000000008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.173614  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0593  RpiR family transcriptional regulator  32.67 
 
 		 280 aa  63.9  0.0000000008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000590128  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001002  transcriptional regulator RpiR family  33.33 
 
 		 283 aa  63.2  0.000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1686  transcriptional regulator  38.24 
 
 		 272 aa  62.8  0.000000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0801516  hitchhiker  0.000000000302216 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0662  RpiR family transcriptional regulator  29.92 
 
 		 303 aa  62.4  0.000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0182  RpiR family transcriptional regulator  30.48 
 
 		 279 aa  62  0.000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1348  transcriptional regulator, RpiR family  31.03 
 
 		 307 aa  61.6  0.000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.478547  normal  0.506779 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2136  transcriptional regulator, RpiR family  27.88 
 
 		 284 aa  61.6  0.000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.000000108566  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0423  RpiR family transcriptional regulator  33.05 
 
 		 287 aa  62  0.000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7211  transcriptional regulator, RpiR family  33.05 
 
 		 287 aa  62  0.000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.84474  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2724  RpiR family transcriptional regulator  32.03 
 
 		 282 aa  61.6  0.000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4164  RpiR family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 282 aa  61.6  0.000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.045816  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0179  RpiR family transcriptional regulator  30.48 
 
 		 279 aa  61.6  0.000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.912597  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0625  bifunctional glucokinase/RpiR family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 639 aa  61.2  0.000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02030  transcriptional regulatory protein HexR  32 
 
 		 288 aa  60.8  0.000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2433  bifunctional glucokinase/RpiR family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 642 aa  60.5  0.000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.399098  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3662  putative DNA-binding transcriptional regulator  30.25 
 
 		 282 aa  60.5  0.000000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3618  putative DNA-binding transcriptional regulator  30.51 
 
 		 279 aa  60.5  0.000000008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1248  putative DNA-binding transcriptional regulator  30.51 
 
 		 279 aa  60.5  0.000000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.964935  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1142  putative DNA-binding transcriptional regulator  30.51 
 
 		 279 aa  60.5  0.000000008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>