More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_7090 on replicon NC_011981
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011981  Avi_7090  ABC transporter membrane spanning protein (urea/amide)  100 
 
 		 289 aa  548  1e-155  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5242  ABC transporter permease  48.8 
 
 		 288 aa  230  2e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.157706 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5536  inner-membrane translocator  41.03 
 
 		 287 aa  182  4.0000000000000006e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0898761  hitchhiker  0.00000762258 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7434  ABC transporter membrane spanning protein (branched chain amino acid)  39.93 
 
 		 287 aa  167  2e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6136  inner-membrane translocator  40.93 
 
 		 290 aa  154  1e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0756138  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4887  inner-membrane translocator  36.86 
 
 		 304 aa  151  1e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4798  inner-membrane translocator  36.73 
 
 		 304 aa  148  1.0000000000000001e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.337539  normal  0.0254161 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2425  ABC branched-chain amino acid transporter, inner membrane subunit  34.38 
 
 		 288 aa  124  1e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.674149  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1438  inner-membrane translocator  34.38 
 
 		 288 aa  124  2e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1533  inner-membrane translocator  34.38 
 
 		 288 aa  124  2e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.575934  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1194  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  32.06 
 
 		 287 aa  119  7e-26  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.633758  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1096  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  32.06 
 
 		 287 aa  119  7e-26  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1928  inner-membrane translocator  36.47 
 
 		 290 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.45272  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5994  branched chain amino acid ABC transporter permease  33.09 
 
 		 290 aa  116  5e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0717664 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1454  inner-membrane translocator  32.42 
 
 		 288 aa  115  6.9999999999999995e-25  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.566264  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1099  inner-membrane translocator  34.08 
 
 		 292 aa  113  3e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.110891  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0933  inner-membrane translocator  33.58 
 
 		 293 aa  113  4.0000000000000004e-24  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00000000263386  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0793  inner-membrane translocator  32.59 
 
 		 290 aa  112  5e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.806317  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1563  inner-membrane translocator  33.81 
 
 		 283 aa  112  6e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1906  inner-membrane translocator  34.65 
 
 		 287 aa  112  7.000000000000001e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.768984 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1676  inner-membrane translocator  34.17 
 
 		 285 aa  111  1.0000000000000001e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0527356 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2006  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  33.6 
 
 		 288 aa  111  2.0000000000000002e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.766894  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2429  inner-membrane translocator  30.74 
 
 		 300 aa  111  2.0000000000000002e-23  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.614779  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1905  inner-membrane translocator  33.33 
 
 		 290 aa  110  3e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.419507 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1581  inner-membrane translocator  32.23 
 
 		 308 aa  110  4.0000000000000004e-23  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5834  inner-membrane translocator  36.15 
 
 		 290 aa  109  5e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00317168 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2006  inner-membrane translocator  34.26 
 
 		 301 aa  109  5e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2127  inner-membrane translocator  34.6 
 
 		 292 aa  109  7.000000000000001e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.172623  normal  0.197273 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3646  inner-membrane translocator  33.58 
 
 		 287 aa  108  9.000000000000001e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.362219  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1707  inner-membrane translocator  32.18 
 
 		 294 aa  108  1e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.666506  normal  0.0117709 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5858  inner-membrane translocator  34.62 
 
 		 299 aa  108  1e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0449527 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2588  inner-membrane translocator  32.16 
 
 		 290 aa  107  2e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0429  inner-membrane translocator  33.08 
 
 		 293 aa  107  2e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.220728 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0862  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  32.04 
 
 		 288 aa  107  3e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0185519  normal  0.209309 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4745  inner-membrane translocator  33.85 
 
 		 287 aa  106  4e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.397028  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0142  inner-membrane translocator  36.4 
 
 		 288 aa  106  4e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1523  inner-membrane translocator  35.02 
 
 		 291 aa  106  5e-22  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  hitchhiker  0.00164732  normal  0.617596 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2893  inner-membrane translocator  32.18 
 
 		 652 aa  106  6e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1619  inner-membrane translocator  29.5 
 
 		 290 aa  105  7e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.755467  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0847  inner-membrane translocator  33.33 
 
 		 291 aa  105  7e-22  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.658608 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1227  inner-membrane translocator  33.33 
 
 		 288 aa  105  9e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0358415  normal  0.0652986 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3000  inner-membrane translocator  32.95 
 
 		 534 aa  105  9e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.825647  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2501  inner-membrane translocator  28.68 
 
 		 302 aa  104  1e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.123023 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1621  inner-membrane translocator  33.07 
 
 		 287 aa  104  2e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.77317 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1973  inner-membrane translocator  32.59 
 
 		 300 aa  103  2e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2312  inner-membrane translocator  33.47 
 
 		 551 aa  103  2e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.280528  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3304  inner-membrane translocator  35.66 
 
 		 289 aa  103  3e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3697  inner-membrane translocator  33.46 
 
 		 291 aa  103  3e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1391  inner-membrane translocator  31.82 
 
 		 294 aa  103  3e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0266  inner-membrane translocator  28.62 
 
 		 304 aa  103  3e-21  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.000146885  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2986  inner-membrane translocator  32.68 
 
 		 287 aa  103  3e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0359468  normal  0.478138 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3749  inner-membrane translocator  33.33 
 
 		 295 aa  103  3e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1949  inner-membrane translocator  33.88 
 
 		 292 aa  103  3e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.926324  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3794  inner-membrane translocator  32.45 
 
 		 293 aa  103  3e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.751055  normal  0.192822 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0481  branched chain amino acid ABC transporter permease  28.36 
 
 		 292 aa  103  3e-21  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3907  inner-membrane translocator  32.45 
 
 		 293 aa  103  3e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2705  inner-membrane translocator  30.77 
 
 		 289 aa  102  5e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.787107 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0548  inner-membrane translocator  35.27 
 
 		 291 aa  102  6e-21  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.081498  hitchhiker  0.0000417079 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1161  high affinity branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  30.8 
 
 		 298 aa  102  8e-21  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1581  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  32 
 
 		 289 aa  102  8e-21  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000593948  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0078  inner-membrane translocator  34.25 
 
 		 290 aa  102  8e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0657  inner-membrane translocator  32.69 
 
 		 338 aa  102  9e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2141  inner-membrane translocator  34.39 
 
 		 292 aa  102  9e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.694846 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1829  inner-membrane translocator  32.42 
 
 		 289 aa  102  1e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000486818  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0393  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  30.49 
 
 		 294 aa  101  1e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.844252  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0771  high affinity branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  30.8 
 
 		 298 aa  101  1e-20  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.171374  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1036  high affinity branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  30.8 
 
 		 298 aa  102  1e-20  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.203386  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0949  inner-membrane translocator  32.05 
 
 		 540 aa  101  1e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0336  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  30.49 
 
 		 294 aa  102  1e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1501  inner-membrane translocator  32.32 
 
 		 291 aa  101  1e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.14327  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0220  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  35.46 
 
 		 290 aa  102  1e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.168677  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0400  hydrophobic amino acid ABC transporter permease/ATP-binding protein  28.41 
 
 		 298 aa  101  1e-20  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4700  inner-membrane translocator  32.76 
 
 		 296 aa  101  2e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.365465  normal  0.476107 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2177  integral membrane protein of the ABC-type Nat permease for neutral amino acids NatD  29.81 
 
 		 296 aa  100  2e-20  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.801545 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0994  inner-membrane translocator  29.46 
 
 		 642 aa  100  2e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0399  branched chain amino acid ABC transporter permease  30 
 
 		 294 aa  101  2e-20  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.615306  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2987  ABC transporter inner-membrane translocator  29.53 
 
 		 547 aa  100  2e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.334441 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4182  inner-membrane translocator  32.64 
 
 		 289 aa  100  3e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0096  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  33.33 
 
 		 607 aa  100  4e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.26664 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5354  inner-membrane translocator  28.21 
 
 		 309 aa  100  4e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.764467 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3292  hypothetical protein  31.02 
 
 		 301 aa  99.8  5e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00518243 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4485  inner-membrane translocator  31.3 
 
 		 295 aa  99.8  5e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.19585  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2082  inner-membrane translocator  33.59 
 
 		 289 aa  99.4  6e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.936766  normal  0.326487 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4644  inner-membrane translocator  31.25 
 
 		 291 aa  99.4  6e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.706844  normal  0.122145 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1112  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  29.92 
 
 		 298 aa  99  9e-20  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0332  inner-membrane translocator  30.94 
 
 		 293 aa  98.6  1e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.952251  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5695  inner-membrane translocator  35.38 
 
 		 290 aa  98.2  1e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00418313 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3001  inner-membrane translocator  27.08 
 
 		 338 aa  98.6  1e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.893544 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2696  inner-membrane translocator  30.8 
 
 		 554 aa  98.6  1e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.665567  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1875  inner-membrane translocator  27.24 
 
 		 309 aa  98.6  1e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.152214  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3799  inner-membrane translocator  34.36 
 
 		 294 aa  98.2  1e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.266224  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2201  inner-membrane translocator  25.1 
 
 		 289 aa  98.6  1e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.796899  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0644  inner-membrane translocator  35.38 
 
 		 290 aa  98.6  1e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3619  inner-membrane translocator  32.23 
 
 		 305 aa  97.8  2e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.551009 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1848  inner-membrane translocator  31.82 
 
 		 292 aa  97.4  2e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.623579  normal  0.509442 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4370  inner-membrane translocator  33.05 
 
 		 290 aa  97.4  2e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.178005  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0734  inner-membrane translocator  30.27 
 
 		 324 aa  97.4  2e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.993171  normal  0.748996 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1136  inner-membrane translocator  29.93 
 
 		 286 aa  97.4  2e-19  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0602243  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0611  inner-membrane translocator  27.76 
 
 		 300 aa  97.4  2e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4606  urea ABC transporter, permease protein UrtB  31.4 
 
 		 558 aa  97.1  3e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>