More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tneu_0548 on replicon NC_010525
Organism: Thermoproteus neutrophilus V24Sta



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010525  Tneu_0548  inner-membrane translocator  100 
 
 		 291 aa  550  1e-155  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.081498  hitchhiker  0.0000417079 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1523  inner-membrane translocator  87.97 
 
 		 291 aa  468  1.0000000000000001e-131  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  hitchhiker  0.00164732  normal  0.617596 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0847  inner-membrane translocator  74.91 
 
 		 291 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.658608 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0447  inner-membrane translocator  72.85 
 
 		 290 aa  372  1e-102  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1707  inner-membrane translocator  38.06 
 
 		 294 aa  156  4e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.666506  normal  0.0117709 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1619  inner-membrane translocator  35.89 
 
 		 290 aa  147  2.0000000000000003e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.755467  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2429  inner-membrane translocator  34.6 
 
 		 300 aa  144  2e-33  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.614779  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0260  inner-membrane translocator  37.63 
 
 		 287 aa  139  6e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0793  inner-membrane translocator  32.53 
 
 		 290 aa  137  3.0000000000000003e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.806317  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1563  inner-membrane translocator  34.74 
 
 		 283 aa  134  9.999999999999999e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3749  inner-membrane translocator  36.68 
 
 		 295 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3646  inner-membrane translocator  34.13 
 
 		 287 aa  132  6e-30  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.362219  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1905  inner-membrane translocator  31.71 
 
 		 290 aa  132  9e-30  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.419507 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0220  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  35.25 
 
 		 290 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.168677  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4925  inner-membrane translocator  33.45 
 
 		 293 aa  130  3e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0402653  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3660  inner-membrane translocator  35.07 
 
 		 287 aa  129  6e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.741665  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1892  branched-chain amino acid AbC-type transport system permease  32.99 
 
 		 308 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.339228  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0896  inner-membrane translocator  35.29 
 
 		 295 aa  127  2.0000000000000002e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1066  inner-membrane translocator  32.99 
 
 		 297 aa  127  2.0000000000000002e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00641991  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0513  inner-membrane translocator  31.43 
 
 		 309 aa  127  3e-28  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0503611  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0611  inner-membrane translocator  33.33 
 
 		 300 aa  126  4.0000000000000003e-28  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0862  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  32.3 
 
 		 288 aa  126  5e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0185519  normal  0.209309 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3980  ABC transporter permease  34.26 
 
 		 287 aa  125  6e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0118656 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3056  inner-membrane translocator  32.44 
 
 		 292 aa  125  1e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0393  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  33.81 
 
 		 294 aa  122  6e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.844252  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0142  inner-membrane translocator  37.45 
 
 		 288 aa  122  7e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0336  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  33.81 
 
 		 294 aa  121  9.999999999999999e-27  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1099  inner-membrane translocator  33.45 
 
 		 292 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.110891  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2500  inner-membrane translocator  32.63 
 
 		 287 aa  119  4.9999999999999996e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0400  hydrophobic amino acid ABC transporter permease/ATP-binding protein  32.76 
 
 		 298 aa  119  6e-26  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5994  branched chain amino acid ABC transporter permease  32.29 
 
 		 290 aa  119  7e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0717664 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3057  inner-membrane translocator  33.6 
 
 		 292 aa  119  7e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.299271  normal  0.394011 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0481  branched chain amino acid ABC transporter permease  28.62 
 
 		 292 aa  118  9e-26  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1928  inner-membrane translocator  33.56 
 
 		 290 aa  118  9.999999999999999e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.45272  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2112  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  32.18 
 
 		 291 aa  118  9.999999999999999e-26  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1091  inner-membrane translocator  32.75 
 
 		 325 aa  118  9.999999999999999e-26  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2127  inner-membrane translocator  33.45 
 
 		 292 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.172623  normal  0.197273 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3619  inner-membrane translocator  31.39 
 
 		 305 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.551009 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2885  putative ABC transporter permiase component  32.16 
 
 		 277 aa  117  3e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0257829 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0005  inner-membrane translocator  35.27 
 
 		 294 aa  116  3.9999999999999997e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.901395  hitchhiker  0.00000431174 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0228  inner-membrane translocator  34.67 
 
 		 297 aa  116  3.9999999999999997e-25  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0160417  normal  0.113525 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0461  inner-membrane translocator  33.22 
 
 		 298 aa  116  5e-25  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2607  inner-membrane translocator  31.7 
 
 		 308 aa  116  6e-25  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.00528539  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3254  inner-membrane translocator  31.7 
 
 		 308 aa  116  6e-25  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.25929 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2177  integral membrane protein of the ABC-type Nat permease for neutral amino acids NatD  33.33 
 
 		 296 aa  115  7.999999999999999e-25  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.801545 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5101  inner-membrane translocator  35.27 
 
 		 603 aa  115  7.999999999999999e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.208256  normal  0.176436 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2555  high affinity branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  32.18 
 
 		 293 aa  114  1.0000000000000001e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.1036  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5318  inner-membrane translocator  34.36 
 
 		 603 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0891799  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1676  inner-membrane translocator  35.62 
 
 		 285 aa  114  2.0000000000000002e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0527356 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1161  high affinity branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  31.58 
 
 		 298 aa  114  2.0000000000000002e-24  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1194  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  28.52 
 
 		 287 aa  114  2.0000000000000002e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.633758  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2534  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  34.02 
 
 		 603 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1096  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  28.52 
 
 		 287 aa  114  2.0000000000000002e-24  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1479  inner-membrane translocator  35.2 
 
 		 302 aa  114  2.0000000000000002e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3936  inner-membrane translocator  34.02 
 
 		 603 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.240526  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1036  high affinity branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  31.58 
 
 		 298 aa  114  2.0000000000000002e-24  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.203386  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3584  inner-membrane translocator  34.02 
 
 		 603 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2253  inner-membrane translocator  34.47 
 
 		 301 aa  114  2.0000000000000002e-24  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2239  inner-membrane translocator  33.46 
 
 		 293 aa  114  2.0000000000000002e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1581  inner-membrane translocator  32.82 
 
 		 308 aa  113  3e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0940  hydrophobic amino acid ABC transporter permease/ATP-binding protein  30.13 
 
 		 316 aa  113  3e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0796319  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1848  inner-membrane translocator  29.93 
 
 		 292 aa  113  3e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.623579  normal  0.509442 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2141  inner-membrane translocator  33.1 
 
 		 292 aa  113  3e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.694846 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5858  inner-membrane translocator  35.52 
 
 		 299 aa  113  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0449527 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1165  inner-membrane translocator  33 
 
 		 306 aa  113  4.0000000000000004e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.893809 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0989  hydrophobic amino acid ABC transporter permease/ATP-binding protein  30.13 
 
 		 316 aa  113  5e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.341358  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1143  putative amino-acid transport permease protein  30.13 
 
 		 316 aa  113  5e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.0034863  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0785  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  29.81 
 
 		 316 aa  112  5e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0983  hydrophobic amino acid ABC transporter permease/ATP-binding protein  30.13 
 
 		 316 aa  113  5e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.156629  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1949  inner-membrane translocator  29.2 
 
 		 292 aa  112  6e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.926324  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1501  inner-membrane translocator  30.9 
 
 		 291 aa  112  6e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.14327  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0327  inner-membrane translocator  31.56 
 
 		 293 aa  112  7.000000000000001e-24  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0975712  normal  0.166918 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3535  inner-membrane translocator  31.25 
 
 		 291 aa  112  7.000000000000001e-24  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.152281  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0521  inner-membrane translocator  30.87 
 
 		 304 aa  112  9e-24  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1721  inner-membrane translocator  29.82 
 
 		 290 aa  111  1.0000000000000001e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.021923  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0589  inner-membrane translocator  30.9 
 
 		 316 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1130  inner-membrane translocator  32.09 
 
 		 293 aa  111  1.0000000000000001e-23  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1664  inner-membrane translocator  32.23 
 
 		 292 aa  111  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0933  inner-membrane translocator  34.01 
 
 		 293 aa  110  2.0000000000000002e-23  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00000000263386  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0652  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  31.77 
 
 		 319 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.276019  normal  0.481307 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3837  inner-membrane translocator  33.56 
 
 		 287 aa  111  2.0000000000000002e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.622329  normal  0.114435 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3349  inner-membrane translocator  31.44 
 
 		 319 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5018  inner-membrane translocator  31.44 
 
 		 319 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.52703 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0861  inner-membrane translocator  30.93 
 
 		 287 aa  110  2.0000000000000002e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.231658  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0771  high affinity branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  32.18 
 
 		 298 aa  110  2.0000000000000002e-23  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.171374  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3399  inner-membrane translocator  33.78 
 
 		 304 aa  110  2.0000000000000002e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0293629 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1391  inner-membrane translocator  31.19 
 
 		 294 aa  110  3e-23  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4332  inner-membrane translocator  31.19 
 
 		 308 aa  110  3e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.797929  normal  0.146471 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1112  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  31.49 
 
 		 298 aa  110  3e-23  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5269  inner-membrane translocator  31.33 
 
 		 308 aa  110  3e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.867489  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1123  putative amino-acid transmembrane ABC transporter protein  31.67 
 
 		 335 aa  110  3e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.121709  normal  0.109582 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2115  inner-membrane translocator  34.23 
 
 		 304 aa  110  3e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.592251  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5829  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  29.77 
 
 		 316 aa  109  4.0000000000000004e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.903514  normal  0.264846 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1906  inner-membrane translocator  32.45 
 
 		 287 aa  109  4.0000000000000004e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.768984 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3796  inner-membrane translocator  31.65 
 
 		 309 aa  110  4.0000000000000004e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0797  inner-membrane translocator  29.77 
 
 		 316 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.320354 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4431  inner-membrane translocator  31.44 
 
 		 308 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.964764  hitchhiker  0.00013091 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1675  inner-membrane translocator  31.25 
 
 		 299 aa  109  5e-23  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.644536  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0271  inner-membrane translocator  30.48 
 
 		 319 aa  109  5e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.297409  normal  0.531451 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1838  high-affinity branched-chain amino acid transport system permease protein  31.89 
 
 		 308 aa  109  5e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>