More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_1687 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008541  Arth_1687  indole-3-glycerol-phosphate synthase  100 
 
 
272 aa  527  1e-149  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.144549  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1682  indole-3-glycerol-phosphate synthase  83.46 
 
 
273 aa  417  9.999999999999999e-116  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000484528 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2966  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  61.28 
 
 
274 aa  300  2e-80  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0215924  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10960  indole-3-glycerol phosphate synthase  61.98 
 
 
268 aa  294  1e-78  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.0068358  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1499  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  60.84 
 
 
275 aa  286  2e-76  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1986  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  57.52 
 
 
270 aa  280  2e-74  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20750  indole-3-glycerol phosphate synthase  57.89 
 
 
270 aa  279  4e-74  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.600467  normal  0.621032 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1215  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  57.89 
 
 
271 aa  278  1e-73  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.783684  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3067  indole-3-glycerol-phosphate synthase  57.03 
 
 
272 aa  272  4.0000000000000004e-72  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.285409  normal  0.207369 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3051  indole-3-glycerol-phosphate synthase  57.03 
 
 
272 aa  272  4.0000000000000004e-72  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3110  indole-3-glycerol-phosphate synthase  57.03 
 
 
272 aa  272  4.0000000000000004e-72  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.475678  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3600  indole-3-glycerol-phosphate synthase  57.41 
 
 
272 aa  272  5.000000000000001e-72  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.962067  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1450  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  55.64 
 
 
274 aa  269  2.9999999999999997e-71  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2816  indole-3-glycerol-phosphate synthase  56.6 
 
 
272 aa  268  5e-71  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.07226  normal  0.927217 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5702  indole-3-glycerol-phosphate synthase  54.24 
 
 
271 aa  268  8.999999999999999e-71  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.344478  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2221  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  57.89 
 
 
270 aa  266  2e-70  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2939  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  57.89 
 
 
269 aa  265  8e-70  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.998614 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28110  indole-3-glycerol-phosphate synthase  54.98 
 
 
269 aa  263  3e-69  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3397  indole-3-glycerol-phosphate synthase  56.49 
 
 
267 aa  261  1e-68  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3017  indole-3-glycerol-phosphate synthase  55.15 
 
 
317 aa  260  2e-68  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.145676 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3218  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  56.02 
 
 
269 aa  258  8e-68  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0577102  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3076  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  54.04 
 
 
269 aa  258  9e-68  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000445652  hitchhiker  0.0000898073 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2948  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  55.89 
 
 
272 aa  257  1e-67  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.544839  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11627  indole-3-glycerol-phosphate synthase  55.09 
 
 
282 aa  257  1e-67  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.271209 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1073  indole-3-glycerol phosphate synthase  57.14 
 
 
287 aa  255  4e-67  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.110907  normal  0.803257 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1931  indole-3-glycerol-phosphate synthase  53.79 
 
 
268 aa  255  5e-67  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.535725 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2509  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  51.29 
 
 
269 aa  253  3e-66  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.69466  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5711  indole-3-glycerol-phosphate synthase  54.14 
 
 
274 aa  251  1e-65  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3172  indole-3-glycerol-phosphate synthase  55.19 
 
 
286 aa  248  1e-64  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.291676 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2046  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  54.07 
 
 
272 aa  246  2e-64  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.941423  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3027  indole-3-glycerol phosphate synthase  55.94 
 
 
260 aa  241  9e-63  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14890  indole-3-glycerol phosphate synthase  60.62 
 
 
277 aa  233  3e-60  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.165384  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3175  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  53.76 
 
 
268 aa  233  4.0000000000000004e-60  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.504045  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12880  indole-3-glycerol phosphate synthase  55.34 
 
 
273 aa  230  2e-59  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.315308  normal  0.0294244 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2875  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  57.52 
 
 
268 aa  228  9e-59  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000186744  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1164  indole-3-glycerol-phosphate synthase  55.64 
 
 
268 aa  224  1e-57  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2497  indole-3-glycerol-phosphate synthase  41.63 
 
 
271 aa  197  1.0000000000000001e-49  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0317819  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1232  indole-3-glycerol-phosphate synthase  45.12 
 
 
270 aa  197  1.0000000000000001e-49  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0182595  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1254  Indole-3-glycerol phosphate synthase  43.48 
 
 
259 aa  194  2e-48  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2798  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  43.41 
 
 
265 aa  189  4e-47  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.822714  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0182  indole-3-glycerol-phosphate synthase  44.32 
 
 
264 aa  189  5.999999999999999e-47  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1274  indole-3-glycerol-phosphate synthase  42.97 
 
 
259 aa  188  9e-47  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0160  indole-3-glycerol-phosphate synthase  44.32 
 
 
264 aa  187  1e-46  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.286588  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1484  indole-3-glycerol-phosphate synthase  42.8 
 
 
259 aa  184  2.0000000000000003e-45  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1306  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  40.4 
 
 
262 aa  183  2.0000000000000003e-45  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3582  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  46.79 
 
 
263 aa  184  2.0000000000000003e-45  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.433048  normal  0.034535 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2319  indole-3-glycerol phosphate synthase  46.8 
 
 
270 aa  182  6e-45  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.043656  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1339  indole-3-glycerol phosphate synthase  46.43 
 
 
259 aa  182  7e-45  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.419917  normal  0.796071 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1251  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  42.15 
 
 
270 aa  180  2e-44  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1926  indole-3-glycerol-phosphate synthase  39.55 
 
 
296 aa  180  2e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0159  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  42.86 
 
 
287 aa  179  4.999999999999999e-44  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.422132  normal  0.0132448 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0519  indole-3-glycerol-phosphate synthase  39.04 
 
 
258 aa  179  4.999999999999999e-44  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0606  indole-3-glycerol-phosphate synthase  39.04 
 
 
258 aa  179  5.999999999999999e-44  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.64209  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2990  indole-3-glycerol-phosphate synthase  43.97 
 
 
272 aa  179  5.999999999999999e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.508852  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1188  indole-3-glycerol-phosphate synthase  43.95 
 
 
275 aa  177  1e-43  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0171952  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1252  indole-3-glycerol phosphate synthase  45.08 
 
 
257 aa  177  1e-43  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1138  indole-3-glycerol-phosphate synthase  41.7 
 
 
269 aa  177  1e-43  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.69839 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2300  indole-3-glycerol-phosphate synthase  43.75 
 
 
273 aa  177  2e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0956436  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3845  indole-3-glycerol-phosphate synthase  43.9 
 
 
271 aa  177  2e-43  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0731  indole-3-glycerol-phosphate synthase  41.7 
 
 
263 aa  177  2e-43  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.374579  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0711  indole-3-glycerol-phosphate synthase  40.56 
 
 
267 aa  177  2e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1436  indole-3-glycerol-phosphate synthase  38.65 
 
 
258 aa  176  3e-43  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.567597  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1650  indole-3-glycerol-phosphate synthase  42.51 
 
 
262 aa  176  5e-43  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5135  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  45.83 
 
 
285 aa  175  7e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0596485 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4672  indole-3-glycerol-phosphate synthase  45.83 
 
 
285 aa  175  7e-43  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1252  indole-3-glycerol-phosphate synthase  43.75 
 
 
269 aa  175  8e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.157221 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2798  indole-3-glycerol-phosphate synthase  43.5 
 
 
265 aa  174  9.999999999999999e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.812151  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1174  indole-3-glycerol phosphate synthase  42.06 
 
 
262 aa  174  9.999999999999999e-43  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2079  indole-3-glycerol-phosphate synthase  43.55 
 
 
272 aa  174  1.9999999999999998e-42  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2358  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  41.27 
 
 
268 aa  174  1.9999999999999998e-42  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0251  indole-3-glycerol-phosphate synthase  39.51 
 
 
265 aa  173  1.9999999999999998e-42  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3242  indole-3-glycerol phosphate synthase  41.04 
 
 
263 aa  173  2.9999999999999996e-42  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.857016  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0754  indole-3-glycerol phosphate synthase  40.93 
 
 
265 aa  173  2.9999999999999996e-42  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.297551 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2843  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  41.04 
 
 
263 aa  173  2.9999999999999996e-42  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00184612  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04004  indole-3-glycerol-phosphate synthase  41.38 
 
 
265 aa  173  3.9999999999999995e-42  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2858  indole-3-glycerol-phosphate synthase  44.14 
 
 
269 aa  172  3.9999999999999995e-42  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3801  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  37.88 
 
 
295 aa  172  3.9999999999999995e-42  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2567  indole-3-glycerol-phosphate synthase  41.87 
 
 
271 aa  172  3.9999999999999995e-42  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0720427  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46110  indole-3-glycerol-phosphate synthase  41.63 
 
 
266 aa  172  5e-42  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5212  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  42.4 
 
 
285 aa  172  5e-42  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.69886  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0872  indole-3-glycerol-phosphate synthase  41.9 
 
 
260 aa  172  5e-42  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.169431  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06390  indole-3-glycerol phosphate synthase  36.64 
 
 
260 aa  172  5.999999999999999e-42  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3601  indole-3-glycerol-phosphate synthase  40.77 
 
 
264 aa  172  5.999999999999999e-42  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.147374  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3718  indole-3-glycerol-phosphate synthase  41.09 
 
 
264 aa  172  5.999999999999999e-42  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0881817  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0269  indole-3-glycerol-phosphate synthase  39.61 
 
 
268 aa  171  7.999999999999999e-42  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000502728  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1952  indole-3-glycerol-phosphate synthase  39.52 
 
 
261 aa  169  3e-41  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.0048932  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1639  indole-3-glycerol phosphate synthase  41.46 
 
 
271 aa  170  3e-41  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.189756  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3169  indole-3-glycerol phosphate synthase  36.82 
 
 
297 aa  170  3e-41  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.119969 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2130  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  35.08 
 
 
259 aa  169  4e-41  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0640  indole-3-glycerol-phosphate synthase  37.4 
 
 
258 aa  169  4e-41  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1670  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  39.54 
 
 
267 aa  169  5e-41  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00153325  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2587  indole-3-glycerol phosphate synthase  40.64 
 
 
265 aa  168  8e-41  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.804047  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4370  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  39.7 
 
 
270 aa  168  8e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4894  indole-3-glycerol-phosphate synthase  37.1 
 
 
259 aa  168  8e-41  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4451  indole-3-glycerol-phosphate synthase  41.04 
 
 
264 aa  167  1e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0983396  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5394  indole-3-glycerol-phosphate synthase  40.96 
 
 
285 aa  167  2e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.467387  normal  0.310018 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0594  indole-3-glycerol phosphate synthase  41.11 
 
 
278 aa  167  2e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3236  indole-3-glycerol-phosphate synthase  42.68 
 
 
265 aa  167  2e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3489  indole-3-glycerol-phosphate synthase  36.57 
 
 
293 aa  167  2e-40  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1047  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  41.96 
 
 
273 aa  167  2e-40  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>