More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_3017 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007777  Francci3_3017  indole-3-glycerol-phosphate synthase  100 
 
 
317 aa  617  1e-176  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.145676 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1931  indole-3-glycerol-phosphate synthase  79.7 
 
 
268 aa  405  1.0000000000000001e-112  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.535725 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5711  indole-3-glycerol-phosphate synthase  65.93 
 
 
274 aa  332  7.000000000000001e-90  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1986  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  66.91 
 
 
270 aa  331  1e-89  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3600  indole-3-glycerol-phosphate synthase  66.04 
 
 
272 aa  328  8e-89  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.962067  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1450  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  65.66 
 
 
274 aa  326  3e-88  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28110  indole-3-glycerol-phosphate synthase  64.64 
 
 
269 aa  318  6e-86  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3076  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  68.82 
 
 
269 aa  318  6e-86  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000445652  hitchhiker  0.0000898073 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2816  indole-3-glycerol-phosphate synthase  64.53 
 
 
272 aa  318  6e-86  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.07226  normal  0.927217 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1215  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  63.94 
 
 
271 aa  316  3e-85  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.783684  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3218  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  67.3 
 
 
269 aa  315  5e-85  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0577102  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1499  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  64.64 
 
 
275 aa  313  1.9999999999999998e-84  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2939  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  66.04 
 
 
269 aa  313  1.9999999999999998e-84  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.998614 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3067  indole-3-glycerol-phosphate synthase  63.5 
 
 
272 aa  312  4.999999999999999e-84  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.285409  normal  0.207369 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3051  indole-3-glycerol-phosphate synthase  63.5 
 
 
272 aa  312  4.999999999999999e-84  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3110  indole-3-glycerol-phosphate synthase  63.5 
 
 
272 aa  312  4.999999999999999e-84  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.475678  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5702  indole-3-glycerol-phosphate synthase  63.5 
 
 
271 aa  311  6.999999999999999e-84  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.344478  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20750  indole-3-glycerol phosphate synthase  62.45 
 
 
270 aa  308  6.999999999999999e-83  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.600467  normal  0.621032 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2221  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  65.43 
 
 
270 aa  307  1.0000000000000001e-82  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3397  indole-3-glycerol-phosphate synthase  65.13 
 
 
267 aa  305  9.000000000000001e-82  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2046  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  64.89 
 
 
272 aa  303  2.0000000000000002e-81  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.941423  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2875  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  66.79 
 
 
268 aa  300  2e-80  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000186744  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2966  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  63 
 
 
274 aa  300  2e-80  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0215924  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3172  indole-3-glycerol-phosphate synthase  65.27 
 
 
286 aa  300  2e-80  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.291676 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3175  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  67.55 
 
 
268 aa  300  2e-80  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.504045  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11627  indole-3-glycerol-phosphate synthase  62.6 
 
 
282 aa  299  4e-80  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.271209 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2948  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  61.98 
 
 
272 aa  296  4e-79  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.544839  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2509  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  61.22 
 
 
269 aa  295  9e-79  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.69466  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1164  indole-3-glycerol-phosphate synthase  67.17 
 
 
268 aa  295  9e-79  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1073  indole-3-glycerol phosphate synthase  62.64 
 
 
287 aa  279  6e-74  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.110907  normal  0.803257 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3027  indole-3-glycerol phosphate synthase  63.49 
 
 
260 aa  263  2e-69  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1687  indole-3-glycerol-phosphate synthase  54.62 
 
 
272 aa  244  1.9999999999999999e-63  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.144549  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10960  indole-3-glycerol phosphate synthase  56.42 
 
 
268 aa  242  7.999999999999999e-63  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.0068358  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1682  indole-3-glycerol-phosphate synthase  53.85 
 
 
273 aa  241  1e-62  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000484528 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12880  indole-3-glycerol phosphate synthase  57.55 
 
 
273 aa  234  2.0000000000000002e-60  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.315308  normal  0.0294244 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14890  indole-3-glycerol phosphate synthase  56.22 
 
 
277 aa  197  2.0000000000000003e-49  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.165384  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1251  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  45.59 
 
 
270 aa  195  7e-49  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1339  indole-3-glycerol phosphate synthase  48.24 
 
 
259 aa  195  1e-48  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.419917  normal  0.796071 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3801  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  42.21 
 
 
295 aa  192  7e-48  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1252  indole-3-glycerol-phosphate synthase  47.62 
 
 
269 aa  188  9e-47  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.157221 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1274  indole-3-glycerol-phosphate synthase  46.55 
 
 
259 aa  187  2e-46  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1188  indole-3-glycerol-phosphate synthase  54.55 
 
 
275 aa  186  3e-46  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0171952  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1484  indole-3-glycerol-phosphate synthase  46.55 
 
 
259 aa  186  6e-46  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0640  indole-3-glycerol-phosphate synthase  39.75 
 
 
258 aa  183  4.0000000000000006e-45  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0731  indole-3-glycerol-phosphate synthase  40.84 
 
 
263 aa  182  6e-45  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.374579  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1254  Indole-3-glycerol phosphate synthase  44.68 
 
 
259 aa  182  8.000000000000001e-45  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2497  indole-3-glycerol-phosphate synthase  41.7 
 
 
271 aa  181  1e-44  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0317819  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1393  indole-3-glycerol-phosphate synthase  38.98 
 
 
295 aa  179  4e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0159  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  42.35 
 
 
287 aa  179  4.999999999999999e-44  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.422132  normal  0.0132448 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2300  indole-3-glycerol-phosphate synthase  47.45 
 
 
273 aa  177  1e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0956436  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_14821  indole-3-glycerol-phosphate synthase  37.64 
 
 
295 aa  177  2e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.857167  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2798  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  44.19 
 
 
265 aa  177  2e-43  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.822714  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1232  indole-3-glycerol-phosphate synthase  41.53 
 
 
270 aa  177  3e-43  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0182595  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3099  indole-3-glycerol-phosphate synthase  45.69 
 
 
295 aa  176  4e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1306  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  39.52 
 
 
262 aa  176  4e-43  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1416  indole-3-glycerol-phosphate synthase  45.69 
 
 
278 aa  176  5e-43  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2858  indole-3-glycerol-phosphate synthase  45.24 
 
 
269 aa  175  8e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14961  indole-3-glycerol-phosphate synthase  36.9 
 
 
295 aa  175  8e-43  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.147831  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3845  indole-3-glycerol-phosphate synthase  42.79 
 
 
271 aa  174  1.9999999999999998e-42  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2990  indole-3-glycerol-phosphate synthase  44.78 
 
 
272 aa  173  2.9999999999999996e-42  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.508852  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1156  indole-3-glycerol phosphate synthase  43.58 
 
 
260 aa  173  3.9999999999999995e-42  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.721483  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0174  indole-3-glycerol-phosphate synthase  42.39 
 
 
257 aa  172  7.999999999999999e-42  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2627  indole-3-glycerol-phosphate synthase  42.08 
 
 
293 aa  172  1e-41  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.236975  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0711  indole-3-glycerol-phosphate synthase  47.42 
 
 
267 aa  171  2e-41  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0606  indole-3-glycerol-phosphate synthase  39.83 
 
 
258 aa  170  3e-41  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.64209  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3489  indole-3-glycerol-phosphate synthase  41.67 
 
 
293 aa  170  3e-41  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1436  indole-3-glycerol-phosphate synthase  39.83 
 
 
258 aa  170  3e-41  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.567597  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13441  indole-3-glycerol-phosphate synthase  41.94 
 
 
295 aa  170  3e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.847237  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1926  indole-3-glycerol-phosphate synthase  38.72 
 
 
296 aa  169  4e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2494  indole-3-glycerol-phosphate synthase  43.03 
 
 
266 aa  169  4e-41  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.141997  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1252  indole-3-glycerol phosphate synthase  44.86 
 
 
257 aa  170  4e-41  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2048  indole-3-glycerol-phosphate synthase  42.67 
 
 
266 aa  169  5e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5212  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  44.4 
 
 
285 aa  169  5e-41  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.69886  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0519  indole-3-glycerol-phosphate synthase  39.42 
 
 
258 aa  169  7e-41  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2195  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  42.74 
 
 
273 aa  169  8e-41  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.228441  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5576  Indole-3-glycerol phosphate synthase  43.97 
 
 
288 aa  168  9e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.513944  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1141  indole-3-glycerol-phosphate synthase  42.24 
 
 
268 aa  168  1e-40  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3216  indole-3-glycerol-phosphate synthase  43.6 
 
 
260 aa  168  1e-40  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0269  indole-3-glycerol-phosphate synthase  46.12 
 
 
268 aa  168  1e-40  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000502728  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2798  indole-3-glycerol-phosphate synthase  42.8 
 
 
265 aa  167  1e-40  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.812151  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3582  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  50 
 
 
263 aa  167  2e-40  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.433048  normal  0.034535 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1174  indole-3-glycerol phosphate synthase  38.21 
 
 
262 aa  167  2e-40  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0872  indole-3-glycerol-phosphate synthase  38.02 
 
 
260 aa  167  2.9999999999999998e-40  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.169431  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1566  indole-3-glycerol-phosphate synthase  48.19 
 
 
263 aa  166  2.9999999999999998e-40  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0503  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  48.21 
 
 
276 aa  166  2.9999999999999998e-40  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1100  indole-3-glycerol-phosphate synthase  42.24 
 
 
268 aa  167  2.9999999999999998e-40  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_14581  indole-3-glycerol-phosphate synthase  38.74 
 
 
295 aa  166  4e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2358  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  43.6 
 
 
268 aa  166  4e-40  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1159  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  40.08 
 
 
266 aa  166  4e-40  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3236  indole-3-glycerol-phosphate synthase  49.74 
 
 
265 aa  166  5e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0756  indole-3-glycerol-phosphate synthase  48.19 
 
 
266 aa  166  6.9999999999999995e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2562  indole-3-glycerol-phosphate synthase  41.09 
 
 
279 aa  165  8e-40  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.00548778  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5135  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  43.04 
 
 
285 aa  165  9e-40  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0596485 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1957  indole-3-glycerol-phosphate synthase  39.76 
 
 
266 aa  165  1.0000000000000001e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4672  indole-3-glycerol-phosphate synthase  43.04 
 
 
285 aa  165  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1047  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  46.97 
 
 
273 aa  164  1.0000000000000001e-39  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5394  indole-3-glycerol-phosphate synthase  42.67 
 
 
285 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.467387  normal  0.310018 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0182  indole-3-glycerol-phosphate synthase  43.03 
 
 
264 aa  165  1.0000000000000001e-39  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4370  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  40.15 
 
 
270 aa  164  2.0000000000000002e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2567  indole-3-glycerol-phosphate synthase  42.62 
 
 
271 aa  164  2.0000000000000002e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0720427  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>