More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_11627 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009565  TBFG_11627  indole-3-glycerol-phosphate synthase  100 
 
 
282 aa  546  1e-154  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.271209 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3067  indole-3-glycerol-phosphate synthase  86.76 
 
 
272 aa  461  1e-129  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.285409  normal  0.207369 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3051  indole-3-glycerol-phosphate synthase  86.76 
 
 
272 aa  461  1e-129  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3110  indole-3-glycerol-phosphate synthase  86.76 
 
 
272 aa  461  1e-129  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.475678  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2816  indole-3-glycerol-phosphate synthase  85.66 
 
 
272 aa  458  9.999999999999999e-129  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.07226  normal  0.927217 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3600  indole-3-glycerol-phosphate synthase  84.19 
 
 
272 aa  451  1.0000000000000001e-126  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.962067  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2948  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  77.94 
 
 
272 aa  403  1e-111  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.544839  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2046  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  78.31 
 
 
272 aa  399  9.999999999999999e-111  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.941423  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3076  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  75.37 
 
 
269 aa  391  1e-108  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000445652  hitchhiker  0.0000898073 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5702  indole-3-glycerol-phosphate synthase  71.27 
 
 
271 aa  384  1e-106  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.344478  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28110  indole-3-glycerol-phosphate synthase  69.4 
 
 
269 aa  373  1e-102  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3218  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  71.27 
 
 
269 aa  365  1e-100  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0577102  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3397  indole-3-glycerol-phosphate synthase  71.16 
 
 
267 aa  364  1e-100  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2509  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  67.16 
 
 
269 aa  355  3.9999999999999996e-97  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.69466  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3172  indole-3-glycerol-phosphate synthase  70.44 
 
 
286 aa  348  8e-95  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.291676 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1931  indole-3-glycerol-phosphate synthase  66.67 
 
 
268 aa  333  1e-90  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.535725 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2939  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  66.92 
 
 
269 aa  319  3e-86  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.998614 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20750  indole-3-glycerol phosphate synthase  63.88 
 
 
270 aa  317  1e-85  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.600467  normal  0.621032 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1986  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  63.5 
 
 
270 aa  314  9.999999999999999e-85  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1215  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  61.6 
 
 
271 aa  313  1.9999999999999998e-84  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.783684  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1499  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  63.26 
 
 
275 aa  311  7.999999999999999e-84  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1450  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  61.22 
 
 
274 aa  306  3e-82  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5711  indole-3-glycerol-phosphate synthase  62.31 
 
 
274 aa  305  4.0000000000000004e-82  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3017  indole-3-glycerol-phosphate synthase  62.6 
 
 
317 aa  305  6e-82  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.145676 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2221  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  63.53 
 
 
270 aa  300  1e-80  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2966  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  61.57 
 
 
274 aa  300  2e-80  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0215924  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1073  indole-3-glycerol phosphate synthase  62.32 
 
 
287 aa  297  1e-79  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.110907  normal  0.803257 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2875  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  67.3 
 
 
268 aa  296  2e-79  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000186744  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1164  indole-3-glycerol-phosphate synthase  67.94 
 
 
268 aa  291  8e-78  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3175  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  63.5 
 
 
268 aa  285  4e-76  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.504045  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1682  indole-3-glycerol-phosphate synthase  56.92 
 
 
273 aa  266  2.9999999999999995e-70  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000484528 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10960  indole-3-glycerol phosphate synthase  58.2 
 
 
268 aa  261  6.999999999999999e-69  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.0068358  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1687  indole-3-glycerol-phosphate synthase  55.6 
 
 
272 aa  249  5e-65  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.144549  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3027  indole-3-glycerol phosphate synthase  55.38 
 
 
260 aa  245  4.9999999999999997e-64  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12880  indole-3-glycerol phosphate synthase  54.98 
 
 
273 aa  243  1.9999999999999999e-63  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.315308  normal  0.0294244 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14890  indole-3-glycerol phosphate synthase  58.63 
 
 
277 aa  210  2e-53  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.165384  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1339  indole-3-glycerol phosphate synthase  48.24 
 
 
259 aa  203  3e-51  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.419917  normal  0.796071 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1252  indole-3-glycerol-phosphate synthase  47.53 
 
 
269 aa  202  5e-51  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.157221 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1254  Indole-3-glycerol phosphate synthase  43.02 
 
 
259 aa  200  1.9999999999999998e-50  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0731  indole-3-glycerol-phosphate synthase  43.19 
 
 
263 aa  198  7e-50  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.374579  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1251  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  43.85 
 
 
270 aa  196  5.000000000000001e-49  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0174  indole-3-glycerol-phosphate synthase  44.88 
 
 
257 aa  195  6e-49  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3582  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  47.13 
 
 
263 aa  193  2e-48  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.433048  normal  0.034535 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2300  indole-3-glycerol-phosphate synthase  44.12 
 
 
273 aa  187  2e-46  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0956436  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0640  indole-3-glycerol-phosphate synthase  36.61 
 
 
258 aa  186  3e-46  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1274  indole-3-glycerol-phosphate synthase  39.92 
 
 
259 aa  183  3e-45  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2195  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  41.31 
 
 
273 aa  182  5.0000000000000004e-45  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.228441  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5212  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  41.26 
 
 
285 aa  182  7e-45  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.69886  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1926  indole-3-glycerol-phosphate synthase  39.26 
 
 
296 aa  180  2e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3801  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  38.58 
 
 
295 aa  181  2e-44  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1484  indole-3-glycerol-phosphate synthase  39.53 
 
 
259 aa  180  2.9999999999999997e-44  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3169  indole-3-glycerol phosphate synthase  37.17 
 
 
297 aa  179  2.9999999999999997e-44  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.119969 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2567  indole-3-glycerol-phosphate synthase  41.22 
 
 
271 aa  179  2.9999999999999997e-44  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0720427  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4672  indole-3-glycerol-phosphate synthase  40.52 
 
 
285 aa  179  5.999999999999999e-44  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0680  indole-3-glycerol phosphate synthase protein  38.2 
 
 
268 aa  177  1e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.694431  normal  0.104573 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1232  indole-3-glycerol-phosphate synthase  41.38 
 
 
270 aa  177  1e-43  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0182595  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5135  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  40.52 
 
 
285 aa  178  1e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0596485 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1188  indole-3-glycerol-phosphate synthase  42.75 
 
 
275 aa  177  2e-43  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0171952  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3099  indole-3-glycerol-phosphate synthase  41.79 
 
 
295 aa  177  2e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2497  indole-3-glycerol-phosphate synthase  36.68 
 
 
271 aa  176  3e-43  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0317819  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3489  indole-3-glycerol-phosphate synthase  39.85 
 
 
293 aa  176  3e-43  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5576  Indole-3-glycerol phosphate synthase  41.86 
 
 
288 aa  176  3e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.513944  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2858  indole-3-glycerol-phosphate synthase  44.7 
 
 
269 aa  176  3e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0100  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  37.59 
 
 
294 aa  176  4e-43  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2627  indole-3-glycerol-phosphate synthase  39.85 
 
 
293 aa  176  5e-43  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.236975  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2024  indole-3-glycerol-phosphate synthase  42.97 
 
 
262 aa  176  5e-43  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2990  indole-3-glycerol-phosphate synthase  40.3 
 
 
272 aa  176  5e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.508852  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0490  indole-3-glycerol-phosphate synthase  46.12 
 
 
259 aa  175  7e-43  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1159  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  40.47 
 
 
266 aa  174  9.999999999999999e-43  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0872  indole-3-glycerol-phosphate synthase  42.79 
 
 
260 aa  174  1.9999999999999998e-42  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.169431  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2358  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  38.76 
 
 
268 aa  174  1.9999999999999998e-42  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2798  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  40.31 
 
 
265 aa  174  1.9999999999999998e-42  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.822714  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06390  indole-3-glycerol phosphate synthase  36.44 
 
 
260 aa  174  1.9999999999999998e-42  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1252  indole-3-glycerol phosphate synthase  45.63 
 
 
257 aa  173  2.9999999999999996e-42  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1306  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  36.61 
 
 
262 aa  173  2.9999999999999996e-42  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2798  indole-3-glycerol-phosphate synthase  42.97 
 
 
265 aa  173  2.9999999999999996e-42  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.812151  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1733  indole-3-glycerol-phosphate synthase  41.2 
 
 
281 aa  173  2.9999999999999996e-42  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.582058  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1639  indole-3-glycerol phosphate synthase  40 
 
 
271 aa  173  2.9999999999999996e-42  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.189756  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0519  indole-3-glycerol-phosphate synthase  37.35 
 
 
258 aa  172  3.9999999999999995e-42  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0606  indole-3-glycerol-phosphate synthase  37.35 
 
 
258 aa  172  5e-42  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.64209  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1436  indole-3-glycerol-phosphate synthase  37.35 
 
 
258 aa  172  5e-42  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.567597  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3845  indole-3-glycerol-phosphate synthase  41.15 
 
 
271 aa  171  1e-41  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1047  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  39.76 
 
 
273 aa  171  1e-41  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1100  indole-3-glycerol-phosphate synthase  39 
 
 
268 aa  171  2e-41  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1141  indole-3-glycerol-phosphate synthase  39 
 
 
268 aa  170  2e-41  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2274  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  38.46 
 
 
288 aa  170  3e-41  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.066309 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0159  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  41.94 
 
 
287 aa  170  3e-41  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.422132  normal  0.0132448 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1877  indole-3-glycerol phosphate synthase  40.46 
 
 
266 aa  169  4e-41  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.597244  normal  0.150585 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0650  indole-3-glycerol-phosphate synthase  44.81 
 
 
256 aa  169  5e-41  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3216  indole-3-glycerol-phosphate synthase  38.78 
 
 
260 aa  169  6e-41  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0531  indole-3-glycerol-phosphate synthase  41.11 
 
 
258 aa  169  7e-41  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.44411  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13441  indole-3-glycerol-phosphate synthase  39.18 
 
 
295 aa  168  8e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.847237  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1670  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  42.08 
 
 
267 aa  168  9e-41  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00153325  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46110  indole-3-glycerol-phosphate synthase  40.38 
 
 
266 aa  167  1e-40  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1800  indole-3-glycerol-phosphate synthase  43.37 
 
 
271 aa  167  1e-40  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00000789952  normal  0.147475 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1174  indole-3-glycerol phosphate synthase  37.07 
 
 
262 aa  168  1e-40  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0711  indole-3-glycerol-phosphate synthase  41.2 
 
 
267 aa  167  1e-40  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2048  indole-3-glycerol-phosphate synthase  38.22 
 
 
266 aa  167  2e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1650  indole-3-glycerol-phosphate synthase  43.55 
 
 
262 aa  167  2e-40  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1952  indole-3-glycerol-phosphate synthase  36.43 
 
 
261 aa  167  2e-40  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.0048932  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>