More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_2274 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011729  PCC7424_2274  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  100 
 
 
288 aa  579  1e-164  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.066309 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3489  indole-3-glycerol-phosphate synthase  62.36 
 
 
293 aa  328  7e-89  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2627  indole-3-glycerol-phosphate synthase  62.36 
 
 
293 aa  328  8e-89  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.236975  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3801  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  58.56 
 
 
295 aa  313  1.9999999999999998e-84  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3169  indole-3-glycerol phosphate synthase  57.04 
 
 
297 aa  309  2.9999999999999997e-83  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.119969 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1926  indole-3-glycerol-phosphate synthase  59.77 
 
 
296 aa  308  8e-83  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4892  indole-3-glycerol-phosphate synthase  57.79 
 
 
280 aa  306  4.0000000000000004e-82  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0121047 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0100  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  57.95 
 
 
294 aa  299  4e-80  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5042  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  60.77 
 
 
302 aa  293  2e-78  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1529  indole-3-glycerol-phosphate synthase  52.63 
 
 
294 aa  276  2e-73  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.260745  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0870  indole-3-glycerol-phosphate synthase  52.87 
 
 
295 aa  276  2e-73  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.474663  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13441  indole-3-glycerol-phosphate synthase  54.02 
 
 
295 aa  271  7e-72  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.847237  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3804  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  50 
 
 
291 aa  269  2.9999999999999997e-71  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.743841  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1197  indole-3-glycerol-phosphate synthase  52.65 
 
 
295 aa  263  2e-69  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.075446  normal 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_32358  predicted protein  50.55 
 
 
355 aa  256  2e-67  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.125229  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_19771  indole-3-glycerol-phosphate synthase  51.29 
 
 
301 aa  253  2.0000000000000002e-66  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0661236 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14961  indole-3-glycerol-phosphate synthase  47.41 
 
 
295 aa  236  2e-61  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.147831  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_14821  indole-3-glycerol-phosphate synthase  46.67 
 
 
295 aa  231  1e-59  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.857167  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1393  indole-3-glycerol-phosphate synthase  46.67 
 
 
295 aa  230  2e-59  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0863  indole-3-glycerol-phosphate synthase  50.57 
 
 
295 aa  228  8e-59  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.233057  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17161  indole-3-glycerol-phosphate synthase  50.57 
 
 
295 aa  228  9e-59  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2195  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  47.17 
 
 
273 aa  223  3e-57  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.228441  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_14581  indole-3-glycerol-phosphate synthase  44.03 
 
 
295 aa  218  7e-56  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2494  indole-3-glycerol-phosphate synthase  44.94 
 
 
266 aa  212  4.9999999999999996e-54  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.141997  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0711  indole-3-glycerol-phosphate synthase  44.79 
 
 
267 aa  212  4.9999999999999996e-54  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2484  indole-3-glycerol-phosphate synthase  44.4 
 
 
266 aa  210  2e-53  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0174  indole-3-glycerol-phosphate synthase  48.3 
 
 
257 aa  209  3e-53  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1141  indole-3-glycerol-phosphate synthase  44.15 
 
 
268 aa  206  3e-52  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1100  indole-3-glycerol-phosphate synthase  44.15 
 
 
268 aa  206  5e-52  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5394  indole-3-glycerol-phosphate synthase  40.43 
 
 
285 aa  205  9e-52  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.467387  normal  0.310018 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1339  indole-3-glycerol phosphate synthase  43.31 
 
 
259 aa  204  2e-51  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.419917  normal  0.796071 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2259  indole-3-glycerol-phosphate synthase  43.61 
 
 
266 aa  203  2e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2778  indole-3-glycerol-phosphate synthase  43.73 
 
 
262 aa  203  2e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.000331448  hitchhiker  0.0000255859 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1734  indole-3-glycerol-phosphate synthase  44.19 
 
 
268 aa  204  2e-51  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2247  indole-3-glycerol phosphate synthase  42.16 
 
 
267 aa  203  2e-51  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.835264  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0872  indole-3-glycerol-phosphate synthase  47.15 
 
 
260 aa  204  2e-51  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.169431  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2380  indole-3-glycerol-phosphate synthase  44.94 
 
 
266 aa  203  3e-51  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.446118  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2843  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  43.56 
 
 
263 aa  203  3e-51  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00184612  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3242  indole-3-glycerol phosphate synthase  43.56 
 
 
263 aa  203  3e-51  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.857016  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1957  indole-3-glycerol-phosphate synthase  42.54 
 
 
266 aa  200  1.9999999999999998e-50  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2024  indole-3-glycerol-phosphate synthase  42.91 
 
 
262 aa  201  1.9999999999999998e-50  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1877  indole-3-glycerol phosphate synthase  43.28 
 
 
266 aa  199  3.9999999999999996e-50  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.597244  normal  0.150585 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1274  indole-3-glycerol-phosphate synthase  45.08 
 
 
259 aa  198  1.0000000000000001e-49  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5212  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  41.45 
 
 
285 aa  197  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.69886  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2798  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  43.02 
 
 
265 aa  197  2.0000000000000003e-49  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.822714  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1254  Indole-3-glycerol phosphate synthase  46.79 
 
 
259 aa  197  2.0000000000000003e-49  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3099  indole-3-glycerol-phosphate synthase  39.5 
 
 
295 aa  196  4.0000000000000005e-49  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3219  indole-3-glycerol-phosphate synthase  44.66 
 
 
264 aa  196  4.0000000000000005e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0365471 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1232  indole-3-glycerol-phosphate synthase  42.97 
 
 
270 aa  196  4.0000000000000005e-49  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0182595  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5576  Indole-3-glycerol phosphate synthase  41.06 
 
 
288 aa  196  5.000000000000001e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.513944  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2798  indole-3-glycerol-phosphate synthase  43.24 
 
 
265 aa  196  5.000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.812151  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3520  indole-3-glycerol-phosphate synthase  39.64 
 
 
270 aa  195  6e-49  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2048  indole-3-glycerol-phosphate synthase  42.26 
 
 
266 aa  195  7e-49  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2465  indole-3-glycerol phosphate synthase  42.64 
 
 
271 aa  195  8.000000000000001e-49  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1484  indole-3-glycerol-phosphate synthase  44.91 
 
 
259 aa  194  1e-48  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2319  indole-3-glycerol phosphate synthase  41.35 
 
 
270 aa  194  1e-48  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.043656  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46110  indole-3-glycerol-phosphate synthase  42.52 
 
 
266 aa  193  2e-48  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1416  indole-3-glycerol-phosphate synthase  41.44 
 
 
278 aa  193  2e-48  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1188  indole-3-glycerol-phosphate synthase  43.35 
 
 
275 aa  194  2e-48  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0171952  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2048  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  41.79 
 
 
269 aa  194  2e-48  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0288886  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5135  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  39.79 
 
 
285 aa  193  3e-48  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0596485 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4672  indole-3-glycerol-phosphate synthase  39.78 
 
 
285 aa  192  4e-48  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2497  indole-3-glycerol-phosphate synthase  42.48 
 
 
271 aa  192  4e-48  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0317819  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0594  indole-3-glycerol phosphate synthase  40 
 
 
278 aa  192  6e-48  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3236  indole-3-glycerol-phosphate synthase  42.86 
 
 
265 aa  191  8e-48  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0792  indole-3-glycerol-phosphate synthase  39.93 
 
 
278 aa  191  1e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2858  indole-3-glycerol-phosphate synthase  43.87 
 
 
269 aa  191  1e-47  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0160  indole-3-glycerol-phosphate synthase  41.2 
 
 
264 aa  190  2e-47  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.286588  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08360  indole-3-glycerol-phosphate synthase  39.93 
 
 
278 aa  190  2e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000387982 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0731  indole-3-glycerol-phosphate synthase  40.68 
 
 
263 aa  190  2.9999999999999997e-47  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.374579  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4781  indole-3-glycerol-phosphate synthase  41.57 
 
 
277 aa  190  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.574175 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3649  indole-3-glycerol-phosphate synthase  41.73 
 
 
263 aa  189  5e-47  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0909  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  43.91 
 
 
271 aa  189  5.999999999999999e-47  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000352387  hitchhiker  0.00000000301828 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0756  indole-3-glycerol-phosphate synthase  42.26 
 
 
266 aa  189  5.999999999999999e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1252  indole-3-glycerol-phosphate synthase  42.91 
 
 
269 aa  189  5.999999999999999e-47  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.157221 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3944  indole-3-glycerol-phosphate synthase  42.35 
 
 
279 aa  189  5.999999999999999e-47  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0182  indole-3-glycerol-phosphate synthase  40.82 
 
 
264 aa  188  7e-47  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1733  indole-3-glycerol-phosphate synthase  42.21 
 
 
281 aa  188  9e-47  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.582058  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1063  indole-3-glycerol-phosphate synthase  41.67 
 
 
271 aa  187  1e-46  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.493253  normal  0.0834035 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0251  indole-3-glycerol-phosphate synthase  46.03 
 
 
265 aa  187  1e-46  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2587  indole-3-glycerol phosphate synthase  41.04 
 
 
265 aa  187  2e-46  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.804047  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5113  indole-3-glycerol-phosphate synthase  40.07 
 
 
278 aa  187  2e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2300  indole-3-glycerol-phosphate synthase  41.91 
 
 
273 aa  187  2e-46  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0956436  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1952  indole-3-glycerol-phosphate synthase  39.54 
 
 
261 aa  186  3e-46  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.0048932  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2990  indole-3-glycerol-phosphate synthase  40.29 
 
 
272 aa  186  4e-46  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.508852  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1409  indole-3-glycerol-phosphate synthase  43.77 
 
 
271 aa  186  4e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.827257  normal  0.309445 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0455  indole-3-glycerol-phosphate synthase  41.18 
 
 
277 aa  186  5e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.811875  normal  0.264325 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0503  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  41.44 
 
 
276 aa  185  6e-46  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2175  bifunctional indole-3-glycerol phosphate synthase/phosphoribosylanthranilate isomerase  43.13 
 
 
461 aa  185  7e-46  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.750011  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4483  indole-3-glycerol-phosphate synthase  41.54 
 
 
272 aa  185  8e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.249423  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1800  indole-3-glycerol-phosphate synthase  43.8 
 
 
271 aa  184  1.0000000000000001e-45  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00000789952  normal  0.147475 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0422  indole-3-glycerol-phosphate synthase  40.78 
 
 
277 aa  183  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.909241 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4579  indole-3-glycerol-phosphate synthase  40.39 
 
 
278 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0514187  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3718  indole-3-glycerol-phosphate synthase  40.07 
 
 
264 aa  183  2.0000000000000003e-45  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0881817  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3601  indole-3-glycerol-phosphate synthase  41.89 
 
 
264 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.147374  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2141  indole-3-glycerol-phosphate synthase  42.05 
 
 
258 aa  183  2.0000000000000003e-45  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4451  indole-3-glycerol-phosphate synthase  41.13 
 
 
264 aa  184  2.0000000000000003e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0983396  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1322  indole-3-glycerol-phosphate synthase  42.97 
 
 
260 aa  184  2.0000000000000003e-45  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1935  bifunctional indole-3-glycerol phosphate synthase/phosphoribosylanthranilate isomerase  43.13 
 
 
461 aa  183  2.0000000000000003e-45  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2139  indole-3-glycerol-phosphate synthase  41.98 
 
 
263 aa  183  2.0000000000000003e-45  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.248459  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>