More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daud_1188 on replicon NC_010424
Organism: Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010424  Daud_1188  indole-3-glycerol-phosphate synthase  100 
 
 
275 aa  545  1e-154  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0171952  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1232  indole-3-glycerol-phosphate synthase  50.19 
 
 
270 aa  236  2e-61  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0182595  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1339  indole-3-glycerol phosphate synthase  52.55 
 
 
259 aa  230  2e-59  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.419917  normal  0.796071 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1159  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  49.41 
 
 
266 aa  230  2e-59  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2858  indole-3-glycerol-phosphate synthase  51.52 
 
 
269 aa  222  4.9999999999999996e-57  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2798  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  49.03 
 
 
265 aa  221  9.999999999999999e-57  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.822714  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2195  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  47.06 
 
 
273 aa  219  3e-56  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.228441  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0872  indole-3-glycerol-phosphate synthase  44.53 
 
 
260 aa  219  3.9999999999999997e-56  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.169431  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2130  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  41.02 
 
 
259 aa  216  2.9999999999999998e-55  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2990  indole-3-glycerol-phosphate synthase  47.35 
 
 
272 aa  216  2.9999999999999998e-55  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.508852  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1484  indole-3-glycerol-phosphate synthase  48.65 
 
 
259 aa  213  1.9999999999999998e-54  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1252  indole-3-glycerol-phosphate synthase  50.38 
 
 
269 aa  213  1.9999999999999998e-54  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.157221 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3649  indole-3-glycerol-phosphate synthase  49.23 
 
 
263 aa  213  1.9999999999999998e-54  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14961  indole-3-glycerol-phosphate synthase  43.61 
 
 
295 aa  213  2.9999999999999995e-54  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.147831  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0711  indole-3-glycerol-phosphate synthase  48.26 
 
 
267 aa  213  2.9999999999999995e-54  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1274  indole-3-glycerol-phosphate synthase  48.26 
 
 
259 aa  212  4.9999999999999996e-54  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2380  indole-3-glycerol-phosphate synthase  48.08 
 
 
266 aa  211  7e-54  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.446118  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0909  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  52.04 
 
 
271 aa  211  1e-53  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000352387  hitchhiker  0.00000000301828 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_14821  indole-3-glycerol-phosphate synthase  43.98 
 
 
295 aa  211  2e-53  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.857167  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1734  indole-3-glycerol-phosphate synthase  47.13 
 
 
268 aa  210  2e-53  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2300  indole-3-glycerol-phosphate synthase  47.74 
 
 
273 aa  209  3e-53  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0956436  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2494  indole-3-glycerol-phosphate synthase  46.15 
 
 
266 aa  209  4e-53  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.141997  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3601  indole-3-glycerol-phosphate synthase  47.91 
 
 
264 aa  209  5e-53  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.147374  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3718  indole-3-glycerol-phosphate synthase  46.15 
 
 
264 aa  207  1e-52  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0881817  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2484  indole-3-glycerol-phosphate synthase  47.49 
 
 
266 aa  207  1e-52  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0478  indole-3-glycerol-phosphate synthase  48.65 
 
 
259 aa  207  2e-52  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3801  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  45.63 
 
 
295 aa  206  2e-52  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1529  indole-3-glycerol-phosphate synthase  46.21 
 
 
294 aa  207  2e-52  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.260745  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1393  indole-3-glycerol-phosphate synthase  43.23 
 
 
295 aa  206  2e-52  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0579  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  49 
 
 
266 aa  206  2e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2358  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  48.59 
 
 
268 aa  207  2e-52  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3099  indole-3-glycerol-phosphate synthase  45.62 
 
 
295 aa  206  3e-52  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0251  indole-3-glycerol-phosphate synthase  49.55 
 
 
265 aa  206  3e-52  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1639  indole-3-glycerol phosphate synthase  45.45 
 
 
271 aa  206  3e-52  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.189756  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2778  indole-3-glycerol-phosphate synthase  48.65 
 
 
262 aa  205  7e-52  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.000331448  hitchhiker  0.0000255859 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1322  indole-3-glycerol-phosphate synthase  45.17 
 
 
260 aa  205  7e-52  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2079  indole-3-glycerol-phosphate synthase  47.31 
 
 
272 aa  204  9e-52  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1254  Indole-3-glycerol phosphate synthase  52.83 
 
 
259 aa  204  1e-51  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4451  indole-3-glycerol-phosphate synthase  47.69 
 
 
264 aa  204  1e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0983396  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2048  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  46.42 
 
 
269 aa  204  1e-51  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0288886  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13441  indole-3-glycerol-phosphate synthase  45.66 
 
 
295 aa  204  2e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.847237  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1866  indole-3-glycerol-phosphate synthase  46.8 
 
 
260 aa  203  3e-51  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1566  indole-3-glycerol-phosphate synthase  43.46 
 
 
263 aa  202  3e-51  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1306  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  43.92 
 
 
262 aa  203  3e-51  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3845  indole-3-glycerol-phosphate synthase  40.25 
 
 
271 aa  203  3e-51  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0895  indole-3-glycerol-phosphate synthase  41.96 
 
 
258 aa  202  4e-51  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0870  indole-3-glycerol-phosphate synthase  45.83 
 
 
295 aa  202  4e-51  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.474663  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0586  indole-3-glycerol-phosphate synthase  46.01 
 
 
266 aa  202  4e-51  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.338589  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0733  indole-3-glycerol-phosphate synthase  49.62 
 
 
266 aa  202  6e-51  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2856  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  49.41 
 
 
264 aa  202  7e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.659803  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4892  indole-3-glycerol-phosphate synthase  44.74 
 
 
280 aa  201  9.999999999999999e-51  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0121047 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2141  indole-3-glycerol-phosphate synthase  46.69 
 
 
258 aa  200  1.9999999999999998e-50  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1416  indole-3-glycerol-phosphate synthase  45.35 
 
 
278 aa  200  1.9999999999999998e-50  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0864  indole-3-glycerol-phosphate synthase  41.57 
 
 
258 aa  200  3e-50  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1323  indole-3-glycerol-phosphate synthase  45 
 
 
261 aa  200  3e-50  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1926  indole-3-glycerol-phosphate synthase  43.18 
 
 
296 aa  199  3.9999999999999996e-50  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2562  indole-3-glycerol-phosphate synthase  44.53 
 
 
279 aa  199  3.9999999999999996e-50  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.00548778  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2247  indole-3-glycerol phosphate synthase  47.13 
 
 
267 aa  199  3.9999999999999996e-50  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.835264  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2627  indole-3-glycerol-phosphate synthase  44.15 
 
 
293 aa  199  5e-50  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.236975  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2567  indole-3-glycerol-phosphate synthase  44.19 
 
 
271 aa  199  5e-50  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0720427  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1957  indole-3-glycerol-phosphate synthase  42.69 
 
 
266 aa  198  6e-50  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1773  indole-3-glycerol-phosphate synthase  44.96 
 
 
265 aa  199  6e-50  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.908281  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2259  indole-3-glycerol-phosphate synthase  43.85 
 
 
266 aa  198  7.999999999999999e-50  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3489  indole-3-glycerol-phosphate synthase  44.15 
 
 
293 aa  198  1.0000000000000001e-49  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0269  indole-3-glycerol-phosphate synthase  42.15 
 
 
268 aa  197  1.0000000000000001e-49  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000502728  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0535  indole-3-glycerol-phosphate synthase  44.49 
 
 
258 aa  197  1.0000000000000001e-49  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0182  indole-3-glycerol-phosphate synthase  46.54 
 
 
264 aa  197  2.0000000000000003e-49  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3242  indole-3-glycerol phosphate synthase  47.58 
 
 
263 aa  197  2.0000000000000003e-49  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.857016  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_32358  predicted protein  44.65 
 
 
355 aa  197  2.0000000000000003e-49  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.125229  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0174  indole-3-glycerol-phosphate synthase  42.64 
 
 
257 aa  197  2.0000000000000003e-49  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0754  indole-3-glycerol phosphate synthase  44.96 
 
 
265 aa  197  2.0000000000000003e-49  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.297551 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2843  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  47.58 
 
 
263 aa  197  2.0000000000000003e-49  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00184612  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1063  indole-3-glycerol-phosphate synthase  44.32 
 
 
271 aa  197  2.0000000000000003e-49  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.493253  normal  0.0834035 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0160  indole-3-glycerol-phosphate synthase  46.54 
 
 
264 aa  197  2.0000000000000003e-49  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.286588  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3216  indole-3-glycerol-phosphate synthase  40 
 
 
260 aa  197  2.0000000000000003e-49  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1648  indole-3-glycerol-phosphate synthase  43.13 
 
 
281 aa  196  3e-49  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.386424 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3876  indole-3-glycerol-phosphate synthase  46.59 
 
 
262 aa  196  3e-49  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1141  indole-3-glycerol-phosphate synthase  42.8 
 
 
268 aa  196  4.0000000000000005e-49  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0756  indole-3-glycerol-phosphate synthase  43.68 
 
 
266 aa  196  5.000000000000001e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0731  indole-3-glycerol-phosphate synthase  45.35 
 
 
263 aa  195  5.000000000000001e-49  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.374579  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0159  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  47.79 
 
 
287 aa  195  6e-49  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.422132  normal  0.0132448 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1650  indole-3-glycerol-phosphate synthase  43.32 
 
 
262 aa  195  7e-49  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_14581  indole-3-glycerol-phosphate synthase  41.73 
 
 
295 aa  194  9e-49  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2048  indole-3-glycerol-phosphate synthase  43.41 
 
 
266 aa  194  1e-48  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2274  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  43.35 
 
 
288 aa  194  1e-48  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.066309 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0100  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  41.83 
 
 
294 aa  194  1e-48  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1100  indole-3-glycerol-phosphate synthase  42.59 
 
 
268 aa  194  1e-48  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0640  indole-3-glycerol-phosphate synthase  37.89 
 
 
258 aa  194  1e-48  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0370  indole-3-glycerol-phosphate synthase  46.64 
 
 
266 aa  193  2e-48  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1436  indole-3-glycerol-phosphate synthase  42.74 
 
 
258 aa  194  2e-48  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.567597  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_19771  indole-3-glycerol-phosphate synthase  46.3 
 
 
301 aa  194  2e-48  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0661236 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0606  indole-3-glycerol-phosphate synthase  42.74 
 
 
258 aa  193  3e-48  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.64209  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0361  indole-3-glycerol-phosphate synthase  46.64 
 
 
266 aa  193  3e-48  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.331099  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04004  indole-3-glycerol-phosphate synthase  44.62 
 
 
265 aa  192  4e-48  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0519  indole-3-glycerol-phosphate synthase  42.34 
 
 
258 aa  192  4e-48  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1251  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  47.81 
 
 
270 aa  192  5e-48  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28110  indole-3-glycerol-phosphate synthase  46.34 
 
 
269 aa  192  6e-48  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3169  indole-3-glycerol phosphate synthase  42.11 
 
 
297 aa  192  6e-48  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.119969 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4672  indole-3-glycerol-phosphate synthase  44.57 
 
 
285 aa  192  7e-48  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0503  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  44.4 
 
 
276 aa  191  8e-48  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>