More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtox_0909 on replicon NC_013216
Organism: Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013216  Dtox_0909  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  100 
 
 
271 aa  540  1e-153  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000352387  hitchhiker  0.00000000301828 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2195  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  46.21 
 
 
273 aa  229  3e-59  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.228441  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1339  indole-3-glycerol phosphate synthase  48.48 
 
 
259 aa  219  3e-56  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.419917  normal  0.796071 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0872  indole-3-glycerol-phosphate synthase  44.53 
 
 
260 aa  217  2e-55  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.169431  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1232  indole-3-glycerol-phosphate synthase  45.32 
 
 
270 aa  216  2.9999999999999998e-55  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0182595  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1188  indole-3-glycerol-phosphate synthase  51.34 
 
 
275 aa  213  1.9999999999999998e-54  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0171952  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1734  indole-3-glycerol-phosphate synthase  46.15 
 
 
268 aa  212  4.9999999999999996e-54  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3216  indole-3-glycerol-phosphate synthase  48.72 
 
 
260 aa  212  4.9999999999999996e-54  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2380  indole-3-glycerol-phosphate synthase  44.32 
 
 
266 aa  210  2e-53  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.446118  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2494  indole-3-glycerol-phosphate synthase  43.45 
 
 
266 aa  209  4e-53  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.141997  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1254  Indole-3-glycerol phosphate synthase  44.53 
 
 
259 aa  204  9e-52  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3649  indole-3-glycerol-phosphate synthase  44.66 
 
 
263 aa  204  9e-52  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1251  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  42.38 
 
 
270 aa  203  3e-51  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1159  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  42.75 
 
 
266 aa  203  3e-51  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0711  indole-3-glycerol-phosphate synthase  43.82 
 
 
267 aa  202  5e-51  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2222  indole-3-glycerol phosphate synthase  49.54 
 
 
262 aa  201  9e-51  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.688049 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3801  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  44.69 
 
 
295 aa  201  9.999999999999999e-51  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4451  indole-3-glycerol-phosphate synthase  46.98 
 
 
264 aa  201  9.999999999999999e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0983396  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2247  indole-3-glycerol phosphate synthase  42.26 
 
 
267 aa  201  9.999999999999999e-51  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.835264  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0251  indole-3-glycerol-phosphate synthase  45.25 
 
 
265 aa  200  1.9999999999999998e-50  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0490  indole-3-glycerol-phosphate synthase  44.22 
 
 
259 aa  201  1.9999999999999998e-50  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1866  indole-3-glycerol-phosphate synthase  46.8 
 
 
260 aa  199  3e-50  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0174  indole-3-glycerol-phosphate synthase  42.08 
 
 
257 aa  198  9e-50  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3601  indole-3-glycerol-phosphate synthase  41.79 
 
 
264 aa  198  1.0000000000000001e-49  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.147374  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1957  indole-3-glycerol-phosphate synthase  43.07 
 
 
266 aa  197  1.0000000000000001e-49  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1484  indole-3-glycerol-phosphate synthase  43.61 
 
 
259 aa  197  2.0000000000000003e-49  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0370  indole-3-glycerol-phosphate synthase  40.81 
 
 
266 aa  197  2.0000000000000003e-49  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2259  indole-3-glycerol-phosphate synthase  43.8 
 
 
266 aa  197  2.0000000000000003e-49  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3460  indole-3-glycerol phosphate synthase  42.7 
 
 
267 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.860463  normal  0.18397 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2274  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  44.28 
 
 
288 aa  196  3e-49  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.066309 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0895  indole-3-glycerol-phosphate synthase  41.73 
 
 
258 aa  196  3e-49  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2079  indole-3-glycerol-phosphate synthase  42.54 
 
 
272 aa  196  3e-49  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1274  indole-3-glycerol-phosphate synthase  43.23 
 
 
259 aa  196  4.0000000000000005e-49  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2843  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  43.23 
 
 
263 aa  195  6e-49  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00184612  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3242  indole-3-glycerol phosphate synthase  43.23 
 
 
263 aa  195  6e-49  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.857016  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0269  indole-3-glycerol-phosphate synthase  39.85 
 
 
268 aa  195  6e-49  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000502728  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2484  indole-3-glycerol-phosphate synthase  41.35 
 
 
266 aa  195  6e-49  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0361  indole-3-glycerol-phosphate synthase  40.44 
 
 
266 aa  195  7e-49  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.331099  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2048  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  40.66 
 
 
269 aa  195  8.000000000000001e-49  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0288886  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0182  indole-3-glycerol-phosphate synthase  42.75 
 
 
264 aa  194  1e-48  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2990  indole-3-glycerol-phosphate synthase  42.91 
 
 
272 aa  194  1e-48  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.508852  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0160  indole-3-glycerol-phosphate synthase  42.75 
 
 
264 aa  194  1e-48  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.286588  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04004  indole-3-glycerol-phosphate synthase  48.34 
 
 
265 aa  194  1e-48  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2798  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  47.64 
 
 
265 aa  193  2e-48  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.822714  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0864  indole-3-glycerol-phosphate synthase  41.35 
 
 
258 aa  193  2e-48  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0100  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  42.07 
 
 
294 aa  194  2e-48  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2358  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  43.27 
 
 
268 aa  193  2e-48  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0535  indole-3-glycerol-phosphate synthase  42.8 
 
 
258 aa  194  2e-48  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2048  indole-3-glycerol-phosphate synthase  40.38 
 
 
266 aa  192  4e-48  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46110  indole-3-glycerol-phosphate synthase  44.53 
 
 
266 aa  192  4e-48  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0159  indole-3-glycerol-phosphate synthase  40.15 
 
 
267 aa  192  5e-48  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.927898  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1047  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  46.26 
 
 
273 aa  192  7e-48  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0586  indole-3-glycerol-phosphate synthase  40.81 
 
 
266 aa  192  7e-48  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.338589  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3520  indole-3-glycerol-phosphate synthase  38.95 
 
 
270 aa  191  7e-48  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0770  indole-3-glycerol-phosphate synthase  39.19 
 
 
267 aa  191  1e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.383206  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1174  indole-3-glycerol phosphate synthase  46.01 
 
 
262 aa  191  1e-47  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0503  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  41.2 
 
 
276 aa  190  2e-47  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13441  indole-3-glycerol-phosphate synthase  41.61 
 
 
295 aa  190  2e-47  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.847237  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1825  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  40.71 
 
 
266 aa  190  2e-47  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1209  indole-3-glycerol-phosphate synthase  43.22 
 
 
267 aa  190  2e-47  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.148422  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1773  indole-3-glycerol-phosphate synthase  41.57 
 
 
265 aa  190  2e-47  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.908281  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1639  indole-3-glycerol phosphate synthase  42.22 
 
 
271 aa  190  2.9999999999999997e-47  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.189756  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1322  indole-3-glycerol-phosphate synthase  45.85 
 
 
260 aa  190  2.9999999999999997e-47  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3718  indole-3-glycerol-phosphate synthase  41.73 
 
 
264 aa  189  4e-47  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0881817  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2130  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  41.83 
 
 
259 aa  189  4e-47  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2856  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  42.48 
 
 
264 aa  189  5e-47  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.659803  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5394  indole-3-glycerol-phosphate synthase  42.59 
 
 
285 aa  188  5.999999999999999e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.467387  normal  0.310018 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0478  indole-3-glycerol-phosphate synthase  46.46 
 
 
259 aa  188  7e-47  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0579  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  41.29 
 
 
266 aa  188  9e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1650  indole-3-glycerol-phosphate synthase  45.54 
 
 
262 aa  187  1e-46  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0754  indole-3-glycerol phosphate synthase  41.42 
 
 
265 aa  187  1e-46  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.297551 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2465  indole-3-glycerol phosphate synthase  38.75 
 
 
271 aa  187  2e-46  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2319  indole-3-glycerol phosphate synthase  41.42 
 
 
270 aa  187  2e-46  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.043656  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0145  indole-3-glycerol-phosphate synthase  40.67 
 
 
267 aa  187  2e-46  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.694484  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3489  indole-3-glycerol-phosphate synthase  40.88 
 
 
293 aa  186  3e-46  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3845  indole-3-glycerol-phosphate synthase  38.15 
 
 
271 aa  186  3e-46  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2627  indole-3-glycerol-phosphate synthase  40.88 
 
 
293 aa  186  3e-46  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.236975  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2497  indole-3-glycerol-phosphate synthase  39.1 
 
 
271 aa  186  3e-46  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0317819  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1436  indole-3-glycerol-phosphate synthase  47.06 
 
 
258 aa  186  4e-46  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.567597  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1063  indole-3-glycerol-phosphate synthase  40.07 
 
 
271 aa  186  5e-46  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.493253  normal  0.0834035 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0519  indole-3-glycerol-phosphate synthase  46.67 
 
 
258 aa  185  6e-46  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0606  indole-3-glycerol-phosphate synthase  46.67 
 
 
258 aa  185  7e-46  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.64209  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1566  indole-3-glycerol-phosphate synthase  40.46 
 
 
263 aa  185  7e-46  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0756  indole-3-glycerol-phosphate synthase  38.81 
 
 
266 aa  185  9e-46  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2587  indole-3-glycerol phosphate synthase  39.34 
 
 
265 aa  183  2.0000000000000003e-45  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.804047  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3099  indole-3-glycerol-phosphate synthase  40.3 
 
 
295 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1141  indole-3-glycerol-phosphate synthase  37.6 
 
 
268 aa  183  3e-45  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1030  indole-3-glycerol-phosphate synthase  43.38 
 
 
266 aa  183  3e-45  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2141  indole-3-glycerol-phosphate synthase  45.89 
 
 
258 aa  183  3e-45  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3127  indole-3-glycerol-phosphate synthase  44.44 
 
 
267 aa  182  4.0000000000000006e-45  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.663286  normal  0.570682 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1416  indole-3-glycerol-phosphate synthase  38.87 
 
 
278 aa  182  4.0000000000000006e-45  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1393  indole-3-glycerol-phosphate synthase  38.1 
 
 
295 aa  182  5.0000000000000004e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1100  indole-3-glycerol-phosphate synthase  37.6 
 
 
268 aa  182  6e-45  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1529  indole-3-glycerol-phosphate synthase  39.71 
 
 
294 aa  182  7e-45  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.260745  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1926  indole-3-glycerol-phosphate synthase  41.64 
 
 
296 aa  181  9.000000000000001e-45  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_14821  indole-3-glycerol-phosphate synthase  38.46 
 
 
295 aa  181  1e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.857167  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5212  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  39.31 
 
 
285 aa  181  1e-44  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.69886  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1252  indole-3-glycerol-phosphate synthase  42.28 
 
 
269 aa  181  1e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.157221 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3293  indole-3-glycerolphosphate synthase  39.39 
 
 
261 aa  181  1e-44  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0358334 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5576  Indole-3-glycerol phosphate synthase  39.31 
 
 
288 aa  181  1e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.513944  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>