More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CJE0606 on replicon NC_003912
Organism: Campylobacter jejuni RM1221



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008787  CJJ81176_0519  indole-3-glycerol-phosphate synthase  99.22 
 
 
258 aa  507  1e-143  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0606  indole-3-glycerol-phosphate synthase  100 
 
 
258 aa  510  1e-143  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.64209  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1436  indole-3-glycerol-phosphate synthase  98.84 
 
 
258 aa  504  9.999999999999999e-143  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.567597  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1952  indole-3-glycerol-phosphate synthase  68.75 
 
 
261 aa  352  2.9999999999999997e-96  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.0048932  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1306  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  68.22 
 
 
262 aa  343  2e-93  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1323  indole-3-glycerol-phosphate synthase  66.28 
 
 
261 aa  321  9.000000000000001e-87  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0731  indole-3-glycerol-phosphate synthase  62.79 
 
 
263 aa  318  5e-86  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.374579  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0640  indole-3-glycerol-phosphate synthase  59.22 
 
 
258 aa  288  7e-77  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1322  indole-3-glycerol-phosphate synthase  50 
 
 
260 aa  231  9e-60  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1254  Indole-3-glycerol phosphate synthase  47.51 
 
 
259 aa  224  1e-57  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2494  indole-3-glycerol-phosphate synthase  44.4 
 
 
266 aa  223  2e-57  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.141997  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1484  indole-3-glycerol-phosphate synthase  45.21 
 
 
259 aa  222  4e-57  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1274  indole-3-glycerol-phosphate synthase  45.21 
 
 
259 aa  221  9e-57  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2380  indole-3-glycerol-phosphate synthase  48.66 
 
 
266 aa  217  2e-55  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.446118  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0872  indole-3-glycerol-phosphate synthase  47.79 
 
 
260 aa  216  2e-55  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.169431  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1734  indole-3-glycerol-phosphate synthase  45.95 
 
 
268 aa  216  2.9999999999999998e-55  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2259  indole-3-glycerol-phosphate synthase  43.24 
 
 
266 aa  213  2.9999999999999995e-54  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1957  indole-3-glycerol-phosphate synthase  42.47 
 
 
266 aa  211  5.999999999999999e-54  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1339  indole-3-glycerol phosphate synthase  44.76 
 
 
259 aa  207  1e-52  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.419917  normal  0.796071 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3582  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  44.57 
 
 
263 aa  206  3e-52  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.433048  normal  0.034535 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2843  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  42.08 
 
 
263 aa  205  7e-52  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00184612  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3242  indole-3-glycerol phosphate synthase  42.08 
 
 
263 aa  205  7e-52  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.857016  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2195  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  40.47 
 
 
273 aa  203  2e-51  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.228441  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0754  indole-3-glycerol phosphate synthase  42.41 
 
 
265 aa  201  9.999999999999999e-51  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.297551 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0711  indole-3-glycerol-phosphate synthase  47.2 
 
 
267 aa  201  9.999999999999999e-51  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2130  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  45.42 
 
 
259 aa  200  1.9999999999999998e-50  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2358  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  43.63 
 
 
268 aa  200  1.9999999999999998e-50  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2990  indole-3-glycerol-phosphate synthase  41.73 
 
 
272 aa  199  3e-50  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.508852  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2484  indole-3-glycerol-phosphate synthase  42.08 
 
 
266 aa  199  3e-50  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2798  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  41.47 
 
 
265 aa  198  7e-50  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.822714  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0733  indole-3-glycerol-phosphate synthase  47.06 
 
 
266 aa  198  7e-50  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2247  indole-3-glycerol phosphate synthase  40.15 
 
 
267 aa  198  7.999999999999999e-50  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.835264  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1073  indole-3-glycerol phosphate synthase  43.58 
 
 
287 aa  196  2.0000000000000003e-49  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.110907  normal  0.803257 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0182  indole-3-glycerol-phosphate synthase  42.19 
 
 
264 aa  196  3e-49  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1047  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  45.14 
 
 
273 aa  196  5.000000000000001e-49  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1866  indole-3-glycerol-phosphate synthase  50.5 
 
 
260 aa  195  7e-49  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0160  indole-3-glycerol-phosphate synthase  41.8 
 
 
264 aa  195  7e-49  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.286588  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2048  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  42.25 
 
 
269 aa  195  7e-49  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0288886  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46110  indole-3-glycerol-phosphate synthase  41.47 
 
 
266 aa  194  8.000000000000001e-49  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0579  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  41.22 
 
 
266 aa  195  8.000000000000001e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3845  indole-3-glycerol-phosphate synthase  40.58 
 
 
271 aa  194  1e-48  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2497  indole-3-glycerol-phosphate synthase  41.09 
 
 
271 aa  193  2e-48  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0317819  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0174  indole-3-glycerol-phosphate synthase  43.85 
 
 
257 aa  193  3e-48  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3397  indole-3-glycerol-phosphate synthase  40.47 
 
 
267 aa  192  3e-48  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3718  indole-3-glycerol-phosphate synthase  39.15 
 
 
264 aa  192  4e-48  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0881817  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4894  indole-3-glycerol-phosphate synthase  42.69 
 
 
259 aa  192  4e-48  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2465  indole-3-glycerol phosphate synthase  39.61 
 
 
271 aa  192  4e-48  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1566  indole-3-glycerol-phosphate synthase  39.77 
 
 
263 aa  192  6e-48  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1063  indole-3-glycerol-phosphate synthase  40.08 
 
 
271 aa  192  6e-48  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.493253  normal  0.0834035 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1450  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  43.44 
 
 
274 aa  192  7e-48  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3099  indole-3-glycerol-phosphate synthase  40 
 
 
295 aa  191  8e-48  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0535  indole-3-glycerol-phosphate synthase  44.58 
 
 
258 aa  191  1e-47  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1529  indole-3-glycerol-phosphate synthase  40.3 
 
 
294 aa  191  1e-47  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.260745  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2701  indole-3-glycerol-phosphate synthase  40.32 
 
 
261 aa  191  1e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0503  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  39.38 
 
 
276 aa  191  1e-47  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1141  indole-3-glycerol-phosphate synthase  39 
 
 
268 aa  190  2e-47  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0159  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  37.93 
 
 
287 aa  190  2e-47  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.422132  normal  0.0132448 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3216  indole-3-glycerol-phosphate synthase  41.98 
 
 
260 aa  190  2e-47  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3601  indole-3-glycerol-phosphate synthase  39.53 
 
 
264 aa  189  2.9999999999999997e-47  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.147374  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1188  indole-3-glycerol-phosphate synthase  47.39 
 
 
275 aa  189  2.9999999999999997e-47  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0171952  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2858  indole-3-glycerol-phosphate synthase  42.19 
 
 
269 aa  189  2.9999999999999997e-47  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1100  indole-3-glycerol-phosphate synthase  39 
 
 
268 aa  189  4e-47  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0895  indole-3-glycerol-phosphate synthase  42.02 
 
 
258 aa  189  5e-47  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1650  indole-3-glycerol-phosphate synthase  45.67 
 
 
262 aa  189  5e-47  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1416  indole-3-glycerol-phosphate synthase  39.38 
 
 
278 aa  189  5e-47  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0650  indole-3-glycerol-phosphate synthase  40.71 
 
 
256 aa  188  9e-47  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3172  indole-3-glycerol-phosphate synthase  41.25 
 
 
286 aa  188  9e-47  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.291676 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0756  indole-3-glycerol-phosphate synthase  40 
 
 
266 aa  188  9e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1252  indole-3-glycerol-phosphate synthase  41.09 
 
 
269 aa  187  1e-46  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.157221 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5576  Indole-3-glycerol phosphate synthase  39.38 
 
 
288 aa  187  1e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.513944  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1159  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  41.63 
 
 
266 aa  187  1e-46  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2798  indole-3-glycerol-phosphate synthase  39.2 
 
 
265 aa  187  1e-46  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.812151  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2567  indole-3-glycerol-phosphate synthase  40.15 
 
 
271 aa  187  2e-46  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0720427  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2509  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  40.71 
 
 
269 aa  186  3e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.69466  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0864  indole-3-glycerol-phosphate synthase  41.63 
 
 
258 aa  185  5e-46  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2079  indole-3-glycerol-phosphate synthase  38.52 
 
 
272 aa  186  5e-46  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2141  indole-3-glycerol-phosphate synthase  42 
 
 
258 aa  186  5e-46  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2856  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  41 
 
 
264 aa  186  5e-46  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.659803  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3649  indole-3-glycerol-phosphate synthase  39.15 
 
 
263 aa  185  5e-46  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2048  indole-3-glycerol-phosphate synthase  39.92 
 
 
266 aa  185  6e-46  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2587  indole-3-glycerol phosphate synthase  39.38 
 
 
265 aa  185  6e-46  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.804047  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0490  indole-3-glycerol-phosphate synthase  41.73 
 
 
259 aa  185  8e-46  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28110  indole-3-glycerol-phosphate synthase  41.11 
 
 
269 aa  184  9e-46  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3175  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  45.5 
 
 
268 aa  184  1.0000000000000001e-45  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.504045  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12880  indole-3-glycerol phosphate synthase  38.1 
 
 
273 aa  184  1.0000000000000001e-45  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.315308  normal  0.0294244 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0909  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  47.06 
 
 
271 aa  184  1.0000000000000001e-45  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000352387  hitchhiker  0.00000000301828 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2017  indole-3-glycerol-phosphate synthase  41.63 
 
 
270 aa  184  1.0000000000000001e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.00220799  normal  0.525687 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4451  indole-3-glycerol-phosphate synthase  39.92 
 
 
264 aa  184  1.0000000000000001e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0983396  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1733  indole-3-glycerol-phosphate synthase  38.85 
 
 
281 aa  184  1.0000000000000001e-45  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.582058  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1639  indole-3-glycerol phosphate synthase  39.15 
 
 
271 aa  184  1.0000000000000001e-45  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.189756  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08360  indole-3-glycerol-phosphate synthase  40.38 
 
 
278 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000387982 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2966  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  40.61 
 
 
274 aa  184  1.0000000000000001e-45  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0215924  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3460  indole-3-glycerol phosphate synthase  44.39 
 
 
267 aa  183  2.0000000000000003e-45  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.860463  normal  0.18397 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0770  indole-3-glycerol-phosphate synthase  37.88 
 
 
267 aa  184  2.0000000000000003e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.383206  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0792  indole-3-glycerol-phosphate synthase  40 
 
 
278 aa  183  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1822  indole-3-glycerol-phosphate synthase  41.96 
 
 
270 aa  183  3e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0025467 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3236  indole-3-glycerol-phosphate synthase  41.86 
 
 
265 aa  183  3e-45  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1838  indole-3-glycerol-phosphate synthase  42.73 
 
 
264 aa  182  4.0000000000000006e-45  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1877  indole-3-glycerol phosphate synthase  42.23 
 
 
266 aa  182  4.0000000000000006e-45  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.597244  normal  0.150585 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5702  indole-3-glycerol-phosphate synthase  40.08 
 
 
271 aa  182  4.0000000000000006e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.344478  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>