More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_0733 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007498  Pcar_0733  indole-3-glycerol-phosphate synthase  100 
 
 		 266 aa  523  1e-147  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2494  indole-3-glycerol-phosphate synthase  63.85 
 
 		 266 aa  306  3e-82  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.141997  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2380  indole-3-glycerol-phosphate synthase  64.62 
 
 		 266 aa  300  1e-80  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.446118  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1734  indole-3-glycerol-phosphate synthase  62.31 
 
 		 268 aa  291  8e-78  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2484  indole-3-glycerol-phosphate synthase  59.07 
 
 		 266 aa  280  2e-74  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2259  indole-3-glycerol-phosphate synthase  58.08 
 
 		 266 aa  278  5e-74  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1957  indole-3-glycerol-phosphate synthase  57.69 
 
 		 266 aa  276  2e-73  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0711  indole-3-glycerol-phosphate synthase  58.14 
 
 		 267 aa  276  3e-73  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2195  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  54.58 
 
 		 273 aa  271  1e-71  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.228441  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1639  indole-3-glycerol phosphate synthase  52.51 
 
 		 271 aa  268  5.9999999999999995e-71  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.189756  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2798  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  55.6 
 
 		 265 aa  260  2e-68  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.822714  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2567  indole-3-glycerol-phosphate synthase  52.71 
 
 		 271 aa  259  4e-68  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0720427  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2048  indole-3-glycerol-phosphate synthase  52.65 
 
 		 266 aa  257  1e-67  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3173  indole-3-glycerol-phosphate synthase  52.71 
 
 		 265 aa  257  2e-67  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.568636 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2497  indole-3-glycerol-phosphate synthase  51.72 
 
 		 271 aa  255  4e-67  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0317819  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1141  indole-3-glycerol-phosphate synthase  51.94 
 
 		 268 aa  254  9e-67  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1100  indole-3-glycerol-phosphate synthase  51.55 
 
 		 268 aa  253  3e-66  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2798  indole-3-glycerol-phosphate synthase  53.6 
 
 		 265 aa  251  6e-66  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.812151  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0756  indole-3-glycerol-phosphate synthase  50 
 
 		 266 aa  251  1e-65  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2139  indole-3-glycerol-phosphate synthase  51.16 
 
 		 263 aa  250  1e-65  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.248459  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2829  indole-3-glycerol-phosphate synthase  53.05 
 
 		 265 aa  250  2e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.232078  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3649  indole-3-glycerol-phosphate synthase  50.97 
 
 		 263 aa  250  2e-65  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3236  indole-3-glycerol-phosphate synthase  54.4 
 
 		 265 aa  249  3e-65  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1897  indole-3-glycerol phosphate synthase  53.08 
 
 		 263 aa  249  3e-65  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.995297  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4451  indole-3-glycerol-phosphate synthase  52.12 
 
 		 264 aa  249  4e-65  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0983396  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0579  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  51.15 
 
 		 266 aa  249  4e-65  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2465  indole-3-glycerol phosphate synthase  53.01 
 
 		 271 aa  248  5e-65  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3718  indole-3-glycerol-phosphate synthase  54.47 
 
 		 264 aa  248  7e-65  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0881817  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1138  indole-3-glycerol-phosphate synthase  49.81 
 
 		 269 aa  248  9e-65  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.69839 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1232  indole-3-glycerol-phosphate synthase  51.74 
 
 		 270 aa  248  1e-64  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0182595  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0895  indole-3-glycerol-phosphate synthase  50.97 
 
 		 258 aa  248  1e-64  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2079  indole-3-glycerol-phosphate synthase  53.28 
 
 		 272 aa  247  1e-64  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2024  indole-3-glycerol-phosphate synthase  50 
 
 		 262 aa  246  2e-64  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3460  indole-3-glycerol phosphate synthase  52.67 
 
 		 267 aa  245  4e-64  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.860463  normal  0.18397 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0864  indole-3-glycerol-phosphate synthase  50.58 
 
 		 258 aa  245  6e-64  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3601  indole-3-glycerol-phosphate synthase  51.81 
 
 		 264 aa  244  9e-64  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.147374  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04004  indole-3-glycerol-phosphate synthase  54.07 
 
 		 265 aa  243  1.9999999999999999e-63  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0269  indole-3-glycerol-phosphate synthase  48.85 
 
 		 268 aa  242  6e-63  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000502728  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3876  indole-3-glycerol-phosphate synthase  50.19 
 
 		 262 aa  241  7.999999999999999e-63  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3242  indole-3-glycerol phosphate synthase  52.44 
 
 		 263 aa  240  1e-62  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.857016  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2843  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  52.44 
 
 		 263 aa  240  1e-62  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00184612  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3026  indole-3-glycerol-phosphate synthase  52.09 
 
 		 267 aa  241  1e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0114163  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3181  indole-3-glycerol-phosphate synthase  53.39 
 
 		 270 aa  241  1e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.509881  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0503  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  47.79 
 
 		 276 aa  240  2e-62  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1800  indole-3-glycerol-phosphate synthase  52.51 
 
 		 271 aa  239  5e-62  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00000789952  normal  0.147475 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2701  indole-3-glycerol-phosphate synthase  51.22 
 
 		 261 aa  238  5.999999999999999e-62  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4483  indole-3-glycerol-phosphate synthase  52.31 
 
 		 272 aa  238  6.999999999999999e-62  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.249423  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1838  indole-3-glycerol-phosphate synthase  51.55 
 
 		 264 aa  238  6.999999999999999e-62  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0160  indole-3-glycerol-phosphate synthase  52.44 
 
 		 264 aa  238  1e-61  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.286588  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0370  indole-3-glycerol-phosphate synthase  49.81 
 
 		 266 aa  238  1e-61  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2587  indole-3-glycerol phosphate synthase  51.81 
 
 		 265 aa  236  2e-61  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.804047  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0182  indole-3-glycerol-phosphate synthase  52.44 
 
 		 264 aa  236  2e-61  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4375  indole-3-glycerol-phosphate synthase  52.33 
 
 		 263 aa  237  2e-61  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.893043  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5576  Indole-3-glycerol phosphate synthase  49.61 
 
 		 288 aa  236  4e-61  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.513944  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1529  indole-3-glycerol-phosphate synthase  52.08 
 
 		 294 aa  234  8e-61  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.260745  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0586  indole-3-glycerol-phosphate synthase  47.53 
 
 		 266 aa  234  1.0000000000000001e-60  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.338589  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46110  indole-3-glycerol-phosphate synthase  51.61 
 
 		 266 aa  234  1.0000000000000001e-60  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1733  indole-3-glycerol-phosphate synthase  49.81 
 
 		 281 aa  234  1.0000000000000001e-60  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.582058  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2778  indole-3-glycerol-phosphate synthase  49.42 
 
 		 262 aa  234  1.0000000000000001e-60  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.000331448  hitchhiker  0.0000255859 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0770  indole-3-glycerol-phosphate synthase  46.59 
 
 		 267 aa  233  2.0000000000000002e-60  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.383206  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1877  indole-3-glycerol phosphate synthase  48.06 
 
 		 266 aa  233  2.0000000000000002e-60  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.597244  normal  0.150585 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2466  indole-3-glycerol-phosphate synthase  52.69 
 
 		 272 aa  233  2.0000000000000002e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.00979183  normal  0.597636 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1339  indole-3-glycerol phosphate synthase  51.95 
 
 		 259 aa  233  3e-60  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.419917  normal  0.796071 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0159  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  51.88 
 
 		 287 aa  233  3e-60  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.422132  normal  0.0132448 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0361  indole-3-glycerol-phosphate synthase  49.05 
 
 		 266 aa  232  4.0000000000000004e-60  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.331099  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3099  indole-3-glycerol-phosphate synthase  49.25 
 
 		 295 aa  232  5e-60  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1306  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  48.65 
 
 		 262 aa  232  5e-60  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1416  indole-3-glycerol-phosphate synthase  49.22 
 
 		 278 aa  231  8.000000000000001e-60  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1822  indole-3-glycerol-phosphate synthase  49.43 
 
 		 270 aa  231  9e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0025467 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1254  Indole-3-glycerol phosphate synthase  50.19 
 
 		 259 aa  230  2e-59  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5394  indole-3-glycerol-phosphate synthase  50 
 
 		 285 aa  230  2e-59  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.467387  normal  0.310018 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4579  indole-3-glycerol-phosphate synthase  50.19 
 
 		 278 aa  229  3e-59  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0514187  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2358  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  50.57 
 
 		 268 aa  229  4e-59  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2247  indole-3-glycerol phosphate synthase  52.85 
 
 		 267 aa  229  4e-59  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.835264  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3520  indole-3-glycerol-phosphate synthase  47.88 
 
 		 270 aa  229  4e-59  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1399  indole-3-glycerol phosphate synthase  50.19 
 
 		 268 aa  229  5e-59  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.105391  hitchhiker  0.00077331 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2332  indole-3-glycerol phosphate synthase  49.43 
 
 		 268 aa  229  5e-59  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1030  indole-3-glycerol-phosphate synthase  50.95 
 
 		 266 aa  228  8e-59  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1409  indole-3-glycerol-phosphate synthase  51.16 
 
 		 271 aa  228  8e-59  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.827257  normal  0.309445 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0870  indole-3-glycerol-phosphate synthase  50.38 
 
 		 295 aa  228  9e-59  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.474663  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3127  indole-3-glycerol-phosphate synthase  50.38 
 
 		 267 aa  227  1e-58  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.663286  normal  0.570682 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1209  indole-3-glycerol-phosphate synthase  51.18 
 
 		 267 aa  226  2e-58  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.148422  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0835  indole-3-glycerol-phosphate synthase  51.94 
 
 		 261 aa  226  3e-58  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0303265  hitchhiker  0.00447803 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2762  indole-3-glycerol-phosphate synthase  49.24 
 
 		 267 aa  226  4e-58  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2017  indole-3-glycerol-phosphate synthase  50.19 
 
 		 270 aa  226  4e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.00220799  normal  0.525687 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4672  indole-3-glycerol-phosphate synthase  48.11 
 
 		 285 aa  226  4e-58  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5135  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  48.11 
 
 		 285 aa  225  5.0000000000000005e-58  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0596485 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2885  indole-3-glycerol-phosphate synthase  51.33 
 
 		 267 aa  225  5.0000000000000005e-58  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.733031 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0640  indole-3-glycerol-phosphate synthase  43.24 
 
 		 258 aa  225  7e-58  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5212  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  49.22 
 
 		 285 aa  225  7e-58  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.69886  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13441  indole-3-glycerol-phosphate synthase  50.38 
 
 		 295 aa  225  7e-58  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.847237  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5113  indole-3-glycerol-phosphate synthase  49.2 
 
 		 278 aa  224  8e-58  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3499  indole-3-glycerol-phosphate synthase  52.21 
 
 		 261 aa  224  8e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.413739  hitchhiker  0.000209901 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08360  indole-3-glycerol-phosphate synthase  52.78 
 
 		 278 aa  224  9e-58  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000387982 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1188  indole-3-glycerol-phosphate synthase  49.23 
 
 		 275 aa  224  1e-57  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0171952  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0458  indole-3-glycerol-phosphate synthase  53.66 
 
 		 261 aa  224  1e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1566  indole-3-glycerol-phosphate synthase  47.67 
 
 		 263 aa  224  1e-57  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2912  indole-3-glycerol-phosphate synthase  51.55 
 
 		 261 aa  223  3e-57  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0792  indole-3-glycerol-phosphate synthase  52.38 
 
 		 278 aa  222  4e-57  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0503  indole-3-glycerol-phosphate synthase  52.82 
 
 		 261 aa  222  4.9999999999999996e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.883215 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>