More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmur_2130 on replicon NC_014150
Organism: Brachyspira murdochii DSM 12563



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014150  Bmur_2130  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  100 
 
 
259 aa  508  1e-143  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3216  indole-3-glycerol-phosphate synthase  53.7 
 
 
260 aa  276  2e-73  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3845  indole-3-glycerol-phosphate synthase  45.93 
 
 
271 aa  245  4.9999999999999997e-64  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1174  indole-3-glycerol phosphate synthase  47.49 
 
 
262 aa  230  1e-59  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0145  indole-3-glycerol-phosphate synthase  48.63 
 
 
267 aa  226  2e-58  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.694484  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0159  indole-3-glycerol-phosphate synthase  46.09 
 
 
267 aa  219  3.9999999999999997e-56  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.927898  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3876  indole-3-glycerol-phosphate synthase  41.83 
 
 
262 aa  218  8.999999999999998e-56  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2798  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  41.7 
 
 
265 aa  216  2e-55  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.822714  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1188  indole-3-glycerol-phosphate synthase  41.02 
 
 
275 aa  214  9.999999999999999e-55  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0171952  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4451  indole-3-glycerol-phosphate synthase  43.24 
 
 
264 aa  214  9.999999999999999e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0983396  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4781  indole-3-glycerol-phosphate synthase  42.25 
 
 
277 aa  213  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.574175 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1030  indole-3-glycerol-phosphate synthase  44.96 
 
 
266 aa  214  1.9999999999999998e-54  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1306  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  46.99 
 
 
262 aa  212  4.9999999999999996e-54  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0579  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  40.53 
 
 
266 aa  211  7e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0422  indole-3-glycerol-phosphate synthase  41.31 
 
 
277 aa  211  7.999999999999999e-54  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.909241 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2587  indole-3-glycerol phosphate synthase  42.02 
 
 
265 aa  211  1e-53  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.804047  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0455  indole-3-glycerol-phosphate synthase  41.31 
 
 
277 aa  210  1e-53  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.811875  normal  0.264325 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5113  indole-3-glycerol-phosphate synthase  42.47 
 
 
278 aa  211  1e-53  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2701  indole-3-glycerol-phosphate synthase  43.15 
 
 
261 aa  210  2e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0872  indole-3-glycerol-phosphate synthase  44.4 
 
 
260 aa  208  8e-53  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.169431  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2259  indole-3-glycerol-phosphate synthase  41.15 
 
 
266 aa  207  1e-52  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1734  indole-3-glycerol-phosphate synthase  45.06 
 
 
268 aa  207  2e-52  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3520  indole-3-glycerol-phosphate synthase  39.08 
 
 
270 aa  206  2e-52  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0535  indole-3-glycerol-phosphate synthase  43.44 
 
 
258 aa  207  2e-52  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1957  indole-3-glycerol-phosphate synthase  41.15 
 
 
266 aa  207  2e-52  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08360  indole-3-glycerol-phosphate synthase  41.31 
 
 
278 aa  207  2e-52  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000387982 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0711  indole-3-glycerol-phosphate synthase  40.38 
 
 
267 aa  207  2e-52  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2494  indole-3-glycerol-phosphate synthase  40 
 
 
266 aa  206  3e-52  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.141997  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3944  indole-3-glycerol-phosphate synthase  40.93 
 
 
279 aa  206  3e-52  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0792  indole-3-glycerol-phosphate synthase  41.09 
 
 
278 aa  206  3e-52  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04004  indole-3-glycerol-phosphate synthase  46.38 
 
 
265 aa  206  4e-52  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3460  indole-3-glycerol phosphate synthase  39.31 
 
 
267 aa  205  5e-52  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.860463  normal  0.18397 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1209  indole-3-glycerol-phosphate synthase  42.02 
 
 
267 aa  205  6e-52  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.148422  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0586  indole-3-glycerol-phosphate synthase  40.39 
 
 
266 aa  205  7e-52  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.338589  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3718  indole-3-glycerol-phosphate synthase  40.15 
 
 
264 aa  204  8e-52  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0881817  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0895  indole-3-glycerol-phosphate synthase  43.92 
 
 
258 aa  204  1e-51  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2247  indole-3-glycerol phosphate synthase  38.61 
 
 
267 aa  204  1e-51  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.835264  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0468  indole-3-glycerol-phosphate synthase  44.9 
 
 
258 aa  204  1e-51  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2380  indole-3-glycerol-phosphate synthase  44.21 
 
 
266 aa  204  2e-51  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.446118  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46110  indole-3-glycerol-phosphate synthase  41.09 
 
 
266 aa  203  2e-51  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0650  indole-3-glycerol-phosphate synthase  42.86 
 
 
256 aa  203  2e-51  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0174  indole-3-glycerol-phosphate synthase  44.76 
 
 
257 aa  204  2e-51  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0490  indole-3-glycerol-phosphate synthase  48.99 
 
 
259 aa  204  2e-51  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0864  indole-3-glycerol-phosphate synthase  43.92 
 
 
258 aa  202  3e-51  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1232  indole-3-glycerol-phosphate synthase  40.54 
 
 
270 aa  203  3e-51  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0182595  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0640  indole-3-glycerol-phosphate synthase  44.53 
 
 
258 aa  202  4e-51  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2195  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  38.43 
 
 
273 aa  202  5e-51  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.228441  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2484  indole-3-glycerol-phosphate synthase  40.93 
 
 
266 aa  202  5e-51  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3601  indole-3-glycerol-phosphate synthase  42 
 
 
264 aa  202  6e-51  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.147374  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0452  indole-3-glycerol-phosphate synthase  45 
 
 
277 aa  202  6e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.42981  normal  0.418549 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0770  indole-3-glycerol-phosphate synthase  40.46 
 
 
267 aa  202  6e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.383206  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0594  indole-3-glycerol phosphate synthase  39.77 
 
 
278 aa  201  7e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0731  indole-3-glycerol-phosphate synthase  43.58 
 
 
263 aa  201  9.999999999999999e-51  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.374579  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1866  indole-3-glycerol-phosphate synthase  52.53 
 
 
260 aa  201  9.999999999999999e-51  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3649  indole-3-glycerol-phosphate synthase  41.76 
 
 
263 aa  200  1.9999999999999998e-50  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0606  indole-3-glycerol-phosphate synthase  45.42 
 
 
258 aa  200  1.9999999999999998e-50  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.64209  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3026  indole-3-glycerol-phosphate synthase  40.46 
 
 
267 aa  200  1.9999999999999998e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0114163  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0531  indole-3-glycerol-phosphate synthase  43.41 
 
 
258 aa  200  1.9999999999999998e-50  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.44411  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2465  indole-3-glycerol phosphate synthase  46.73 
 
 
271 aa  199  3e-50  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0370  indole-3-glycerol-phosphate synthase  40.68 
 
 
266 aa  199  3e-50  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0519  indole-3-glycerol-phosphate synthase  45.04 
 
 
258 aa  198  6e-50  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3242  indole-3-glycerol phosphate synthase  41.06 
 
 
263 aa  198  6e-50  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.857016  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2843  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  41.06 
 
 
263 aa  198  6e-50  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00184612  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1436  indole-3-glycerol-phosphate synthase  45.04 
 
 
258 aa  198  6e-50  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.567597  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0754  indole-3-glycerol phosphate synthase  39.15 
 
 
265 aa  197  9e-50  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.297551 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4579  indole-3-glycerol-phosphate synthase  39.15 
 
 
278 aa  197  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0514187  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1952  indole-3-glycerol-phosphate synthase  44.18 
 
 
261 aa  197  1.0000000000000001e-49  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.0048932  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0361  indole-3-glycerol-phosphate synthase  40.3 
 
 
266 aa  197  2.0000000000000003e-49  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.331099  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0160  indole-3-glycerol-phosphate synthase  40 
 
 
264 aa  196  2.0000000000000003e-49  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.286588  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1047  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  45.92 
 
 
273 aa  196  2.0000000000000003e-49  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2497  indole-3-glycerol-phosphate synthase  39.23 
 
 
271 aa  196  3e-49  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0317819  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0269  indole-3-glycerol-phosphate synthase  37.84 
 
 
268 aa  196  4.0000000000000005e-49  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000502728  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3099  indole-3-glycerol-phosphate synthase  45.89 
 
 
295 aa  196  5.000000000000001e-49  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0182  indole-3-glycerol-phosphate synthase  40 
 
 
264 aa  195  5.000000000000001e-49  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1274  indole-3-glycerol-phosphate synthase  43.02 
 
 
259 aa  195  5.000000000000001e-49  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0159  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  39.08 
 
 
287 aa  195  6e-49  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.422132  normal  0.0132448 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1650  indole-3-glycerol-phosphate synthase  41.43 
 
 
262 aa  195  7e-49  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1484  indole-3-glycerol-phosphate synthase  43.02 
 
 
259 aa  194  1e-48  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1339  indole-3-glycerol phosphate synthase  46.08 
 
 
259 aa  194  1e-48  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.419917  normal  0.796071 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0458  indole-3-glycerol-phosphate synthase  43.97 
 
 
261 aa  194  1e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2079  indole-3-glycerol-phosphate synthase  36.54 
 
 
272 aa  192  3e-48  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3499  indole-3-glycerol-phosphate synthase  43.58 
 
 
261 aa  193  3e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.413739  hitchhiker  0.000209901 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1254  Indole-3-glycerol phosphate synthase  47.64 
 
 
259 aa  192  3e-48  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2762  indole-3-glycerol-phosphate synthase  44.12 
 
 
267 aa  192  5e-48  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0503  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  39.53 
 
 
276 aa  191  1e-47  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1063  indole-3-glycerol-phosphate synthase  38.78 
 
 
271 aa  191  1e-47  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.493253  normal  0.0834035 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2358  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  39.76 
 
 
268 aa  190  2e-47  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2222  indole-3-glycerol phosphate synthase  40.7 
 
 
262 aa  190  2.9999999999999997e-47  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.688049 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0460  indole-3-glycerol-phosphate synthase  42.41 
 
 
261 aa  189  2.9999999999999997e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.212838 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0436  indole-3-glycerol-phosphate synthase  42.41 
 
 
261 aa  189  2.9999999999999997e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0251  indole-3-glycerol-phosphate synthase  43.54 
 
 
265 aa  189  2.9999999999999997e-47  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1100  indole-3-glycerol-phosphate synthase  37.21 
 
 
268 aa  189  4e-47  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4672  indole-3-glycerol-phosphate synthase  42.53 
 
 
285 aa  189  4e-47  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1566  indole-3-glycerol-phosphate synthase  38.76 
 
 
263 aa  189  5e-47  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5135  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  42.53 
 
 
285 aa  189  5e-47  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0596485 
 
 
-
 
NC_004310  BR1141  indole-3-glycerol-phosphate synthase  37.21 
 
 
268 aa  188  5.999999999999999e-47  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12880  indole-3-glycerol phosphate synthase  37.25 
 
 
273 aa  188  5.999999999999999e-47  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.315308  normal  0.0294244 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5212  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  43.96 
 
 
285 aa  188  7e-47  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.69886  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1416  indole-3-glycerol-phosphate synthase  37.6 
 
 
278 aa  188  8e-47  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2048  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  42.31 
 
 
269 aa  188  8e-47  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0288886  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>