More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHAB381_1323 on replicon NC_009714
Organism: Campylobacter hominis ATCC BAA-381



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009714  CHAB381_1323  indole-3-glycerol-phosphate synthase  100 
 
 
261 aa  526  1e-148  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1952  indole-3-glycerol-phosphate synthase  69.11 
 
 
261 aa  379  1e-104  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.0048932  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1306  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  64.75 
 
 
262 aa  355  5e-97  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0519  indole-3-glycerol-phosphate synthase  66.28 
 
 
258 aa  344  1e-93  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0606  indole-3-glycerol-phosphate synthase  66.28 
 
 
258 aa  343  2e-93  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.64209  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1436  indole-3-glycerol-phosphate synthase  66.28 
 
 
258 aa  342  2.9999999999999997e-93  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.567597  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0731  indole-3-glycerol-phosphate synthase  61 
 
 
263 aa  337  9.999999999999999e-92  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.374579  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0640  indole-3-glycerol-phosphate synthase  57.69 
 
 
258 aa  286  2e-76  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1322  indole-3-glycerol-phosphate synthase  45.56 
 
 
260 aa  223  2e-57  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0872  indole-3-glycerol-phosphate synthase  45.8 
 
 
260 aa  216  2e-55  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.169431  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1484  indole-3-glycerol-phosphate synthase  45.21 
 
 
259 aa  211  7.999999999999999e-54  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1254  Indole-3-glycerol phosphate synthase  45.59 
 
 
259 aa  211  9e-54  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1188  indole-3-glycerol-phosphate synthase  45 
 
 
275 aa  210  2e-53  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0171952  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1274  indole-3-glycerol-phosphate synthase  44.83 
 
 
259 aa  208  7e-53  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1957  indole-3-glycerol-phosphate synthase  44.44 
 
 
266 aa  205  6e-52  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2259  indole-3-glycerol-phosphate synthase  44.89 
 
 
266 aa  203  2e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2024  indole-3-glycerol-phosphate synthase  41.18 
 
 
262 aa  202  5e-51  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1339  indole-3-glycerol phosphate synthase  43.8 
 
 
259 aa  202  6e-51  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.419917  normal  0.796071 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0754  indole-3-glycerol phosphate synthase  41.86 
 
 
265 aa  200  1.9999999999999998e-50  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.297551 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2798  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  41.92 
 
 
265 aa  199  3e-50  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.822714  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2141  indole-3-glycerol-phosphate synthase  46.85 
 
 
258 aa  199  3e-50  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2494  indole-3-glycerol-phosphate synthase  38.46 
 
 
266 aa  195  5.000000000000001e-49  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.141997  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2380  indole-3-glycerol-phosphate synthase  43.56 
 
 
266 aa  195  7e-49  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.446118  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1734  indole-3-glycerol-phosphate synthase  45.13 
 
 
268 aa  194  9e-49  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1252  indole-3-glycerol-phosphate synthase  42.16 
 
 
269 aa  194  2e-48  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.157221 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0174  indole-3-glycerol-phosphate synthase  44.78 
 
 
257 aa  192  3e-48  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2130  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  41.31 
 
 
259 aa  193  3e-48  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2701  indole-3-glycerol-phosphate synthase  40 
 
 
261 aa  192  3e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2247  indole-3-glycerol phosphate synthase  41.31 
 
 
267 aa  192  4e-48  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.835264  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3242  indole-3-glycerol phosphate synthase  43.55 
 
 
263 aa  192  5e-48  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.857016  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2843  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  43.55 
 
 
263 aa  192  5e-48  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00184612  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3582  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  41.92 
 
 
263 aa  191  8e-48  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.433048  normal  0.034535 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2358  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  44 
 
 
268 aa  191  1e-47  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3216  indole-3-glycerol-phosphate synthase  38.85 
 
 
260 aa  191  1e-47  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0490  indole-3-glycerol-phosphate synthase  44.44 
 
 
259 aa  191  1e-47  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0160  indole-3-glycerol-phosphate synthase  43.08 
 
 
264 aa  191  1e-47  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.286588  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0182  indole-3-glycerol-phosphate synthase  43.08 
 
 
264 aa  190  2e-47  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2856  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  42.64 
 
 
264 aa  190  2e-47  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.659803  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1866  indole-3-glycerol-phosphate synthase  49.75 
 
 
260 aa  190  2e-47  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3845  indole-3-glycerol-phosphate synthase  37.87 
 
 
271 aa  190  2e-47  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1639  indole-3-glycerol phosphate synthase  40.84 
 
 
271 aa  189  2.9999999999999997e-47  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.189756  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0468  indole-3-glycerol-phosphate synthase  44.63 
 
 
258 aa  189  5e-47  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2048  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  40.53 
 
 
269 aa  187  1e-46  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0288886  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1897  indole-3-glycerol phosphate synthase  39.69 
 
 
263 aa  186  3e-46  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.995297  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0535  indole-3-glycerol-phosphate synthase  47 
 
 
258 aa  186  3e-46  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0503  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  40.54 
 
 
276 aa  186  3e-46  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3173  indole-3-glycerol-phosphate synthase  38.91 
 
 
265 aa  186  4e-46  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.568636 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2858  indole-3-glycerol-phosphate synthase  41.79 
 
 
269 aa  186  4e-46  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1141  indole-3-glycerol-phosphate synthase  37.98 
 
 
268 aa  185  5e-46  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3397  indole-3-glycerol-phosphate synthase  39.3 
 
 
267 aa  185  5e-46  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1063  indole-3-glycerol-phosphate synthase  40.71 
 
 
271 aa  185  6e-46  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.493253  normal  0.0834035 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2497  indole-3-glycerol-phosphate synthase  41.11 
 
 
271 aa  185  7e-46  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0317819  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1047  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  45.91 
 
 
273 aa  184  9e-46  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5394  indole-3-glycerol-phosphate synthase  39.29 
 
 
285 aa  184  9e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.467387  normal  0.310018 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0756  indole-3-glycerol-phosphate synthase  41.26 
 
 
266 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0650  indole-3-glycerol-phosphate synthase  47.09 
 
 
256 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1877  indole-3-glycerol phosphate synthase  38.13 
 
 
266 aa  184  1.0000000000000001e-45  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.597244  normal  0.150585 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46110  indole-3-glycerol-phosphate synthase  39.69 
 
 
266 aa  184  2.0000000000000003e-45  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2465  indole-3-glycerol phosphate synthase  45.69 
 
 
271 aa  183  2.0000000000000003e-45  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1733  indole-3-glycerol-phosphate synthase  38.61 
 
 
281 aa  183  2.0000000000000003e-45  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.582058  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1100  indole-3-glycerol-phosphate synthase  37.6 
 
 
268 aa  183  3e-45  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2798  indole-3-glycerol-phosphate synthase  39.37 
 
 
265 aa  182  3e-45  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.812151  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5576  Indole-3-glycerol phosphate synthase  39.04 
 
 
288 aa  183  3e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.513944  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2587  indole-3-glycerol phosphate synthase  40.24 
 
 
265 aa  182  4.0000000000000006e-45  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.804047  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2195  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  38.98 
 
 
273 aa  182  5.0000000000000004e-45  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.228441  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2509  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  39.15 
 
 
269 aa  182  7e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.69466  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2484  indole-3-glycerol-phosphate synthase  38.76 
 
 
266 aa  182  7e-45  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12880  indole-3-glycerol phosphate synthase  39.6 
 
 
273 aa  181  9.000000000000001e-45  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.315308  normal  0.0294244 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4483  indole-3-glycerol-phosphate synthase  39 
 
 
272 aa  181  1e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.249423  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0531  indole-3-glycerol-phosphate synthase  46.26 
 
 
258 aa  181  1e-44  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.44411  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_6214  indole-3-glycerol-phosphate synthase  41.94 
 
 
270 aa  180  2e-44  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2048  indole-3-glycerol-phosphate synthase  41.26 
 
 
266 aa  180  2e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3718  indole-3-glycerol-phosphate synthase  37.98 
 
 
264 aa  180  2e-44  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0881817  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0733  indole-3-glycerol-phosphate synthase  43.65 
 
 
266 aa  179  2.9999999999999997e-44  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1450  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  39.69 
 
 
274 aa  179  2.9999999999999997e-44  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1174  indole-3-glycerol phosphate synthase  37.4 
 
 
262 aa  179  2.9999999999999997e-44  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0710  indole-3-glycerol-phosphate synthase  41.94 
 
 
270 aa  179  4e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.251699 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1416  indole-3-glycerol-phosphate synthase  38.37 
 
 
278 aa  179  4e-44  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0458  indole-3-glycerol-phosphate synthase  42.8 
 
 
261 aa  179  4e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3236  indole-3-glycerol-phosphate synthase  41.67 
 
 
265 aa  179  4e-44  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1773  indole-3-glycerol-phosphate synthase  39.75 
 
 
265 aa  178  7e-44  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.908281  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10960  indole-3-glycerol phosphate synthase  38.46 
 
 
268 aa  178  8e-44  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.0068358  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1822  indole-3-glycerol-phosphate synthase  37.55 
 
 
270 aa  177  1e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0025467 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0895  indole-3-glycerol-phosphate synthase  40.47 
 
 
258 aa  177  1e-43  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2079  indole-3-glycerol-phosphate synthase  38.4 
 
 
272 aa  177  1e-43  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2829  indole-3-glycerol-phosphate synthase  41.06 
 
 
265 aa  177  1e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.232078  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2319  indole-3-glycerol phosphate synthase  40.77 
 
 
270 aa  177  1e-43  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.043656  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0478  indole-3-glycerol-phosphate synthase  40.84 
 
 
259 aa  177  1e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3499  indole-3-glycerol-phosphate synthase  42 
 
 
261 aa  177  2e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.413739  hitchhiker  0.000209901 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3172  indole-3-glycerol-phosphate synthase  39.3 
 
 
286 aa  177  2e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.291676 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3099  indole-3-glycerol-phosphate synthase  42.93 
 
 
295 aa  177  2e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2816  indole-3-glycerol-phosphate synthase  37.74 
 
 
272 aa  177  2e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.07226  normal  0.927217 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1650  indole-3-glycerol-phosphate synthase  43.07 
 
 
262 aa  176  3e-43  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0792  indole-3-glycerol-phosphate synthase  41.41 
 
 
278 aa  176  3e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0711  indole-3-glycerol-phosphate synthase  43 
 
 
267 aa  176  3e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2139  indole-3-glycerol-phosphate synthase  40.89 
 
 
263 aa  176  3e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.248459  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1931  indole-3-glycerol-phosphate synthase  39.92 
 
 
268 aa  176  4e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.535725 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08360  indole-3-glycerol-phosphate synthase  41.41 
 
 
278 aa  176  4e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000387982 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0159  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  37.02 
 
 
287 aa  176  5e-43  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.422132  normal  0.0132448 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0909  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  43.75 
 
 
271 aa  176  5e-43  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000352387  hitchhiker  0.00000000301828 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>