More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A0458 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007951  Bxe_A0458  indole-3-glycerol-phosphate synthase  100 
 
 
261 aa  520  1e-146  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3499  indole-3-glycerol-phosphate synthase  96.55 
 
 
261 aa  484  1e-136  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.413739  hitchhiker  0.000209901 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2701  indole-3-glycerol-phosphate synthase  88.89 
 
 
261 aa  475  1e-133  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3618  indole-3-glycerol-phosphate synthase  83.52 
 
 
261 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.870182 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2912  indole-3-glycerol-phosphate synthase  83.14 
 
 
261 aa  414  9.999999999999999e-116  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3586  indole-3-glycerol-phosphate synthase  82.38 
 
 
261 aa  407  1e-113  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0503  indole-3-glycerol-phosphate synthase  82.76 
 
 
261 aa  409  1e-113  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.883215 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2574  indole-3-glycerol-phosphate synthase  82.76 
 
 
261 aa  409  1e-113  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3559  indole-3-glycerol-phosphate synthase  82.38 
 
 
261 aa  408  1e-113  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.723493  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0460  indole-3-glycerol-phosphate synthase  83.14 
 
 
261 aa  409  1e-113  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.212838 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0436  indole-3-glycerol-phosphate synthase  83.14 
 
 
261 aa  409  1e-113  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0531  indole-3-glycerol-phosphate synthase  82.76 
 
 
261 aa  409  1e-113  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0530  indole-3-glycerol-phosphate synthase  81.99 
 
 
261 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.343706  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3578  indole-3-glycerol-phosphate synthase  81.61 
 
 
261 aa  404  1.0000000000000001e-112  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.928975  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0943  indole-3-glycerol-phosphate synthase  81.99 
 
 
261 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1913  indole-3-glycerol-phosphate synthase  81.99 
 
 
261 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0647  indole-3-glycerol-phosphate synthase  81.99 
 
 
261 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2863  indole-3-glycerol-phosphate synthase  81.61 
 
 
261 aa  402  1e-111  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.890478  normal  0.979961 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0586  indole-3-glycerol-phosphate synthase  67.55 
 
 
266 aa  350  8.999999999999999e-96  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.338589  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3876  indole-3-glycerol-phosphate synthase  68.97 
 
 
262 aa  348  3e-95  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0579  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  67.92 
 
 
266 aa  345  6e-94  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4451  indole-3-glycerol-phosphate synthase  67.43 
 
 
264 aa  344  8e-94  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0983396  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3649  indole-3-glycerol-phosphate synthase  66.67 
 
 
263 aa  342  2.9999999999999997e-93  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3460  indole-3-glycerol phosphate synthase  67.18 
 
 
267 aa  339  2.9999999999999998e-92  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.860463  normal  0.18397 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3601  indole-3-glycerol-phosphate synthase  64.75 
 
 
264 aa  337  9.999999999999999e-92  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.147374  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0770  indole-3-glycerol-phosphate synthase  64.66 
 
 
267 aa  337  1.9999999999999998e-91  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.383206  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3026  indole-3-glycerol-phosphate synthase  65.04 
 
 
267 aa  327  1.0000000000000001e-88  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0114163  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0145  indole-3-glycerol-phosphate synthase  60.15 
 
 
267 aa  325  3e-88  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.694484  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2222  indole-3-glycerol phosphate synthase  65.9 
 
 
262 aa  323  3e-87  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.688049 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2465  indole-3-glycerol phosphate synthase  63.6 
 
 
271 aa  320  1.9999999999999998e-86  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0159  indole-3-glycerol-phosphate synthase  58.65 
 
 
267 aa  318  6e-86  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.927898  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46110  indole-3-glycerol-phosphate synthase  64.02 
 
 
266 aa  317  9e-86  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3181  indole-3-glycerol-phosphate synthase  63.77 
 
 
270 aa  316  2e-85  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.509881  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4579  indole-3-glycerol-phosphate synthase  63.08 
 
 
278 aa  315  4e-85  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0514187  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2587  indole-3-glycerol phosphate synthase  63.71 
 
 
265 aa  315  5e-85  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.804047  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0370  indole-3-glycerol-phosphate synthase  62.26 
 
 
266 aa  314  9e-85  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0361  indole-3-glycerol-phosphate synthase  62.26 
 
 
266 aa  313  9.999999999999999e-85  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.331099  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3475  indole-3-glycerol phosphate synthase  65.13 
 
 
262 aa  310  1e-83  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00758651  normal  0.194157 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2798  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  63.36 
 
 
265 aa  309  2e-83  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.822714  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08360  indole-3-glycerol-phosphate synthase  63.85 
 
 
278 aa  308  4e-83  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000387982 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0792  indole-3-glycerol-phosphate synthase  63.85 
 
 
278 aa  307  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0594  indole-3-glycerol phosphate synthase  60.38 
 
 
278 aa  306  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1209  indole-3-glycerol-phosphate synthase  63.16 
 
 
267 aa  306  3e-82  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.148422  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5113  indole-3-glycerol-phosphate synthase  60.69 
 
 
278 aa  306  3e-82  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3718  indole-3-glycerol-phosphate synthase  61.07 
 
 
264 aa  303  1.0000000000000001e-81  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0881817  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0455  indole-3-glycerol-phosphate synthase  62.21 
 
 
277 aa  301  6.000000000000001e-81  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.811875  normal  0.264325 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1030  indole-3-glycerol-phosphate synthase  65.15 
 
 
266 aa  301  6.000000000000001e-81  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0422  indole-3-glycerol-phosphate synthase  62.21 
 
 
277 aa  301  7.000000000000001e-81  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.909241 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2048  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  63.22 
 
 
269 aa  299  3e-80  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0288886  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4781  indole-3-glycerol-phosphate synthase  60.69 
 
 
277 aa  299  4e-80  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.574175 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2762  indole-3-glycerol-phosphate synthase  64.29 
 
 
267 aa  298  5e-80  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0160  indole-3-glycerol-phosphate synthase  61.36 
 
 
264 aa  298  5e-80  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.286588  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3127  indole-3-glycerol-phosphate synthase  65.04 
 
 
267 aa  298  8e-80  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.663286  normal  0.570682 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2885  indole-3-glycerol-phosphate synthase  65.04 
 
 
267 aa  297  1e-79  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.733031 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04004  indole-3-glycerol-phosphate synthase  62.12 
 
 
265 aa  297  1e-79  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0182  indole-3-glycerol-phosphate synthase  60.98 
 
 
264 aa  297  1e-79  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0452  indole-3-glycerol-phosphate synthase  61.45 
 
 
277 aa  297  1e-79  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.42981  normal  0.418549 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2562  indole-3-glycerol-phosphate synthase  58.33 
 
 
279 aa  296  2e-79  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.00548778  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3242  indole-3-glycerol phosphate synthase  61.45 
 
 
263 aa  296  3e-79  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.857016  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2843  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  61.45 
 
 
263 aa  296  3e-79  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00184612  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3944  indole-3-glycerol-phosphate synthase  60 
 
 
279 aa  290  1e-77  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0269  indole-3-glycerol-phosphate synthase  57.47 
 
 
268 aa  290  2e-77  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000502728  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0754  indole-3-glycerol phosphate synthase  57.53 
 
 
265 aa  288  5.0000000000000004e-77  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.297551 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2497  indole-3-glycerol-phosphate synthase  55.56 
 
 
271 aa  278  6e-74  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0317819  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2247  indole-3-glycerol phosphate synthase  57.14 
 
 
267 aa  277  1e-73  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.835264  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3520  indole-3-glycerol-phosphate synthase  54.65 
 
 
270 aa  277  2e-73  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1063  indole-3-glycerol-phosphate synthase  54.2 
 
 
271 aa  274  9e-73  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.493253  normal  0.0834035 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2358  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  53.26 
 
 
268 aa  265  4e-70  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1639  indole-3-glycerol phosphate synthase  54.33 
 
 
271 aa  265  5e-70  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.189756  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2798  indole-3-glycerol-phosphate synthase  55.16 
 
 
265 aa  264  1e-69  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.812151  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2567  indole-3-glycerol-phosphate synthase  53.17 
 
 
271 aa  259  3e-68  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0720427  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3236  indole-3-glycerol-phosphate synthase  55.02 
 
 
265 aa  259  4e-68  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0503  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  54.22 
 
 
276 aa  252  4.0000000000000004e-66  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4483  indole-3-glycerol-phosphate synthase  55.38 
 
 
272 aa  252  5.000000000000001e-66  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.249423  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1416  indole-3-glycerol-phosphate synthase  54.22 
 
 
278 aa  251  8.000000000000001e-66  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2319  indole-3-glycerol phosphate synthase  56.98 
 
 
270 aa  251  9.000000000000001e-66  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.043656  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0864  indole-3-glycerol-phosphate synthase  48.85 
 
 
258 aa  250  2e-65  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2494  indole-3-glycerol-phosphate synthase  53.49 
 
 
266 aa  250  2e-65  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.141997  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2079  indole-3-glycerol-phosphate synthase  54.02 
 
 
272 aa  250  2e-65  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2380  indole-3-glycerol-phosphate synthase  56.59 
 
 
266 aa  249  3e-65  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.446118  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5394  indole-3-glycerol-phosphate synthase  52.49 
 
 
285 aa  248  6e-65  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.467387  normal  0.310018 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3173  indole-3-glycerol-phosphate synthase  52.59 
 
 
265 aa  248  7e-65  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.568636 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0895  indole-3-glycerol-phosphate synthase  48.46 
 
 
258 aa  247  1e-64  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1838  indole-3-glycerol-phosphate synthase  53.41 
 
 
264 aa  247  1e-64  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1822  indole-3-glycerol-phosphate synthase  51.59 
 
 
270 aa  245  4e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0025467 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0756  indole-3-glycerol-phosphate synthase  51.57 
 
 
266 aa  245  6e-64  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3099  indole-3-glycerol-phosphate synthase  54.66 
 
 
295 aa  243  1.9999999999999999e-63  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2829  indole-3-glycerol-phosphate synthase  52.61 
 
 
265 aa  242  3.9999999999999997e-63  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.232078  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2466  indole-3-glycerol-phosphate synthase  54.62 
 
 
272 aa  239  2.9999999999999997e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.00979183  normal  0.597636 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1733  indole-3-glycerol-phosphate synthase  53.01 
 
 
281 aa  237  1e-61  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.582058  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1141  indole-3-glycerol-phosphate synthase  49.6 
 
 
268 aa  237  2e-61  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2484  indole-3-glycerol-phosphate synthase  51.15 
 
 
266 aa  236  2e-61  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5576  Indole-3-glycerol phosphate synthase  49.62 
 
 
288 aa  234  8e-61  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.513944  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1957  indole-3-glycerol-phosphate synthase  48.06 
 
 
266 aa  234  1.0000000000000001e-60  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1100  indole-3-glycerol-phosphate synthase  49.2 
 
 
268 aa  234  1.0000000000000001e-60  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4672  indole-3-glycerol-phosphate synthase  50.6 
 
 
285 aa  234  1.0000000000000001e-60  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5135  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  50.6 
 
 
285 aa  234  2.0000000000000002e-60  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0596485 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2139  indole-3-glycerol-phosphate synthase  51 
 
 
263 aa  233  2.0000000000000002e-60  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.248459  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1877  indole-3-glycerol phosphate synthase  48.45 
 
 
266 aa  233  3e-60  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.597244  normal  0.150585 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0711  indole-3-glycerol-phosphate synthase  50.97 
 
 
267 aa  232  4.0000000000000004e-60  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>